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mir-206-3p在运动缓解氟暴露小鼠学习记忆障碍中的作用机制研究

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MiR-206-3p在运动缓解氟暴露小鼠学习记忆障碍中的作用机制研究

作者：柴蕾山西农业大学

学位级别：硕士

【目的】本研究从体内体外两个方面探究mir-206-3p在运动缓解氟暴露小鼠学习记忆障碍过程中的作用机制,为氟神经毒性的防治提供理论依据。【方法】本研究共有三个模型。模型一为跑台运动小鼠模型,64只雌雄各半的三周龄ICR小鼠,分为四个... 详细信息

【目的】本研究从体内体外两个方面探究mir-206-3p在运动缓解氟暴露小鼠学习记忆障碍过程中的作用机制,为氟神经毒性的防治提供理论依据。【方法】本研究共有三个模型。模型一为跑台运动小鼠模型,64只雌雄各半的三周龄ICR小鼠,分为四个组:对照组(C,自由饮用蒸馏水),氟组[F,自由饮用100 mg/L氟化钠(Na F)],运动组(E,自由饮用蒸馏水+跑台运动)和运动加氟组(EF,自由饮用100 mg/L Na F+跑台运动)。本课题组之前的研究表明,跑台运动可以缓解氟暴露小鼠的学习记忆障碍,同时对跑台运动小鼠模型的海马组织进行mirNA测序后发现有四个mirNA发生了改变,但其测序结果尚未验证。因此,我们通过q RT-pCR技术验证了这四个mirNA的表达量并筛选了靶基因进行m RNA含量的检测。为了研究在自然状态下是否能得到与跑台运动一致的结果,接下来建立了自由转轮运动小鼠模型。选用80只雌雄各半的三周龄ICR小鼠,分为八组:对照组(C,自由饮用蒸馏水),白天运动组(ME,自由饮用蒸馏水+白天运动),晚上运动组(NE,自由饮用蒸馏水+晚上运动),全天运动组(AE,自由饮用蒸馏水+全天运动),氟组(F,自由饮用100 mg/L Na F),白天运动加氟组(MEF,自由饮用100 mg/L Na F+白天运动),晚上运动加氟组(NEF,自由饮用100 mg/L Na F+晚上运动)和全天运动加氟组(AEF,自由饮用100 mg/L Na F+全天运动),其中C、ME、NE、AE统称为无氟组,F、MEF、NEF和AEF统称为高氟组。六个月后,检测小鼠的学习记忆能力、学习记忆相关基因和上述四个mirNA及其靶基因的表达量并进行相关性分析。综合以上两个模型的试验结果发现,mir-206-3p可能是运动缓解氟神经毒性中的关键靶点,因此建立了过表达mir-206-3p细胞模型,小鼠海马神经元(HT22)细胞系分为五个组:对照组(C),阴性对照组(NC,转染阴性对照),氟组(F,1 mmol/L Na F),mir-206-3p组(mir-206-3p,转染mir-206-3p mimics),mir-206-3p+F组(mir-206-3p+F,转染mir-206-3p mimics+1 mmol/L Na F),48 h后,检测细胞内mir-206-3p及靶基因的表达量。【结果】(1)跑台运动的结果显示:mir-206-3p、mir-96-5p和mir-144-3p的相对表达量与本课题组之前的测序结果基本一致。初步筛选mir-206-3p的靶基因结果显示:与C组相比,F组Jun D、HDAC4、Gng4和Rnf165的含量显著升高(pppCR技术未筛选到mir-96-5p和mir-144-3p与学习记忆相关的靶基因,因此后续试验主要围绕mir-206-3p进行。(2)自由转轮运动行为学试验:测试的第一至七天,参考记忆错误与工作记忆错误均有下降的趋势。第三至七天,与C组相比,F组小鼠参考记忆错误率和工作记忆错误率显著上调(pppp3)自由转轮运动小鼠模型学习记忆相关基因的表达量:与C组相比,F组NMDAR2A、Glu R、SNAp-25、SYT-1、CREB和Synaptophysin m RNA水平显著降低(pp-25、SYT-1和CREB m RNA水平显著升高(ppmirNA及靶基因的表达量:与C组相比,F组mir-206-3p的含量显著降低(ppmir-206-3p含量显著升高(ppmir-206-3p及靶基因与学习记忆间的相关性分析:测试的第六至七天,无氟组和高氟组mir-206-3p的含量与参考记忆错误率和工作记忆错误率呈负相关关系(pp<0.05),第六至七天,Jun

关键词：氟暴露运动 mir-206-3p 学习记忆障碍小鼠

mmu-mir-206-3p通过靶向孤核受体Nurr1影响小鼠ADHD样行为的机制研究

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mmu-miR-206-3p通过靶向孤核受体Nurr1影响小鼠ADHD样行为的机制...

作者：王云苏州大学

学位级别：硕士

注意力缺陷多动障碍(Attention-deficit/hyperactivity disorder,ADHD)又称多动症,是一种常见的由儿童时期发病的神经发育障碍类疾病,其特征是多动、冲动和注意力不集中。目前临床诊断主要依赖行为评估,缺乏有效的分子诊断标记,儿童早... 详细信息

注意力缺陷多动障碍(Attention-deficit/hyperactivity disorder,ADHD)又称多动症,是一种常见的由儿童时期发病的神经发育障碍类疾病,其特征是多动、冲动和注意力不集中。目前临床诊断主要依赖行为评估,缺乏有效的分子诊断标记,儿童早期诊断仍面临很大的困难。阐明ADHD的发病机制对早期精确诊断与靶向治疗具有重要意义。研究发现多巴胺能神经递质系统在ADHD中起到关键的作用,多巴胺的功能异常可能是ADHD发病的重要原因之一。小鼠per1突变体被认为是一个良好的ADHD动物模型。前期研究中,我们从per1敲除小鼠大脑中筛选出一系列差异表达的microRNA,其中mir-206表达量明显增高。预测结果显示mir-206-3p靶向特异性调节多巴胺能神经元发育的关键因子Nurr1(Nuclear receptor related factor 1,Nr4a2)。Nurr1是胚胎发育过程中决定中脑多巴胺能神经元发育和维持的重要转录因子之一,在多巴胺能神经元的产生和存活中发挥重要的作用。有研究发现,Nurr1杂合突变小鼠表现出典型的ADHD表型。近年来,研究发现microRNA作为疾病诊断生物标志物具有很大的潜能,microRNA表达和功能失调与多种神经疾病的发病机制有关,在ADHD中也发现了多种microRNA的差异表达,而目前microRNA如何参与调控ADHD的研究鲜有报导。本研究以小鼠为研究对象,综合利用分子生物学及动物行为学研究方法,旨在探讨mir-206-3p在ADHD中的调控作用,为ADHD早期分子诊断提供理论依据。研究方法:(1)per1敲除小鼠鼠脑microRNA深度测序寻找差异表达的microRNA,确定候选小分子RNA。(2)real-time pCR检测mir-206-3p在小鼠体内的表达谱及节律表达规律;分析mir-206-3p启动子功能,明确mir-206-3p节律调控的作用机制。(3)通过生物信息学数据库(TargetScan和mirDB)预测mir-206-3p的靶基因,分析筛选与神经发育相关的基因。(4)构建 Nurr1 3’UTR 和去除 mir-206-3p 识别位点的 Nurr1 mutant 3’UTR 荧光素酶报告质粒,用双荧光素酶实验验证mir-206-3p与Nurr1的相互作用。(5)在小鼠中脑多巴胺神经元细胞系MN9D中转染mir-206-3p mimics和inhibitor 来过表达和敲降 mir-206-3p,real-time pCR 和 western blot 检测Nurr1的mRNA和蛋白质表达水平。(6)构建腺相关病毒(AAV)对小鼠进行侧脑室注射,过表达或敲降mir-206-3p,用旷场实验、高架十字迷宫、Morris水迷宫及宿主入侵等行为学试验评估自发活动、焦虑水平和学习等认知功能,用ELISA检测小鼠多巴胺的水平,确定mir-206-3p的功能。(7)取小鼠鼠脑进行RNA-seq,real-time pCR检测鼠脑中多巴胺代谢通路、神经元保护以及生物节律相关基因的表达。(8)ADHD临床治疗药物拯救mir-206-3p异常表达小鼠的表型。研究结果:(1)mir-206-3p在小鼠中脑内节律性表达,其表达峰值在ZT8,表达谷值在ZT24,并且mir-206-3p受到核心生物钟的调控。(2)mir-206-3p直接作用于Nurr1,在小鼠中脑多巴胺神经元细胞系MN9D中过表达/敲降mir-206-3p,Nurr1表达量明显降低/增高。(3)过表达mir-206-3p小鼠出现多动、冲动和攻击性强的表型,同时表现出焦虑的症状,血清多巴胺水平显著降低。(4)过表达mir-206-3p小鼠鼠脑中共有8个差异表达的基因定位到生物节律调控,GO分析结果显示多个上调基因所在通路跟神经系统发育及功能有关,数个下调基因所在通路跟酪氨酸代谢过程有关。(5)过表达mir-206-3p不影响多巴胺的合成,但是催化多巴胺代谢的酶Dbh和Mao表达量显著增加,并且多巴胺受体Drd2、Drd4表达显著降低。(6)ADHD临床治疗药物利他林以及Nurr1的激动剂5-氯吲哚均可以拯救过表达mir-206-3p小鼠的多动表型。(7)敲降mir-206-3p小鼠的活动量和焦虑水平与对照小鼠相比没有显著差异。结论:mir-206-3p受到核心生物钟的调控,通过负向调控Nurr1上调Mao和Dbh的表达,引起多巴胺含量下降,导致小鼠出现部分ADHD表型。mir-206-3p在ADHD中的调控作用对于ADHD早期临床诊断具有重要的理论和应用价值。

关键词：注意力缺陷多动障碍多巴胺 Nurr1 mir-206-3p 生物节律

脊髓背角mir-206-3p在游泳运动改善神经病理性疼痛中的作用

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脊髓背角miR-206-3p在游泳运动改善神经病理性疼痛中的作用

作者：陈雨梦上海体育学院

学位级别：硕士

研究目的:神经病理性疼痛(neuropathic pain,Np)是一种慢性疼痛,患病率逐年增高,目前仍缺乏有效的治疗措施。运动作为一种无副作用、成本低且有效的治疗方式,逐渐被推荐用于Np的管理中。然而,其治疗机制尚未被阐明。微小RNA(microRNA,mi... 详细信息

研究目的:神经病理性疼痛(neuropathic pain,Np)是一种慢性疼痛,患病率逐年增高,目前仍缺乏有效的治疗措施。运动作为一种无副作用、成本低且有效的治疗方式,逐渐被推荐用于Np的管理中。然而,其治疗机制尚未被阐明。微小RNA(microRNA,mirNA)有望成为调控Np的潜在靶点。基于此,本研究目的:1.检测Np状态下脊髓背角(spinal dorsal horn,SDH)中mirNA表达的变化,筛选运动改善Np的潜在靶点;2.阐明游泳运动对Np模型小鼠疼痛行为及SDH中mir-206-3p及其靶基因脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor,BDNF)表达的影响。研究方法:本研究共包括两个部分,研究一中,将9只雄性成年Sprague-Dawley大鼠按每组3只随机分为假手术组(sham组)、Np模型组(Np组)和Np模型+游泳组(Np+swim组)。对Np组和Np+swim组大鼠进行坐骨神经慢性压迫性损伤(chronic constriction injury,CCI)造模,Np+swim组大鼠在造模后进行游泳运动干预,其余组常规饲养。干预结束后,取造模侧L4-L6脊髓背角,提取RNA并进行RNA测序,分析Np与sham组、Np+swim与Np组之间差异表达的mirNA,以及两个比较组共同差异表达的mirNA。随后,构建坐骨神经分支选择性损伤(spared nerve injury,SNI)小鼠模型,使用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time pCR,qRT-pCR)对共同差异表达mirNA进行验证。研究二中,将75只雄性成年C57BL/6小鼠按每组15只随机分为正常组(naive组)、假手术组(sham组)、假手术+游泳组(sham+swim组)、SNI组和SNI+游泳组(SNI+swim组)。sham+swim组和SNI+swim组在手术造模后进行6周游泳运动,其余组常规饲养。疼痛行为学检测于术前、术后3、7、14、21、28、35、42d进行,包括各组小鼠足底机械性刺激缩足阈值(mechanical withdrawal threshold,MWT)和反应频率(response frequency,RF)。术后第42d,取各组小鼠造模侧坐骨神经和L4-L6 SDH。HE染色观察造模侧坐骨神经和SDH形态学改变,免疫荧光染色观察SDH中BDNF的定位及表达。使用qRT-pCR检测SDH中mir-206-3p和BDNF mRNA的表达,使用蛋白免疫印迹检测SDH中BDNF蛋白表达。研究结果:研究一中,RNA测序结果显示,Np组相比sham组,存在15个差异表达的mirNAs,其中11个上调,4个下调(pp+swim组相比Np组,存在25个差异表达mirNAs,其中19个上调,6个下调(pmirNA维恩图结果显示,在Np vs sham和Np+swim vs Np两个比较组中,mir-206-3p是唯一共同差异表达的mirNA。经qRT-pCR验证,与sham组相比,mir-206-3p在Np组中表达上调(p=0.005);与Np组相比,mir-206-3p在Np+swim组中表达下调(p=0.008)。研究二中,疼痛行为学结果显示,SNI组小鼠术后MWT显著降低(术后3d:p=0.001;术后7、14、21、28、35和42d:ppppp35d开始,患侧MWT与健侧无显著差异(p>0.05)。HE染色结果显示,SNI组坐骨神经纤维间隙增大,存在炎性细胞浸润和施旺细胞增殖,脊髓背角神经元受损,周围组织松散。与SNI组相比,SNI+swim组坐骨神经和SDH整体形态均有所改善。免疫荧光染色结果显示,SDH中BDNF与神经元胞体存在共定位,SNI组BDNF荧光强度降低,SNI+swim组BDNF荧光强度较SNI组有所增强。SNI组SDH中mir-206-3p表达显著升高(ppp=0.007)表达显著降低;游泳运动干预后,mir-206-3p表达显著降低(p=0.012),BDNF mRNA(p=0.036)和蛋白(p=0.03)表达显著升高,mir-206-3p和BDNF mRNA之间呈显著负相关(r=-0.833,p=0.003)。研究结论:神经病理性疼痛可以引起脊髓背角中mir-206-3p表达显著升高,BDNF表达显著降低。游泳运动可以显著

关键词：神经病理性疼痛脊髓游泳运动 mir-206-3p 脑源性神经营养因子

mir-206-3p靶向调控S100A9对缺氧/复氧诱导的心肌细胞损伤的影响

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中西医结合心脑血管病杂志 2021年第23期19卷 4066-4071,4076页

作者：单会艳俞艳华赵瑞彪枣庄矿业集团枣庄医院山东枣庄277100 枣庄矿务局医院山东枣庄277100

目的探讨mir-206-3p对缺氧/复氧(H/R)诱导的心肌细胞损伤的影响及分子机制。方法实验设置正常对照(Con)组、H/R组、H/R+mir-NC组、H/R+mir-206-3p组、H/R+si-NC组、H/R+si-S100A9组、H/R+mir-206-3p+pcDNA组、H/R+mir-206-3p+pcDNA-S100A9组。实时荧光定量pCR(RT-qpCR)检测mir-206-3p和S100A9 mRNA的表达水平;蛋白免疫印迹(Western Blot)法检测S100钙结合蛋白A9(S100A9)、B细胞淋巴瘤/白血病-2(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)蛋白表达;采用超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-px)和丙二醛(MDA)试剂盒分别检测细胞SOD、GSH-px活性和MDA含量;流式细胞术检测细胞凋亡;荧光素酶报告实验检测mir-206-3p对S100A9的靶向调控。结果H/R诱导的心肌细胞中mir-206-3p低表达,S100A9高表达,MDA含量明显升高,SOD、GSH-px活性明显降低,细胞凋亡率明显升高,Bcl-2蛋白表达水平明显降低,Bax蛋白表达水平明显升高,差异均有统计学意义(pmir-206-3p或抑制S100A9表达,MDA含量明显降低,SOD、GSH-px活性明显升高,细胞凋亡率明显降低,Bcl-2蛋白表达水平明显升高,Bax蛋白表达水平明显降低,差异均有统计学意义(pmir-206-3p靶向调控S100A9的表达;上调S100A9表达逆转了mir-206-3p过表达对H/R诱导的心肌细胞损伤的保护作用。结论过表达mir-206-3p通过靶向下调S100A9抑制H/R诱导的心肌细胞凋亡和氧化应激,mir-206-3p对H/R诱导的心肌细胞损伤具有保护作用。

关键词：心肌细胞损伤缺氧/复氧细胞凋亡 mir-206-3p S1钙结合蛋白A9,S100A9 实验研究

mir-206-3p调控RAW264.7细胞向破骨细胞分化的体外研究

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口腔生物医学 2021年第2期12卷 87-90页

作者：吴青蘅王徐雯朱昕妍山轶凡周宣顾嘉雯郭舒瑜南京医科大学附属口腔医院口腔正畸科江苏省口腔疾病研究重点实验室江苏省口腔转化医学工程研究中心江苏南京210029

目的:探究mir-206-3p对破骨细胞生成的影响。方法:RAW264.7细胞体外诱导破骨分化,过表达或抑制其mir-206-3p,实时定量RT-pCR检测mir-206-3p表达水平。通过纤维状肌动蛋白染色、抗酒石酸酸性磷酸酶染色观察破骨细胞形成,实时定量RT-pCR及... 详细信息

目的:探究mir-206-3p对破骨细胞生成的影响。方法:RAW264.7细胞体外诱导破骨分化,过表达或抑制其mir-206-3p,实时定量RT-pCR检测mir-206-3p表达水平。通过纤维状肌动蛋白染色、抗酒石酸酸性磷酸酶染色观察破骨细胞形成,实时定量RT-pCR及Western Blot检测破骨细胞分化相关基因——活化T细胞核因子1(NFATc1)的表达。结果:过表达mir-206-3p后,破骨细胞生成受到抑制,NFATc1表达水平降低,而敲减mir-206-3p后可促进破骨细胞的生成,NFATc1表达显著上调(pmir-206-3p通过影响NFATc1的表达,调控RAW264.7细胞向破骨细胞分化。

关键词： mir-206-3p 活化T细胞核因子1 破骨细胞分化

mir-206-3p在缺氧复氧诱导的心肌细胞损伤中的作用及机制的研究

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解剖科学进展 2022年第5期28卷 543-546,550页

作者：陈悦李青吕文君张毅黄海东武警辽宁总队医院内一科辽宁沈阳110034 武警辽宁总队医院药剂科辽宁沈阳110034 武警辽宁总队医院卫生防疫科辽宁沈阳110034 中国医科大学附属盛京医院老年病科辽宁汰阳110004 武警辽宁省总队医院特色专业二科辽宁沈阳110034

目的探究mir-206-3p在缺氧/复氧(H/R)诱导的大鼠H9c2心肌细胞损伤中的作用及机制。方法体外培养H9c2细胞,建立H/R损伤心肌细胞模型,将细胞分为对照组(Control),H/R模型组,H/R+mirNA阴性对照组(H/R+mir-NC),H/R+mir-206-3p模拟物组(H/R+mir-206-3p mimics),H/R+mir-206-3p模拟物组+pcDNA阴性对照组(H/R+mir-206-3p mimics+pcDNA3.1)和H/R+mir-206-3p模拟物组+pDCD4过表达组(H/R+mir-206-3p mimics+pcDNA3.1-pDCD4),实时荧光定量pCR检测各组细胞中mir-206-3p和pDCD4的相对表达水平,Western blot检测各组细胞中pDCD4蛋白表达,Targetscan和双荧光素酶实验分析pDCD4与mir-206-3p的靶向关系,MTT法检测各组细胞活性,流式细胞术检测各组细胞凋亡。结果与对照组相比,H/R组mir-206-3p表达降低,pDCD4表达升高(pmir-NC组相比,mir-206-3p模拟物组中mir-206-3p表达升高,pDCD4表达降低(ppDCD4为mir-206-3p的靶基因。相比mir-NC组,mir-206-3p模拟物组细胞活力升高,凋亡率下降;相比mir-206-3p mimics+pcDNA3.1组,pDCD4过表达组细胞活力下降,凋亡率升高。结论过表达mir-206-3p可以靶向负调控pDCD4在缺氧复氧诱导的心肌细胞损伤中发挥保护作用。

关键词： mir-206-3p 缺氧复氧 H9c2细胞程序性细胞死亡因子4

“痛泻要方”抑木组分调控肠道mirNA-206-3p缓解腹泻型肠易激综合征内脏高敏的实验研究

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“痛泻要方”抑木组分调控肠道MiRNA-206-3p缓解腹泻型肠易激综合...

作者：肖瑾成都中医药大学

学位级别：硕士

目的:建立腹泻型肠易激综合征(IBS-D)大鼠模型,对比观察痛泻要方拆方对IBS-D大鼠内脏敏感性、mir-206-3p、脑源性神经营养因子mRNA(BDNFmRNA)、脑源性神经营养因子(BDNF)蛋白表达的影响,探究痛泻要方抑木组分是否通过mirNA-206-3p、BDNF... 详细信息

目的:建立腹泻型肠易激综合征(IBS-D)大鼠模型,对比观察痛泻要方拆方对IBS-D大鼠内脏敏感性、mir-206-3p、脑源性神经营养因子mRNA(BDNFmRNA)、脑源性神经营养因子(BDNF)蛋白表达的影响,探究痛泻要方抑木组分是否通过mirNA-206-3p、BDNFmRNA、BDNF蛋白路径的方式调节IBS-D内脏高敏感,缓解大鼠的症状,进一步完善IBS-D的发病机制研究。方法:将45只成年雄性Wistar大鼠,采用随机抽样法分为空白组,模型组,抑木组(白芍防风组),白芍组,防风组,每组9只。除空白组外,其余大鼠均使用结直肠扩张联合慢性束缚应激连续刺激14天,构建IBS-D内脏高敏感模型,通过观察模型大鼠一般情况、AWR评分以及病理学观察判断模型是否成功,剔除造模失败大鼠。造模结束后使用中药浸膏治疗14天,空白组和模型组仅用蒸馏水灌胃,抑木组予以0.27g/ml的白芍防风浸膏灌胃,白芍组予以0.18g/ml的白芍浸膏灌胃,防风组予以0.09g/ml的防风浸膏灌胃。实验期间观察大鼠一般情况,大便性状,测量体重变化。治疗结束,处死大鼠后取末端结肠组织。首先使用基因测序初步测出各组间的差异mirNA,再使用mirBase、Target Scan网站对各组间的差异mirNA进行分析,获取每个mirNA交叉的基因,最后使用David网站进行GO和KEGG分析获得下游通路,通过以上网站对每个差异mirNA进行筛选,最终获得本实验所需的目标mirNA。使用荧光定量pCR方法测定mir206-3p、BDNFmRNA的表达量;使用酶联免疫吸附法测定BDNF蛋白的表达量。结果:1、一般情况:经药物治疗后的大鼠精神状态、活动量、皮毛色泽好转、食量增加,大便基本成形。2、大鼠体重:药物治疗前,各组大鼠体重增长均小于空白组(pp防风组>白芍组,各组间白防组较白芍组明显(pppppp>0.05)。4.结肠病理:各组大鼠肠组织未见溃疡、炎细胞浸润,形态完整连续。5.高通量测序:经高通量测序后共获得28条差异mirNA,选取mir-206-3p作为研究重点。6.大鼠结肠mir-206-3p相对表达量:与模型组相比,空白组及三个治疗组中mir-206-3p的相对表达量均升高(p>0.05),三个治疗组间抑木组>防风组>白芍组,各组间差异不明显(p>0.05)。7.大鼠结肠BDNFmRNA相对表达量:与模型组相比,余四组大鼠结肠BDNFmRNA相对表达量均降低(p>0.05),治疗组间抑木组p>0.05)。8.大鼠BDNF蛋白表达量:与模型组相比,四组大鼠结肠BDNF蛋白表达量均降低(p>0.05),治疗组间抑木组p>0.05)。结论:1.采用结直肠扩张+慢性束缚应激造模法可导致大鼠超敏反应,腹泻增多,且大鼠肠道无器质性病变,可成功构建IBS-D模型大鼠。2.痛泻要方抑木组及拆分组可能通过上调mir-206-3p表达量,下调BDNFmRNA及BDNF蛋白方式改善IBS-D大鼠的肠道超敏反应,对IBS-D发挥治疗作用。3.大鼠结肠内mir-206-3p可下调BDNFmRNA及BDNF的表达量,为负调节作用。4.拆分组中,防风组在改善大鼠内脏高敏、腹痛腹泻方面优于白芍组。

关键词： IBS-D 痛泻要方痛泻要方拆方 mir-206-3p BDNF

基于基因表达数据库(GEO)的大鼠中暑神经损伤mRNA表达差异分析

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职业卫生与应急救援 2023年第5期41卷 623-630页

作者：王蕾姜岱山朱保锋贾寒雨沈君华张毅南通大学第二附属医院急诊中心江苏南通226001 南通大学附属医院急诊中心江苏南通226001 南通大学第二附属医院科教科江苏南通226001

目的基于基因表达数据库(GEO)分析大鼠中暑神经损伤的基因表达差异,探讨lncRNA-mirNA-mRNA共表达调控网络(ceRNA网络)参与中暑神经损伤的作用。方法通过GEO数据库检索中暑相关数据集GSE64778获得差异表达基因(differential expression g... 详细信息

目的基于基因表达数据库(GEO)分析大鼠中暑神经损伤的基因表达差异,探讨lncRNA-mirNA-mRNA共表达调控网络(ceRNA网络)参与中暑神经损伤的作用。方法通过GEO数据库检索中暑相关数据集GSE64778获得差异表达基因(differential expression genes,DEGs),结合GeneCards和CTD数据库检索中暑相关靶基因,取交集筛选获得候选靶基因。采用R语言对中暑相关候选靶基因进行GO和KEGG富集分析;进一步STRING数据库构建靶基因的交互作用网络图,并对关键基因进行相关性分析获得核心基因。通过RNAInter、mirWalk及RAID2数据库对候选靶基因的上游mirNA进行预测,再利用mirDB数据库预测与lncRNA靶向结合的mirNA,筛选并构建lncRNA-mirNA-mRNA共表达调控通路。结果GSE64778数据集的SRA数据筛选,共获得1178个DEGs,其中322个上调,856个下调。GeneCards数据库筛选到2914个基因,CTD数据库筛选到2377个基因。将GSE64778数据集差异表达排名前300的基因,与GeneCards和CTD数据库检索结果取交集,最终筛出25个候选DEGs。GO功能注释结果表明靶基因主要参与细胞凋亡、应激反应以及细胞过程的负调控,在蛋白质二聚化和蛋白结合等过程中发挥功能。KEGG富集分析提示候选靶基因主要富集在pI3K-Akt信号通路。蛋白-蛋白交互作用(ppI)网络分析Hsp90aa1是degree值最高的枢纽基因,且在pI3K-Akt信号通路中富集。对Hsp90aa1基因的上游mirNA以及候选lncRNA的靶mirNA进行预测,锁定3个lncRNAs、8个mirNAs和1个mRNA,DIANA TOOLS数据库通路富集和相关性分析得到LOC102547734与mir-206-3p、mir-206-3p与Hsp90aa1存在靶向结合位点。结论基于生物信息学分析,中暑神经损伤与细胞凋亡、应激反应以及细胞过程的负调控相关;LOC102547734-mir-206-3p-Hsp90aa1调控网络可能抑制中暑神经损伤的发生。

关键词：中暑神经损伤基因表达 ceRNA网络 Hsp90aa1 pI3K-Akt信号通路 mir-206-3p LOC102547734