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Transcriptional Wiring of Cell Wall-Related Genes in Arabidopsis

Molecular Plant 2009年第5期2卷 1015-1024页

作者： Marek Mutwil colin Ruprecht Federico M. Giorgi Martin Bringmann Bjorn Usadel Staffan Persson Max-Planck-lnstitute for Molecular Plant Physiology Am Muhlenberg 1 14476 Potsdam Germany

Transcriptional coordination, or co-expression. of genes may signify functional relatedness of the corresponding proteins. For example, several genes involved in secondary cell wall cellulose biosynthesis are co-expressed with genes engaged in the synthesis of xylan, which is a major component of the secondary cell wall. To extend these types of analyses, we investigated the co-expression.relationships of all Carbohydrate-Active enZYmes （CAZy）-related genes for Arabidopsis thaliana. Thus, the intention was to transcriptionally link different cell wall-related processes to each other, and also to other biological functions. To facilitate easy manual inspection, we have displayed these interactions as networks and matrices, and created a web-based interface （http：***） containing downloadable files for all the transcriptional associations.

关键词： Cell walls bioinformatics Arabidopsis co-expression.

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