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中国园艺学会2015年学术年会

作者：张计育黄胜男莫正海郭忠仁王刚宣继萍贾晓东江苏省中国科学院植物研究所

猕猴桃是世界上最受欢迎的果品之一。中国华东地区夏季雨水多,经常发生涝害,而猕猴桃是较不耐涝树种,增强猕猴桃的耐涝性可以促进产业发展。但迄今为止,尚未见猕猴桃涝害处理后转录组信息方面的报道。本研究中提出了猕猴桃在涝害胁迫下... 详细信息

猕猴桃是世界上最受欢迎的果品之一。中国华东地区夏季雨水多,经常发生涝害,而猕猴桃是较不耐涝树种,增强猕猴桃的耐涝性可以促进产业发展。但迄今为止,尚未见猕猴桃涝害处理后转录组信息方面的报道。本研究中提出了猕猴桃在涝害胁迫下的转录组序列资源,为进一步研究猕猴桃涝害胁迫反应的分子机制提供了重要信息。对‘金魁’猕猴桃一年生扦插苗进行淹水处理0 d和5 d,收集根部样品后用液氮速冻后进行转录组测序。利用illumina测序技术生成序列,对其进行基因重组。将重组的Unigenes与公共数据库(nr)进行比较,通过相似性对Unigenes进行功能注释。在两个样本之间进行GO和KEGG富集分析,寻找差异表达基因,并分析基因与。KEGG中酶注释的关系文件以及映射到途径的信息。利用illumina测序技术生成的序列组成了140 187个Unigenes(平均长度为556 bp)。与公共数据库(nr)比对,发现有56 912个Unigene(40.60%)的功能被注释。在两个样本中确定出14 843个差异表达基因。其中,有5 697个差异表达基因(约38.5%)是受涝害诱导表达的,9 146个差异表达基因(约61.5%)下调。差异表达基因数量最多的前3个途径是"核糖体"、"植物激素信号转导"、"淀粉和蔗糖代谢"途径,因此推测这些途径在植物遭受涝害胁迫时具有重要作用。本研究中确定出许多转录因子,如AP2/ERF、WRKY、TGA、MYB、bZIP等,揭示了它们在猕猴桃对涝害胁迫反应中的作用。

关键词：猕猴桃 illumina 涝害转录组

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基于Miseq测序初步分析兴安落叶林外生菌根菌的生态分布

引用

赤峰学院学报（自然科学版） 2018年第2期34卷 23-26页

作者：乌仁陶格斯王娟呼和浩特民族学院环境工程系内蒙古呼和浩特010051

本文以兴安落叶松为研究对象,采用illumina Mi Seq测序平台技术,对兴安落叶松外生菌根菌生态分布进行了初步分析.结果表明,在大兴安岭兴安林区落叶松外生菌根菌,隶属于2个门、4个纲、8个目、8个科.优势菌属主要为棉革菌属Tomentella、... 详细信息

本文以兴安落叶松为研究对象,采用illumina Mi Seq测序平台技术,对兴安落叶松外生菌根菌生态分布进行了初步分析.结果表明,在大兴安岭兴安林区落叶松外生菌根菌,隶属于2个门、4个纲、8个目、8个科.优势菌属主要为棉革菌属Tomentella、丝膜菌属Cortinarius、红菇属Russula、乳菇属Lactarius、乳牛肝菌属Suillus.在每个采样地均出现的外生菌根菌种有乳牛肝菌属2种、红菇属2种、乳菇属1种和拟棉革菌属Pseudotomentella 1种.

关键词：兴安落叶松外生菌根菌生态分布 illumina MiSeq测序

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