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QSAR prediction of antagonistic activity of PCBs towards human PXR by using heuristic method and best subset modeling

引用

Science China Chemistry 2012年第7期55卷 1459-1466页

作者： ZHANG YiMing YANG XuShu SUN Cheng WANG LianSheng School of Basic Medical Sciences Nanjing Medical UniversityNanjing 210029China School of Pharmacy Nanjing Medical UniversityNanjing 210029China State Key Laboratory of Pollution Control and Resources Reuse School of Environment Nanjing UniversityNanjing 210093China

Polychlorinated biphenyls(PCBs) can antagonize human pregnane X receptor(hPXR) *** chemicals could pose a serious threat to the reproductive and developmental ability of *** quantitative structure activity relationship(QSAR) provides a promising method for the estimation of PCBs' antagonistic *** this investigation,a QSAR model was developed by using heuristic method and best subset modeling(r2 = 0.873,q2LOO=0.742).The built model was validated externally by splitting the original data set into training and prediction *** results of the model derived are as follows:r2 = 0.907,q2LOO=0.709,r2pred=0.676,suggesting developed QSAR model had good robustness and predictive *** applicability domain(AD) of the model was assessed by Williams *** antagonistic activity(?logKi) of 108 PCBs,which are unavailable by experiment at present,was predicted within the applicability domain of the *** critical structural features related to the activity of PCBs were identified.

关键词： polychlorinated biphenyls (PCBs) human pregnane X receptor (hPXR) heuristic method best subset modeling method quantitative structure-activity relationship (QSAR)

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