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Soliton excitations and interaction in alpha helical protein with interspine coupling in modified nonlinear schrodinger equation

引用

Chinese Physics B 2019年第12期28卷 130-135页

作者： Ming-Ming Li Cheng-Lai Hu Jun Wu Xian-Jing Lai Yue-Yue Wang Zhejiang Provincial Key Laboratory of Chemical Utilization of Forestry Biomass School of SciencesZhejiang A&F UniversityHangzhou 311300China School of Humanity and Law Zhejiang A&F UniversityHangzhou 311300China College of Basic Science Zhejiang Shuren UniversityHangzhou 310015China

The three-coupling modified nonlinear Schr?dinger(MNLS) equation with variable-coefficients is used to describe the dynamics of soliton in alpha helical protein. This MNLS equation with variable-coefficients is firstly transformed to the MNLS equation with constant-coefficients by similarity transformation. And then the one-soliton and two-soliton solutions of the variable-coefficient-MNLS equation are obtained by solving the constant-coefficient-MNLS equation with Hirota method. The effects of different parameter conditions on the soliton solutions are discussed in detail. The interaction between two solitons is also discussed. Our results are helpful to understand the soliton dynamics in alpha helical protein.

关键词： soliton three-coupling nonlinear modified schrodinger equation similarity transformation

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