检索结果-南通市图书馆

作者：赵雪芳甘肃农业大学

学位级别：硕士

Lactiplantibacillus plantarum MC5（Lp.plantarum MC5）是本研究团队前期分离自甘肃藏区传统发酵牦牛乳中的一株优势乳酸菌,其有良好的发酵特性和益生特性。产胞外多糖（exopolysaccharide,eps）是Lp.plantarum MC5的益生特性之一,有... 详细信息

Lactiplantibacillus plantarum MC5（Lp.plantarum MC5）是本研究团队前期分离自甘肃藏区传统发酵牦牛乳中的一株优势乳酸菌,其有良好的发酵特性和益生特性。产胞外多糖（exopolysaccharide,eps）是Lp.plantarum MC5的益生特性之一,有待深入研究。本试验以Lp.plantarum MC5为研究对象,基于菌株的全基因组序列揭示了其基因组结构和编码的功能基因。通过对益生菌MC5进行功能注释,分析其糖特异性磷酸转移系统（PTS）、eps合成途径、合成eps的关键酶和eps合成相关基因簇,从基因层面揭示了益生菌MC5的产eps机理。又从表型层面测定了益生菌MC5的产eps能力、不同碳源下的最大eps产量,从而验证了益生菌MC5的产eps特性。进而研究了菌株MC5产生的eps的生物活性,包括抗消化活性和抗氧化活性。最后,用不同比例的益生菌MC5和商业发酵剂制备了四组酸奶。在应用层面探究了菌株MC5做为复合发酵剂对酸奶在贮藏期间的稳定性、流变特性、质构特性和抗氧化活性的改善作用。以期为Lp.plantarum MC5的产eps机理提供理论依据,也为益生菌MC5的工业化生产提供理论指导。主要研究结果如下:（1）基于Lp.plantarum MC5的全基因组序列,其全基因组长度为3,317,904bp。菌株MC5有一条环状染色体,长度为2,791,014 bp,GC含量为45.55%,有两个质粒,即质粒1（60,060 bp,GC含量38.79%）和质粒2（15,567 bp,GC含量36.82%）。菌株MC5预测的基因数量为3138个,存在15个r RNA（5S、16S、23S）,74个t RNA和38个s RNA;其数据库注释结果表明该菌株有很强的碳水化合物代谢、氨基酸代谢和膜转运能力。菌株MC5有7个糖核苷酸合成途径、11个糖特异性磷酸转运系统（PTS）和21种eps合成关键酶;此外,菌株MC5具有2个典型的eps合成基因簇,包括保守基因eps A、eps B、eps C、eps D、eps E、wzx、wzy,6个多糖生物合成蛋白和1个菌株MC5特有的eps G基因。（2）菌株MC5的验证结果表明,MC5有较强的eps产生能力,在不同的培养条件下都能产生eps。并且菌株MC5可以利用基因层面预测到的碳源产生大量eps。以eps产量为响应值对菌株的培养条件响应面优化后最高eps产量为345.81 mg/L,此时菌株的最佳培养条件为4.0%接种量、培养时间30 h、培养温度34.0℃和初始p H值6.40。并且菌株MC5的培养温度、培养时间和初始p H值都影响产eps的关键酶活。（3）菌株MC5产生的胞外多糖（eps-MC5）的生物活性结果表明,eps-MC5在α-淀粉酶液、模拟胃液（p H 2.0、3.0、4.0）和模拟肠液（p H 6.8）中消化180 mins后的抗消化能力分别为98.59%、98.62%、98.78%、98.86%和98.74%。eps-MC5浓度为10 mg/m L时对DPPH·、ABTS·和·OH的清除率以及三价铁还原力(OD)分别为73.33%、87.74%、46.07%和1.24。流变学结果表明,eps-MC5具有较高的表观粘度（3.01 Pa）和剪切应力（41.78 Pa）,其在剪切频率为100 Hz时弹性模量和粘性模量分别为161.03 Pa和4.02 Pa。（4）菌株MC5的应用结果表明,添加益生菌MC5可以显著增加酸奶在贮藏过程中eps的产量（Peps含量最高,分别为982.42 mg/L和751.71 mg/L。添加益生菌MC5的酸奶的表观粘度、粘稠度、凝聚力和持水率（WHR）显著高于对照组S（P基因组序列分析了其eps的生物合成途径、产eps的关键酶和eps基因簇;结合菌株MC5的表型指标验证了其产eps的能力,通过响应面优化从而得到了菌株MC5的最佳产eps条件和最高eps产量。又测定了eps-MC5的抗消化活性、抗氧化活性和流变特性。最后以益生菌MC5为复合发酵剂制备了益生菌酸奶,研究了该酸奶在贮藏期间（1,7,14和21 d）的稳定性、流变特性、质构特性和抗氧化活性。上述结果从Lp.plantarum MC5的基因-表型-应用三个层面系统全面的为菌株MC5的产eps机理提供理论依据,也为菌株益生特性的开发利用提供理论指导

关键词： Lp.plantarum MC5 全基因组序列胞外多糖 eps基因簇酸奶

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产胞外多糖嗜热链球菌eps基因簇的表达及生物信息学分析

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中国食品学报 2021年第11期21卷 244-251页

作者：田佳乐刘洋李嘉雯乔少婷胡海敏丹彤内蒙古农业大学食品科学与工程学院呼和浩特010018

目的:胞外多糖(eps)作为乳酸菌(LAB)重要的次级代谢产物,在发酵乳制品的生产中发挥着重要作用。采用生物信息学方法分析乳酸菌产eps的分子机制,为开发利用eps提供理论依据。方法:采用二代测序技术(Illumina Hiseq 4000)及实时荧光定量PC... 详细信息

目的:胞外多糖(eps)作为乳酸菌(LAB)重要的次级代谢产物,在发酵乳制品的生产中发挥着重要作用。采用生物信息学方法分析乳酸菌产eps的分子机制,为开发利用eps提供理论依据。方法:采用二代测序技术(Illumina Hiseq 4000)及实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)对分离自蒙古国酸牛奶中一株高产eps的嗜热链球菌IMAU20756进行基因组测序,并对不同时间点eps基因表达量进行定量分析。结果:该菌株基因组全长为1838440 bp,GC含量为38.8%,共编码2120个基因,包含1962个功能基因,36个t RNA、515个假基因、1个tmRNA和2个重复单位。其中和eps生产相关的基因有12个,epsA、epsB是调控基因,epsC、epsD决定多糖链长,eps1E、eps2E、epsG、epsF、epsH、epsI、epsJ是编码糖基转移酶基因,epsK调控多糖聚合及输出。结论:所有和eps生物合成相关的基因在发酵过程中均能表达,特别是糖基转移酶的基因表达量在发酵6 h时达最高。

关键词：嗜热链球菌胞外多糖 eps基因簇生物信息学分析

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嗜热链球菌937胞外多糖生物合成途径及表型分析

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食品与发酵工业 2024年第12期50卷 101-108页

作者：夏亚灵徐欣徐心怡瓦云超顾瑞霞扬州大学食品科学与工程学院江苏扬州225000 江苏省乳品生物技术与安全控制重点实验室江苏扬州225000

嗜热链球菌在生长过程中产生的胞外多糖能够改善发酵乳制品质地,还具有多种生理生化功能。为探究组氨酸、异亮氨酸和谷氨酸对嗜热链球菌937胞外多糖的调控机制,该研究通过全基因组测序,分析了菌株胞外多糖合成途径,随后探究了3种氨基酸... 详细信息

嗜热链球菌在生长过程中产生的胞外多糖能够改善发酵乳制品质地,还具有多种生理生化功能。为探究组氨酸、异亮氨酸和谷氨酸对嗜热链球菌937胞外多糖的调控机制,该研究通过全基因组测序,分析了菌株胞外多糖合成途径,随后探究了3种氨基酸浓度提升对菌株生长、胞外多糖产量和性质以及epsABCD转录水平的影响。结果发现,该菌具有转运葡萄糖、蔗糖等特异性PTS转运系统和乳糖渗透酶;具有合成UDP-葡萄糖、UDP-半乳糖和dTDP-鼠李糖的潜力;染色体上存在由18个编码基因组成的eps基因簇。当3种氨基酸浓度提升至15 mmol/L时,菌株胞外多糖产量提升1.5倍、分子质量提升1.2倍、单糖组成摩尔比发生变化并且epsABCD转录水平均显著上调(PepsABCD的表达,提升了胞外多糖产量并调节了化学性质,该研究结果在基因水平上为嗜热链球菌胞外多糖生物合成提供了更好的解释。

关键词：嗜热链球菌胞外多糖 eps基因簇氨基酸转录调控机制

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乳酸菌胞外多糖合成条件的优化及eps基因簇分析

乳酸菌胞外多糖合成条件的优化及eps基因簇分析

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作者： GANKHUYAG JAVZAN（扎娃）哈尔滨工业大学

学位级别：硕士

德氏乳杆菌保加利亚亚种（Lactobacillus delbrueckii subsp.bulgaricus）和副干酪乳杆菌（Lactobacillus paracasei）产生的胞外多糖（Exopolysaccharides,epss）具有广泛的用途,它们不仅可以改善乳制品的品质,并且还具有抗氧化活性、抗癌、降血糖等益生作用。本研究对德氏乳杆菌保加利亚亚种菌株LDB-C1与副干酪乳杆菌菌株LC-C2产eps发酵条件进行优化;并对eps基因簇进行生物信息学分析,旨在为以上菌株eps的定向合成奠定理论依据。本实验通过对6株德氏乳杆菌保加利亚亚种菌株和18株副干酪乳杆菌菌株eps合成能力进行评价,选择了高产eps的德氏乳杆菌保加利亚亚种菌株LDB-C1与副干酪乳杆菌菌株LC-C2作为eps发酵条件优化的实验菌株。本研究在MRS培养基和脱脂乳培养基条件下,对菌株LDB-C1与LC-C2产eps条件进行了优化。在MRS培养基中,LDB-C1与LC-C2菌株的最佳接种量均为3%;最适p H分别为6.5和7.0;最佳碳源均为半乳糖,最佳碳源的浓度为4%。在脱脂乳培养基条件下,LDB-C1与LC-C2菌株最佳碳源分别为蔗糖和果糖,最佳碳源浓度分别为4%和1%;最佳氮源分别为大豆蛋白胨和胰蛋白胨,最佳氮源浓度均为9%。利用响应面的中心复合实验CCD法对LDB-C1产eps的发酵条件进行优化,确定最优培养条件为:蔗糖含量为4%,大豆蛋白胨含量为9%,接种量为5%。在最优条件下,LDB-C1的eps产量为0.802 mg/m L。本研究对L.delbrueckii subsp.bulgaricus（DSM 20080、LJJ、KCTC13731、ATCC 11842、2038）和Lactobacillus casei（LC5、W56、IIA、BL23、DSM20080）的eps基因簇进行生物信息学分析。结果表明,来自不同菌种eps基因簇存在显著差异,即使来自同一物种的不同菌株中也存在明显差异,表明eps基因簇具有丰富的多样性。研究发现,L.delbrueckii subsp.bulgaricus的eps基因簇中含有保守的转录调控蛋白基因和翻转酶基因。值得一提的是,菌株2038和ATCC11842有一个额外的翻转酶基因,推测菌株具有较强的转运eps的能力。在L.casei的eps基因簇中含有保守的参与eps合成调控的酪氨酸蛋白磷酸酶基因和转录调节基因。糖基转移酶系统发育树分析发现,L.delbrueckii subsp.bulgaricus和L.casei的eps基因簇中,糖基转移酶存在着丰富的多样性。特殊的糖基转移酶将有利于具有独特结构的eps的合成。明确eps基因簇中糖基转移酶,将有利于指导eps的定向合成。

关键词：德氏乳杆菌保加利亚亚种副干酪乳杆菌胞外多糖 eps基因簇

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乳酸乳球菌乳酸亚种IMAU11823胞外多糖结构及eps基因簇转录分析

乳酸乳球菌乳酸亚种IMAU11823胞外多糖结构及eps基因簇转录分析

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作者：李敏内蒙古农业大学

学位级别：硕士

乳酸乳球菌广泛应用于发酵乳制品,其中一些菌株具有产胞外多糖(Exopolysaccharides,eps)的特性。乳酸菌eps结构多变,生物合成复杂,为了解析新的乳酸菌eps结构特征,探究其生物合成机制,本论文以分离自锡林郭勒盟嚼口的一株具有产eps的乳... 详细信息

乳酸乳球菌广泛应用于发酵乳制品,其中一些菌株具有产胞外多糖(Exopolysaccharides,eps)的特性。乳酸菌eps结构多变,生物合成复杂,为了解析新的乳酸菌eps结构特征,探究其生物合成机制,本论文以分离自锡林郭勒盟嚼口的一株具有产eps的乳酸乳球菌乳酸亚种IMAU11823为研究对象,对其产生的eps进行分离纯化、初级结构解析,完成菌株全基因组测序和菌株不同生长阶段eps基因簇转录分析等。主要研究结果如下:1.菌株IMAU11823以2%的接种量接种于M17液体培养基,37℃培养24 h后粗多糖得率为201.44 mg/L;该粗多糖具有较强的还原能力和DPPH自由基、羟基自由基清除能力,且具有浓度依赖性。利用DEAE-52阴离子交换柱对获得的粗多糖进行分离纯化得到三个组分,分别命名为eps-1、eps-2 和 eps-3。2.进一步对eps-1和eps-2的结构特征进行研究,结果表明eps-1由甘露糖和葡萄糖组成,摩尔比为1:7.01;eps-2由甘露糖、鼠李糖和葡萄糖组成,摩尔比为7.45:1:2.34。红外光谱分析结果表明,两者均具有多糖的特征吸收峰,且都含有吡喃糖苷。结合1D和2D NMR分析结果,推测 eps-1 的糖链骨架由→4)-α-D-Glcp-(1,→4,6)-α-D-Manp-(1→和T-α-D-Glcp组成;eps-2 的糖链骨架由 T-α-D-Manp,T-α-D-G1cp,→2,3,4)-α-D-Manp-(1-→,→4,6)-α-D-Manp-(1-→,→2,3)-α-D-Manp-(1→,→2)-α-D-Manp-(1→,→6)-α-D-Manp-(1→,→4)-α-D-Manp-(1→,→2)-β-D-Rhap-(1→和→4)-β-D-G1cp-(1→组成。3.全基因组测序结果表明,菌株IMAU11823基因组内包含一条染色体DNA和三个环状质粒。在染色体上识别到一条16 Kb的eps基因簇,包含20个编码基因。ddPCR分析发现,在eps合成起始阶段epsR开始高表达,在菌株生长6 h时epsD、epsB、epsK的表达量达到最高,此时eps合成速率最快,由此推测eps合成主要通过epsR调控epsD、epsB和epsK等基因的表达进行eps产量的积累。本研究对L.lactis IMAU11823产生eps的结构特征进行初步解析并探讨其合成机制,为乳酸菌及eps的综合利用提供理论依据和数据支持。

关键词：乳酸乳球菌乳酸亚种胞外多糖结构分析 eps基因簇 ddPCR

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不同嗜热链球菌菌株的胞外多糖合成能力及eps基因簇分析

不同嗜热链球菌菌株的胞外多糖合成能力及eps基因簇分析

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作者：蒋旭哈尔滨工业大学

学位级别：硕士

嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus,S.thermophilus)是世界上公认的最具经济价值的同型发酵乳酸菌之一,广泛用于乳制品的生产。嗜热链球菌胞外多糖(Exopolysaccharides,eps)由于其具有改善乳制品的品质,并已被证实具有抗氧化、抑... 详细信息

嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus,S.thermophilus)是世界上公认的最具经济价值的同型发酵乳酸菌之一,广泛用于乳制品的生产。嗜热链球菌胞外多糖(Exopolysaccharides,eps)由于其具有改善乳制品的品质,并已被证实具有抗氧化、抑菌等生物活性,而具有广泛的应用前景。本研究首先采用苯酚硫酸法和3,5-二硝基水杨酸法对从本实验室前期分离获得的22株S.thermophilus CS1S22产eps能力进行评价,比较不同菌株所产eps含量的差异,从中筛选确定高产eps的优良菌株CS5、CS6、CS9和CS18。本研究以产eps含量较高的S.thermophilus CS6为研究对象,对该菌eps合成条件进行优化。采用单因素实验确定传代次数、接种量、发酵温度、后熟时间和碳源(乳糖、半乳糖、果糖、葡萄糖和蔗糖)等影响因素的范围。利用Plackett-Burman设计来筛选单因素中关键因素;利用响应面的中心复合实验CCD法确定最佳培养条件如下:接种量4.34%,发酵温度44°C,脱脂乳含量10%,后熟时间24 h,后熟温度4°C,传代次数3代,乳糖含量为1.7%,并进行验证,得到eps粗提取物的含量为343.75 mg/L,与预测值接近,且比优化前提高了11.64%。本研究通过对S.thermophilus CS6进行补充碳源(麦芽糖、甘露糖、甘露醇、木糖和核糖)和氮源(蛋白胨、大豆蛋白胨、胰蛋白胨、牛肉膏和乳清浓缩蛋白)优化实验,同时对最大影响eps产量的碳源(麦芽糖)和氮源(大豆蛋白胨)进行梯度实验设计,得到它们的最佳浓度范围,为碳源和氮源的进一步优化做准备,最终为后续即将完成eps基因簇序列分析的全部22株S.thermophilus产eps的培养条件优化奠定基础。本研究对22株S.thermophilus eps基因簇的测定:首先对已公布的eps基因簇进行分析、归类,并根据其5’端deoD和3’端orf14.9之间基因的保守序列设计引物(共计8对);分别以22株S.thermophilus的基因组DNA为模板,扩增eps基因簇,对PCR产物鉴定、纯化及测序,序列进行拼接,获得完整的eps基因簇序列。本研究最终得到3株S.thermophilus(CS2、CS6和CS10)完整的eps基因簇序列信息,以及其它菌株大部分eps基因簇片段的序列信息。序列分析发现,菌株CS2、CS6和CS10均与S.thermophilus ASCC 1275菌株(ID:CP006819.1)的eps基因簇具有高度同源性,含有额外的与eps长度相关的eps2C和eps2D基因,推测有利于eps的合成;同时含有丰富的糖基转移酶基因,负责葡萄糖、半乳糖、鼠李糖、UDP-N-乙酰葡萄糖胺和UDP-呋喃半乳糖的转运,有利于形成独特单体组成的eps。以上研究,为进一步研究eps基因簇在菌株产eps差异中的作用奠定基础。

关键词：嗜热链球菌胞外多糖 eps基因簇

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Streptococcus thermophilus IMAU20551胞外多糖基因簇及其表达分析

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食品科学 2022年第22期43卷 136-144页

作者：乔少婷代安娜尔解敏孙思霖聂佳莹丹彤内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室内蒙古呼和浩特010018

以1株产胞外多糖(exopolysaccharide,eps)的嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)IMAU20551为研究对象,提取其DNA后采用Illumina HiSeq技术对DNA进行二代基因组重测序,并利用SOAPdenovo软件对其进行组装,通过与RAST、直系同源集、基因本体论、京都基因与基因组百科全书等数据库进行比对,注释基因组中功能基因。发现S.thermophilus IMAU20551基因组全长1725107 bp,共注释出1884个功能基因,其中包含一个长度为19376 bp的完整eps基因簇,该基因簇中与eps合成相关的基因共有18个,主要包括epsA、epsB、epsC、epsD、epsE、eps1F、eps2F、epsJ、wzx、epsP和epsX等,这些基因分别对eps的合成、组装以及转运输出进行调控。另一方面,利用实时聚合酶链式反应对S.thermophilus IMAU20551 eps基因簇表达进行验证,发现所有基因均可表达,且除个别糖基转移酶基因外,其他被测基因均在6 h达到最大表达量。本研究介绍了S.thermophilus IMAU20551的基因组特征、eps基因簇及其表达能力,为今后深入研究S.thermophilus eps基因簇及其表征结构的互作关系奠定基础。

关键词：胞外多糖嗜热链球菌 eps基因簇基因组信息实时聚合酶链式反应

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嗜热链球菌IMAU20246胞外多糖基因簇及其表达分析

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微生物学报 2023年第1期63卷 403-418页

作者：代安娜尔乔少婷孙思霖聂佳莹丹彤孙志宏内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室、农业农村部奶制品加工重点实验室、内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室内蒙古呼和浩特010018

【目的】嗜热链球菌IMAU20246是一株具有良好发酵特性且高产胞外多糖(exopolysaccharides,eps)的菌株,但其eps基因簇及合成途径尚不清晰。因此可通过全基因组测序及生物信息学分析菌株基因组序列,探究eps合成及调控机制。【方法】本实... 详细信息

【目的】嗜热链球菌IMAU20246是一株具有良好发酵特性且高产胞外多糖(exopolysaccharides,eps)的菌株,但其eps基因簇及合成途径尚不清晰。因此可通过全基因组测序及生物信息学分析菌株基因组序列,探究eps合成及调控机制。【方法】本实验对嗜热链球菌IMAU20246进行全基因组测序并进行生物信息学分析,解析eps生物合成相关基因簇及eps合成途径,同时采用实时荧光定量PCR技术(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)对其不同时间点eps基因簇的表达进行定量分析。【结果】嗜热链球菌IMAU20246基因组中有一个18.1 kb的eps生物合成基因簇,编码15个与eps生物合成相关的基因。嗜热链球菌IMAU20246通过转运葡萄糖、甘露糖、果糖、半乳糖、乳糖、海藻糖、纤维二糖及蔗糖合成UDP-葡萄糖、dTDP-葡萄糖、dTDP-鼠李糖、UDP-半乳糖、UDP-呋喃半乳糖、UDP-N-乙酰葡萄糖胺和UDP-N-乙酰半乳糖胺等7种糖核苷酸。qRT-PCR的结果表明,eps基因簇中的基因在细胞生长阶段均能表达,特别是糖基转移酶基因epsE、epsF、epsH和epsJ在培养6 h时表达量最高,此时eps产量达到最高。【结论】本研究从基因组解析了嗜热链球菌IMAU20246 eps基因簇及其合成途径,为菌株的进一步开发提供了理论依据。

关键词：嗜热链球菌胞外多糖 eps基因簇生物合成生物信息学分析

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Streptococcus thermophilus IMAU20551胞外多糖的结构及其生物合成基因簇的研究

Streptococcus thermophilus IMAU20551胞外多糖的结构及其生物合...

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作者：乔少婷内蒙古农业大学

学位级别：硕士

胞外多糖(Exopolysaccharide,eps)作为乳酸菌的一种重要的次级代谢产物,具有改善产品质构,提高产品甜度及营养价值等特性,是近年来研究人员追捧的热点。本研究以一株产eps的嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus,S.thermophilus)IMAU2... 详细信息

胞外多糖(Exopolysaccharide,eps)作为乳酸菌的一种重要的次级代谢产物,具有改善产品质构,提高产品甜度及营养价值等特性,是近年来研究人员追捧的热点。本研究以一株产eps的嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus,S.thermophilus)IMAU20551为研究对象,对其所产eps的结构、生物活性及基因组信息进行分析,并对eps合成相关基因在菌株不同生长时期的表达量进行研究。结果如下:(1)从传统发酵乳制品中分离出一株高产胞外多糖的S.thermophilus IMAU20551,采用苯酚-硫酸法测定其在M17培养基中eps的产量为268.25±5.36mg/m L。采用离子交换柱层析和凝胶分子筛层析对eps进行分离纯化,共得到2种多糖组分,其中中性多糖(WPS-807)分子量为1.028×10Da,主要由葡萄糖、半乳糖和甘露糖组成,并含有少量的鼠李糖和阿拉伯糖,酸性多糖(SPS-807)分子量为8.601×10Da,单糖组分相较于WPS-807更为复杂,主要由甘露糖、半乳糖和阿拉伯糖组成。(2)提取S.thermophilus IMAU20551的DNA,采用illumina Hiseq技术进行二代基因组重测序,并利用SOAPdenovo软件对其进行组装,通过与RAST、COG、GO、KEGG等数据库进行比对分析,注释基因组中的功能基因。发现S.thermophilus IMAU20551基因组全长1725107 bp,共注释得到1884个功能基因,其中包含一个长度为19376 bp的完整eps基因簇,该基因簇中与eps合成相关的基因共有18个,主要包括epsA、epsB、epsC、epsD、epsE、eps1F、eps2F、epsJ、wzx、epsP和epsX等,这些基因分别调控eps的合成,组装以及转运输出。(3)利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对不同生长时期S.thermophilus IMAU20551 eps基因簇的表达情况进行分析,发现eps基因簇中的所有基因均可表达,且除个别糖基转移酶基因外,其他被测基因均在菌株生长6 h时表达量达到最大。(4)SPS-807和WPS-807对羟自由基、DPPH自由基以及超氧阴离子的清除能力分析结果表明,这两种纯多糖均具有良好的抗氧化活性和对羟自由基的清除能力,且SPS-807的抗氧化能力要优于WPS-807。

关键词：胞外多糖表征特性基因组信息 eps基因簇实时荧光定量PCR(RT-qPCR)

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Limosilactobacillus fermentum F-6的遗传背景和功能基因组

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微生物学报 2022年第4期62卷 1438-1451页

作者：吴琼李伟程李敏李瑜孙天松内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业部奶制品加工重点实验室内蒙古乳品生物技术与工程重点实验室内蒙古呼和浩特010018

【目的】Limosilactobacillus fermentum具有增强免疫力、产胞外多糖(exopolysaccharide,eps)等多种功能特性,广泛应用于食品领域,具有较高经济价值。本文从群体遗传学角度,解析L.fermentum F-6的遗传背景和功能基因特征,为其开发利用... 详细信息

【目的】Limosilactobacillus fermentum具有增强免疫力、产胞外多糖(exopolysaccharide,eps)等多种功能特性,广泛应用于食品领域,具有较高经济价值。本文从群体遗传学角度,解析L.fermentum F-6的遗传背景和功能基因特征,为其开发利用提供遗传学基础。【方法】本研究对NCBI已公开的23株L.fermentum全基因组序列和1株模式菌株ATCC 14931T的基因组序列进行比较基因组学分析。利用Roary软件识别核心基因集与泛基因集;采用rapid annotation using subsystem technology(RAST)网站对基因组进行功能注释,以探究F-6基因组特征。【结果】以识别到的997个核心基因构建系统发育树,发现聚类趋势与分离源无关,但F-6与3株食品分离株聚在同一分支。功能注释分析发现,24株L.fermentum中仅F-6含有参与支链氨基酸合成途径的基因(ilvD、leuA等),可为机体提供必需氨基酸。F-6含有大量编码糖基转移酶和UDP-葡萄糖4-表异构酶的基因,且含有1个完整的eps基因簇。与其他L.fermentum相比,F-6携带的特有功能基因gadC与菌株耐酸能力有关。此外,F-6具有与谷胱甘肽、抗菌肽和黏附分子合成相关的功能基因。【结论】本文从全基因组水平解析L.fermentum F-6遗传背景和功能基因特征,认为其是一株具有耐酸基因、支链氨基酸合成基因和完整eps基因簇的潜在益生菌株,为其应用研究提供了必要的理论依据。

关键词： Limosilactobacillus fermentum F-6 比较基因组学遗传背景功能基因 eps基因簇

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