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Sequence analysis of rDNA intergenic spacer region (igs) as a tool for phylogenetic studies in Trichoderma spp.

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浙江大学学报(农业与生命科学版) 2004年第4期30卷 460-461页

作者： Mercatelli Elisabetta Pecchia Susanna Ciliegi Sandro Vannacci Giovanni Dipartimento di Coltivazione e Difesa delle Specie Legnose "G. Scaramuzzi" Sez. Patologia Vegetale Università di Pisa Via del Borghetto 80 I-56124 Pisa Italy

Different from ribosomal genes, which contain highly conserved sequences that are detected in all organisms, the intergenic spacer of rDNA (igs) appears to be the most rapidly-evolving spacer region. For this reason we tested this region for phylogenetic studies. This report focuses on the study of igs sequences of isolates belonging to Trichoderma section (T. viride, T. koningii, T. hamatum, T. erinaceus, T. asperellum) and Pachybasium section (T. harzianum, T. crassum, T. fasciculatum, T. oblongisporum, T. virens). Using the primer pair 28STD and CNS1, the Fast Start Taq DNA Polymerase (Roche), and a three temperature PCR protocol, products ranging from ca 1900 to 2400 bp were obtained from all tested isolates. The PCR product of 16 Trichoderma spp. isolates was cloned into a pGEM-TEeasy Vector (Promega) and sequenced. Based on a BLAST search we can conclude that the PCR product represents the whole igs region. Multiple alignments of igs sequences revealed two portions with different homology level. Portion A (ca 1660 bp) is the portion that contains 3’ end of 28S gene and is the more variable, while portion B (ca 830 bp), that contains the 3’ end of igs region and the 5’ end of 18S gene, is the less variable. Comparing all sequences in region A 705 identical pairs occur out of 1704 total nucleotides (41.4%), while in region B identical pairs were 723 out of 832 total nucleotides (86.9%) . Sequence comparison of the two regions at intraspecific level (where it was possible) showed higher variability in region A (0.17%-6.8%) than in region B (0.0%-1.0%) . At interspecific level, performing all possible comparisons, the variability of region A (19.5%-52.7%) and B (0.8%- 16.9%). were significantly higher. Comparing sequences of species belonging to Trichoderma section variability of the two regions appears reduced if compared with that obtained from comparisons of species belonging to Pachybasium section. On the basis of sequence alignment, phylogenetic trees were o

关键词： igs rDNA sequences Trichoderma spp. phylogeny

基于频谱分析的igs精密星历卫星钟差精度分析研究

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武汉大学学报（信息科学版） 2008年第5期33卷 496-499页

作者：黄观文张勤许国昌王利长安大学地测学院西安市710054 德国地球科学研究中心波茨坦14473

采用频谱分析法,对igs精密星历中各卫星的钟差精度进行了分析,发现不同的卫星钟钟差存在精度差异;通过与卫星钟差的标称精度相比较,发现部分igs精密星历钟差还存在量级偏差。

关键词：卫星钟差精密星历频谱分析 igs 误差分析

基于igs台网观测的2001—2008年赤道电离异常的强度和半球不对称特征

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地球物理学报 2019年第9期62卷 3235-3246页

作者：梅雪飞罗伟华蔡红涛朱正平常珊珊武汉大学电子信息学院武汉430072 中南民族大学电子信息工程学院武汉430074 中南民族大学智能无线通信湖北省重点实验室武汉430074

赤道电离异常(Equatorial Ionization Anomaly,EIA)是低纬电离层中的一个重要现象.本文基于igs台网提供的2001-2008年期间的电离层总电子含量(Total Electron Content,TEC)数据,分析了120°E区的EIA强度和磁南北半球不对称性在磁平静时... 详细信息

赤道电离异常(Equatorial Ionization Anomaly,EIA)是低纬电离层中的一个重要现象.本文基于igs台网提供的2001-2008年期间的电离层总电子含量(Total Electron Content,TEC)数据,分析了120°E区的EIA强度和磁南北半球不对称性在磁平静时期的变化特征,包括对地方时、季节和太阳活动的依赖.本文结果表明,(1)EIA强度表现出显著的随地方时和季节的变化特征.EIA强度在0200LT和2000LT附近分别出现一个极值,且2000LT附近的EIA强度更大;EIA强度通常在春/秋季较大,在夏/冬季较小,且冬季要大于夏季.(2)EIA南北半球不对称也表现出随地方时和季节变化特征.EIA半球不对称在0200LT和2000-2200LT附近分别出现一个极值;EIA半球不对称的季节变化特征还依赖于太阳活动,太阳活动高年期间,EIA半球不对称通常在春/秋季更显著;太阳活动低年期间,EIA半球不对称通常在冬季更显著.(3)EIA强度和半球不对称性的逐日变化和月变化表现出对太阳活动存在一定的依赖,但依赖性并不显著.2000LT(0200LT)附近的EIA强度的月变化与太阳活动整体呈正(负)相关,而2200LT(0200LT)附近的EIA半球不对称的月变化与太阳活动整体呈负(负)相关.(4)影响EIA强度变化的主要因素可归于纬圈电场和中性风场;影响EIA半球不对称变化的主要因素可归因为子午中性风场.

关键词：电离层赤道电离异常强度半球不对称 igs

宫城Mw9.0级地震前日本igs站GPS时间序列分析

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西南交通大学学报 2013年第1期48卷 62-68页

作者：李萌黄丁发严丽冯威西南交通大学地球科学与环境工程学院四川成都610031

为探讨日本宫城Mw9.0级地震前igs(国际全球导航卫星服务)站的运动特征,针对日本7个igs站4年(2007—2011)的观测资料,分别采用多项式拟合、小波降噪的方法分析站点水平方向运动的变化,采用小波分析、三角函数建模的方法分析竖向运动的变... 详细信息

为探讨日本宫城Mw9.0级地震前igs(国际全球导航卫星服务)站的运动特征,针对日本7个igs站4年(2007—2011)的观测资料,分别采用多项式拟合、小波降噪的方法分析站点水平方向运动的变化,采用小波分析、三角函数建模的方法分析竖向运动的变化.研究结果表明:宫城地震前6个月,日本境内多个igs站竖向隆起速率加快,北方向运动速率减慢,东方向存在较陡的跳动现象.

关键词：地表运动 igs 宫城地震时间序列

Precise Point Positioning Technique with igs Real-Time Service (RTS) for Maritime Applications

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Positioning 2015年第4期6卷 71-80页

作者： Mohammed El-Diasty Mohamed Elsobeiey Department of Hydrographic Surveying Faculty of Maritime Studies King Abdulaziz University Jeddah Saudi Arabia Engineering Department of Public Works Faculty of Engineering Mansoura University Mansoura Egypt

The maritime navigation accuracy requirements for radionavigation systems such as GPS are specified by the International Maritime Organization (IMO). Maritime navigation usually consists of three major phases identified as Ocean/Coastal/Port approach/Inland waterway, in port navigation and automatic docking with an accuracy requirement that ranges from 10 m to 0.1 m. With the advancement in autonomous GPS positioning techniques such as Precise Point Positioning (PPP) and with the advent of the new igs-Real-Time-Service (RTS), it is necessary to assess the possibility of a wider role of the PPP-based positioning technique in maritime applications. This paper investigates the performance of an autonomous real-time PPP-positioning solution by using the igs- RTS service for maritime applications that require an accurate positioning system. To examine the performance of the real-time igs-RTS PPP-based technique for maritime applications, kinematic data from a dual frequency GPS receiver is investigated. It is shown that the real-time igs-RTS PPP-based GPS positioning technique fulfills IMO requirements for maritime applications with an accuracy requirement ranges from 10 m for Ocean/Coastal/Port approach/Inland waterways navigation to 1.0 m for in port navigation but cannot fulfill the automatic docking application with an accuracy requirement of 0.10 m. To further investigate the real-time PPP-based GPS positioning technique, a comparison is made between the real-time igs-RTS PPP-based positioning technique and the real-time PPP-based positioning by using the predicted part of the igs Ultra-Rapid products and the real-time GPS positioning technique with the Wide Area Differential GPS service (WADGPS). It is shown that the igs-RTS PPP-based positioning technique is superior to the igs-Ultra-Rapid PPP-based and WADGPS-based positioning techniques.

关键词： Real-Time Service RTS Maritime Navigation igs GPS IMO Ultra-Rapid WADGPS

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igs产品在GPS时间比对中的应用

天文学报 2004年第4期45卷 428-436页

作者：高玉平中国科学院国家授时中心西安710600

在利用GPS CV(GPS Common View)技术进行高精度时间比对时,电离层和卫星位置误差对观测到的卫星信号的影响是不容忽视的,需要对它进行精确的估计和改正.讨论igs精密星历和CODE全球总电子含量图(TEC MAPs)在GPS时间传递中的应用.计算结... 详细信息

在利用GPS CV(GPS Common View)技术进行高精度时间比对时,电离层和卫星位置误差对观测到的卫星信号的影响是不容忽视的,需要对它进行精确的估计和改正.讨论igs精密星历和CODE全球总电子含量图(TEC MAPs)在GPS时间传递中的应用.计算结果表明,采用igs产品可有效提高单站定时和远距离时间传递的精度.

关键词： igs GPS 时间比对总电子含量电离层改正观测卫星信号单站星历

高黎贡山旱冬瓜Frankia的igs PCR-RFLP分析

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应用生态学报 2004年第2期15卷 186-190页

作者：代玉梅曹军唐晓萌张成刚中国科学院沈阳应用生态研究所沈阳110016

在云南省高黎贡山自然保护区海拔 1310～ 2 4 0 0m的范围内 ,采集 30个旱冬瓜根瘤样品 ,直接从根瘤中提取FrankiaDNA ,对其nifD nifK基因间隔区 (intergenicspacer,igs)和 16S 2 3SrDNAigs进行PCR RFLP分析 .结果表明 ,nifD nifKigs的PC... 详细信息

在云南省高黎贡山自然保护区海拔 1310～ 2 4 0 0m的范围内 ,采集 30个旱冬瓜根瘤样品 ,直接从根瘤中提取FrankiaDNA ,对其nifD nifK基因间隔区 (intergenicspacer,igs)和 16S 2 3SrDNAigs进行PCR RFLP分析 .结果表明 ,nifD nifKigs的PCR产物长度差异很大 ,经HaeⅢ和AfaⅠ双酶切后 ,得到 15种酶切带型 ,检测到多种基因型的菌株同时与同一株宿主植物共生 ;16S 2 3SrDNAigs的PCR产物长度相似 ,酶切后亦区分出 15种酶切带型 .通过对两个基因间隔区的PCR RFLP联合分析 ,发现高黎贡山旱冬瓜Frankia存在 2

关键词： Frankia基因型高黎贡山 igs PCR—RFLP

全球igs站数据与GPS区域网数据的联合处理

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测绘学报 2000年第Z1期29卷 90-95页

作者：焦文海王刚贾小林西安测绘研究所陕西西安710054

:为了使区域 GPS网建立的参考框架与国际地球参考框架 (ITRF )更加接近 ,利用全球igs站观测数据无疑是一条最佳途径。本文对处理大尺度 GPS网数据时如何利用全球分布均匀的 igs站观测数据以及如何选择全球基准站的问题进行了研究。给出... 详细信息

:为了使区域 GPS网建立的参考框架与国际地球参考框架 (ITRF )更加接近 ,利用全球igs站观测数据无疑是一条最佳途径。本文对处理大尺度 GPS网数据时如何利用全球分布均匀的 igs站观测数据以及如何选择全球基准站的问题进行了研究。给出了利用全球 igs站数据的数学模型 ,分析了国内专家选择基准站时存在的一些问题 ,提出了选择基准站的新方法 ,这一方法适合于建立我国新的地心参考框架。实测数据计算结果表明 ,这种方法计算的未知站地心坐标精度相对于 ITRF96参考框架约± 2 cm。

关键词： igs GPS 数据处理基准站

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GPS数据处理中igs站点选取的研究

测绘通报 2009年第8期 32-35页

作者：曹泉根安艳辉丁玉平江苏省测绘工程院江苏南京210013

近年来,igs基准站的选取是GPS数据处理中讨论的热点问题。但到目前为止,该问题仍然没有得到解决。从理论和实践两个方面对该问题进行研究,首先从理论上分析igs基准站选取的几何意义和统计意义,然后利用已知精确坐标的igs站点的GPS观测... 详细信息

近年来,igs基准站的选取是GPS数据处理中讨论的热点问题。但到目前为止,该问题仍然没有得到解决。从理论和实践两个方面对该问题进行研究,首先从理论上分析igs基准站选取的几何意义和统计意义,然后利用已知精确坐标的igs站点的GPS观测数据作为试验数据,从不同分布情况以及不同igs站点个数两个方面,分析igs站点选取对坐标内外符合精度的影响,最后给出对于不同要求高精度GPS数据处理的igs站点选取原则。

关键词： igs GPS GPS数据处理内符合精度外符合精度