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Chromatin-binding in vivo of the erythroid kruppel-like factor,EKLF,in the murine globin loci

Cell Research 2006年第4期16卷 347-355页

作者： Yu-Chiau Shyu Shau-Ching Wen Tung-Liang Lee Xin Chen Chia-Tse Hsu Hsin Chen Ruei-Lin Chen Jau-Lang Hwang Che-Kun James Shen Institute of Molecular Biology Academia SinicaNankangTaipei 115 Institute of Life Sciences National Defense UniversityNei-huTaipei 114 Division of Biotechnology and Pharmaceutical Research National Health Research InstitutesZhunan TownMiaoli County 350 ~

EKLF is an erythroid-specific,zinc finger-containing transcription factor essential for the activation of the mamma-lian beta globin gene in erythroid cells of definitive *** have prepared a polyclonal anti-mouse EKLF antibodysuitable for Western blotting and immunoprecipitation(IP)qualities,and used it to define the expression patterns of theEKLF protein during mouse erythroid *** have also used this antibody for the chromatin-immunoprecipi-tation(ChIP)*** was found to bind in vivo at both the mouse beta-major-globin promoter and the HS2 site ofbeta-LCR in the mouse erythroleukemia cells(MEL)in a DMSO-inducible *** DMSO-induced bindings ofEKLF as well as three other proteins,namely,RNA polymerase Ⅱ,acetylated histone H3,and methylated histone H3,were not abolished but significantly lowered in CB3,a MEL-derived cell line with null-expression of p45/NF-E2,anerythroid-enriched factor needed for activation of the mammalian globin ***,binding of EKLF in vivowas also detected in the mouse alpha-like globin locus,at the adult alpha globin promoter and its far upstream regula-tory element alpha-MRE(HS26).This study provides direct evidence for EKLF-binding in vivo at the major regulatoryelements of the mouse beta-like globin gene clusters the data also have interesting implications with respect to the roleof EKLF-chromatin interaction in mammalian globin gene regulation.

关键词： EKLF mutine globin gene clusters chromatin-immunoprecipitation (CHIP) chromosome structure

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