检索结果-南通市图书馆

攀西高原不同轮作制度下土壤固氮微生物nifh基因多样性与群落结构特征

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

微生物学通报 2023年第1期50卷 118-130页

作者：梁锦鹏陈玉蓝王勇罗琳雷善钰杨沁閻陈强辜运富四川农业大学资源学院四川成都611134 四川省烟草公司凉山州公司四川西昌615050

[背景]关于高原生境轮作制度对土壤固氮微生物群落组成及多样性的影响研究尚少。[目的]深入认识攀西高原不同轮作制度对农田土壤肥力及土壤固氮微生物nifh基因群落结构与多样性的影响,以期建立合理的轮作制度。[方法]以凉山州冕宁县不... 详细信息

[背景]关于高原生境轮作制度对土壤固氮微生物群落组成及多样性的影响研究尚少。[目的]深入认识攀西高原不同轮作制度对农田土壤肥力及土壤固氮微生物nifh基因群落结构与多样性的影响,以期建立合理的轮作制度。[方法]以凉山州冕宁县不同作物轮作制度[包括光叶紫花苕-烤烟(分轮作15年和20年两种,分别为G1和G2)、苦荞-烤烟(KQ)、大麦-烤烟(DM)和撂荒(CK)]的土壤为研究对象,通过化学分析和Illumina MiSeq技术,对土壤理化性质、土壤固氮微生物nifh基因多样性及群落组成进行分析。[结果]撂荒土壤全氮、铵态氮、硝态氮、有机碳和含水量最显著(Pnifh基因多样性以G1轮作最高、G2轮作最低,门水平上以变形菌门(Proteobacteria)是优势共有nifh基因类群,相对丰度占群落的63.0%-92.4%;属水平上,偶氮氢单胞菌属(Azohydromonas)是不同轮作制度下的优势物种,慢生根瘤属(Bradyrhizobium)是撂荒土壤中的优势物种。[结论]冗余分析发现,土壤pH和含水量是驱动土壤固氮微生物nifh基因的群落组成的关键因子。本研究表明不同轮作制度可以明显改变土壤肥力状况和固氮微生物nifh基因群落组成,其中以光叶紫花苕-烤烟轮作15年的影响最明显,可以提高土壤养分含量,增加土壤固氮微生物nifh基因多样性。

关键词： nifh基因高通量测序多样性群落结构轮作制度

nifh基因能够在高等植物叶绿体原核环境中表达

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

科学通报 2001年第12期46卷 1026-1030页

作者：张中林钱凯先沈桂芳中国农业科学院生物技术研究所北京100081 浙江大学生物科学与技术系杭州310027

以高等模式植物烟草为材料，对固氮酶铁蛋白基因ｎｉｆＨ在叶绿体中的表达进行了研究．构建了ｎｉｆＨ基因叶绿体转化载体，并利用基因枪轰击法对烟草叶片进行了转化．基因枪轰击后，共获得６株壮观霉素抗性再生植株．ＰＣＲ检测及Ｓｏ... 详细信息

以高等模式植物烟草为材料，对固氮酶铁蛋白基因ｎｉｆＨ在叶绿体中的表达进行了研究．构建了ｎｉｆＨ基因叶绿体转化载体，并利用基因枪轰击法对烟草叶片进行了转化．基因枪轰击后，共获得６株壮观霉素抗性再生植株．ＰＣＲ检测及Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交鉴定结果表明，ａａｄＡ和ｎｉｆＨ等外源基因已整合进入受体植物叶绿体基因组中；　Ｗｅｓｔｅｒｎ免疫沉淀法的测定结果则证明，ｎｉｆＨ基因能够在叶绿体原核环境中表达．

关键词：叶绿体 nifh基因基因表达高等植物原核表达固氮酶铁蛋白基因烟草

亚热带不同林分类型对土壤团聚体中固氮基因丰度的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生态学杂志 2024年

作者：韩风毅邓米林宛颂胥超叶桂萍贺纪正林永新福建师范大学地理科学学院福建三明森林生态系统与全球变化国家野外科学观测研究站湿润亚热带山地生态国家重点实验室培育基地闽江学院地理与海洋学院

随着我国社会发展对林木资源需求的增加，大面积的天然林已转变为次生林或人工林。不同的林分类型对森林生态系统结构和功能产生深刻影响。为了研究森林转换后不同林分类型对固氮基因nifh丰度的影响，我们选取了杉木和马尾松两种人工林... 详细信息

随着我国社会发展对林木资源需求的增加，大面积的天然林已转变为次生林或人工林。不同的林分类型对森林生态系统结构和功能产生深刻影响。为了研究森林转换后不同林分类型对固氮基因nifh丰度的影响，我们选取了杉木和马尾松两种人工林和择伐后形成的米槠次生林进行研究。结果表明，人工林土壤中速效磷(AP)含量和含水量高于次生林，其中，马尾松人工林的AP含量显著高于次生林和杉木人工林。马尾松人工林土壤中的nifh基因丰度为4.26×109copies·g-1，显著高于米槠次生林的2.16×109copies·g-1和杉木人工林的3.07×109copies·g-1。相关性分析表明，土壤nifh基因丰度与AP含量和含水率呈显著正相关。此外，团聚体粒径显著影响nifh基因丰度，三种林分土壤nifh基因丰度均在粉黏颗粒中最低，小团聚体中最高。马尾松人工林不同粒径团聚体的nifh基因丰度整体上高于米槠次生林和杉木人工林。综上，林分类型和团聚体粒径均显著影响亚热带森林土壤nifh基因丰度，AP含量和含水率是关键影响因素。

关键词：菌根林分类型 nifh基因土壤团聚体

稻草还田对水稻土固氮基因(nifh)组成结构和多样性的影响

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

应用生态学报 2013年第8期24卷 2339-2344页

作者：张苗苗刘毅盛荣秦红灵伍延正魏文学中国科学院亚热带农业生态研究所亚热带农业生态过程重点实验室长沙410125 中国科学院桃源农业生态试验站长沙410125 中国科学院大学北京100049

以中国科学院桃源农业生态试验站长期定位施肥试验为平台,选取稻草还田(C)、氮磷钾(NPK)、氮磷钾加稻草还田(NPK+C)和不施肥对照(CK)4个处理,在晚稻的分蘖期、孕穗期和成熟期分别采集土样,利用实时定量PCR(Q-PCR)和末端限制性片段多态性... 详细信息

以中国科学院桃源农业生态试验站长期定位施肥试验为平台,选取稻草还田(C)、氮磷钾(NPK)、氮磷钾加稻草还田(NPK+C)和不施肥对照(CK)4个处理,在晚稻的分蘖期、孕穗期和成熟期分别采集土样,利用实时定量PCR(Q-PCR)和末端限制性片段多态性(T-RFLP)等分子生物学方法研究长期稻草还田对水稻土含nifh基因固氮微生物群落丰度、组成和多样性的影响.结果表明:与对照相比,稻草还田和单施化肥处理均显著增加nifh基因的丰度(分蘖期除外),NPK+C处理中含nifh基因的微生物数量最高;nifh基因组成也受到长期施肥的影响,其中CK处理nifh基因组成与各施肥处理明显不同,C与NPK处理间nifh基因组成存在一定差异,而NPK与NPK+C处理间无显著差异.长期施肥不会引起含nifh基因微生物群落多样性的显著改变.可见,稻草还田不仅引起nifh基因群落的组成发生变化,而且导致其数量显著增加,因而可增加土壤的固氮能力.

关键词：稻草还田 nifh基因基因丰度群落组成多样性

盐度对水稻土壤固氮微生物nifh基因多样性的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

安徽农业科学 2022年第12期50卷 1-4页

作者：廖洁深何杰珩刘广超马驿丁月霞周鸿凯广东海洋大学滨海农业学院广东湛江524088

[目的]研究盐浓度对水稻土壤固氮微生物nifh基因多样性的影响。[方法]在不同盐浓度的土壤区域采集样品,提取土壤总DNA,采用末端限制性片段长度多样性分析技术(T-RFLP)对土壤固氮微生物nifh基因进行多样性分析。[结果]随着水稻土壤盐度上... 详细信息

[目的]研究盐浓度对水稻土壤固氮微生物nifh基因多样性的影响。[方法]在不同盐浓度的土壤区域采集样品,提取土壤总DNA,采用末端限制性片段长度多样性分析技术(T-RFLP)对土壤固氮微生物nifh基因进行多样性分析。[结果]随着水稻土壤盐度上升,土壤有机质、全氮和碱解氮含量也呈现一定程度的上升趋势;水稻土壤nifh基因的分类操作单元(OTU)总数在土壤盐度最高时达最大值,各组优势细菌数量在2.5种左右,样本丰度主要集中在4个片段内,各组相对丰度差异不显著(P>0.05);水稻组土壤与富贵竹土壤相比,多样性和均匀度均差异显著(P0.05)。[结论]土壤盐度影响土壤性质及固氮微生物,微生物多样性呈现一定盐度依赖效应。

关键词：固氮微生物盐度水稻土壤 nifh基因多样性

呼伦贝尔草原土壤固氮微生物nifh基因多样性与群落结构

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生态学杂志 2011年第4期30卷 790-797页

作者：文都日乐李刚杨殿林张静妮易津农业部环境保护科研监测所天津300191 内蒙古农业大学农学院呼和浩特010018

采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术及扩增产物序列分析方法比较研究了呼伦贝尔5种草地类型(线叶菊草原、贝加尔针茅草原、羊草草原、大针茅草原、克氏针茅草原)土壤固氮微生物nifh基因多样性及群落结构特征。结果表明... 详细信息

采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术及扩增产物序列分析方法比较研究了呼伦贝尔5种草地类型(线叶菊草原、贝加尔针茅草原、羊草草原、大针茅草原、克氏针茅草原)土壤固氮微生物nifh基因多样性及群落结构特征。结果表明,不同草地类型间土壤固氮微生物群落组成差异显著,羊草草原和大针茅草原相似性较高,相似度为67%,而其他3个草地类型间相似性较低,相似度均低于60%。羊草草原土壤nifh基因多样性最高,其次是克氏针茅草原、大针茅草原和贝加尔针茅草原,线叶菊草原最低。系统发育分析结果表明,呼伦贝尔草原土壤固氮微生物大部分属于变形菌门的α-变形菌纲,分别隶属于慢生根瘤菌属、中慢生根瘤菌属、红假单胞菌属、固氮螺菌属。5种草地类型中,克氏针茅草原土壤中联合固氮菌和自生固氮菌居多,而其他4个草地类型均以共生固氮菌为优势生态类型。

关键词：呼伦贝尔草原 nifh基因多样性系统发育分析

甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nifh基因的克隆与序列分析(英文)

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

南方农业学报 2014年第10期45卷 1719-1725页

作者：张琨琨牛俊奇魏春燕邢永秀杨丽涛李杨瑞广西大学农学院南宁530005 广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室南宁530005 中国农业科学院甘蔗研究中心/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室南宁530007

【目的】了解甘蔗内生固氮菌变栖克雷伯氏菌（Klebsiella variicola）DX120E nif H基因的生物信息学,为揭示甘蔗内生固氮菌DX120E的固氮分子机理提供理论依据。【方法】根据NCBI上其他固氮菌株的nif H序列设计引物,对内生固氮菌Klebsiel... 详细信息

【目的】了解甘蔗内生固氮菌变栖克雷伯氏菌（Klebsiella variicola）DX120E nif H基因的生物信息学,为揭示甘蔗内生固氮菌DX120E的固氮分子机理提供理论依据。【方法】根据NCBI上其他固氮菌株的nif H序列设计引物,对内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E菌进行PCR扩增;运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列进行分析,并对其蛋白结构进行预测。【结果】甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nif H基因的ORF为882bp,Gen Bank登录号为KF732646.1,与Klebsiella pneumoniae 342、Klebsiella variicola At-22等6种固氮菌的nif H基因氨基酸序列同源性高达95.0%-99.0%。DX120E nifh蛋白与Klebsiella pneumoniae 342的亲缘关系最近,与非克雷伯氏菌固氮菌的亲缘关系较远。生物信息学分析显示,菌株DX120E的nif H基因编码293个氨基酸,起特别重要的氨基酸残基非常保守。该基因在N端有11个氨基酸残基即酪氨酸—甘氨酸—赖氨酸—甘氨酸—甘氨酸—异亮氨酸—甘氨酸—赖氨酸—丝氨酸—苏氨酸—苏氨酸,其属于典型结合ATP的基序结构。nif H蛋白分子量为32.07k D,pI为4.92,为酸性蛋白;其具有2个ASN糖基化位点,1个CAMP磷酸化位点,6个CK2磷酸化位点,6个PKC磷酸化位点。疏水性预测显示该蛋白为亲水性蛋白,无信号肽。【结论】变栖克雷伯氏菌（Klebsiella variicola）DX120E nif H基因的推导氨基酸序列与克雷伯氏菌固氮菌属具有较高的同源性,该基因在甘蔗生物固氮过程中可能起重要作用。

关键词：甘蔗内生固氮菌变栖克雷伯氏菌 nifh基因克隆

3种典型荒漠灌木内生固氮菌及固氮酶基因nifh多样性分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国沙漠 2014年第2期34卷 472-480页

作者：徐正金罗明王卫霞王纯利新疆农业大学农学院新疆乌鲁木齐830052 新疆农业大学林学与园艺学院新疆乌鲁木齐830052 新疆农业大学草业科学与环境学院新疆乌鲁木齐830052

具有特殊生境的内生固氮菌,对改善植物营养、增强植物抗逆性及群落稳定性具有重要作用,是一类潜力巨大、尚待开发的微生物资源。以新疆3种典型荒漠灌木多枝柽柳(Tamarix ramosissima)、黑果枸杞(Lycium ruthenicum)、盐穗木(Halostachys... 详细信息

具有特殊生境的内生固氮菌,对改善植物营养、增强植物抗逆性及群落稳定性具有重要作用,是一类潜力巨大、尚待开发的微生物资源。以新疆3种典型荒漠灌木多枝柽柳(Tamarix ramosissima)、黑果枸杞(Lycium ruthenicum)、盐穗木(Halostachys caspica)为材料,从根和枝条组织中分离筛选获得137个内生固氮菌菌株,采用16SrDNA PCR-RFLP、16SrDNA序列测定、BOXAIR-PCR指纹图谱、nifh PCR-RFLP等方法分析其遗传多样性及系统发育关系。结果表明:分离菌株经16SrDNA PCR-RFLP酶切图谱聚类划分为9个遗传类型。序列测定和系统发育分析显示,代表菌株分属于拉恩氏菌属(Rahnella)、假单胞菌属(Pseudomonas)、泛菌属(Pantoea)、芽孢杆菌属(Bacillus)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)和申氏杆菌属(Shinella),其中Rahnella为优势种群。一个测定菌株的16SrDNA序列同源性低于97%,提示可能为一个潜在的新种。BOXAIR-PCR分析优势种群的基因组结构特征,获得12种指纹图谱类型,显示出该种群具有丰富的基因组多样性。nifh PCR-RFLP分析分离内生固氮菌菌株固氮酶基因nifh的分子多态性,将其划分为3种基因型,体现了nifh具有高度保守性,同时在不同固氮微生物种群和菌株间也存在一定的多样性。研究结果丰富了固氮微生物物种资源库和基因库,对于内生固氮菌资源的保护和利用奠定了科学基础。

关键词：荒漠灌木内生固氮菌遗传多样性 16SrDNA全序列 nifh基因

氮对巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifh基因表达的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

福建农林大学学报（自然科学版） 2020年第1期49卷 103-108页

作者：林标声吕正阳罗茂春何玉琴林占熺龙岩学院生命科学学院福建龙岩364012 福建农林大学生命科学学院福建福州350002 国家菌草工程技术研究中心福建福州350002

采用DNA电泳、qRT-PCR及Western blot技术分析了在无氮和含氮培养条件下,巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02菌株nifh基因序列长度、基因与蛋白表达量的差异.结果表明,GN02菌株在无氮及含氮条件下均有nifh基因表达,其克隆得到的... 详细信息

采用DNA电泳、qRT-PCR及Western blot技术分析了在无氮和含氮培养条件下,巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02菌株nifh基因序列长度、基因与蛋白表达量的差异.结果表明,GN02菌株在无氮及含氮条件下均有nifh基因表达,其克隆得到的nifh基因与同属禾本科的甘蔗的nifh基因亲缘关系较近;无氮培养条件下nifh基因和蛋白表达量明显高于含氮条件下的表达量.表明无氮条件能诱导GN02菌株nifh基因表达量的增加,而氮源抑制nifh基因的表达.

关键词：氮巨菌草内生固氮菌 Klebsiella variicola nifh基因差异表达