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Distribution of chromophytic phytoplankton in the Western Subarctic Gyre of Pacific Ocean revealed by morphological observation and rbc l gene sequences

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Journal of Oceanology and limnology 2023年第6期41卷 2166-2179页

作者： Tao JIANG Xiaohan QIN Guannan WU Huaxian ZHAO Xiaotao YU Xueyan XIAO Wenjing lIU Qingjing HU Jufa CHEN Nan lI School of Ocean Yantai UniversityYantai 264005China Key laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries Ministry of AgricultureYellow Sea Fisheries Research InstituteChinese Academy of Fishery SciencesQingdao 266071China Key laboratory of Ministry of Education for Environment Change and Resources Use in Beibu Gulf Guangxi Key Laboratory of Earth Surface Processes and Intelligent SimulationNanning Normal UniversityNanning 530001China State Key laboratory of Acoustics Institute of AcousticsChinese Academy of SciencesBeijing 100190China School of Medicine Yunnan UniversityKunming 650091China College of Ocean and Meteorology Guangdong Ocean UniversityZhanjiang 524088China

Western Subarctic Gyre(WSG),which possesses distinctive differences in oceanographic and biogeochemical processes,is situated in the northwest subarctic *** WSG is characterized by high nutrient and low *** carried out a field investigation in this area in summer 2020 and performed microscopic observation,cytometric counting,and RuBisCO large subunit(rbc l)gene analysis to understand the community structure and spatial distribution of chromophytic phytoplankton *** method revealed that total phytoplankton(>10μm,including Bacillariophyta,Dinoflagellata,Ochrophyta,and Chlorophyta)abundances ranged(0.6×10^(3))-(167.4×10^(3))cells/l with an increasing trend from south to *** and Pennatae diatoms dominated the phytoplankton assemblages in the southern and northern stations,*** chromophytic phytoplankton groups derived from rbc l genes included Haptophyta,Ochrophyta,Bacillariophyta,as well as rarely occurring groups,such as Xanthophyta,Cyanobacteria,Dinoflagellata,Rhodophyta,and *** the phylum level,Haptophyta was the most abundant phylum,accounting for approximately 30.80%of the total obtained operational taxonomic units in all *** and Bacillariophyta were the second and third most abundant phylum,and their relative abundance was 20.26% and 19.60%,***,redundancy analysis showed that high proportion of diatoms(e.g.,microscopic and rbc l methods)was positively correlated with nutrients(e.g.,dissolved inorganic nitrogen(DIN),dissolved inorganic phosphorous,and dissolved silicate(DSi))and negatively correlated with temperature and *** proportion of Ochrophyta,Rhodophyta,and Cyanobateria identified by rbc l genes was positively correlated with salinity and temperature and showed negative correlation to *** work is the first molecular study of phytoplankton accomplished in the WSG,and our results show some discrepancies between morphological observa

关键词： flow cytometry microscopic counting phytoplankton rbc l Western Subarctic Gyre

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Virescentia guangxiensis(Batrachospermales,Rhodophyta):a new freshwater red algal species from South China

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Journal of Oceanology and limnology 2021年第4期39卷 1538-1546页

作者： Kunpeng FANG Fangru NAN Jia FENG Junping lÜ Qi lIU Xudong lIU Shulian XIE School of life Science Shanxi Key Laboratory for Research and Development of Regional PlantsShanxi UniversityTaiyuan 030006China

Virescentia guangxiensis,a new species of Virescentia from Guangxi,South China,is described and illustrated based on morphological observations and phylogenetic *** species was distinguished morphologically from other species by the presence of special expansion cells with a variable shape,obovoid,spherical,pear-shaped,located in the penultimate cells of primary or secondary fascicles,rarely terminal on primary fascicles,as well as by small whorls(250-350-μm wide)and short primary fascicles(5-7 cell stories).Phylogenetic analysis of molecular data from the rbc l and COI-5P loci supported the separation of the proposed new species from other species in the genus *** is the first species of the order Batrachospermales reported in Guangxi and the second species of the genus Virescentia reported in *** study expands the known species diversity and geographical distribution of freshwater Rhodophyta in China.

关键词： Virescentia new species rbc l COI-5P China

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Phylogenetic Relationship of an Extremely Endangered Species, Pinus squamata (Pinaceae) Inferred from Four Sequences of the Chloroplast Genome and ITS of the Nuclear Ribosomal DNA

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Acta Botanica Sinica 2003年第5期45卷 530-535页

作者：张志勇杨俊波李德铢中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理开放实验室江西农业大学农学院南昌330045

Pinus squamata X. W. li, a recently-described species of the Pinaceae, is an extremely endangered pine with only 32 individuals in the wild. This species was thought to be intermediate between P. bungeana Zuec. ex Endl. of subgen. Strobus and P. yunnanensis Franch. of subgen. Pinus by the original author. We made an effort to address the question of the phylogenetic relationship of this peculiar and important species in the context of the major groups of the genus Pinus by using sequences of the rbcl, matK,genes, rpl20-rps18 spacer, trnV intron of the chloroplast genome and the nuclear ribosomal ITS region. The results of the separated analysis and the combined analysis of the four cpDNA sequences and ITS sequence indicated that P. squamata was a stable member of subsect. Gerardianae and P. gerardiana Wall. was the closest species of P. squamata phylogenetically. As a result, the causes of the distribution pattern of subsect. Gerardianae were also discussed.

关键词： Pinus squamata phylogenetic relationship rbc l mat K rpl20-rps 18 trn V ITS

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山西省超微型绿藻的系统发育分析

山西省超微型绿藻的系统发育分析

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作者：张瑶太原师范学院

学位级别：硕士

超微型真核浮游植物(0.2～3μm)的个体微小,分布广泛,系统发育多样性丰富,在藻类生物量、水生态系统的初级生产力以及生产清洁型能源等方面具有非常重要的贡献。目前,我国关于淡水中超微真核藻的多样性研究还比较少,现有认知不足,有研... 详细信息

超微型真核浮游植物(0.2～3μm)的个体微小,分布广泛,系统发育多样性丰富,在藻类生物量、水生态系统的初级生产力以及生产清洁型能源等方面具有非常重要的贡献。目前,我国关于淡水中超微真核藻的多样性研究还比较少,现有认知不足,有研究表明淡水中超微型绿藻的多样性非常丰富,但由于该类群个体微小、形态特征相似,使用传统的分类学方法很难对其进行准确鉴定。为了研究山西省淡水中超微型绿藻的物种多样性,确定其系统发育位置,本研究以山西省为研究范围,从山西省多个地方的水库、河流、湖泊等淡水水体进行了水样的采集,分离、纯化培养得到37株超微型绿藻,通过光学显微镜下形态学特征的观察结果以及3个基因序列(18S r RNA、rbc l、tuf A)的系统发育分析结果,共鉴定到3属13种。具体结果如下:(1)麦可属(Mychonastes)隶属于绿藻纲(Chlorophyceae)环藻目(Sphaeropleales),该属的物种分布广泛。基于形态学特征以及3个分子标记(18S r RNA、rbc l、tuf A)的系统发育分析结果,将分离得到的18株藻鉴定为7个物种,其中包括1个已知物种Mychonastes homosphaera,1个中国新记录种***,剩余5个物种由于数据库中麦可属已知物种的rbc l、tuf A分子数据有限,尚不能将其鉴定为现有物种或者是新物种,因此,暂将其鉴定为5个待定种,后续还需要获取更多的分子数据来对麦可属的物种进行进一步的分类与修订。(2)索囊藻属(Choricystis)隶属于共球藻纲(Trebouxiophyceae)。在索囊藻属中存在着不同的遗传结构,主要以两个系统发育谱系为代表,广泛分布于我国山西省的河流、湖泊、水库中。基于形态学观察、叶绿体的2个基因rbc l和tuf A序列的系统发育树的分析结果,结合目前能够获取的到的有关于索囊藻属的分子数据,将分离到的11株藻鉴定为至少5个不同的物种,其中包含1个已知物种寄生索囊藻Choricystis parasitica,1个中国新记录种***,还有3个待定种。(3)中国新记录属——Medakamo属隶属于共球藻纲(Trebouxiophyceae)。该属的物种于近几年才被发现与研究,本研究结合藻株形态学特征的观察与18S r RNA、rbc l和tuf A三个分子标记的系统发育学研究结果,将采集到的8株藻鉴定为中国新记录属Medakamo属的1个待定种。将不同的分子标记与传统的分类学方法相结合,可以使我们的研究结果更加地准确、可靠。中国新记录属、种的发现与建立,有助于丰富麦可属、索囊藻属以及Medakamo属的物种多样性及地理分布情况,为超微型绿藻的多样性研究及其资源的开发与利用提供理论依据。

关键词：超微型绿藻系统发育分析 18S rRNA rbc l tufA

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淡水中麦可藻的分离纯化与鉴定

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太原师范学院学报（自然科学版） 2023年第2期22卷 69-76页

作者：张瑶李砧李艳晖太原师范学院山西晋中030619

麦可属(Mychonastes)在淡水中分布广,物种多样性丰富,在生产生物柴油以及净化水质等方面具有潜在的重要价值.但是该类群个体微小,形态简单,需要利用形态以及分子数据对其进行鉴定.从山西省晋中市潇河流域以及运城市新绛县三泉水库采集... 详细信息

麦可属(Mychonastes)在淡水中分布广,物种多样性丰富,在生产生物柴油以及净化水质等方面具有潜在的重要价值.但是该类群个体微小,形态简单,需要利用形态以及分子数据对其进行鉴定.从山西省晋中市潇河流域以及运城市新绛县三泉水库采集分离到3株球状绿藻XH-5、XH-13、SQ-9,通过观察其显微结构,分析3个分子标记(18S rRNA、rbc l、tuf A)的系统发育树.结果表明,XH-5、XH-13、SQ-9的18S rRNA序列与麦可属的序列聚为一支,并且3株藻的rbc l和tuf A序列与同球麦可藻(Mychonastes homosphaera)聚为一支,形态上与同球麦可藻的形态相似,基于此,将3株藻鉴定为同球麦可藻.该研究结果可以丰富麦可属在我国的物种多样性和分布状况,促进麦可藻资源的开发与利用.

关键词：麦可属显微结构系统发育 18S rRNA rbc l tuf A

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