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An updated megaphylogeny of plants,a tool for generating plant phylogenies and an analysis of phylogenetic community structure

引用

Journal of Plant ecology 2016年第2期9卷 233-239页

作者： Hong Qian Yi Jin Research and Collections Center Illinois State Museum1011 East Ash StreetSpringfieldIL 62703USA College of Life Sciences Zhejiang UniversityHangzhou 310058China

Aims The aim of this article is ***,we present an updated version of a published megaphylogeny of vascular plants that can be used in studies of plant ecology and ***,we develop a tool that can be used by botanists and plant ecologists to generate phylogenetic hypotheses in three ***,we use a set of regional assemblages of angiosperm trees in North america as a model system to evaluate the effect of differences in phylogenies generated using the three scenarios on the quantification of phylogenetic properties and the relationship between measures of phylogenetic properties and *** The taxonomy and nomenclature of plant species in the megaphy-logeny were standardized according to The Plant list(version 1.1).a tool for generating phylogenies was created using the r *** robustness of derived phylogenies was evaluated using correlation and regression *** Findingsan updated megaphylogeny of vascular plants(PhytoPhylo)and a tool for reconstructing phylogenies of seed plants(***)were *** study shows that phylogenies generated by *** using the PhytoPhylo megaphylogeny as a backbone are nearly as good as phylogeny resolved at the species level when using derived phylogenies to quantify phylogenetic properties(*** diversity and phylogenetic relatedness)of biological assemblages,and that ***-generated phylogenies are robust for studies of community ecology and biogeography,par-ticularly those seeking for patterns of phylogenetic properties along environmental gradients.

关键词： megatree megaphylogeny phylogenetic community ecology phylogenetic metrics phylogenetic tree supertree vascular plants

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