检索结果-南通市图书馆

山西医科大学学报 2024年第1期55卷 1-12页

作者：胡玮彬孙玄子张晓智惠蓓娜西安交通大学第一附属医院肿瘤放疗科西安710061

目的探究ddx解旋酶39A(DEAD-box RNA helicases 39A,ddx39a)对食管鳞癌KYSE-150和TE-1细胞生物学行为的影响及作用机制。方法利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)分析ddx39a在食管鳞癌肿瘤组织和正常组织中的表达差异。进一步在TCGA数据库中,采用Spearman相关分析(设置r>0.5,Pddx39a表达最相关基因,通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA),注释ddx39a在食管鳞癌中的生物学功能。通过慢病毒介导的短发夹RNA(shRNA)干扰技术下调ddx39a在食管鳞癌KYSE-150和TE-1细胞中的表达,并将细胞分为对照(shCtrl)组和ddx39a敲减(shddx39a)组。利用qPCR和Western blot法检测敲减效率;利用Celigo法、克隆形成实验和MTT法检测KYSE-150和TE-1细胞的增殖能力和活力;利用流式细胞术检测KYSE-150和TE-1细胞的凋亡水平;利用Transwell实验检测KYSE-150和TE-1细胞的迁移和侵袭能力;利用裸鼠成瘤实验检测敲减ddx39a对体内肿瘤的作用。利用Western blot法筛选敲减ddx39a后KYSE-150细胞内蛋白表达水平显著变化的肿瘤相关经典通路分子。通过慢病毒转染法构建已筛选的分子CDH2(Cadherin 2)过表达的稳转细胞系,并将KYSE-150细胞分为shddx39a+NC-OE组(转染shddx39a慢病毒和过表达空载对照病毒)和shddx39a+CDH2-OE组(转染shddx39a慢病毒和过表达CDH2病毒)。利用Celigo法、MTT法和Transwell实验分别检测过表达CDH2对ddx39a敲减细胞增殖能力、活力以及转移能力的影响。结果与正常组织相比,食管鳞癌组织中ddx39a的表达显著上调(Pddx39a及其相关基因主要作用于遗传信息的翻译与加工和细胞凋亡等过程。与shCtrl组相比,shddx39a组KYSE-150和TE-1细胞中ddx39a的mRNA和蛋白表达显著降低(Pddx39a敲减后瘤体的体积和质量均明显减少(Pddx39a+NC-OE组相比,shddx39a+CDH2-OE组KYSE-150细胞的增殖、细胞活力以及转移能力均显著提高(Pddx39a可作为食管鳞癌诊治的新靶点,上调其表达可能通过诱导上皮间充质转化促进食管鳞癌细胞生长、迁移与侵袭。

关键词： ddx39a 增殖凋亡迁移侵袭上皮间充质转化食管鳞癌

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

RNA helicase ddx39a regulates final differentiation of cardiomyocyte,skeletal muscle cell and lens fiber cell

RNA helicase ddx39a regulates final differentiation of cardi...

引用

第二届全国发育生物学大会

作者：尹培培娄鑫 Nanjing University Model Animal Research Center

RNA helicases from the DEAD-box family are found in almost all organisms and have important roles in RNA metabolism ranging from RNA synthesis to RNA *** detail function and mechanism about how these helicases engage in scenarios of animal development and diseases remain to *** previous gene-trapping screen,we identified a zebrafish line carrying a null allele of ddx39a,a DEAD box RNA *** the ddx39a null embryos revealed cardiac and trunk muscle dystrophy and defects in *** sequencing and following verification experiments indicated in when ddx39a lost,the final cell differentiation in these organs hampered due to mis-expression of structural *** ddx39a mutant embryo,accumulation of mis-processed RNA activated innate immunity pathway and finally led mitotic arrest and enhanced cell death.

关键词： RNA helicase ddx39a cardiomyocyte muscle cell lens fiber cell myotrophy

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

ddx39a低表达影响精子发生的机制研究

DDX39A低表达影响精子发生的机制研究

引用

作者：王庆刚苏州大学

学位级别：硕士

背景:男性不育症是一个全球性的健康问题,正受到越来越多的关注。非梗阻性无精子症(Non-obstructive azoospermia,NOA)是不育症中最严重的表型,是一种高度异质性的疾病,但其发病机制目前尚不完全明确。NOA患者的睾丸活检可大致分为完全... 详细信息

背景:男性不育症是一个全球性的健康问题,正受到越来越多的关注。非梗阻性无精子症(Non-obstructive azoospermia,NOA)是不育症中最严重的表型,是一种高度异质性的疾病,但其发病机制目前尚不完全明确。NOA患者的睾丸活检可大致分为完全没有生精细胞的唯支持细胞综合征(Sertoli cell only syndrome,SCO)、精子发生提前停止即成熟阻滞(Maturation arrest,MA)和生精功能低下(Hypo-spermatogenesis,HSG)三种组织学亚型。MA又可进一步分为早期和晚期,前者阻滞于精原干细胞有丝分裂增殖或精母细胞减数分裂,后者阻滞于精子形成阶段。不育症男性中有相当一部分患者表现为早期MA,这些患者经常伴有遗传异常。本研究的目的是基于基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO),通过生物信息学分析寻找减数分裂前即精原干细胞有丝分裂增殖阻滞阶段(Premeiotic arrest,PRE)NOA的致病基因,并通过细胞实验进行验证及机制分析,为男性不育症的诊疗提供新的靶点和思路。方法:1.生物信息学分析:(1)应用GEO2R在线工具进行PRE-NOA和正常生精样本间的差异表达基因分析;(2)基于注释可视化和集成发现数据库(Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery,DAVID)在线工具进行基因本体/京都基因和基因组数据库(Gene Ontology/Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,GO/KEGG)通路富集分析;(3)通过检索人类单细胞测序数据库人类细胞蓝图(Human Cell Landscape),进一步筛选出在睾丸中特异表达于生精细胞上的差异基因;(4)将上述基因与其他人类NOA数据集的差异表达基因进行比对,寻找NOA患者群体中发生差异表达的PRE-NOA致病基因。2.实验验证:(1)通过siRNA干扰技术完成对小鼠精原细胞GC-1、小鼠精母细胞GC-2中死盒解旋酶39a基因(DEAD box helicase 39a,ddx39a)的敲减;(2)通过细胞集落形成实验、细胞增殖实验CCK-8及Transwell实验评估ddx39a敲降后对GC-1、GC-2细胞增殖、迁移能力的影响;(3)通过Western Blot分别检测敲减ddx39a后GC-1、GC-2细胞中总蛋白、胞核蛋白、胞质蛋白中β-catenin的相对表达水平,明确ddx39a与Wnt/β-catenin信号通路的关系。结果:1.生物信息学分析:(1)减数分裂前阻滞的差异基因中大部分都是表达下降;(2)通过GO/KEGG富集分析发现,差异表达显著下调的基因能够更多地影响生精细胞的分化增殖及迁移过程;(3)差异基因中有7个表达上调的基因(TEX11,MAGEB16,LRP6,CT55,SLC25A14,ZNF280C,ZFYVE9)和 16 个表达下调的基因(FMN1,PCLAF,DXD9A,CCDC24,C20orf96,SFMBT1,YBX3,H2AC1,AURKA,DHX30,RAE1,KAT5,CHCHD6,KRT10-AS1,C15orf61,MRPL36)定位于人生精细胞上,且该23个基因均为减数分裂前阻滞阶段相对特异表达的差异基因;(4)减数分裂前阻滞阶段特异表达的差异基因中仅有ddx39a和KRT10-AS1在NOA患者群体的基因数据集中也差异表达,可作为诊治NOA的潜在基因标志物。2.实验验证:(1)利用siRNA干扰技术可以有效敲减小鼠精原细胞GC-1及小鼠精母细胞GC-2中ddx39a的表达;(2)敲减ddx39a后,GC-1、GC-2细胞增殖及迁移能力明显下降;(3)敲减GC-1、GC-2内的ddx39a后,细胞核内β-catenin的表达明显下降,而细胞总体及细胞质内的表达量未有明显变化。结论:精子发生过程中ddx39a表达下调,通过阻断Wnt/β-catenin信号通路抑制生精细胞增殖及迁移,进而阻滞生精细胞减数分裂前过程,引起非梗阻性无精子症。

关键词：非梗阻性无精子症 ddx39a 生物信息学精子发生

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

ddx39a对神经胶质瘤细胞恶性生物学行为的影响和机制的研究

DDX39A对神经胶质瘤细胞恶性生物学行为的影响和机制的研究

引用

作者：王思雨沈阳医学院

学位级别：硕士

目的神经胶质瘤是中枢神经系统常见肿瘤之一,占脑恶性肿瘤的4/5,5年病死率在全身肿瘤中位居第三,易复发,预后差。因此,寻找新的与神经胶质瘤进展和预后相关的生物学标志物,可以为神经胶质瘤的早期诊断和治疗提供理论依据。DEAD-box RNA... 详细信息

目的神经胶质瘤是中枢神经系统常见肿瘤之一,占脑恶性肿瘤的4/5,5年病死率在全身肿瘤中位居第三,易复发,预后差。因此,寻找新的与神经胶质瘤进展和预后相关的生物学标志物,可以为神经胶质瘤的早期诊断和治疗提供理论依据。DEAD-box RNA解旋酶39A(The DEAD-box RNA Helicase 39A,ddx39a)属于DEAD-box解旋酶(The DEAD-box Helicase,ddx)家族,具有增强转录的功能,广泛参与RNA代谢、细胞周期调控、干细胞信号传导等过程。已有研究证明ddx39a的表达水平与肿瘤的恶性生物学行为有关,能够促进肿瘤细胞增殖、侵袭和转移,是肿瘤患者预后不良的危险因素。但ddx39a在神经胶质瘤中的表达、作用及机制尚未明确。本研究拟检测分析ddx39a在神经胶质瘤中的表达,通过改变ddx39a的表达水平观察其对神经胶质瘤细胞恶性生物学行为及其相关的信号通路蛋白的影响,旨在探讨ddx39a在神经胶质瘤中的生物学功能和作用机制,为神经胶质瘤诊断和治疗提供新的思路。方法1.生物信息学分析:利用基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)检索ddx39a在不同肿瘤中的表达情况;利用人类蛋白图谱(Human Protein Atlas,HPA)检索ddx39a在正常脑组织和神经胶质瘤组织中的表达情况;利用中国神经胶质瘤基因组图谱(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)检索ddx39a对不同级别神经胶质瘤患者总体生存期(Overall Survival,OS)的影响,以及ddx39a与细胞周期相关因子、EMT相关标志物、WNT/β-catenin信号通路关键因子表达的相关性。2.利用逆转录酶聚合酶链反应(Real-time Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)检测ddx39a在正常脑组织及神经胶质瘤组织中m RNA表达情况。3.在神经胶质瘤细胞系U87和U251中应用小分子干扰RNA(si RNA)及过表达质粒,敲低和过表达ddx39a,通过蛋白免疫印迹法(Western Blot)检测转染效果。再分别利用CCK-8实验、细胞划痕实验和Transwell迁移实验、Transwell侵袭实验,检测神经胶质瘤细胞增殖、迁移、侵袭能力的变化。4.利用Western Blot检测敲低和过表达ddx39a后,细胞周期相关蛋白、EMT相关蛋白和WNT/β-catenin信号通路关键蛋白的表达变化。结果1.生物信息学分析结果显示:ddx39a在多种肿瘤中高表达,且在神经胶质瘤组织中的表达水平显著高于正常脑组织(Pddx39a在低级别神经胶质瘤组织(Low-grade Glioma,LGG)和高级别神经胶质瘤组织(High-grade Glioma,HGG)中均呈阳性表达;ddx39a高表达的神经胶质瘤患者总体生存期较ddx39a低表达患者显著缩短(Pddx39a与细胞周期相关因子cyclin D1、cyclin E1的表达呈正相关(Pddx39a在神经胶质瘤组织中m RNA表达水平显著上升;且ddx39a在高级别神经胶质瘤组织中m RNA表达水平显著高于低级别神经胶质瘤组织(Pddx39a。si-ddx39a敲减组与si-NC对照组相比:细胞增殖能力显著下降(Pddx39a过表达组与pc DNA3.1(+)-NC对照组相比:细胞增殖能力显著上升(Pddx39a后,si-ddx39a敲减组与si-NC对照组相比:细胞周期相关蛋白cyclin D1及cyclin E1蛋白表达水平显著下降(P<0.05);EMT相关蛋白N-cadherin蛋白表达水平显著下降(P<

关键词： ddx39a 神经胶质瘤恶性生物学行为

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

TRAIP在人舌鳞状细胞癌中的表达及其对增殖、侵袭及迁移能力的影响

TRAIP在人舌鳞状细胞癌中的表达及其对增殖、侵袭及迁移能力的影响

引用

作者：王萍青岛大学

学位级别：硕士

目的检测TRAIP(Tumor necrosis factor receptor-associated factor interaction protein)在舌鳞状细胞癌(Tongue squamous cell carcinoma,TSCC)组织和细胞中的表达,研究TRAIP与TSCC患者临床病理资料之间的关系;探讨TRAIP与ddx39a(DEx D-Box Helicase 39A)对舌鳞状细胞癌(TSCC)增殖转移的影响及相关分子机制。方法采用TCGA数据库分析TRAIP在人头颈部鳞状细胞癌(Head and neck squamous cell carcinoma,HNSC)中的表达;Western blot检测9对新鲜TSCC组织和癌旁正常组织中TRAIP的表达;免疫组化检测65对TSCC组织及癌旁正常组织中TRAIP的表达情况;生信、质谱和免疫共沉淀分析TRAIP与ddx39a的关系;构建TRAIP与ddx39a过表达及敲降的舌鳞癌细胞系,CCK-8实验、集落形成实验、迁移实验、Transwell和流式细胞术检测TRAIP和ddx39a对TSCC细胞增殖及迁移侵袭能力的影响;Western blot检测TRAIP与ddx39a对上皮间充质转化(Epithelial mesenchymal transition,EMT)及Wnt/β-catenin信号通路相关蛋白表达的影响;将稳定敲降TRAIP的CAL27细胞注射到裸鼠皮下或尾静脉,检测TRAIP对肿瘤增殖及转移能力的影响。结果TCGA数据库显示,TRAIP在HNSC组织中的表达显著高于癌旁正常组织(Pddx39a可能存在相互作用,CCK-8和集落形成实验表明,TRAIP或ddx39a沉默后细胞增殖能力明显降低,而过表达后可显著增强TSCC细胞的增殖能力。流式细胞术周期实验显示,TRAIP或ddx39a敲降后G1期细胞增多,而S期细胞减少,而过表达后结果相反。迁移实验和Transwell结果显示,TRAIP或ddx39a敲低后细胞迁移侵袭能力明显减弱,而过表达TRAIP或ddx39a后细胞迁移侵袭能力增强,敲低ddx39a可以逆转TRAIP过表达对细胞迁移能力的增强作用。裸鼠皮下成瘤和肺转移模型结果显示干扰TRAIP基因后细胞增殖及转移能力降低。敲低TRAIP或ddx39a后EMT相关蛋白N-cadherin、Vimentin、Slug、Snail、MMP2及MMP9表达降低,E-cadherin表达无明显变化,而过表达TRAIP或ddx39a后上述蛋白表达升高,E-cadherin表达无明显变化,敲低ddx39a可以逆转TRAIP过表达对EMT的激活作用。干扰TRAIP或ddx39a后p-β-catenin、c-Myc、cyclin D1表达降低,β-catenin表达无明显变化,而过表达TRAIP或ddx39a后p-β-catenin、c-Myc、cyclin D1表达升高,β-catenin表达无明显变化。结论TRAIP在舌鳞癌中表达上调,可能通过与ddx39a相互作用激活EMT及Wnt/β-catenin信号通路,从而促进舌鳞癌细胞的增殖和转移。

关键词： TRAIP ddx39a 舌鳞状细胞癌(TSCC) 增殖转移

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：