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marking RNA:m^6a writers,readers,and functions in Arabidopsis

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Journal of molecular Cell Biology 2019年第10期11卷 899-910页

作者： marlene Reichel Tino Koster Dorothee Staiger RNA Biology and molecular Physiology Faculty of BiologyBielefeld University33615 BielefeldGermany

N^6-methyladenosine(m^6a)emerges as an important modification in eukaryotic mRNAs.m^6a has first been reported in 1974,and its functional significance in mammalian gene regulation and importance for proper development have been well *** arsenal of writer,eraser,and reader proteins accomplish deposition,removal,and interpretation of the m^6a mark,resulting in dynamic *** led to the concept of an epitranscriptome,the compendium of RNA species with chemical modification ofthe nucleobases in the cell,in analogy to the *** m^6a has long been known to also exist in plant mRNAs,proteins involved in m^6a metabolism have only recently been detected by mutant analysis,homology search,and mRNA interactome capture in the reference plant Arabidopsis *** ofthe m^6a modification causes severe developmental abnormalities of leaves and roots and altered timing of reproductive ***,m^6a modification affects viral ***,we discuss recent progress in identifying m^6a sites transcriptome-wide,in identifying the molecular players involved in writing,removing,and reading the mark,and in assigning functions to this RNA modification in *** highlight similarities and differences to m^6a modification in mammals and provide an outlook on important questions that remain to be addressed.

关键词： Arabidopsis m^6a mRNA interactome posttranscriptional RNA-binding protein

RNA m^6a modification and its function in diseases

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Frontiers of medicine 2018年第4期12卷 481-489页

作者： Jiyu Tong Richard A. Flavell Hua-Bing Li Shanghai Institute of Immunology Department of Microbiology and Immunology Shanghai Jiao Tong University School of Medicine (SJTU- SM) Shanghai 200025 China Department of Immunobiology Yale University School of Medicine New Haven CT 06520 USA Howard Hughes medical Institute Chevy Chase MD 20815-6789 USA

N^6-methyladenosine （m^6a） is the most common post-transcriptional RNA modification throughout the transcriptome, affecting fundamental aspects of RNA metabolism, m^6a modification could be installed by m^6a ＂writers＂ composed of core catalytic components （mETTL3/mETTL14/WTAP） and newly defined regulators and removed by m^6a ＂erasers＂（FTO and ALKBH5）. The function of m^6a is executed by m^6a ＂readers＂ that bind to m^6a directly （YTH domain-containing proteins, eIF3 and IGF2BPs） or indirectly （HNRNPA2B1）. In the past few years, advances in m^6a modulators （＂writers,＂＂erasers,＂ and ＂readers＂） have remarkably renewed our understanding of the function and regulation of m^6a in different cells under normal or disease conditions. However, the mechanism and the regulatory network of m^6a are still largely unknown. moreover, investigations of the m^6a physiological roles in human diseases are limited. In this review, we summarize the recent advances in m^6a research and highlight the functional relevance and importance of m^6a modification in in vitro cell lines, in physiological contexts, and in cancers.

关键词： RNA modification m^6a immunity cancer epigenetics

mRNA表观修饰方式及m^6a功能研究进展

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生物工程学报 2019年第5期35卷 775-783页

作者：甘海丽洪岭杨凤莲柳定凤金莉萍郑青亮同济大学附属第一妇婴保健院临床转化研究中心上海201204

mRNA上能发生100多种化学修饰,其中N^6-腺嘌呤(m^6a)是mRNA修饰中最广泛的表观修饰方式之一。在细胞分化、胚胎发育和应激等生物学过程中,特定的mRNA会发生包括N^1-腺嘌呤甲基化、N^5-胞嘧啶甲基化、假尿嘧啶以及N`6-腺嘌呤甲基化等修饰... 详细信息

mRNA上能发生100多种化学修饰,其中N^6-腺嘌呤(m^6a)是mRNA修饰中最广泛的表观修饰方式之一。在细胞分化、胚胎发育和应激等生物学过程中,特定的mRNA会发生包括N^1-腺嘌呤甲基化、N^5-胞嘧啶甲基化、假尿嘧啶以及N`6-腺嘌呤甲基化等修饰,它们共同形成了mRNA转录后调控的表观修饰转录组,实现对mRNA翻译成蛋白质过程的精确时空调控,特别是m^6a修饰能通过调控mRNA的代谢和翻译等进而调控细胞的一系列生物学过程。文中主要综述mRNA的表观修饰类型和特点,特别是m^6a修饰参与调控mRNA和细胞生物学功能的最新研究进展,并展望了将来m^6a表观修饰的研究重点和方向。

关键词： mRNA表观修饰 m^6a m^1A 假尿嘧啶 mRNA代谢细胞分化

RNA m^6a甲基化修饰对生物学功能调控作用的研究进展

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生命科学 2020年第4期32卷 373-377页

作者：姚牧笛马严蒋沁南京医科大学附属眼科医院南京210029

目前发现的RNA表观遗传修饰存在多种方式,如N^6-甲基腺嘌呤(N^6-methyladenosine, m^6a)、N^1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenosine, m^1A)、5-甲基胞嘧啶(5-methylcytidine, m5C)和假尿嘧啶核苷(pseudouridine,PD)等。m^6a是最常见的一种修饰,它是由甲基转移酶和去甲基化酶以及结合蛋白所催化的一种动态可逆的修饰方式,具有重要的调控功能,参与多种细胞进程和疾病的病理过程。最近5年,随着RNA检测技术的发展,m^6a修饰的生物学功能探索已成为RNA领域的前沿热点,该文拟对m^6a甲基化修饰的相关蛋白、生物学功能等方面进行简要概述。

关键词： RNA表观遗传修饰 m^6a m^6a酶系统生物学功能

mETTL3在RNA m^6a甲基化修饰的研究进展

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生理科学进展 2019年第6期50卷 458-463页

作者：黄芳芳周诺广西医科大学附属口腔医院口腔颌面外科广西口腔颌面修复与重建研究重点实验室.颌面外科疾病诊治研究重点实验室广西颅颌面畸形临床医学研究中心

m^6a是RNA分子广泛存在的一种表观遗传修饰,主要影响mRNA剪接、翻译和稳定性以及某些非编码RNA的表观遗传效应等。目前研究表明,m^6a甲基化转移酶mETTL3在肿瘤、大脑发育、调控干细胞命运等起着重要作用。本文结合近期的研究进展对mETTL... 详细信息

m^6a是RNA分子广泛存在的一种表观遗传修饰,主要影响mRNA剪接、翻译和稳定性以及某些非编码RNA的表观遗传效应等。目前研究表明,m^6a甲基化转移酶mETTL3在肿瘤、大脑发育、调控干细胞命运等起着重要作用。本文结合近期的研究进展对mETTL3这一m^6a甲基化转移酶组分进行了综述,旨在为mRNA和非编码RNA上发生m^6a动态修饰代表的新的遗传信息调控方式提供新的研究思路和治疗靶点。

关键词： mETTL3 m^6a 甲基化甲基化转移酶

IBDV感染对法氏囊RNA m^6a和DNA 5mC修饰以及相关催化酶基因表达的影响

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中国兽医学报 2019年第5期39卷 936-942页

作者：张艳红吴庆茹师梦梦王建李光辉袁梦琪朱昱波侯丽敏杜新府郭锋河南科技学院动物科技学院河南新乡453003 叶县畜牧局河南平顶山467200

传染性法氏囊病毒(IBDV)感染造成病鸡法氏囊严重损伤,引起免疫抑制,然其具体机制仍不明晰。本研究旨在探讨IBDV感染对法氏囊表遗传修饰及其相关酶表达的影响。试验采用21日龄商品肉鸡,给予IBDV处理,感染后3,5 d收集法氏囊组织。应用基于... 详细信息

传染性法氏囊病毒(IBDV)感染造成病鸡法氏囊严重损伤,引起免疫抑制,然其具体机制仍不明晰。本研究旨在探讨IBDV感染对法氏囊表遗传修饰及其相关酶表达的影响。试验采用21日龄商品肉鸡,给予IBDV处理,感染后3,5 d收集法氏囊组织。应用基于ELISA试剂盒检测总5mC和m^6a,Real-time PCR检测相关催化酶基因表达。结果显示,感染后5 d,总m^6a水平及其甲基转移酶mETTL3和mETTL14 mRNA表达均显著降低(PmC水平在感染后3 d明显升高(PmRNA表达明显降低(PmT1 mRNA表达显著降低(PmT3a的表达明显升高(PmC和m^6a谱及相关酶的表达,这可能是IBDV影响宿主免疫功能的途径之一。

关键词： IBDV 5mC m^6a 甲基化 DNmT Tet mETTL FTO

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m^6a甲基化在猪中研究进展

湖北农业科学 2019年第S02期58卷 31-35页

作者：乔木吴俊静刘贵生武华玉周佳伟万绪波梅书棋彭先文湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室武汉430064 武汉市江夏区农业产业化服务中心武汉430200

N^6-甲基腺嘌呤(m^6a)修饰是真核生物mRNA中一种高丰度表观转录组学修饰。m^6a广泛存在于生物体中并发挥着重要的生物学功能,其修饰水平受到甲基转移酶和去甲基化酶活性的动态调控。鉴定RNA甲基化修饰酶及研发其转录组水平高通量检测技... 详细信息

N^6-甲基腺嘌呤(m^6a)修饰是真核生物mRNA中一种高丰度表观转录组学修饰。m^6a广泛存在于生物体中并发挥着重要的生物学功能,其修饰水平受到甲基转移酶和去甲基化酶活性的动态调控。鉴定RNA甲基化修饰酶及研发其转录组水平高通量检测技术,是揭示RNA化学修饰调控基因表达和功能规律的基础。随着m^6a修饰检测和测序技术的发展以及单碱基分辨率等新兴技术的兴起,多种m^6a修饰相关的调控蛋白被鉴定,其调控的生物学功能也得到了更深入的解析。主要综述了m^6a修饰的特征、检测技术、生物学功能及在猪中的研究进展,以期对未来研究m^6a在猪的遗传育种方面的调控作用提供重要的理论支持。

关键词： m^6a 特征检测技术生物学功能

m^6a修饰参与调控初级microRNA的加工剪切

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中国肿瘤生物治疗杂志 2015年第3期22卷 330-330页

作者：郑青亮侯晋 Alarcon CR H Lee Goodarzi H 不详

m^6a修饰广泛存在于高等真核生物的RNA上,特别是存在于mRNA的CDS区、3’-UTR区及终止密码子附近区域,其广泛参与了RNA代谢的各种生物学过程,包括RNA剪接、RNA出核、RNA与蛋白相互作用和RNA降解等。microRNA(miRNA)成熟的第一步就是由加... 详细信息

m^6a修饰广泛存在于高等真核生物的RNA上,特别是存在于mRNA的CDS区、3’-UTR区及终止密码子附近区域,其广泛参与了RNA代谢的各种生物学过程,包括RNA剪接、RNA出核、RNA与蛋白相互作用和RNA降解等。microRNA(miRNA)成熟的第一步就是由加工复合体(RNA结合蛋白DGCR8和RNA酶DROSHA)介导的初级miRNA的剪切。该剪切过程首先需要DGCR8识别初级miRNA发夹结构中的单链RNA,从而招募DROSHA酶将双链RNA剪切成前体miRNA。虽然初级miRNA剪切加工的机制已经很明确,

关键词： RNA 终止密码子高等真核生物剪切过程 m^6a 特异性识别转录子结合蛋白发夹结构复合体

m^6a修饰参与调控初级microRNA的加工剪切

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中国肿瘤生物治疗杂志 2015年第5期22卷 618-618页

作者：郑青亮 Alarcón CR Lee H Goodarzi H

m6a修饰是广泛存在于真核高等生物的RNA上,特别是在mRNA上,该修饰主要存在于mRNA的CDS区的3’-UTR区,特别是终止密码子附近区域,其广泛参与了RNA代谢的各种生物学过程,包括RNA剪接、RNA出核、RNA与蛋白相互作用和RNA降解等。miRNA成熟... 详细信息

m6a修饰是广泛存在于真核高等生物的RNA上,特别是在mRNA上,该修饰主要存在于mRNA的CDS区的3’-UTR区,特别是终止密码子附近区域,其广泛参与了RNA代谢的各种生物学过程,包括RNA剪接、RNA出核、RNA与蛋白相互作用和RNA降解等。miRNA成熟的第一步就是由加工复合体(RNA结合蛋白DGCR8和RNA酶DROSHA)介导的初级microRNA的剪切。该剪切过程首先需要DGCR8识别初级miRNA发夹结构中的单链RNA,从而招募DROSHA酶对双链RNA剪切成前体miRNA。

关键词： microRNA m^6a 终止密码子剪切过程高等生物结合蛋白发夹结构复合体体外转录转录子