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A multiplex method for detection of SARS-CoV-2 variants based on MALDI-TOF mass spectrometry

Biosafety and Health 2023年第2期5卷 101-107页

作者： Ziyuan Zhao Liying Sun Liqin Wang Xiaodong Li Junping Peng NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens Institute of Pathogen BiologyChinese Academy of Medical Sciences&Peking Union Medical CollegeBeijing 100730China Key Laboratory of Respiratory Disease Pathogenomics Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeBeijing 100730China Shimadzu China Innovation Center Shimadzu CorporationBeijing 100020China

The recent outbreak of the coronavirus disease 2019(COVID-19)pandemic and the continuous evolution of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)have highlighted the significance of new detection methods for global monitoring and *** quantitative reverse transcription PCR(RT-qPCR),the current gold standard for diagnosis,performs excellently in genetic testing,its multiplexing capability is limited because of the signal crosstalk of various ***,we present a highly effi-cient platform which combines 17-plex assays with matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry(MALDI-TOF MS),enabling the targeting of 14 different mutation sites of the spike *** using a set of 324 nasopharyngeal swabs or sputum clinical samples with SARS-CoV-2 MS method was identical to that with the *** detection consistency of mutation sites was 97.9%(47/48)com-pared to Sanger sequencing without cross-reaction with other respiratory-related ***,the MS method is highly potent to track and assess SARS-CoV-2 changes in a timely manner,thereby aiding the continuous response to viral variation and prevention of further transmission.

关键词： COVID-19 SARS-CoV-2 Multiplexing capability MALDI-TOF mass spectrometry viral variation

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