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中国畜牧杂志 2017年第12期53卷 26-28,36页

作者：聂光伟王恩森李明杨毛翠毛慧敏王国水左波徐在言华中农业大学动科动医学院湖北武汉430070 浙江天蓬集团有限公司浙江江山324111

组织蛋白酶L(ctsl)基因属于组织蛋白酶(cathepsin)家族成员之一,该基因在调控肉质嫩度上发挥着重要作用,可以作为猪生长和胴体性状的候选基因。实验采用PCR-RFLP技术在大白猪群体中对ctsl基因第5外显子g.143 C>T单核苷酸多态性位点进行... 详细信息

组织蛋白酶L(ctsl)基因属于组织蛋白酶(cathepsin)家族成员之一,该基因在调控肉质嫩度上发挥着重要作用,可以作为猪生长和胴体性状的候选基因。实验采用PCR-RFLP技术在大白猪群体中对ctsl基因第5外显子g.143 C>T单核苷酸多态性位点进行检测,分析该位点与生长及胴体性状的关联性。结果表明:在大白猪群体中共有3种基因型,分别是TT、TC和CC基因型,CC基因型个体达100 kg体重日龄天数显著小于TT基因型个体(P<0.05),但其他性状关联分析结果未达到显著水平。

关键词：猪 ctsl基因多态性关联分析生长性状

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ctsd、ctsl基因的多态性与“雪龙”黑牛胴体性状相关性研究

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中国农学通报 2012年第2期28卷 6-9页

作者：陈晓杰吴蒙张立敏陈翠刘喜冬周正奎张猛黄萌刘利高雪许尚忠李俊雅高会江张路培李姣中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 大连雪龙产业集团有限公司大连116001

为了提高雪龙黑牛的胴体性状,进行新品种选育,以组织蛋白酶D、L(Cathepsin D,Cathepsin L)基因为候选基因,利用PCR-RFLP方法对114头雪龙黑牛F1代商品牛进行多态性检测,应用SAS9.2软件采用最小二乘拟合线性模型进行分析,结果表明,ctsd、c... 详细信息

为了提高雪龙黑牛的胴体性状,进行新品种选育,以组织蛋白酶D、L(Cathepsin D,Cathepsin L)基因为候选基因,利用PCR-RFLP方法对114头雪龙黑牛F1代商品牛进行多态性检测,应用SAS9.2软件采用最小二乘拟合线性模型进行分析,结果表明,ctsd、c581t位点与雪龙黑牛的经济性状无明显的相关性,ctsl基因Xma I位点与雪龙黑牛的三角牛腩厚显著相关,且AB型个体三角牛腩厚与AA和BB型个体三角牛腩厚差异显著。

关键词：雪龙黑牛 ctsd基因 ctsl基因胴体性状

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凡纳滨对虾AMY、ctsl基因SNPs及其与生长性状的关联分析

凡纳滨对虾AMY、CTSL基因SNPs及其与生长性状的关联分析

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作者：辛静静西北农林科技大学

学位级别：硕士

本研究以海南南疆生物技术有限公司对虾繁育中心凡纳滨对虾繁育群体的379尾个体为研究对象,采用PCR-RFLP/PCR-SSCP标记技术结合DNA测序方法对研究凡纳滨对虾群体的AMY基因和ctsl基因的遗传多态性进行了分析,同时与生长性状进行相关性分... 详细信息

本研究以海南南疆生物技术有限公司对虾繁育中心凡纳滨对虾繁育群体的379尾个体为研究对象,采用PCR-RFLP/PCR-SSCP标记技术结合DNA测序方法对研究凡纳滨对虾群体的AMY基因和ctsl基因的遗传多态性进行了分析,同时与生长性状进行相关性分析,以检测对凡纳滨对虾生长发育具有影响作用的分子遗传标记,旨在为凡纳滨对虾高效选育提供遗传学依据。 1.凡纳滨对虾AMY基因多态性分析对凡纳滨对虾AMY基因的8个基因座A2-A9进行检测,分别包含了外显子2-9区域,在A2、A3、A7、A8和A9这5个基因座中未发现多态性,在A4、A5和A6基因座上发现了多态性,PCR-SSCP/PCR-RFLP检测结果分别出现了3种带型。对A4、A5和A6基因座不同带型的PCR扩增产物进行测序,共发现4个SNP位点,分别为:第4外显子109bp处T→C的突变、第4内含子46bp处T→C的突变、第5外显子123bp处C→T的突变和第6外显子81bp处C→T的突变,其中A4基因座的2处突变表现为连锁突变,4处突变均未引起氨基酸的改变,表现为沉默突变。对AMY基因多态位点遗传结构分析,结果A4、A5和A6基因座有效等位基因Ne、杂合度He及多态信息含量PIC分别为:1.632/1.991/1.784、0.387/0.498/0.439和0.387/0.374/0.343,3个多态位点在该凡纳滨对虾群体上均处于中度多态,说明AMY基因的A4、A5和A6这3个基因座多态性比较丰富,可供选择潜力较大。 2. AMY基因多态性与凡纳滨对虾生长性状的关联分析利用最小二乘法对AMY基因A4基因座不同基因型之间的生长性状进行均值差异显著性检验,结果发现:A4基因座不同基因型对其生长性状具有显著影响,在体长、头胸甲宽、第一腹节长及尾节长4个指标上,TT和CC基因型显著高于杂合基因型CT （P＜0.05）;在体重和头胸甲长2个指标上,CC、TT和CT 3种基因型之间差异均达到了显著水平（P＜0.05）。 A5基因座:在体重指标上,CC、CT和TT3种基因型之间差异均达到了显著水平（P＜0.05）;在其它5个指标上,CC与CT基因型之间差异不显著,但与TT基因型之间的差异达到了显著水平（P＜0.05）。 A6基因座:在体重、头胸甲长和头胸甲宽3个指标上,AA基因型与AB基因型之间差异显著（P＜0.05）;在体长、第一腹节长和尾节长3个指标上,AA、BB基因型与AB基因型之间差异达到了显著水平（P＜0.05）。 3.凡纳滨对虾ctsl基因多态性分析对ctsl基因的5个基因座C2-C6进行检测,包含了外显子2-6及部分内含子区域,在C6基因座中发现有多态性,在其它基因座中未发现多态性,PCR-SSCP检测结果出现了3种带型,分别为CC、CT和TT。对C6基因座不同带型的PCR扩增产物进行测序,发现在ctsl基因第6外显子的92bp处存在1个C→T的碱基突变,该处碱基的改变未引起氨基酸的变化,表现为沉默突变。 ctsl基因多态位点遗传结构分析,结果C6基因座有效等位基因Ne、杂合度He及多态信息含量PIC分别为:1.726、0.421和0.332,C6基因座多态位点在该凡纳滨对虾群体上均处于中度多态。 4. ctsl基因多态性与凡纳滨对虾生长性状的关联分析 ctsl基因C6基因座多态性与生长性状进行相关性分析,C6基因座不同基因型对凡纳滨对虾的生长发育具有影响,总体来说三种基因型在各生长指标上按优劣程度依次排列为CC、CT和TT。在体重、体长、第一腹节长和尾节长4个指标上,CC、CT基因型显著高于TT突变基因型（P＜0.05）;在头胸甲长和头胸甲宽2个指标上,CC基因型显著高与CT和TT基因型（P＜0.05）。总之,AMY和ctsl基因多态性对凡纳滨对虾生长具有一定的影响,可以作为分子标记为凡纳滨对虾育种提供一定的参考价值。

关键词：凡纳滨对虾 AMY基因 ctsl基因多态性生长性状

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ctsd、ctsl基因的多态性与“雪龙”黑牛胴体性状相关性研究

ctsd、ctsl基因的多态性与“雪龙”黑牛胴体性状相关性研究

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第八届中国牛业发展大会

作者：陈晓杰吴蒙张立敏陈翠刘喜冬周正奎张猛黄萌刘利高雪许尚忠李俊雅高会江张路培李姣中国农业科学院北京畜牧兽医研究所大连雪龙产业集团有限公司

为了提高雪龙黑牛的胴体性状,进行新品种选育,以组织蛋白酶D、L(Cathepsin D,Cathepsin L)基因为候选基因,利用PCR-RFLP方法对114头雪龙黑牛F1代商品牛进行多态性检测,应用SAS 9.2软件采用最小二乘拟合线性模型进行分析,结果表明,ctsd、... 详细信息

为了提高雪龙黑牛的胴体性状,进行新品种选育,以组织蛋白酶D、L(Cathepsin D,Cathepsin L)基因为候选基因,利用PCR-RFLP方法对114头雪龙黑牛F1代商品牛进行多态性检测,应用SAS 9.2软件采用最小二乘拟合线性模型进行分析,结果表明,ctsd、c581t位点与雪龙黑牛的经济性状无明显的相关性,ctsl基因Xma I位点与雪龙黑牛的三角牛腩厚显著相关,且AB型个体三角牛腩厚与AA和BB型个体三角牛腩厚差异显著。

关键词：雪龙黑牛 ctsd基因 ctsl基因胴体性状

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天府肉羊ctsl、CTSH和CTSF基因克隆及其在部分组织器官中的表达分析

天府肉羊CTSL、CTSH和CTSF基因克隆及其在部分组织器官中的表达分...

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作者：黄建文四川农业大学

学位级别：硕士

肉质性状是畜禽生产中最重要的经济性状之一,因而近年来对影响畜禽肉质性状基因的研究已成为动物分子遗传育种工作的热点。组织蛋白酶(cathepsin)家族属于半胱氨酸蛋白酶类,它不仅能水解肌纤维中的蛋白,而且还能使动物的结缔组织变松散... 详细信息

肉质性状是畜禽生产中最重要的经济性状之一,因而近年来对影响畜禽肉质性状基因的研究已成为动物分子遗传育种工作的热点。组织蛋白酶(cathepsin)家族属于半胱氨酸蛋白酶类,它不仅能水解肌纤维中的蛋白,而且还能使动物的结缔组织变松散,进而影响到肉的嫩度。在猪、牛和鱼类的有关研究结果表明,组织蛋白酶基因家族成员可以作为影响畜禽的肉质性状候选基因,但在山羊方面却未见有类似报道。本研究运用RT-PCR结合克隆测序方法分别获得了天府肉羊ctsl基因、CTSH基因、CTSF基因的全编码区序列。结果显示,天府肉羊ctsl基因长1103bp包括有1005bp的开放阅读框,编码334个氨基酸,序列提交得到登录号：KF953544.1。ctsl氨基酸存在信号肽,含有17个磷酸化位点,属于亲水性非跨膜蛋白。序列预测表明ctsl氨基酸序列含有两个保守的结构域,即inhibitor29结构域和Pept1结构域。氨基酸序列同源性分析显示天府肉羊ctsl氨基酸序列和其它哺乳动物之间有很高的相似性。氨基酸序列同源性分析和系统进化分析显示天府肉羊ctsl与绵羊ctsl具有很近的遗传关系。ctsl的二级结构以a螺旋和无归卷曲为主。天府肉羊CTSH基因长1043bp包括有1008bp的编码区,编码335个氨基酸,序列提交得到登录号：KJ650499。CTSH氨基酸存在信号肽,有11个磷酸化位点,属于亲水性非跨膜蛋白。CTSH也含有inhibitor29结构域和Pept1结构域。氨基酸序列同源性分析和系统进化分析显示天府肉羊CTSH和其它哺乳动物的CTSH有很近的遗传关系。CTSH二级结构以a螺旋和无归卷曲为主。天府肉羊CTSF基因长1477bp包括有1383bp的编码区,编码460个氨基酸,序列提交得到登录号：KJ650498。它含有28个磷酸化位点,存在信号肽序列,属于亲水性非跨膜蛋白。氨基酸序列同源性分析和系统进化分析显示天府肉羊CTSF与牛和绵羊的CTSF具有很近进化关系。CTSF二级结构以a螺旋和无归卷曲为主。实时荧光定量分析了12月龄天府肉羊ctsl基因、CTSH基因和CTSF基因在心肌、肝脏、肺、肾脏、胸肌、腹殖肌、股二头肌和膈肌等8个组织的相对表达情况,及其在1日龄、6月龄、12月龄和18月龄阶段天府肉羊的肺和股二头肌组织中相对表达的情况。结果显示,ctsl基因、CTSH基因和CTSF基因在8个组织中都有表达,且都是在肺中的表达量最高。在肺中,3个基因的相对表达量都是随年龄的增加而呈现先升高再降低的趋势：在股二头肌组织中,ctsl基因和CTSH基因随着年龄的增长在股二头肌中的相对表达量呈现先降低再升高的趋势,CTSF基因的相对表达量则呈现先升高再降低再升高的趋势。蛋白质免疫印迹(Westren Bloting)分析了CTSH蛋白在12月龄天府肉羊8个组织中的相对表达情况。结果显示,在所有8个组织中都检测到了有表达,股二头肌的相对表达量最高,极显著高于其它所有组织(P<0.01);然后依次是胸肌、肝脏、肾脏、腹殖肌、膈肌、心脏和肺。

关键词： ctsl基因 CTSH基因 CTSF基因序列分析组织表达

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