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基于5.8S rdna-its序列的我国浙江沿海铜藻群体遗传多样性分析

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热带亚热带植物学报 2013年第2期21卷 147-154页

作者：蔡一凡张鹏王铁杆陈少波谢起浪温州医学院生命科学学院浙江温州325035 温州医学院海洋科学研究所浙江温州325035 浙江省海洋水产养殖研究所浙江温州325005 浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室浙江温州325005

为了调查我国浙江沿海铜藻(Sargassum horneri)群体遗传多样性,对浙江省南麂岛火焜岙、洞头岛、枸杞岛的野生群体和南麂岛马祖岙养殖群体的铜藻44个样品的5.8S rdna-its序列进行了PCR扩增和序列分析,获得DNA片段长度为1485 bp,包括部分I... 详细信息

为了调查我国浙江沿海铜藻(Sargassum horneri)群体遗传多样性,对浙江省南麂岛火焜岙、洞头岛、枸杞岛的野生群体和南麂岛马祖岙养殖群体的铜藻44个样品的5.8S rdna-its序列进行了PCR扩增和序列分析,获得DNA片段长度为1485 bp,包括部分its1、完整的5.8S rdna和部分its2序列。序列分析表明仅有1个变异位点,说明群体间没有明显的遗传分化,遗传多样性较低。另外,将包含这一变异位点的基因型与GenBank公共数据库中另外2株铜藻的5.8S rdna-its区序列进行比对,共有31个变异位点,其中插入/缺失位点10个。因此,建议加快人工铜藻场的建设以及野生铜藻场的恢复,保持铜藻场的生态平衡。

关键词：铜藻 5 8S rdna—its 遗传多样性浙江沿海

香蕉穿孔线虫(Radopholus similis)rdna-its-RFLP特征分析

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香蕉穿孔线虫(Radopholus similis)rDNA-ITS-RFLP特征分析

云南烟草赤星病菌及近似种rdna－its序列分析

中国植物病理学会2008年学术年会

作者：李佳彭德良中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室

香蕉穿孔线虫(Radopholus similes)是一种极具毁灭性的外来入侵线虫,APPPC、COSAVE、 EPPO、欧盟、土耳其、阿根廷、智利、巴拉圭、乌拉圭等55个国家对其实施官方控制,我国一直将其列为进境植物检疫有害生物。该线虫寄主植物有350多种,... 详细信息

香蕉穿孔线虫(Radopholus similes)是一种极具毁灭性的外来入侵线虫,APPPC、COSAVE、 EPPO、欧盟、土耳其、阿根廷、智利、巴拉圭、乌拉圭等55个国家对其实施官方控制,我国一直将其列为进境植物检疫有害生物。该线虫寄主植物有350多种,可为害香蕉、胡椒、生姜、番茄、大豆、玉米、甘薯及一些观赏植物,使作物减产30%～60%甚至绝收。近年来,随着我国加入农产品国际贸易的迅速发展、人员交流的日益频繁和旅游业的发展,从香蕉穿孔线虫疫区国家或地区引进香蕉、花烛、肖竹芋、红掌、芭蕉及鹤望兰等花卉苗木及种质材料的种类和数量迅速增加,该线虫传入中国的风险日益剧增。面对这种重大危险性外来线虫入侵的严重形势,深入研究进而建立一种快速和准确的检测方法非常必要。本文采用通用引物 FerF 和 FerR 扩增3个香蕉穿孔线虫种群(RSHN3、RSHK 和 RSHZ)的 rdna-its 区,经纯化、克隆并测序,得到核苷酸序列长度为706bp,GennBank 序列注册号分别为 EU728660、EU728659、EU728661。用8种限制性内切酶(HeaⅢ、Hinf Ⅰ、Rsa Ⅰ、Cfo Ⅰ、PvuⅡ、 BamH Ⅰ、Taq Ⅰ和 Msp Ⅰ)对10个香蕉穿孔线虫种群(RSSH、RSHL、RSSZ、RSLZ、RSHK、 RSHN3、RSHN13、RSHN12p、RSHN12r 和 RSHZ)的 rdna-its 区扩增产物进行 PCR-RFLP 分析。结果表明,Hinf Ⅰ和Rsa Ⅰ可以将香蕉穿孔线虫 RSHN3种群与其他9个种群区分开来,且 Rsa Ⅰ和 Hinf Ⅰ酶切后,RSHN3不仅产生了与其他种群相同的片段,还多产生了与其他种群不同的片段, RSHN3可能与其他种群存在基因型差异或其有可能为混合基因型。

关键词：香蕉穿孔线虫 rdna—its RFLP Radopholus similis

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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云南农业大学学报（自然科学版） 2012年第5期27卷 670-676页

作者：胡中会赵立华严恩平范静华孔宝华陈海如文山学院生化系云南文山663000 云南省文山农业科学研究所云南文山663000 云南农业大学植物保护学院、农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室云南昆明650201

为了进一步研究云南省烟草赤星病病原的系统发育关系,提取28份供试菌株的菌丝基因组DNA,进行rdna-its序列及两侧its序列扩增。28个供试菌株与GenBank中登录的链格孢属7个种(包括5个小孢子种Alternaria citri,***,***,***,***和2个大孢子... 详细信息

为了进一步研究云南省烟草赤星病病原的系统发育关系,提取28份供试菌株的菌丝基因组DNA,进行rdna-its序列及两侧its序列扩增。28个供试菌株与GenBank中登录的链格孢属7个种(包括5个小孢子种Alternaria citri,***,***,***,***和2个大孢子种***,***)14个菌株的序列进行聚类分析:42个菌株明显地分成两支,供试菌株与5个小孢子种聚为一个分支,序列同源性高达99%～100%,没有明显的地域性差异;但另2个大孢子种聚为单独的一支,明显地与供试菌株和其他5个小孢子种区分开。rdna itsl-5.8S-its2序列在相对保守的基础上又存在一定变异,在一些菌物属的研究中可作为分类鉴定、分子标记、系统发育的重要依据,但通过对世界各地Alternaria菌株序列的分析发现,rdnaits1-5.8S-its2仅能将大孢子种和小孢子种分开,还不能作为区分不同地域不同来源菌株的标准。

关键词：烟草赤星病 rdna—its 序列分析

香蕉枯萎病菌1号和4号生理小种rdna-its的比较

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福建农林大学学报（自然科学版） 2009年第3期38卷 231-233页

作者：吕伟成张绍升福建农林大学植物保护学院福建福州350002

对采自福建省香蕉枯萎病菌(***)3个1号生理小种(Foc1)菌株和17个4号生理小种(Foc4)菌株的its区进行PCR扩增,将Foc1代表菌株FOCABB361和Foc4代表菌株FOCAAA315的rdna-its序列提交GenBank,获得的GenBank登录号分别为EU395428和EU332405.序列分析结果表明:Foc4号生理小种的its2区长度为151 bp;Foc1号生理小种的its2区长度为152 bp;Foc1号和4号生理小种的its1区完全一致,长度都为147 ***1号生理小种与4号生理小种的its序列差异不大.表明its区对于镰刀菌属内种间差异鉴别具有参考价值,但不能用于Foc生理小种的鉴别.

关键词：香蕉枯萎病菌 rdna—its 序列分析

不同产区麦冬、山麦冬rdna-its序列分析

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福建农业学报 2009年第6期24卷 508-512页

作者：黄玉吉陈菁瑛苏海兰黄颖桢万学锋福建省农业科学院农业生物资源研究所福建福州350003 福建农林大学园艺植物生物工程研究所福建福州350002

利用特异性引物进行PCR扩增和克隆、测定不同产区麦冬和山麦冬原植物的18S^26S r DNA-its区碱基序列,结果得到供试的7个不同产区麦冬和山麦冬植株样品rdna的its及5.8Srdna全序列、18S和26Srdna部分序列,序列长度在696~711 bp。通过分析... 详细信息

利用特异性引物进行PCR扩增和克隆、测定不同产区麦冬和山麦冬原植物的18S^26S r DNA-its区碱基序列,结果得到供试的7个不同产区麦冬和山麦冬植株样品rdna的its及5.8Srdna全序列、18S和26Srdna部分序列,序列长度在696~711 bp。通过分析比较各its序列,表明不同产区麦冬和山麦冬rdna-its区存在差异,可为其分子鉴别提供了依据。

关键词：麦冬山麦冬 rdna—its

番茄采后红粉病病原鉴定及植物精油抑菌活性研究

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中国食品学报 2013年第10期13卷 170-176页

作者：施俊凤孙常青王建明白云凤山西农业大学农学院山西太谷030801 山西省农业科学院农产品贮藏保鲜研究所太原030031 山西省农业科学院作物科学研究所太原030031 农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室太原030031

为了明确番茄采后红粉病病原菌,通过病原菌rdna-its克隆测序、BLASTn比对分析,构建系统发育树,结合形态学特征,鉴定该病原菌为粉红单端孢霉(Trichothecium roseum)。以粉红单端孢霉为靶标,研究百里香精油、肉豆寇精油、丁香精油、月桂... 详细信息

为了明确番茄采后红粉病病原菌,通过病原菌rdna-its克隆测序、BLASTn比对分析,构建系统发育树,结合形态学特征,鉴定该病原菌为粉红单端孢霉(Trichothecium roseum)。以粉红单端孢霉为靶标,研究百里香精油、肉豆寇精油、丁香精油、月桂精油对该菌的体外抑菌活性。结果表明,该4种植物精油对粉红单端孢霉均有不同程度的抑菌活性。其中,丁香精油、百里香精油和肉豆寇精油抑制活性较强,月桂精油较弱。在2μL/plate,体外熏蒸条件下,前3种植物精油对粉红单端孢霉的抑制率在55%以上;而在培养基接触条件下,要达到相同的抑制率,精油的浓度约为400μL/L。在相同浓度下熏蒸法较培养基接触法对病原菌的抑制作用更强。Na2SiO3可促进百里香精油对粉红单端孢霉的抑菌活性。

关键词：番茄红粉病 rdna—its 植物精油抑菌活性

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脱氧新羟曲霉酸产生菌2101的分类鉴别

中国抗生素杂志 2011年第9期36卷 659-661页

作者：苏静黄明玉张月琴余利岩刘伟姜威司书毅刘红宇中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所北京100050

从土壤中分离到一株真菌菌株2101,经鉴定该菌株发酵产物2101C是新结构化合物—脱氧新羟曲霉酸。通过rdna-its和β-tubulin等基因序列的分析比对得到与Aspergillus属中相似性较高的3株菌株(Aspergillus persii、Aspergillus bridgeri和As... 详细信息

从土壤中分离到一株真菌菌株2101,经鉴定该菌株发酵产物2101C是新结构化合物—脱氧新羟曲霉酸。通过rdna-its和β-tubulin等基因序列的分析比对得到与Aspergillus属中相似性较高的3株菌株(Aspergillus persii、Aspergillus bridgeri和Aspergillus sclerotiorum),结合传统真菌分类方法与这三株菌进行比对,菌株2101定名为Aspergillus sclerotiorum。

关键词：菌株2101 脱氧新羟曲霉酸 β-tubulin rdna—its

穿龙薯蓣立枯病的病原鉴定及其对杀菌剂的敏感性

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东北林业大学学报 2011年第1期39卷 99-101页

作者：白庆荣王楠孙凤发高洁吉林农业大学长春130118 安图县农业局

利用组织分离法对穿龙薯蓣立枯病罹病植株茎段进行病原菌的分离。获得了8个具有致病性的菌株,并对其形态学和培养学性状进行了观察。结果表明:茄立枯丝核菌(Rhizoctonia solani Kühn)为该病害的病原菌。采用常规玻片对峙培养法进行病... 详细信息

利用组织分离法对穿龙薯蓣立枯病罹病植株茎段进行病原菌的分离。获得了8个具有致病性的菌株,并对其形态学和培养学性状进行了观察。结果表明:茄立枯丝核菌(Rhizoctonia solani Kühn)为该病害的病原菌。采用常规玻片对峙培养法进行病菌菌丝融合群测定及菌株rdna-its区序列分析,结果均表明,该病原菌属茄立枯丝核菌AG-1-IB亚群。病原菌的室内药剂敏感性测定结果表明:病菌对达克宁、适乐时和异菌脲敏感性最高(EC505 mg/L)。

关键词：穿龙薯蓣菌丝融合群 rdna—its 室内毒力

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剑麻斑马纹病病原鉴定

东北农业大学学报 2011年第12期42卷 59-64页

作者：郑金龙高建明张世清陈河龙刘巧莲易克贤中国热带农业科学院环境与植物保护研究所海南儋州571737 中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物技术重点开放实验室海口571101

剑麻斑马纹病是剑麻的毁灭性真菌病害,是剑麻最严重的病害之一。从海南、广东和广西的剑麻主产区共收集剑麻斑马纹病样品12份,提取其病原菌的基因组DNA并进行rdna-its区序列扩增,序列的比对结果与形态学的鉴定结果相一致,表明参试菌株... 详细信息

剑麻斑马纹病是剑麻的毁灭性真菌病害,是剑麻最严重的病害之一。从海南、广东和广西的剑麻主产区共收集剑麻斑马纹病样品12份,提取其病原菌的基因组DNA并进行rdna-its区序列扩增,序列的比对结果与形态学的鉴定结果相一致,表明参试菌株的病原菌均为烟草疫霉菌(Phytophthora nicotianae Breda);N-J法构建的系统发育树结果表明,12个参试菌株可分为两个类群,存在一定的地域分化。以上研究将为今后对剑麻斑马纹病的发病规律、防治方法及抗病机制等方面的研究奠定基础,提供了理论依据。

关键词：剑麻斑马纹病 rdna—its 序列分析病原鉴定