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Overexpression of mir-196b and HOXA10 characterize a poor-prognosis gastric cancer subtype

World Journal of Gastroenterology 2013年第41期19卷 7078-7088页

作者： Jae Yun Lim Sun Och Yoon So-Young Seol Soon Won Hong Jong Won Kim Seung Ho Choi Ju-Seog Lee Jae Yong Cho Department of Medical Oncology Gangnam Severance Cancer HospitalYonsei University College of MedicineSeoul 135-720South Korea Department of Systems biology Division of Cancer MedicineUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterHoustonTX 77030United States Department of Pathology Gangnam Severance Cancer HospitalYonsei University College of Medicine 135-720SeoulSouth Korea Department of Surgery Gangnam Severance Cancer HospitalYonsei University College of MedicineSeoul 135-720South Korea

AIM:To identify molecular biologic differences between two gastric adenocarcinoma subgroups presenting different prognoses through the analysis of microRNA and protein ***:Array technologies were used to generate1146 microRNAs and 124 proteins expression profiles of samples from 60 patients with gastric *** the integrative analysis,we used established mRNA expression data published in our previous *** mRNA expression levels were acquired from microarray data for 60 identical gastric cancer *** gastric adenocarcinoma subgroups with distinct mRNA expression profiles presented distinctly different *** and protein expression patterns were compared between gastric cancer tissue and normal gastric tissue and between two different prognostic *** expressed microRNA,associated mRNA,and protein in patients with poor-prognosis gastric cancer were validated by quantitative reverse transcription polymerase chain reaction and immunochemistry in independent ***:We obtained the expression data of 1146microRNAs and 124 cancer-related *** microRNAs were aberrantly expressed in the two prognostic groups and in cancer vs non-cancer tissues(Pmir-196b,mir-135b,and mir-93 were up-regulated and mir-29c*was ***-196b expression positively correlated with Homeobox A10(HOXA10)expression(r=0.726,Pb1(P=0.017)were clearly overexpressed in the poor-prognosis ***:Co-activation of mir-196b and HOXA10characterized a poor-prognosis subgroup of patients with gastric *** of the biologic function of mir-196b and HOXA10 is warranted.

关键词： Gastric cancer Gene expression Microarray MicroRNA mir-196b Homeobox A10

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mir-196b调控PI3K/Akt通路对宫颈癌细胞顺铂耐药的影响研究

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中国免疫学杂志 2021年第23期37卷 2865-2870页

作者：张玉清邢惠海刘立秋王敬徐书方(指导) 石家庄医学高等专科学校石家庄050599 石家庄人民医学高等专科学校石家庄050000 河北省卫健委综合监督执法局石家庄050071 河北大学附属医院保定071000

目的:探讨mir-196b对宫颈癌细胞顺铂耐药性及磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/蛋白激酶b(Akt)通路的影响。方法:体外培养人宫颈癌细胞株HeLa、顺铂耐药细胞株HeLa/DDP,检测HeLa、HeLa/DDP对顺铂的耐药性;将HeLa/DDP细胞分为:空白对照(仅用转染... 详细信息

目的:探讨mir-196b对宫颈癌细胞顺铂耐药性及磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/蛋白激酶b(Akt)通路的影响。方法:体外培养人宫颈癌细胞株HeLa、顺铂耐药细胞株HeLa/DDP,检测HeLa、HeLa/DDP对顺铂的耐药性;将HeLa/DDP细胞分为:空白对照(仅用转染试剂处理)+DDP组、阴性对照(转染mir-196b NC)+DDP组、mir-196b inhibitor(转染mir-196b inhibitor)+DDP组,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测各组细胞mir-196b水平,蛋白印迹(Wb)法检测Akt、磷酸化蛋白激酶b(p-Akt)、PI3K、磷酸化雷帕霉素靶蛋白(p-mTOR)的表达,采用噻唑蓝(MTT)法检测各组细胞的IC_(50),流式细胞仪检测各组细胞凋亡情况。结果:与HeLa细胞相比,HeLa/DDP细胞mir-196b表达显著升高(Pmir-196b inhibitor+DDP组HeLa/DDP细胞中mir-196b表达水平,Akt、p-Akt、PI3K、p-mTOR蛋白水平及顺铂IC_(50)显著下降(Pmir-196b表达可能通过下调PI3K/Akt通路相关蛋白表达,降低宫颈癌细胞对顺铂的耐药性。

关键词： mir-196b 宫颈癌细胞耐药性顺铂机制

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LncRNA XIST负调控mir-196b对急性髓系白血病细胞KG1a生物行为的影响

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中国实验血液学杂志 2022年第5期30卷 1318-1323页

作者：王筝马杏凡万春超张岚王静波航天中心医院血液科北京100049 北京大学首钢医院科研处北京100144

目的:探讨lncRNA X染色体失活特异性转录因子(XIST)对急性髓系白血病细胞KG1a增殖和凋亡的影响及其相关作用机制。方法:收集北京航天中心医院2017年1月至2019年5月收治的41例急性髓系白血病患者,以及20例符合缺铁性贫血国际标准的患者... 详细信息

目的:探讨lncRNA X染色体失活特异性转录因子(XIST)对急性髓系白血病细胞KG1a增殖和凋亡的影响及其相关作用机制。方法:收集北京航天中心医院2017年1月至2019年5月收治的41例急性髓系白血病患者,以及20例符合缺铁性贫血国际标准的患者作为对照组。将KG1a细胞分为pcDNA、pcDNA-XIST、pcDNA-XIST+mir-NC和pcDNA-XIST+mir-196b共4组。实时荧光定量PCR检测XIST和mir-196b表达水平,CCK-8检测细胞活性,流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡,Western blot法检测cleaved-caspase3、pro-caspase3、bax、bcl-2蛋白表达,双荧光素酶报告实验检测XIST和mir-196b的靶向关系。结果:急性髓系白血病组患者骨髓细胞中lncRNA XIST表达水平明显低于缺铁性贫血组(Pbax的表达水平较pcDNA组均明显升高(均Pmir-196b表达水平、细胞活性、S期细胞比例、pro-caspase3和bcl-2表达水平均明显降低(均Pmir-196b组细胞活性、S期细胞所占比例、pro-caspase3和bcl-2表达水平较pcDNA-XIST组均明显升高(均Pbax表达水平均明显降低(均Pmir-196b表达抑制急性髓系白血病细胞KG1a增殖,促进细胞凋亡。

关键词： lncRNA XIST mir-196b 急性髓系白血病增殖凋亡

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mir-196b慢病毒表达载体的构建和功能鉴定

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基础医学与临床 2014年第5期34卷 674-678页

作者：刘玥帅春尹虹宋艳斌马文丽南方医科大学基因工程研究所广东广州510515 广东省妇幼保健院新生儿科越秀院区广东广州510000

目的构建携带mir-196b的慢病毒表达载体,为研究mir-196b在慢性粒细胞白血病中的功能及其对慢粒发生发展的作用奠定基础。方法以人骨髓细胞基因组DNA为模板,PCR法扩增mir-196b的前体序列,慢病毒表达载体plVTHM构建重组载体plVTHM-mir-19... 详细信息

目的构建携带mir-196b的慢病毒表达载体,为研究mir-196b在慢性粒细胞白血病中的功能及其对慢粒发生发展的作用奠定基础。方法以人骨髓细胞基因组DNA为模板,PCR法扩增mir-196b的前体序列,慢病毒表达载体plVTHM构建重组载体plVTHM-mir-196b,并包装病毒和进行滴度测定。用病毒液感染K562细胞,通过荧光观察转染效率和报告基因表达效率,用流式细胞仪分选感染后绿色荧光蛋白阳性的K562细胞,再用实时荧光定量PCR测定细胞内mir-196b的表达水平。最后用CCK-8法检测各组细胞的增殖情况。结果成功构建了plVTHM-mir-196b慢病毒表达载体;载体中绿色荧光蛋白有较好的表达活性;与对照组细胞相比,试验组mir-196b表达水平有显著提升(Pmir-196b后增殖水平显著下降(Pmir-196b过表达载体,并在K562细胞内稳定高表达,mir-196b有抑制K562细胞增殖的作用。

关键词： mir-196b 慢病毒表达载体载体构建

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mir-196b和Hoxb8mRNA在结直肠癌组织中的表达及其临床意义

miR-196b和HoxB8mRNA在结直肠癌组织中的表达及其临床意义

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作者：兰鸿波福建医科大学

学位级别：硕士

目的：研究mir-196b和Hoxb8在结直肠癌组织中的表达及其与临床病理特征的关系，并探讨在结直肠癌组织中mir-196b与靶基因Hoxb8表达的关系。方法：用qRT-PCR技术检测30例结直肠癌组织及正常粘膜组织中mir-196b和Hoxb8mRNA的表达量;Wb检... 详细信息

目的：研究mir-196b和Hoxb8在结直肠癌组织中的表达及其与临床病理特征的关系，并探讨在结直肠癌组织中mir-196b与靶基因Hoxb8表达的关系。方法：用qRT-PCR技术检测30例结直肠癌组织及正常粘膜组织中mir-196b和Hoxb8mRNA的表达量;Wb检测Hoxb8蛋白的表达。结果：mir-196b和Hoxb8mRNA在结直肠癌组织中的表达均较正常粘膜组织升高（Pmir-196b的表达与结直肠癌的淋巴结转移、肿瘤分期（I+II、III+IV）及远处转移有关（P0.05）;Hoxb8mRNA的表达与结直肠癌的淋巴结转移、肿瘤分期（I+II、III+IV）、远处转移、大体类型、浸润深度、组织分化程度、肿瘤大小、肿瘤部位、患者的年龄及性别均无关（P>0.05）。Hoxb8蛋白在结直肠癌组织中低表达，而在正常粘膜组织中高表达（P＜0.001）。mir-196b和Hoxb8mRNA在结直肠癌组织中的表达存在负相关（r=-0.458，P＜0.05)，而与Hoxb8蛋白的表达无明显相关性（r=-0.236，P＞0.05)。结论：mir-196b、Hoxb8mRNA在结直肠癌组织中均高表达, mir-196b的高表达与结直肠癌的发生、发展及预后有关。mir-196b通过与靶基因Hoxb8mRNA的3′非编码区结合抑制Hoxb8mRNA的表达。

关键词：结直肠癌 mir-196b Hoxb8 qRT-PCR western blot

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红系细胞发育相关mir-196b的靶基因预测及意义

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山东医药 2016年第48期56卷 12-15页

作者：丁谨刘芳胡彩艳施继禹青海大学医学院西宁810010

目的预测红系细胞发育相关mir-196b的靶基因,并探讨其作用机制。方法应用mirbase数据库查找多物种已知的mir-196b成熟序列,比对后分析其在多物种间的保守性。应用miranda、mirDb、Targetscan7.1、PITA和mirWalk数据库对mir-196b的靶基... 详细信息

目的预测红系细胞发育相关mir-196b的靶基因,并探讨其作用机制。方法应用mirbase数据库查找多物种已知的mir-196b成熟序列,比对后分析其在多物种间的保守性。应用miranda、mirDb、Targetscan7.1、PITA和mirWalk数据库对mir-196b的靶基因进行预测,筛选重复率较高的靶基因。应用Cytoscape3.3.0和KEGG对重复率较高的靶基因进行GO分类富集分析和信号通路富集分析。查阅文献,再次筛选与红系细胞发育相关的靶基因,采用Targetscan7.1和RNA22分析其与mir-196b的结合情况。结果 22个物种具有mir-196b成熟序列,序列比对发现mir-196b在多物种间高度保守。靶基因预测结果显示,共得到5 004个mir-196b的靶基因,其中重复率较高的靶基因有302个。GO分类富集分析结果显示,mir-196b靶基因在生物学过程显著富集于发育过程、细胞过程和定位等,在分子功能显著富集于蛋白结合和物质转运等,在细胞组分显著富集于细胞突起和细胞器膜等(P均mir-196b的靶基因,其信号通路富集于Ras信号通路、c AMP信号通路和PI3K-Akt信号通路等(P均mir-196b靶基因有5个,分别为GATA1、Cdkn1b、Pld1、Cdh1和Ntrk2,其中GATA1、Cdkn1b和Cdh1可与mir-196b直接结合。结论红系细胞发育相关mir-196b的靶基因可能为GATA1、Cdkn1b、Pld1、Cdh1和Ntrk2;mir-196b可能通过对上述靶基因的直接或间接作用激活相应信号通路,在红系细胞的发育过程中发挥生物学作用。

关键词：红系细胞 mir-196b 靶基因生物信息学

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斑马鱼mir-196a-1、mir-196b在早期发育中功能的初步探究

斑马鱼miR-196a-1、miR-196b在早期发育中功能的初步探究

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作者：付贵芳湖南师范大学

学位级别：硕士

脊椎动物胚胎发育是一个精准且复杂的过程,其发生受到多种调控因子的协同作用。Micro RNAs(mi RNAs)作为一种长度约为22nt、内源性、非编码的小分子RNA,通过与靶基因m RNA的3′-UTR区域结合从而影响其表达,以此实现对生物体发育、疾病... 详细信息

脊椎动物胚胎发育是一个精准且复杂的过程,其发生受到多种调控因子的协同作用。Micro RNAs(mi RNAs)作为一种长度约为22nt、内源性、非编码的小分子RNA,通过与靶基因m RNA的3′-UTR区域结合从而影响其表达,以此实现对生物体发育、疾病发生、细胞分裂及凋亡等方面的调节。目前,虽有大量mi RNA被发掘,但大多数mi RNA的功能和标靶基因仍然未知,其中关于mi R-196影响脊椎动物胚胎发育的机制也知之甚少。mi R-196a-1和mi R-196b作为mi R-196基因家族的重要成员,二者在物种进化中相当保守。本研究以经典模式动物——斑马鱼为研究对象,通过CRISPR/Cas9基因编辑技术建立mi R-196a-1/mi R-196b双敲除纯合品系,发现mi R-196a-1和mi R-196b单突变和双突变对斑马鱼胚胎整体发育均未产生明显影响。利用单细胞期mimic显微注射技术,过表达mi R-196a-1、mi R-196b均导致斑马鱼胚胎体轴变短、发育迟缓、脊柱弯曲、心包水肿,干细胞、神经元分化标志基因表达下调。这些结果证明了mi R-196a-1和mi R-196b在斑马鱼早期胚胎发育过程中发挥着重要的调控作用。通过生物信息学预测发现mi R-196可以结合Hox A9b、Hox b6b、Hox C6a、Hox C8a m RNA的3′-UTR区域,随后RT-q PCR结果显示,过表达mi R-196a-1使得这四个基因表现出不同程度的下调,推测mi R-196a-1通过靶向这四个Hox家族的基因调控斑马鱼胚胎发育。本研究首次成功构建mi R-196a-1/mi R-196b双敲除纯合斑马鱼品系,为脊椎动物胚胎早期发育的相关研究提供了重要工具。本研究发现过表达mi R-196a-1、mi R-196b严重影响了斑马鱼的前后轴发育,期望通过进一步研究,揭示mi R-196影响体轴发育的机制,为脊柱相关疾病的分析提供科学依据。与此同时,通过筛选得到mi R-196a-1的靶基因,对完善mi R-196的调控网络具有重要意义。

关键词：斑马鱼 mir-196a-1 mir-196b CRISPR/Cas9 胚胎发育

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mir-196b靶向ERG促进肺腺癌的增殖和迁移

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昆明医科大学学报 2023年第10期44卷 83-91页

作者：刘邦卿李剑锋刘晓辉张劲男梁金屏唐山市人民医院胸外二科河北唐山063000 唐山市人民医院头颈外科河北唐山063000

目的探究mir-196b影响肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)进展的机制。方法通过TCGA数据库分析mir-196b在LUAD组织中的表达水平,利用TargetScan预测其下游靶基因并用双荧光素酶实验进行验证,qRT-PCR检测mir-196b和ETS相关基因(ETS-related gene,ERG)在LUAD细胞系中的表达情况,MTT、划痕愈合和Transwell实验分别检测不同处理后LUAD细胞的增殖、迁移和侵袭能力的变化情况。结果mir-196b在LUAD中高表达(P=3.50e-17)并靶向负调控ERG,过表达mir-196b能够促进LUAD细胞的增殖、迁移和侵袭(Pmir-196b/ERG调控轴能够影响LUAD细胞增殖、迁移和侵袭(Pmir-196b靶向ERG促进LUAD进展的分子机制,对开发LUAD新的临床治疗方法具有潜在意义。

关键词： mir-196b ERG 肺腺癌增殖迁移

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mir-196b mRNA和Hoxb8 mRNA在结直肠癌组织中的表达及其临床意义

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中国普外基础与临床杂志 2013年第4期20卷 400-405页

作者：兰鸿波潘杰卢星榕池畔福建医科大学附属协和医院结直肠外科福建福州350001 福建医科大学附属协和医院急诊外科福建福州350001

目的研究mir-196b和Hoxb8在结直肠癌组织中的表达及与其临床病理特征的关系,并探讨在结直肠癌组织中mir-196b与靶基因Hoxb8表达的关系。方法用实时荧光定量PCR技术检测30例结直肠癌组织及对应的正常黏膜组织中mir-196b mRNA和Hoxb8 mRN... 详细信息

目的研究mir-196b和Hoxb8在结直肠癌组织中的表达及与其临床病理特征的关系,并探讨在结直肠癌组织中mir-196b与靶基因Hoxb8表达的关系。方法用实时荧光定量PCR技术检测30例结直肠癌组织及对应的正常黏膜组织中mir-196b mRNA和Hoxb8 mRNA的表达量,用Western blot法检测Hoxb8蛋白的表达。结果 mir-196b mRNA和Hoxb8 mRNA在结直肠癌组织中的表达量均高于其在对应的正常黏膜组织中的表达量(Pmir-196b mRNA的表达与结直肠癌的淋巴结转移、肿瘤分期(Ⅰ+Ⅱ与Ⅲ+Ⅳ)及远处转移均有关(P0.05);Hoxb8mRNA的表达与结直肠癌的上述临床病理特征均无关(P>0.05)。mir-196b mRNA与Hoxb8 mRNA的表达存在负相关(r=-0.458,Pb8蛋白的表达无明显相关性(r=-0.236,P>0.05)。结论 mir-196bmRNA及Hoxb8 mRNA在结直肠癌组织中均呈高表达,mir-196b mRNA的高表达与结直肠癌的发生、发展及预后有关。mir-196b可能通过与靶基因Hoxb8 mRNA的3′非编码区结合抑制Hoxb8 mRNA的表达。

关键词：结直肠癌 mir-196b Hoxb8 实时荧光定量PCR Westernblot

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mir-196b、mir-25在儿童急性髓细胞白血病中的表达及临床意义

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实用临床医药杂志 2014年第24期18卷 11-15页

作者：徐丽华胡绍燕岑建农杨乃超洪丹苏州大学附属儿童医院血液肿瘤科江苏苏州215003 江苏省连云港市第一人民医院儿科江苏连云港222002 苏州大学附属第一医院江苏省血液病研究所血液科江苏苏州215006

目的探讨初诊AML患儿mir-196b、mir-25的表达及其临床意义。方法从骨髓标本库中随机抽取2012-2013年收集的20例初诊AML以及20例非白血病对照标本,利用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测mir-196b、mir-25的相对表达量。结果 mir-196... 详细信息

目的探讨初诊AML患儿mir-196b、mir-25的表达及其临床意义。方法从骨髓标本库中随机抽取2012-2013年收集的20例初诊AML以及20例非白血病对照标本,利用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测mir-196b、mir-25的相对表达量。结果 mir-196b的相对表达量在患者和对照组间有显著差异(Pmir-196b在高危组、中危组和低危组有显著差异(PbCmir-196b表达有显著差异(Pmir-25表达有显著差异(Pmir-196b表达水平具有显著差异(Pmir-196b表达水平增高;而mir-25呈低表达现象,差异有显著统计学意义(Pmir-196b在初诊AML患儿中明显高表达,高表达的mir-196b与不良预后相关;mir-25的表达水平增高提示着良好的早期治疗反应和预后。这些mirNAs有望成为儿童AML早期诊断、治疗及判断预后的独特生物标记物。

关键词： mir-196b mir-25 急性髓细胞白血病儿童

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