检索结果-南通市图书馆

药物生物技术 2024年第4期 331-337页

作者：潘成佳吉丽娜华子春南京大学生命科学学院医药生物技术全国重点实验室江苏省产业技术研究院医药生物技术研究所常州南京大学高新技术研究院南京吉芮康生物科技研究院

胶原蛋白是一个复杂而庞大的家族，人胶原蛋白肽链的相对分子质量高达45～344 kD,共有44个家族成员。为了揭示人胶原蛋白的进化机制，本研究构建了人胶原蛋白的进化树，分析了其氨基酸序列中结构域和保守基序(motif)的种类及分布特点。... 详细信息

胶原蛋白是一个复杂而庞大的家族，人胶原蛋白肽链的相对分子质量高达45～344 kD,共有44个家族成员。为了揭示人胶原蛋白的进化机制，本研究构建了人胶原蛋白的进化树，分析了其氨基酸序列中结构域和保守基序(motif)的种类及分布特点。结果发现人胶原蛋白具有14种结构域和10个motif,同一种结构域中往往包含相同的motif,进化树中同一分支上的胶原蛋白肽链也往往具有种类相同的结构域。在人胶原蛋白的非胶原结构域中，vwc结构域(von Willebrand factor type C domain)位于COL1A1、COL2A1、COL3A1和COL5A2中，这4种胶原蛋白位于人胶原蛋白全长序列进化树的同一分支上，但该分支中仅有COL1A2不包含vwc结构域。对不同物种COL1A2的N端序列进行多序列比对结果表明：COL1A2的vwc结构域在无脊椎动物向脊椎动物进化的过程中丢失。VWA结构域(von Willebrand factor type A domain)是胶原蛋白肽链中分布最广的非胶原结构域，存在于12种人胶原蛋白肽链中。VWA结构域蛋白质序列的BLAST比对结果表明，VWA结构域在人胶原蛋白的肽链之间复制。C4结构域(C-terminal tandem repeated domain intype 4 procollagen)只存在于IV型胶原蛋白中，对人胶原蛋白的C4结构域构建进化树，结果显示C4结构域中的C4-1和C4-2两个结构域进化速度一致，具有协同进化的现象。因此，胶原蛋白以结构域为基本进化单位，在进化中出现重复、缺失或协同进化的现象。

关键词：胶原蛋白进化分析结构域序列比对保守基序 VWA结构域 vwc结构域 C4结构域

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