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Estimating ancestral distributions of lineages with uncertain sister groups:a statistical approach to Dispersal-Vicariance Analysis and a case using Aesculus L.(Sapindaceae) including fossils

引用

Journal of Systematics and Evolution 2009年第5期47卷 349-368页

作者： A.J.HARRIS North Carolina State University Department of Plant Biology

We propose a simple statistical approach for using Dispersal-Vicariance Analysis(DIVA) software to infer biogeographic histories without fully bifurcating *** this approach,ancestral ranges are first optimized for a sample of Bayesian *** probability P of an ancestral range r at a node is then calculated as P(rY) = n t=1 F(rY)t Pt where Y is a node,and F(rY) is the frequency of range r among all the optimal solutions resulting from DIVA optimization at node Y,t is one of n topologies optimized,and Pt is the probability of topology *** Y is a hypothesized ancestor shared by a specific crown lineage and the sister of that lineage "x",where x may vary due to phylogenetic uncertainty.polytomies and nodes with posterior probability phylogenetic uncertainty.as well as uncertainty.from DIVA *** is an extension of the previously described method called Bayes-DIVA,which pairs Bayesian phylogenetic analysis with biogeographic analysis using ***,we show that the probability P of an ancestral range at Y calculated using this method does not equate to pp*F(rY) on the Bayesian consensus tree when both variables are phylogenetic *** analysis resolved the geographic ranges of the pare

关键词： Aesculus biogeography DIVA fossil wildcards MrBayes phylogenetic uncertainty.

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