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Fast and furious:insights of back splicing regulation during nascent RNA synthesis

Science China(Life Sciences) 2021年第7期64卷 1050-1061页

作者： Wei Xue Xu-Kai Ma Li Yang CAS Key Laboratory of Computational Biology Shanghai Institute of Nutrition and HealthUniversity of Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesShanghai 200031China School of Life Science and Technology ShanghaiTech UniversityShanghai 201210China

Alternative splicing of eukaryotic precursor(messenger)RNAs in the nucleus not only increases transcriptomic complexity,but also expands proteomic and functional diversity.In addition to basic types of alternative splicing,recent transcriptome-wide analyses have also suggested other new types of non-canonical splicing,such as back splicing and recursive splicing,and their widespread expression across species.Increasing lines of evidence have suggested mechanisms for back splicing,including insights from analyses of nascent RNA sequencing.In this review,we discuss our current understanding of back splicing regulation,and highlight its distinct characteristics in processing during nascent RNA synthesis by taking advantage of metabolic tagging nascent RNA sequencing.Features of recursive splicing are also discussed in the perspective of nascent RNA sequencing.

关键词： alternative splicing back splicing deep sequencing nascent RNA-seq metabolic tagging 4sUDRB-seq transcription recursive splicing

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