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Development of a multiprimer metabarcoding approach to understanding trophic interactions in agroecosystems

Insect Science 2022年第4期29卷 1195-1210页

作者： Ivan Batuecas Oscar Alomar Cristina Castañe Josep Piñol Stéphane Boyer Lorena Gallardo-Montoya Nuria Agustí IRTA Sustainable Plant ProtectionCabrilsBarcelonaSpain Universitat Autònoma Barcelona Cerdanyola del VallèsSpain CREAF Cerdanyola del VallèsSpain Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte(IRBI) Tours UniversityToursFrance

To understand trophic interactions and the precise ecological role of each predatory species,it is important to know which arthropod and plant resources are used by generalist predators in *** approaches,such as the use of high-throughput sequencing(HTS),play a key role in identifying these *** study develops a multiprimer metabarcoding approach for screening the most common trophic interactions of two predatory arthropods with contrasting morphologies,Rhagonycha fulva(Coleoptera:Cantharidae)and Anthocoris nemoralis(Hemiptera:Anthocoridae)collected from a peach *** reduce the time and cost of this metabarcoding approach,we first evaluated the effect of using two different predator-pools of different size(10 and 23 individuals of the same species).We also used our system to analyze the performance of one and two primer pairs in the same *** results show that the analysis of 23 individuals together with the use of two primer pairs in the same library optimize the HTS *** these best-performing conditions,we then analyzed the entire bodies of field-collected predators as well as the washing solutions used to clean the insect *** were able to identify both gut content(i.e.,diet)and external pollen load(i.e.,on the insects’bodies).This study also demonstrates the importance of washing predatory insects’bodies prior to HTS analysis when the target species have a considerable size(>10 mm)and hairy *** metabarcoding approach has significant potential for the study of trophic links in agriculture,revealing expected and unexpected trophic relationships.

关键词： high-throug hput sequencing metabarcoding molecular diet analysis multiprimer approach predatory arthropods trophic interactions

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