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Multiple Endmember Hyperspectral Sparse Unmixing Based on Improved omp Algorithm

Journal of Harbin Institute of Technology(New Series) 2015年第5期22卷 97-104页

作者： Chunhui Zhao Haifeng Zhu Shiling Cui Bin Qi College of Information and Communication Engineering Harbin Engineering University

In conventional linear spectral mixture analysis model,a class is represented by a single ***,the intra-class spectral variability is usually very large,which makes it difficult to represent a class,and in this case,it leads to incorrect unmixing results. Some proposed algorithms play a positive role in overcoming the endmember variability,but there are shortcomings on computation intensive,unsatisfactory unmixing results and so on. Recently,sparse regression has been applied to unmixing,assuming each mixed pixel can be expressed as a linear combination of only a few spectra in a spectral library. It is essentially the same as multiple endmember spectral unmixing. omp( orthogonal matching pursuit),a sparse reconstruction algorithm,has advantages of simple structure and high efficiency. However,it does not take into account the constraints of abundance non-negativity and abundance sum-to-one( ANC and ASC),leading to undesirable unmixing results. In order to solve these issues,this paper presents an improved omp algorithm( fully constraint omp,Fomp) for multiple endmember hyperspectral sparse unmixing. The proposed algorithm overcomes the shortcomings of omp,and on the other hand,it solves the problem of endmember *** ANC and ASC constraints are firstly added into the omp algorithm,and then the endmember set is refined by the relative increase in root-mean-square-error( RMSE) to avoid over-fitting,finally pixels are unmixed by their optimal endmember set. The simulated and real hyperspectral data experiments show that FOPM unmixing results are ideally comparable and abundance RMSE reduces much lower than omp and simple spectral mixture analysis( s SMA),and has a strong anti-noise performance. It proves that multiple endmember spectral mixture analysis is more reasonable.

关键词： hyperspectral image sparse representation multiple endmember spectral unmixing omp ANC and ASC

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基于噪声子空间矢量的omp离格DOA估计

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光学精密工程 2020年第10期28卷 2384-2391页

作者：赵洋石屹然石要武吉林大学通信工程学院吉林长春130022

稀疏恢复算法进行DOA估计时需要在角度空间进行网格化量化处理。针对该量化过程会引入的量化误差从而影响估计性能的问题,本文通过导向矢量的一阶泰勒展开式将量化误差引入阵列输出的二阶矩模型。基于该模型设计了一种使用噪声子空间矢... 详细信息

稀疏恢复算法进行DOA估计时需要在角度空间进行网格化量化处理。针对该量化过程会引入的量化误差从而影响估计性能的问题,本文通过导向矢量的一阶泰勒展开式将量化误差引入阵列输出的二阶矩模型。基于该模型设计了一种使用噪声子空间矢量进行修正的omp算法对DOA和量化误差进行联合估计。新算法基于阵列协方差矩阵对于快拍数的依赖稍显敏感但是弥补了贪婪算法对DOA分辨力的不足并且不需要预知信源个数,同时计算量对比现有的基于lp范数约束的凸优化方法大大降低。仿真实验验证了所提算法的有效性。

关键词： DOA omp 噪声子空间矢量阵列信号处理

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泰山松花粉多糖和乳酸杆菌对禽波氏杆菌omp亚单位疫苗免疫增强的协同作用

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中国兽医学报 2013年第11期33卷 1662-1667页

作者：左雪梅崔国林杨世发梁漫飞钟世勋朱瑞良山东农业大学动物科技学院山东泰安271018

采用改进的水提醇沉法提取泰山松花粉粗多糖,并制备禽波氏杆菌omp亚单位疫苗。取1日龄SPF雏鸡300只,随机分为6组,Ⅰ～Ⅴ组分别免疫含有松花粉多糖100g/L的禽波氏杆菌omp亚单位疫苗,Ⅵ组只免疫禽波氏杆菌omp亚单位疫苗,Ⅰ、Ⅱ组在前2周... 详细信息

采用改进的水提醇沉法提取泰山松花粉粗多糖,并制备禽波氏杆菌omp亚单位疫苗。取1日龄SPF雏鸡300只,随机分为6组,Ⅰ～Ⅴ组分别免疫含有松花粉多糖100g/L的禽波氏杆菌omp亚单位疫苗,Ⅵ组只免疫禽波氏杆菌omp亚单位疫苗,Ⅰ、Ⅱ组在前2周分别口服高、低剂量的乳酸杆菌活菌菌液1mL,Ⅲ、Ⅳ分别口服高、低剂量的乳酸杆菌热灭活菌菌液1mL。在首免后,每周采取血液和小肠,用间接ELISA法检测血清抗体水平、MTT法检测外周血淋巴细胞转化率﹑全自动血细胞分析仪测定外周血淋巴细胞比率、ELISA法检测小肠sIgA含量和IL-2水平。结果表明,Ⅰ～Ⅳ组抗体水平、IL-2含量、淋巴细胞比率、淋巴细胞转化率、sIgA含量显著高于V组、Ⅵ组(Pomp疫苗的免疫力有协同作用。

关键词：泰山松花粉多糖乳酸杆菌禽波氏杆菌 omp 亚单位疫苗雏鸡免疫增强

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基于多核平台多流体网格法的MPI-omp嵌套并行实现

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计算机工程与科学 2009年第A1期31卷 214-215,240页

作者：晏益慧国防科技大学计算机学院湖南长沙410073

多核体系结构的问世为开发人员设计和实现应用软件提供了一个更强大的并行计算平台,本文提出了一种多流体网格法的MPI-omp嵌套并行方案,并给出了其在多核平台上的计算结果。

关键词：多核体系结构多流体网格法 omp MPI

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副猪嗜血杆菌omp P2基因PCR检测方法的建立与应用

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中国兽医学报 2010年第10期30卷 1321-1325页

作者：李鹏李军星李玉峰张国龙宋艳华王先炜姜平南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室江苏南京210095 长江大学动物科学学院湖北荆州434025

通过反应条件的优化、特异性和敏感性的测定,建立了一种快速、简便、准确的PCR方法,用于检测副猪嗜血杆菌(HPS)omp P2基因。PCR扩增片段大小为1 080 bp左右,最小检测量为1 000个HPS。与胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌、大肠杆菌、肠... 详细信息

通过反应条件的优化、特异性和敏感性的测定,建立了一种快速、简便、准确的PCR方法,用于检测副猪嗜血杆菌(HPS)omp P2基因。PCR扩增片段大小为1 080 bp左右,最小检测量为1 000个HPS。与胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌、大肠杆菌、肠沙门菌、金黄色葡萄球菌和链球菌无特异性反应。用该法检测人工感染猪的肺脏、心脏和肾脏抽提的DNA,结果为阳性;检测肝脏、脾脏、脑组织样品抽提的DNA,结果为阴性。用该法检测人工感染发病仔猪及自然感染仔猪肺组织,并结合细菌分离培养,证明以肺脏组织为病料,通过细菌分离培养,再用PCR法鉴定分离菌体,可有效地用于HPS的特异诊断。检测116份来自发病猪场的患病仔猪肺脏病料,其中有110份为阳性,与16S rRNA PCR检测结果一致,表明HPS所致发的Glsser's病已在我国广泛发生和流行。

关键词：副猪嗜血杆菌 omp P2 PCR 建立应用

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Mechanism of omp Decarboxylation in Orotidine 5'-Monophosphate Decarboxylase: the role of protonation process

Mechanism of OMP Decarboxylation in Orotidine 5'-Monophospha...

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第十三届全国量子化学会议

作者： Shizhen Mi Miao Lu Linyi University

In this article, the protonation processes before and after decarboxylation of oro tidine 5 '-monophosphate(omp) catalyzed by orotidine 5'-monophosphate decarboxylase(ODCase) is investigated theoretically at both Hartree-Fork and density functional theory(DFT) levels. The results indicate that firstly O4 is protonated by residues of ODCase bridged by water molecules. Then,after decarboxylation, a fast stepwise protonation process happens. Additionally,the catalytic function of Lys-93 is also discussed. The protonation process plays an important role in the whole reaction.

关键词： omp Protonation process PKa Mechanism Lys93

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抗鸭疫里氏杆菌omp单克隆抗体间接ELISA筛选方法的建立

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中国兽医杂志 2009年第2期45卷 23-24页

作者：覃志初张任娜帅领王豪举吴胜昔重庆市牧草与草食家畜重点实验室重庆北碚400716 西南大学动物科技学院重庆北碚400716 重庆工学院生物工程学院重庆杨家坪400050

鸭传染性浆膜炎病原为鸭疫里氏杆菌(riemerella anatipestifer,RA)。目前世界上报道的RA血清型共有21型,且血清型有变化和增多的趋势,RA各血清型间无交叉免疫保护作用。许多研究表明:RA的抗原类型为荚膜抗原和菌体抗原,血清型不同,荚膜... 详细信息

鸭传染性浆膜炎病原为鸭疫里氏杆菌(riemerella anatipestifer,RA)。目前世界上报道的RA血清型共有21型,且血清型有变化和增多的趋势,RA各血清型间无交叉免疫保护作用。许多研究表明:RA的抗原类型为荚膜抗原和菌体抗原,血清型不同,荚膜及菌体表面免疫原蛋白也不相同。苏敬良等通过超速离心法提取了RA其外膜蛋白并研究了其免疫原性,认为44kD的外膜蛋白是其主要抗原。[第一段]

关键词：鸭疫里氏杆菌间接ELISA 单克隆抗体筛选方法 omp 鸭传染性浆膜炎免疫保护作用外膜蛋白

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沙门菌属外膜蛋白(omp)的分子免疫学研究进展

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中国人兽共患病杂志 2003年第4期19卷 106-108,114页

作者：王丽鸳朱成钢张耀洲浙江大学生物化学研究所杭州310029

沙门菌属隶属于肠杆菌科,是当前研究得较为深入的一类革兰氏阴性细菌.1880年由Eberth提出,1884年Gaffky率先培养成功[1].其特性和大肠埃希菌相似,是具有周鞭毛的革兰阴性杆菌.主要可引起人类热肠病、食物中毒和败血症类等疾病.近几年,... 详细信息

沙门菌属隶属于肠杆菌科,是当前研究得较为深入的一类革兰氏阴性细菌.1880年由Eberth提出,1884年Gaffky率先培养成功[1].其特性和大肠埃希菌相似,是具有周鞭毛的革兰阴性杆菌.主要可引起人类热肠病、食物中毒和败血症类等疾病.近几年,随着分子免疫学技术和基因检测手段的发展,对沙门菌属的外膜蛋白(outer membrane protein,以下简称为omp)的研究也趋于热门.

关键词：沙门菌属外膜蛋白 omp 分子免疫学研究进展

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基于压缩感知omp改进算法的图像重构

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电视技术 2015年第6期39卷 8-12,39页

作者：郎利影王勇李思骞河北工程大学信息与电气工程学院河北邯郸056038

正交匹配追踪(omp)算法中迭代次数严格依赖信号的稀疏度K值,迭代次数选取适当会重构出高精确的图像,反之则会对图像重构质量造成严重影响。针对这一问题,提出了一种根据残差值的相对极差来确定最佳迭代次数的新方法。该方法要求在同一... 详细信息

正交匹配追踪(omp)算法中迭代次数严格依赖信号的稀疏度K值,迭代次数选取适当会重构出高精确的图像,反之则会对图像重构质量造成严重影响。针对这一问题,提出了一种根据残差值的相对极差来确定最佳迭代次数的新方法。该方法要求在同一次迭代中对一幅图像的所有列同时进行迭代计算,根据极差的相对差值与门限值比较来确定最佳迭代次数,从而达到提高重构精度,消除对稀疏度K值依赖的目的。理论分析和仿真结果表明,改进的omp算法比原有算法有更理想的重构效果,有更高的重构精度。

关键词：压缩感知正交匹配追踪算法 omp 信号重构

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副猪嗜血杆菌omp P2基因的克隆与表达

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中国兽医学报 2012年第2期32卷 212-215页

作者：李鹏李军星曹珺张国龙李玉峰宋艳华王先炜姜平南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室江苏南京210095 长江大学动物科学学院湖北荆州434025

利用已分离的菌株HB070412,根据NCBI上GenBank中的HPS序列(ZP_02477753)设计了1对引物,用PCR方法扩增了副猪嗜血杆菌外膜蛋白中的穿孔素前体蛋白P2基因(omp P2),并克隆到载体pMD18-T(T-Vec-tor),序列测定结果表明omp P2基因全长1 077bp... 详细信息

利用已分离的菌株HB070412,根据NCBI上GenBank中的HPS序列(ZP_02477753)设计了1对引物,用PCR方法扩增了副猪嗜血杆菌外膜蛋白中的穿孔素前体蛋白P2基因(omp P2),并克隆到载体pMD18-T(T-Vec-tor),序列测定结果表明omp P2基因全长1 077bp,序列同源性分析表明该基因相当保守,与所报道的HPS ompP2基因之间的核苷酸序列同源性为98.1%,氨基酸序列同源性为95.5%。用pGEX-6p-1构建了原核表达载体pGEX-P2,在大肠杆菌中进行了高效表达,表达蛋白约占菌体总蛋白的50%,主要为包涵体形式。SDS-PAGE电泳结果显示表达的融合蛋白约为65 000,Western blot结果表明该表达蛋白具有抗原性。

关键词：副猪嗜血杆菌 omp P2基因克隆原核表达

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