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Integrative analysis of transcriptomic and metabolomic profiles reveals new insights into the molecular foundation of fruit quality formation in Citrullus lanatus(Thunb.)Matsum.&Nakai

引用

Food Quality and Safety 2022年第1期6卷 112-123页

作者：楚顺鹏王硕硕张锐敏尹萌萌杨晓玉史庆华 College of Horticulture Science and Engineering Shandong Agricultural UniversityTai'anChina State Key Laboratory of Crop Biology Shandong Agricultural UniversityTai'anChina

In this study,an integrated transcriptome and metabolome analysis was used to explore the molecular foundation of fruit quality in two parent lines of Citrullus lanatus with distinct flesh characteristics,including ‘14-1’(sweet,red,and soft)andW600'(bitter,light yellow,and firm),as well as the corresponding F,population(bitter,light yellow,and firm).Numerous differentially expressed genes(DEGs)were identified in the fruit samples:3766 DEGs for ‘14-1’vs.W600,2767 for ‘14-1’vs.F_(1),and 1178 for F_(1) vs.‘W600’at the transition stage;and 4221 for ‘14-1’vs.W6002447 for ‘14-1’vs.F,and 446 for F,vs.‘W600’at the maturity *** gene co-expression network analysis(WGCNA)revealed that a gene module including 1111 DEGs was closely associated with flesh taste and color,and another gene module including 1575 DEGs contributed significantly to flesh *** metabolomic results showed that there were 447 differential metabolites(DMs)for ‘14-1’vs.‘W600’fruits,394 for ‘14-1’vs.F,and 298 for F,vs.‘W600’at the maturity *** WGNCA and metabolomic results,several DEGs and DMs were further identified as hub players in fruitqualityformation:6DEGs with 4DMs for flesh sweetness;6DEGs with 13DMs forbitterness;9DEGs with 10 DMs for flesh color;and 9 DEGs with 4 DMs for flesh ***,these observations not only expand our knowledge of the molecular basis of fruit quality in watermelon,but also provide potential targets for future watermelon improvement.

关键词： Fruit quality metabolome molecular foundation transcriptome watermelon

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