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In Silico Investigation of pH-Dependence of Prolactin and Human Growth Hormone Binding to Human Prolactin Receptor

Communications in Computational Physics 2013年第1期13卷 207-222页

作者： Lin Wang Shawn Witham Zhe Zhang Lin Li Michael Hodsdon Emil Alexov Computational Biophysics and Bioinformatics Department of PhysicsClemson UniversityClemsonSC 29634USA Department of Laboratory Medicine and the Department of Pharmacology Yale School of MedicineNew HavenConnecticut 06520USA

Experimental data shows that the binding of human prolactin(hPRL)to human prolactin receptor(hPRLr-ECD)is strongly pH-dependent,while the binding of the same receptor to human growth hormone(hGH)is *** we carry in silico analysis of the molecular effects causing such a difference and reveal the role of individual amino *** is shown that the computational modeling correctly predicts experimentally determined pka’s of histidine residues in an unbound state in the majority of the cases and the pH-dependence of the binding free *** analysis carried in conjunction with calculated pH-dependence of the binding revealed that the main reason for pH-dependence of the binding of hPRL-hPRLr-ECD is a number of salt-bridges across the interface of the complex,while no salt-bridges are formed in the ***,most of the salt-bridges involve histidine residues and this is the reason for the pH-dependence across a physiological range of *** analysis not only revealed the molecular mechanism of the pH-dependence of the hPRL-hPRLr-ECD,but also provided critical insight into the underlying physicchemical mechanism.

关键词： Human prolactin human prolactin receptor human growth hormone pka calculations pH-dependence electrostatics

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