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Development of RPA-Cas12a-fluorescence assay for rapid and reliable detection of human bocavirus 1

Animal Models and Experimental Medicine 2024年第2期7卷 179-188页

作者： Weidong Qian Xuefei Wang Ting Wang Jie Huang Qian Zhang Yongdong Li Si Chen School of Food and Biological Engineering Shaanxi University of Science and TechnologyXi'anP.R.China Department of Dermatology Huazhong University of Science and Technology Union Shenzhen HospitalShenzhenP.R.China Ningbo Municipal Center for Disease Control and Prevention NingboP.R.China Medical College of Shenzhen University ShenzhenP.R.China

human bocavirus(HBoV)1 is considered an important pathogen that mainly affects infants aged 6–24 months,but preventing viral transmission in resource-limited regions through rapid and affordable on-site diagnosis of individuals with early infection of HBoV1 remains somewhat ***,we present a novel faster,lower cost,reliable method for the detection of HBoV1,which integrates a recombinase polymerase amplification(RPA)assay with the CRISPR/Cas12a system,designated the RPA-Cas12a-fluorescence *** RPA-Cas12a-fluorescence system can specifically detect target gene levels as low as 0.5 copies of HBoV1 plasmid DNA per microliter within 40 min at 37℃without the need for sophisticated *** method also demonstrates excellent specificity without cross-reactivity to non-target ***,the method was appraised using 28 clinical samples,and displayed high accuracy with positive and negative predictive agreement of 90.9%and 100%,***,our proposed rapid and sensitive HBoV1 detection method,the RPA-Cas12a-fluorescence assay,shows promising potential for early on-site diagnosis of HBoV1 infection in the fields of public health and health *** established RPA-Cas12a-fluorescence assay is rapid and reliable method for human bocavirus 1 *** RPA-Cas12a-fluorescence assay can be completed within 40 min with robust specificity and sensitivity of 0.5 copies/μl.

关键词： CRISPR-Cas12a detection human bocavirus 1 on-site diagnosis recombinase polymerase amplification

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