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Determination of RNA hydroxylmethylation in mammals by mass spectrometry analysis

Determination of RNA hydroxylmethylation in mammals by mass ...

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第十一届全国化学生物学学术会议

作者： Xue-Jiao You Ting Liu Bi-Feng Yuan Yu-Qi Feng Key Laboratory of Analytical Chemistry for Biology and Medicine （Ministry of Education） Department of ChemistryWuhan University

RNA molecules harbor diverse chemical modifications that play important regulatory roles in a variety of biological processes. Up to date, more than 150 modifications have been identified in various RNA species.[1] Most of these modifications occurring in DNA and RNA are the methylation of nucleic acids. It has been demonstrated that many of these methylation modifications are reversible and undergo dynamic demethylation and the hydroxylation of the methylated nucleosides may be a general pathway for the demethylation of DNA and RNA methylation. However, so far few other hydroxylmethylation modification has yet been reported existence in mammals. In the current study, we developed a neutral enzymatic digestion method for the mild digestion of nucleic acids followed by liquid chromatography-electrospray ionization-tandem mass spectrometry（LC-ESI-MS/MS） analysis. With the established method, we reported the existence of a new hydroxylmethylated nucleosides, N2-hydroxymethylguanosine（hm2 G）, in mammalian RNA. Our study suggests that RNA hydroxylmethylation may be a new prevalent group of modifications existing in RNA, which expands the diversity of nucleic acid modifications and should exert regulatory functions in living organisms.

关键词： RNA modifications hydroxylmethylation LC-ESI-MS/MS

来源： cnki会议评论

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