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Implications of carbon catabolite repression for plant–microbe interactions

Plant Communications 2022年第2期3卷 13-33页

作者： Theophile Franzino Hasna Boubakri Tomislav Cernava Danis Abrouk Wafa Achouak Sylvie Reverchon William Nasser Feth el Zahar Haichar INSA-Lyon UniversitéClaude Bernard Lyon 1CNRSUMR5240MicrobiologieAdaptationPathogénieUniversitéLyon10 rue Raphaël Dubois69622 VilleurbanneFrance UniversitéLyon UniversitéClaude Bernard Lyon 1CNRSINRAEVetAgro SupUMRÉcologie Microbienne69622 VilleurbanneFrance Institute of Environmental Biotechnology Graz University of TechnologyPetersgasse 12/IGraz 8010Austria Aix Marseille Université CEACNRSBIAMLab Microbial Ecology of the Rhizosphere(LEMiRE)13108 Saint-Paul-Lez-DuranceFrance

Carbon catabolite repression(CCR)plays a key role in many physiological and adaptive responses in a broad range of microorganisms that are commonly associated with eukaryotic *** a mixture of different carbon sources is available,CCR,a global regulatory mechanism,inhibits the expression and activity of cellular processes associated with utilization of secondary carbon sources in the presence of the preferred carbon *** is known to be executed by completely different mechanisms in different bacteria,yeast,and *** addition to regulating catabolic genes,CCR also appears to play a key role in the expression of genes involved in plant–microbe ***,we present a detailed overview of CCR mechanisms in various *** highlight the role of CCR in beneficial as well as deleterious plant–microbe interactions based on the available *** addition,we explore the global distribution of known regulatory mechanisms within bacterial genomes retrieved from public repositories and within metatranscriptomes obtained from different plant *** integrating the available literature and performing targeted meta-analyses,we argue that CCR-regulated substrate use preferences of microorganisms should be considered an important trait involved in prevailing plant–microbe interactions.

关键词： carbon catabolite repression CCR carbon utilization plant–microbe interaction rhizosphere substrate-use preferences

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