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HLA polymorphism of the zhuang population reflects the common HLA characteristics among zhuang-Dong language-speaking populations

引用

Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology) 2011年第6期12卷 428-435页

作者： Li SHI Xiao-qin HUANG Lei SHI Yu-fen TAO Yu-feng YAO Liang YU Ke-qin LIN Wen YI Hao SUN Katsushi TOKUNAGA Jia-you CHU Institute of Medical Biology Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College Kunming 650118 China Department of Human Genetics Graduate School of Medicine University of Tokyo Tokyo 113-0033 Japan Department of Human Genetics Graduate School of Medicine University of Tokyo Tokyo 113-0033 Japan Department of Human Genetics Graduate School of Medicine University of Tokyo Tokyo 113-0033 Japan

A study of the human leukocyte antigen （HLA） genetic characteristics in the zhuang, the largest ethnic population in China, would provide insight into zhuang history and give a useful tool for disease associations, transplantation, and anthropology. In the present study, we report the comprehensive HLA-A, HLA-B, HLA-C, and HLA-DRB1 alleles and haplotypes in the zhuang population of southern China for the first time. A total of 13 HLA-A, 24 HLA-B, 22 HLA-C, and 18 HLA-DRB1 were identified in 104 zhuang individuals. The frequencies of HLA-A＊11：01, A^＊02：07, A^＊24：02, A^＊02：03, and A^＊33：03 on A loci, B^＊15：02, B^＊58：01, B^＊46：01, and B^＊13：01 on B loci, C^＊03：04, C^＊08：01, C^＊01：02, C^＊03：02, and C^＊07：02 on C loci, and DRBl＊15：01, DRBl^＊16：02, DRB1^＊14：01, DRBl^＊15：02, and DRBI^＊03：01 on the DRB1 loci were 〉10%. The A^＊33：03-C^＊03：02-B^＊58：01-DRBl^＊03：01 and A^＊02：07-C^＊01：02- B^＊46：01-DRB1^＊14：01 haplotypes were predominant in the zhuang. The phylogenetic tree, as well as the analysis of haplotypes, suggested that the zhuang are genetically similar to southern Chinese populations, especially the zhuang-Dong language-speaking populations, such as the Bouyei, Dai, and Maonan. Even though the zhuang and southern Chinese populations shared common alleles and haplotypes, the zhuang has maintained its unique genetic characteristics.

关键词： Human leukocyte antigen (HLA) alleles Haplotypes zhuang population

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