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D2003,allele of vp8 in maize,regulate the plant height development

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D2003,allele of Vp8 in maize,regulate the plant height devel...

2011全国植物生物学研讨会

作者： Hongkun Lv,Jun Zheng,Yunsu Shi,Tianyu Wang,Guoying Wang~* Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081

We have identified a maize dwarf mutant,d2003,from the K36 inbred *** mutant displays stable dwarf phenotype with less than one-third of K36 plant height, and with more but severe short *** genetic analysis showed that the dwarf phenotype of d2003 was controlled by a single nuclear recessive gene.A large segregating F2 population consisting of more 7,000 recessive individuals was constructed and used to fine map and clone the target gene,*** D2003 was narrowed and located in the BAC AC210968,which contains vp8 and three predicted *** sequence comparisons involving the four genes showed that only vp8 gene was polymorphic,and the mutant d2003 has a single-base insertion in the first exon of vp8,which has the effect of creating a premature stop *** maize vp8

关键词： Maize D2003 vp8 plant height

来源： cnki会议评论

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vp8解码算法研究及帧内预测硬件实现

VP8解码算法研究及帧内预测硬件实现

作者：赵亮天津大学

学位级别：硕士

随着信息技术的迅速发展,视频信息已经成为人类生活和生产中不可或缺的重要元素。数字视频编解码技术和超大规模集成电路技术的迅猛发展使得视频解码芯片及其应用越来越广泛,视频解码芯片呈现出广阔的市场空间和发展前景。在市场需求的... 详细信息

随着信息技术的迅速发展,视频信息已经成为人类生活和生产中不可或缺的重要元素。数字视频编解码技术和超大规模集成电路技术的迅猛发展使得视频解码芯片及其应用越来越广泛,视频解码芯片呈现出广阔的市场空间和发展前景。在市场需求的巨大推动力作用下,对视频编解码标准及其有效实现方法的研究已经成为业界探索的一个重要课题。 vp8视频是全球著名的互联网公司Google于2010年5月开源的一种全新的视频压缩格式,意在为网络开发一个高质量的、开放的视频格式,每一个人都可以自由免费的获取,在视频会议、网络电视、IPTV、互联网流媒体应用等领域潜在着广阔的应用前景。本文对vp8视频解码标准进行了深入的探索和研究,并详细分析了vp8视频解码器主要模块的算法原理。本文在分析一款已商业使用的视频解码器的SoC设计方案的基础上,提出了vp8视频解码器的整体实现结构和软/硬件划分方案,并着重分析了vp8视频解码帧内预测算法,结合芯片中H264、AVS视频的帧内预测模块硬件设计结构,给出了vp8帧内预测模块的硬件融合方案。最后对该方案进行了Verilog HDL语言实现,并使用Modelsim软件进行了功能仿真验证,同时通过ALTERA公司的Quartus II软件在FPGA平台上进行了综合,对设计的综合性能进行了分析。

关键词： vp8 帧内预测 SoC 硬件加速 FPGA

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vp8实时视频编码器软件实现及优化

VP8实时视频编码器软件实现及优化

作者：杨金凤西安电子科技大学

学位级别：硕士

自On2Technologies于2008年9月13日推出vp8，Google又于2010年2月收购了On2Technologies，并在5月举行的Google I/O开发者大会上正式宣布将vp8以BSD许可证的形式开源，揭开了新一轮互联网多媒体之争的序幕vp8除了具有明显的技术提升外... 详细信息

自On2Technologies于2008年9月13日推出vp8，Google又于2010年2月收购了On2Technologies，并在5月举行的Google I/O开发者大会上正式宣布将vp8以BSD许可证的形式开源，揭开了新一轮互联网多媒体之争的序幕vp8除了具有明显的技术提升外，不同于需要收取专利授权费用的H.264标准，实现了完全的免费开源与授权开放同时用户无需拥有高端的PC或移动设备也能够享受到vp8的视频质量，目前vp8已得到广泛应用及业界的高调支持本课题以Google主推的vp8视频编码器为研究对象先搭起了整个编码器的架构，而后先实现了I帧版本，再设计实现IP帧版本IP帧版本的实现是基于I帧版本的，在预测模块加入了帧间预测模块，以实现P帧中的帧间预测模式此外，为解决软件在硬件芯片中应用中碰到的内存问题及实现复杂性问题，从两个角度出发来对模型中进行了优化：1.从芯片内存角度优化在给芯片提供解决方案的时候，必须考虑芯片内存利用情况软件实现中对MV预测方法与熵编码残差与MV的概率更新模型进行优化旧的模型对存储空间的要求很大,新的优化算法为：熵编码概率更新模型采用上一帧编码后的更新概率，当前帧每个宏块编码后立即进行熵编码一帧所有宏块均编码完后进行熵编码概率更新，就得到了下一帧熵编码的概率2.从硬件实现角度优化旧有模式判决方法涉及到除法操作，但是ARM在硬件上不支持除法指令，采用其他替换方法会消耗较多的软件运行时间，一般都可以考虑如何优化以避免除法消耗过多的CPU运行时间vpX的模式选择失真代价衡量模型设计涉及除法，对于硬件实现来说比较困难所以考虑到硬件实现的复杂度，将所有模式判决方法全部采用SAD模型结合优化前后的性能测试结果，可以看到优化后的模型压缩性能并没有降低

关键词： vp8 实时性软件实现优化

基于Cortex-A8平台的vp8视频解码优化

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基于Cortex-A8平台的VP8视频解码优化

作者：宋文海华中科技大学

学位级别：硕士

随着移动平台的飞速发展，移动智能设备用户对视频的消费需求越来越大。硬件解码的方式虽然在性能方面可以满足流畅播放的要求;但是受限于编码方式和封装格式的限制，不能满足用户观看各种格式的视频的需求。因此，需要利用移动智能设... 详细信息

随着移动平台的飞速发展，移动智能设备用户对视频的消费需求越来越大。硬件解码的方式虽然在性能方面可以满足流畅播放的要求;但是受限于编码方式和封装格式的限制，不能满足用户观看各种格式的视频的需求。因此，需要利用移动智能设备的硬件特性，对软件解码进行优化，以便为用户带来更好的视频播放体验。 vp8是Google提出的针对下一代互联网标准的视频格式。它拥有良好的网络亲和性，广泛的设备适应性，使低性能设备也可以获得良好的播放效果，因此可以更好地满足移动智能设备用户的需求。经历了几代的更新与发展，ARM（Advanced RISC Machine）处理器已经成为大部分移动设备处理器的选择。其中，Cortex-A8是目前使用最广泛的ARM处理器架构。Cortex-A8架构基于ARMv7指令集，带有NEON（Advanced SIMD，业界称为NEON）协处理器，具有很强的多媒体程序加速功能。基于Cortex-A8平台，利用NEON对vp8视频进行解码优化具有很广泛的市场前景。在介绍了Cortex-A8的各项新技术的基础之上，着重对基于SIMD技术的NEON协处理器进行了深入分析，包括SIMD技术的基本优化原理，NEON协处理器架构与寄存器特性等，并选用手工编写汇编代码的方式作为vp8视频解码的优化方法。深入解析了vp8解码流程，对其中的解码模块进行算法分析，结合解码器整体性能测试结果，对耗时较多并且适合SIMD优化的反量化反变换、运动补偿和去块滤波模块进行NEON优化。针对反量化反变换模块，利用NEON寄存器高效地实现矩阵变换;针对运动补偿，利用亚像素插值计算方式一致的特点实现并行计算;针对去块效应滤波，对算法进行微调，去掉判断分支，以实现并行滤波。最后基于开源视频编解码器FFmpeg具体实现了NEON优化方法，并对各组视频片段进行测试，测试结果表明，NEON优化方法实际效果比较理想。以解码速度作为性能指标，可以使vp8视频解码性能提高40%以上;尤其是运动幅度较大的视频，优化效果可以达到70%以上。

关键词：移动平台 vp8 Cortex-A8 NEON协处理器单指令多数据流

一种基于vp8编码的Webp图片压缩格式研究

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单片机与嵌入式系统应用 2012年第3期12卷 40-43页

作者：李莲魏石磊天津理工大学自动化学院天津300384

Webp是一种基于vp8编码的新型图片压缩技术,采用了Fancy采样算法和针对同一图片的不同区域分别压缩等技术。对比Web上最为流行的JPEG图片格式,在保证图片质量基本不变的情况下保证更高的压缩比。采用PSNR和SSIM对Webp和JPEG图片压缩格... 详细信息

Webp是一种基于vp8编码的新型图片压缩技术,采用了Fancy采样算法和针对同一图片的不同区域分别压缩等技术。对比Web上最为流行的JPEG图片格式,在保证图片质量基本不变的情况下保证更高的压缩比。采用PSNR和SSIM对Webp和JPEG图片压缩格式进行对比测试,并对图片进行数据压缩和还原测试。实验结果表明,Webp图片压缩格式具有很高的实用价值。

关键词： Webp vp8 JPEG PSNR 压缩比图片质量

Brucella spp. Lumazine synthase as a novel immunomodulator to produce egg yolk antibodies

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Advances in Bioscience and Biotechnology 2012年第1期3卷 80-86页

作者： Demian Bellido Pablo Chacana Marina Mozgovoj Diego Gonzalez Fernando Goldbaum Andrés Wigdorovitz María José Dus Santos Fundación Instituto Leloir Buenos Aires Argentina Institute Instituto de Virología INTA Castelar Hurlingham Argentina

Lumazine synthase from Brucella spp. (BLS) is a highly immunogenic decameric protein. It has been previously described as a carrier of peptides or proteins to increase their immunogenicity in different animal species, but its activity has never been evaluated in chickens. In this work, the use of BLS to improve the antibody response against bovine rotavirus (BRV) vp8d protein in laying hens was assessed. vp8d is the inner domain of the vp8 spike protein which preserves the sialic acid binding activity and the neutralizing epitopes present in the viral protein. Hens were immunized three times with 2 μg of vp8d alone or fused to BLS. Hens inoculated with BLSvp8d developed higher antibody titers (evaluated by ELISA and viral neutralization test) than hens immunized either with vp8d alone or the mixture of vp8d and BLS. Furthermore, IgY antibodies against BLSvp8d were able to fully protect mice against challenge with virulent BRV in a dose-depent-manner. Overall, these results demonstrate that BLS is a potent immonumodulator that enhances the antibody response in hens, thus increasing the concentration of specific IgY in the egg yolk, one of the main issues to be adressed in order to improve the use of the IgY technology.

关键词： BLS vp8 Bovine Rotavirus IgY

BmCPV对家蚕细胞RNAi系统的抑制及BmCPVS8片段功能研究

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BmCPV对家蚕细胞RNAi系统的抑制及BmCPVS8片段功能研究

作者：许健苏州大学

学位级别：硕士

RNA干扰(RNAi)是一种在真核生物中广泛存在的基因表达调控机制,在昆虫细胞抗病毒感染过程中也发挥着重要的作用。在病毒感染细胞时,一些昆虫病毒也能编码RNAi抑制蛋白从而抑制宿主细胞的RANi抗病毒效果,促进病毒感染。家蚕质型多角体病... 详细信息

RNA干扰(RNAi)是一种在真核生物中广泛存在的基因表达调控机制,在昆虫细胞抗病毒感染过程中也发挥着重要的作用。在病毒感染细胞时,一些昆虫病毒也能编码RNAi抑制蛋白从而抑制宿主细胞的RANi抗病毒效果,促进病毒感染。家蚕质型多角体病毒(Bombyx mori cytoplasmic polyhedrosis virus,BmCPV)是呼肠孤病毒科(Reoviridae)质型多角体病毒属(Cypovirus)的典型种。探明BmCPV感染对宿主细胞RNAi的影响、BmCPV抑制宿主细胞RNAi系统的机制、BmCPV S8片段的功能对理解病毒与宿主的相互作用有重要帮助,也有可能为病毒防治提供分子靶标。目前已发现BmCPV基因组能成为家蚕中肠组织细胞中的RNAi通路的靶,有关BmCPV在感染过程中能否能通过编码某种蛋白抑制RNAi系统从而促进病毒感染的研究还未涉及。有关S8片段的功能研究,总体还停留在通过序列比对进行推测阶段,还没有功能方面的研究。为了验证家蚕细胞利用外源RNA干扰(exo-RNAi)抗病毒通路抑制病毒的入侵与增殖,在本研究中,我们通过高通量测序检测了感染BmCPV的Bm N细胞中病毒来源的small RNA(vs RNA)。结果显示,在感染BmCPV的Bm N细胞中存大量BmCPV来源的vs RNA,其大小分布主要集中在19nt,推测是病毒基因组ds RNA被宿主细胞的Dicer-2切割形成;统计分析结果显示,起源于病毒基因组S3和S4ds RNA片段上的vs RNA较多;所有vs RNA均与病毒基因组ds RNA的正链匹配;与病毒基因组比对结果显示,病毒基因组S3、S4和S10 ds RNA片段上存在vs RNA的高匹配区(hot spots),表明vs RNA的生成存在片段以及片段区域偏好性;切割位点的保守性分析结果显示,在vs RNA的5’和3’端的切割位点附近存在碱基偏好性。已有的研究表明,病毒感染宿主昆虫时,宿主细胞利用自身exo-RNAi通路抵抗病毒入侵和增殖,同时,病毒基因组也会编码RNAi抑制蛋白,与宿主细胞的RNAi系统对抗。为了探讨BmCPV是否能抑制Bm N细胞中的RNAi通路以及在病毒基因组编码的10个蛋白中是否也存在RNAi抑制蛋白,我们将萤火虫荧光素酶基因的特异性小干扰RNA或双链RNA(si RNA或ds RNA)与双荧光素酶报告基因表达载体共转染到BmCPV感染的Bm N细胞中,通过检测分析双荧光素酶相对活性研究BmCPV感染对Bm N细胞中RNAi的效果影响;我们还将萤火虫荧光素酶基因特异性siRNA与双荧光素酶报告基因表达载体共转染到表达单个BmCPV病毒蛋白的转基因细胞中,检测BmCPV病毒蛋白对Bm N细胞中RNAi的影响。结果显示,BmCPV感染能抑制Bm N细胞中siRNA诱导的RNAi,对dsRNA诱导的RNAi没有显著影响;BmCPV表达的病毒蛋白vp8能抑制siRNA诱导的RNAi。业已明确BmCPV表达的病毒蛋白vp8能抑制BmN细胞中si RNA诱导的RNAi,但作用机制还未明确。BmCPV基因组由十个ds RNA片段(S110)组成,vp8为S8片段编码的病毒非结构蛋白。对S8片段的功能研究结果显示,过表达vp8蛋白可促进BmCPV的增殖,vp8在Bm N细胞和酵母细胞中均定位在细胞质。荧光定量PCR结果显示,vp8抑制细胞中Dcr2、Apa和Cyt基因表达。细胞流式实验检测结果显示,过表达vp8基因会促进BmN细胞增殖。Co-IP筛选及质谱鉴定vp8的互作蛋白,结果显示vp8与线粒体抑制素复合物蛋白2、核酸内切酶-逆转录酶、VIG蛋白和TCTP等蛋白以及与转录翻译有关的因子、酶互作。酵母细胞生长实验显示,BmCPV vp6-vp10(多角体蛋白)对酵母细胞生长均有不同程度的抑制效果,其中vp8蛋白对酵母细胞毒性最大。共定位实验表明vp8蛋白在酵母中与Dcp2蛋白共定位、在家蚕细胞中可与Ago2共定位。

关键词： BmCPV RNAi vsRNA vp8

基于WebRTC和Jingle的融合通信研究与实现

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基于WebRTC和Jingle的融合通信研究与实现

作者：贺世茂华南理工大学

学位级别：硕士

目前，随着互联网越来越广泛，各种应用增长迅速，而视频通话的需求一直在不断增长。如今，已经不是一种终端统一整个通信，市面上各种终端的出现，对于人们来说融合通信的需求越来越紧迫。而浏览器的便捷性，使基于浏览器的应用也越来... 详细信息

目前，随着互联网越来越广泛，各种应用增长迅速，而视频通话的需求一直在不断增长。如今，已经不是一种终端统一整个通信，市面上各种终端的出现，对于人们来说融合通信的需求越来越紧迫。而浏览器的便捷性，使基于浏览器的应用也越来越普遍，随着WebRTC技术的出现，无须插件支持的基于浏览器的视频通话成为了现实，而目前在全球浏览器厂商中越来越多的厂商加入到WebRTC技术的大潮中。另一方面，随着开源的普及，支持XMPP协议的即时通信也成为众多厂商的选择。对于Jingle协议，作为XMPP协议的扩展协议，由于支持P2P，以及语音视频也逐渐展现出潜力和未来发展的趋势，因此本文基于标准在研究WebRTC的视频通话技术以及Jingle对语音视频的支持基础上，继续研究了两种异构网络的实现的可能性，并通过采取融合网关的形式来将两种异构网络联系起来。本文通过研究实现的可能性，提出来两种融合方案，并设计了两者融合的整体架构，对信令网关和媒体网关进行了设计，以及信令交互流程，信息流等进行了详细设计。之后对信令网关和媒体网关进行了实现。信令网关主要实现协议转换，媒体网关主要实现vp8和H.264的RTP打包和解包，以及vp8和H.264的编解码转换。最后，通过对融合网关的性能和功能进行了测试分析。功能性测试上，设置测试点进行功能性测试，测试均通过，并对画面采用主观性评价测试方法进行了功能测试，画面表现正常。性能测试分为丢包率测试和延迟测试。丢包率测试方面，客户端发送到融合网关的丢包率在1%以下。对信令包进行分析，测试丢包率为0%，编解码延迟测试上，从H.264到vp8编解码耗时33.02ms，从vp8到H.264的编解码延迟在25.04ms。测试结果满足了实时的要求。说明了融合网关设计的合理性和可行性。从标准上实现了WebRTC和Jingle之间的互通。

关键词： WebRTC Jingle 融合网关 vp8 H.264

猪轮状病毒vp融合蛋白的表达纯化及其生物学活性研究

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猪轮状病毒VP融合蛋白的表达纯化及其生物学活性研究

作者：姚帅武汉大学

学位级别：硕士

猪轮状病毒(Porcine Rotavirus,PRV)属于呼肠孤病毒科(Reoviridae)轮状病毒属(Rotavirus)。作为重要病原之一,猪轮状病毒在全世界各个养猪国家引起了仔猪病毒性腹泻。由猪轮状病毒所引起的病毒性感染无论是单独感染或者交叉感染在猪群... 详细信息

猪轮状病毒(Porcine Rotavirus,PRV)属于呼肠孤病毒科(Reoviridae)轮状病毒属(Rotavirus)。作为重要病原之一,猪轮状病毒在全世界各个养猪国家引起了仔猪病毒性腹泻。由猪轮状病毒所引起的病毒性感染无论是单独感染或者交叉感染在猪群中均普遍存在,由此造成仔猪的患病甚至死亡给猪养殖业造成了巨大的经济损失。猪轮状病毒外衣壳蛋白主要由vp8与vp7组成,vp8与vp7是猪轮状病毒外膜上的主要中和抗原,能够刺激机体产生体液免疫和黏膜免疫,从而激发机体的免疫保护作用,因此具有以vp8与vp7为基础研制抗猪轮状病毒疫苗的潜力。蛋白转导结构域(Protein Transduction Domains,PTD)是一类分子量一般小于20个氨基酸的多肽,在多数情况下也被称为细胞穿膜肽(Cell Penetrating Peptides,CPPs)。研究表明,穿膜肽具有能够携带多种物质,如蛋白、核酸、纳米颗粒、多肽等物质越过细胞屏障而进入细胞的能力。TAT属于PTD成员,是HIV-1中的一个转录激活因子,该蛋白中包含一个11个氨基酸序列的短肽,该短肽能够介导与之相连的外源物质穿过细胞屏障,进入多种组织中。本研究人工合成重组基因vp8-vp7-TAT基因片段,将其连接至pGEX-6p-1表达载体。以测序正确质粒为模板,PCR扩增获得的vp8-TAT、vp7-TAT,连接至pGEX-6p-1表达载体,由此构建了重组质粒pGEX-vp8-vp7-TAT、pGEX-vp8-TAT、pGEX-vp7-TAT。将重组质粒 pGEX-vp8-vp7-TAT、pGEX-vp8-TAT、pGEX-vp7-TAT 分别转化 EschierichiacoliBL21(DE3),构建了含有vp8-vp7-TAT的大肠杆菌基因工程菌株*** BL21(DE3)(pGEX-vp8-vp7-TAT)、含有vp8-TAT的大肠杆菌基因工程菌株Ecoli BL21(DE3)(pGEX-vp8-TAT)和含有vp7-TAT的大肠杆菌基因工程菌株*** BL21(DE3)(pGEX-vp7-TAT)。该基因工程菌株经IPTG诱导表达,分析结果显示:*** BL21(DE3)(pGEX-vp8-vp7-TAT)、*** BL21(DE3)(pGEX-vp8-TAT)、*** BL21(DE3)(pGEX-vp7-TAT)经诱导表达和纯化后分别获得融合蛋白vp8-vp7-TAT、vp8-TAT 和 vp7-TAT。三种融合蛋白 vp8-vp7-TAT、vp8-TAT和vp7-TAT分子量与预期大小59.9kDa、56.3kDa和31.4kDa相符合。经Western Blot试验证明,该三种融合蛋白均可以和抗-GST抗体发生特异性反应。采用纯化的融合蛋白vp8-vp7-TAT、vp8-TAT、vp7-TAT分别以腹腔注射和灌胃的方式免疫小鼠,间接ELISA方法分别检测血清中特异性IgG抗体及粪便黏膜IgA抗体。结果显示,融合蛋白vp8-vp7-TAT经注射或灌胃免疫小鼠后,能够有效诱导小鼠机体产生体液免疫应答,并且融合蛋白vp8-vp7-TAT经灌胃可诱导小鼠机体产生较强的黏膜免疫应答。融合蛋白vp8-vp7-TAT相较vp8-TAT、vp7-TAT,能诱导小鼠机体产生更强的免疫应答,具有更强的免疫原性。融合蛋白vp8-vp7-TAT的穿肠实验结果表明,融合蛋白vp8-vp7-TAT具有穿肠活性。融合蛋白vp8-vp7-TAT经小鼠安全性实验表明具有很好的安全性。本研究为猪轮状病毒(PRV)口服疫苗的研究提供了一种新的思路。

关键词：猪轮状病毒 vp8 vp7 蛋白转导域免疫原性穿肠