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两个周期激励下Duffing-van der pol系统的混沌瞬态和广义激变

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物理学报 2013年第12期62卷 75-82页

作者：韩群徐伟刘涛刘莉西北工业大学应用数学系西安710129

运用广义胞映射图方法研究两个周期激励作用下Duffing-van der pol系统的全局特性.发现了系统的混沌瞬态以及两种不同形式的瞬态边界激变,揭示了吸引域和边界不连续变化的原因.瞬态边界激变是由吸引域内部或边界上的混沌鞍和分形边界上... 详细信息

运用广义胞映射图方法研究两个周期激励作用下Duffing-van der pol系统的全局特性.发现了系统的混沌瞬态以及两种不同形式的瞬态边界激变,揭示了吸引域和边界不连续变化的原因.瞬态边界激变是由吸引域内部或边界上的混沌鞍和分形边界上周期鞍的稳定流形碰撞产生.第一种瞬态边界激变导致吸引域突然变小,吸引域边界突然变大;第二种瞬态边界激变使两个不同的吸引域边界合并成一体.此外,在瞬态合并激变中两个混沌鞍发生合并,最后系统的混沌瞬态在内部激变中消失.这些广义激变现象对混沌瞬态的研究具有重要意义.

关键词：广义胞映射图方法 Duffing-van der pol 混沌瞬态广义激变

具有van der pol边界条件的一维波动方程的非迷向混沌振动(英文)

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中山大学学报（自然科学版） 2004年第5期43卷 5-8页

作者：刘国刚赵怡中山大学数学与计算科学学院广东广州510275

具有vanderpol边界条件的一维波动方程是一种最简单的可能产生迷向或非迷向混沌振动的模型。用混沌振动理论刻画非迷向混沌振动。给出了空间区间上的snapshots在长时间水平线上关于2个参数的变化一个更大有界变差增长区间,改进了已有的... 详细信息

具有vanderpol边界条件的一维波动方程是一种最简单的可能产生迷向或非迷向混沌振动的模型。用混沌振动理论刻画非迷向混沌振动。给出了空间区间上的snapshots在长时间水平线上关于2个参数的变化一个更大有界变差增长区间,改进了已有的结果。

关键词：混沌波动方程 van der pol 全变差

靶向HIV-1pol的高效人工miRNA的构建与体外抗病毒能力评价

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生物工程学报 2010年第1期26卷 63-73页

作者：程通张涛张雅丽魏丽华夏德镇王颖彬张军夏宁邵厦门大学生命科学学院国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心厦门361005

RNAi技术在抗HIV-1治疗研究中已显示出巨大潜力,获得可高效特异抑制HIV-1的RNAi元件是进行相关研究的重要基础。miRNA在抑制和表达方式上相比siRNA具有更多的优势。本研究即探讨构建可高效特异靶向HIV-1的人工miRNA元件。选择以保守性... 详细信息

RNAi技术在抗HIV-1治疗研究中已显示出巨大潜力,获得可高效特异抑制HIV-1的RNAi元件是进行相关研究的重要基础。miRNA在抑制和表达方式上相比siRNA具有更多的优势。本研究即探讨构建可高效特异靶向HIV-1的人工miRNA元件。选择以保守性较好的HIV-1pol基因为靶区筛选高效保守的RNAi序列,设计了16个可靶向pol区高保守区段的RNAi靶点,构建表达载体与HIV-1感染性克隆进行共转染抑制实验,筛选显示pol1026序列兼具高保守性及高抑制效率特点。以天然miR-30a为基础骨架构建了靶向pol1026靶点的人工miRNA元件,通过与HIV-1感染性克隆质粒的共转染抑制实验验证获得了可有效抑制HIV-1表达的人工miRNA元件(miR-1026E)。通过与携带靶序列的报告质粒的共转染实验证明miR-1026E具有良好的靶点特异性。本研究进一步构建了携带miR-1026E表达元件的重组慢病毒,转导MT-4细胞并对转导后细胞进行克隆化筛选,获得稳定整合miR-1026E表达元件的MT-4-miR1026E细胞克隆,该细胞在体外攻毒实验中可高效抑制HIV-1的复制,具有显著的抑制HIV-1的能力。同时应用实时RT-PCR方法检测显示,miR-1026E在细胞中不会影响内源性代表miRNA(miR-181与miR-16)的表达水平和干扰素效应相关基因stat1的表达水平,具有良好的特异性。所获得的可特异高效抑制HIV-1复制的人工miRNA元件可为抗HIV-1研究提供重要参考。

关键词： RNA干扰 HIV-1 pol 人工miRNA

HIV-1毒株gag和pol基因区抗原表位及耐药性突变分析

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病毒学报 2012年第4期28卷 351-357页

作者：尚诚彰陈国敏张怀渝曾毅中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京100052 四川农业大学生命科学与理学院四川雅安625014

通过研究HIV-1 gag和pol基因序列变异特征,以了解抗原表位变异特点和耐药性突变情况。采集HIV-1阳性全血样本,使用巢式PCR扩增gag和pol基因部分区段,得到23份样本的PCR序列和相应样本的克隆序列gag基因为449份、pol基因为402份,基因分型... 详细信息

通过研究HIV-1 gag和pol基因序列变异特征,以了解抗原表位变异特点和耐药性突变情况。采集HIV-1阳性全血样本,使用巢式PCR扩增gag和pol基因部分区段,得到23份样本的PCR序列和相应样本的克隆序列gag基因为449份、pol基因为402份,基因分型为HIV-1B和B′亚型。两种亚型的共享序列在选取的8个CTL抗原表位中,共有4个抗原表位发生了8个突变位点;另外位于p24区的5个抗原表位在PCR序列中没有发生变化,但在它们的克隆序列(9.80%)中发生了少数突变。在pol基因PCR序列和克隆序列中发现蛋白酶抑制剂(Protease inhibitors,PIs)和逆转录酶抑制剂(Reverse transcriptase inhibitors,RTIs)耐药性突变位点分别为18个和24个,其中只在克隆序列中发现的PIs和RTIs耐药性突变位点分别占其总数的94.44%(17/18)和62.50%(15/24)。结果显示本研究样本PCR序列中表现出耐药性的比例较高(17.39%),并在克隆序列中存在少数免疫逃逸和耐药性突变,提示部分样本对现行抗病毒药物产生一定程度的耐药。

关键词： HIV-1 gag pol 抗原表位耐药性突变

polⅡ-ChIP-PE-MS方法的建立及其在SNP功能研究中的应用

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世界华人消化杂志 2005年第20期13卷 2431-2436页

作者：晏泽辉邓国宏王宇明第三军医大学西南医院全军感染病研究所重庆市400038

目的:建立RNA多聚酶Ⅱ-染色质免疫沉淀-引物延伸-飞行时间质谱技术(polⅡ-ChIP-PE-MS),并利用该方法检测SNP等位特异磷酸化polⅡ结合量,为活体状态下研究疾病关联基因SNP的功能研究提供一种高通量的研究手段.方法:采用PCR-RFLP方法对He... 详细信息

目的:建立RNA多聚酶Ⅱ-染色质免疫沉淀-引物延伸-飞行时间质谱技术(polⅡ-ChIP-PE-MS),并利用该方法检测SNP等位特异磷酸化polⅡ结合量,为活体状态下研究疾病关联基因SNP的功能研究提供一种高通量的研究手段.方法:采用PCR-RFLP方法对HepG2细胞印迹基因SNRPN(仅父源等位基因表达)基因组DNA和cDNA进行基因分型,利用polⅡCTD末端Ser5特异性抗体进行染色质免疫沉淀,针对SNP位点两侧序列设计PCR引物和延伸引物,以外侧引物进行PCR扩增,采用延伸引物进行VLET引物延伸,产物纯化后经MALDI-TOF质谱鉴定.结果:对SNRPN杂合子细胞的SNRPNC1654312TSNP进行polⅡ-ChIP-PE-MS分析发现,基因组DNA样本和染色质免疫沉淀前样本在C、T等位点都包含相同polⅡ结合量,但免疫沉淀后标本(被磷酸化RNA多聚酶Ⅱ结合的染色质)就仅在T等位点有结合,与产生mRNA转录的等位点相对应.结论:成功建立起polⅡ-ChIP-PE-MS方法,利用该方法检测SNP等位特异磷酸化polⅡ结合量是可靠的,可以利用polⅡ-ChIP-PE-MS策略鉴定疾病关联基因SNP的功能.

关键词：单核苷酸多态性 RNA多聚酶Ⅱ 染色质免疫沉淀引物延伸质谱 SNP位点 pol 功能研究 ChIP PCR-RFLP方法

Time Delay Induced Oscillation: An Example on a Class of <i>n</i>Coupled Van Der pol Oscillators Model with Delays

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Applied Mathematics 2012年第6期3卷 571-576页

作者： Chunhua Feng Carl S. Pettis College of Science Mathematics and Technology Alabama State University Montgomery USA

In this paper, a class of n coupled van der pol oscillator model with delays is considered. By employing an analysis approach, some sufficient conditions to guarantee the existence of stability and oscillations for th... 详细信息

关键词： n Coupled Van Der pol Oscillator Model Characteristic Equation Delay Oscillation

甘蓝型油菜pol CMS育性恢复基因的PCR标记(英文)

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Acta Genetica Sinica 2000年第11期27卷 1012-1017页

作者：王俊霞杨光圣傅廷栋孟金陵华中农业大学农学系作物遗传改良国家重点实验室武汉430070

采用恢、保回交群体和集团混合分析法，筛选了１０４０个１０—ｍｅｒ随机引物，找到了与甘蓝型油菜波里马细胞质雄性不育系（ＰｏｌＣＭＳ）育性恢复基因（Ｒｆｐ）连锁的两个ＲＡＰＤ标记Ｓ１０１９７２０和Ｓ１０３６８１０。它们... 详细信息

采用恢、保回交群体和集团混合分析法，筛选了１０４０个１０—ｍｅｒ随机引物，找到了与甘蓝型油菜波里马细胞质雄性不育系（ＰｏｌＣＭＳ）育性恢复基因（Ｒｆｐ）连锁的两个ＲＡＰＤ标记Ｓ１０１９７２０和Ｓ１０３６８１０。它们位于Ｒｆｐ的一侧，与该基因的遗传图距分别为５．８ｃＭ和１２．３ｃＭ。随后，克隆并测序这２个多态性片段，根据其２端序列设计了２对２０～２４－ｍｅｒ的特异引物，它们在１３８株的回交群体中ＰＣＲ分离分析的结果与原来各自的ＲＡＰＤ标记相同。这２个ＳＣＡＲ标记将被用于分子标记辅助选育Ｐｏｌ

关键词：甘蓝型油菜 pol CMS 恢复基因 RAPD SCAR

DNA pol β,Ku80与鼻咽癌放射敏感性的关系

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武汉大学学报（医学版） 2010年第4期31卷 462-467页

作者：熊晖孙宁姚运红唐泽立李飞虹蔡琼珍广东医学院病理学教研室广东湛江524023

目的:研究人鼻咽癌细胞系CNE-2Z亚克隆株F1、S1放射后DNA修复相关基因DNA pol β和Ku80的表达,探讨CNE-2Z存在放射敏感性异质性的可能机理。方法:裸鼠体内移植瘤实验观察F1、S1放射后的体内增殖能力,采用Western blot、免疫细胞化学和... 详细信息

目的:研究人鼻咽癌细胞系CNE-2Z亚克隆株F1、S1放射后DNA修复相关基因DNA pol β和Ku80的表达,探讨CNE-2Z存在放射敏感性异质性的可能机理。方法:裸鼠体内移植瘤实验观察F1、S1放射后的体内增殖能力,采用Western blot、免疫细胞化学和免疫组织化学方法检测放射后F1和S1 DNA修复相关蛋白(DNA pol β、Ku80)的表达,Feulgen染色法和图像分析方法检测放射后F1、S1裸鼠体内移植瘤的DNA倍体及细胞周期分布情况。结果:未照射前F1细胞DNA pol β和Ku80的表达高于S1;放射后S1细胞DNA pol β及Ku80表达上调的时间较F1早,上调辐度大于F1。鼻咽癌细胞系CNE-2Z确实存在放射敏感性的异质性,放射后S1体内增殖能力大于F1,较多细胞处于有利于DNA修复的G2/M期(Ppol β和Ku80蛋白表达差异无统计学意义(P>0.05)。结论:本实验进一步证实了鼻咽癌细胞系CNE-2Z确实存在放射敏感性的异质性,F1、S1放射敏感性的差异与两株细胞的DNA修复相关基因(DNA pol β、Ku80)的表达差异所致的DNA SSB、DSB修复的速度和忠实性有关。

关键词： DNA修复相关基因 DNA pol β Ku80 放射敏感性鼻咽癌

The Effects of Liquor Spirits on RNA pol III Genes and Cell Growth of Human Cancer Lines

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Food and Nutrition Sciences 2018年第3期9卷 208-220页

作者： Yunfeng Yi Junxia Lei Ganggang Shi Songlin Chen Yanmei Zhang Zaifa Hong Zhimin He Shuping Zhong Department of Cardiothoracic Surgery Xiamen University Affiliated Southeast Hospital Xiamen China School of Medicine South China University of Technology Guangzhou China Keck School of Medicine University of Southern California Los Angeles USA Department of Pharmacology Shantou University Medical College Shantou China Cancer Hospital and Institute of Guangzhou Medical University Guangzhou China

Alcohol consumption is a major health issue and associated with human cancers, such as liver and breast cancers. Alcohol was classed as carcinogen to human by IARC. We have performed in vivo and in vitro studies which demonstrate that diluted ethanol promotes cell proliferation and transformation and tumor formation. Consumption of liquor spirits (white wines) is a popular behavior. However, it is unclear whether liquor spirits affect cellular phenotypes of human cancers. At present study, we used diluted ethanol and liquor spirits (Sample #1 and Sample #2) to determine the changes in RNA polymerase III-dependent gene (pol III gene) transcription, cell growth and colony formation in the different human cancer lines. The results indicate that low concentration of ethanol increases RNA pol III gene transcription and rate of cell growth. However, both liquor spirits (Sample #1 and Sample #2) inhibit the activity of RNA pol III genes and repress cell proliferation of the cancer lines, compared to diluted ethanol. The liquor spirits reduce the rate of colony formation of human breast cancer cells and esophageal carcinoma cells. The inhibitions of the liquor spirits to RNA pol III genes, cell growth and colony formation are in a dose-dependent manner. These new findings suggest that the liquor spirits contain some active components to repress pol III gene transcription and cell growth caused by ethanol in different human cancer cells.

关键词： Ethanol Liquor Spirits Cancer Cells pol III Genes Cell Growth Colony Formation