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Examining heterogeneity of stromal cells in tumor microenvironment based on pan-cancer single-cell rna sequencing data

引用

cancer Biology & Medicine 2022年第1期19卷 30-42页

作者： Wenhui Wang Li Wang Junjun She Jun Zhu Department of Genetics and Genomic Sciences Icahn School of Medicine at Mount SinaiNew YorkNY 10029USA Sema4 a Mount Sinai ventureStamfordCT 06902USA First Affiliate Hospital of Xi’an Jiaotong University Xi’an 710061China Tisch cancer Institute Icahn School of Medicine at Mount SinaiNew YorkNY 10029USA

Tumor tissues contain both tumor and non-tumor cells,which include infiltrated immune cells and stromal cells,collectively called the tumor microenvironment(TME).single-cell rna sequencing(sc rnaseq)enables the examination of heterogeneity of tumor cells and TME.In this review,we examined sc rnaseq datasets for multiple cancer types and evaluated the heterogeneity of major cell type composition in different cancer types.We further showed that endothelial cells and fibroblasts/myofibroblasts in different cancer types can be classified into common subtypes,and the subtype composition is clearly associated with cancer characteristic and therapy response.

关键词： Stromal cells tumor microenvironment pan-cancer single-cell rna sequencing data

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