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Biochemical Characterization of uracil-DNA Glycosylase from Pyrococcus furiosus

Chemical Research in Chinese Universities 2012年第3期28卷 477-482页

作者： L1N Li-bo LIU Yu-fen LIU Xi-peng LIU Jian-hua Key Laboratory of Microbial Metabolism School of Life Sciences&BiotechnologyShanghai Jiaotong UniversityShanghai 200240P.R.China

We report the characterization of a uracil-DNA glycosylase（UDG） from the hyperthermophilic archaea Pyrococcus furiosus（P, furiosus）. P. furiosus UDG（PfUDG） has high sequence similarity to the families IV and V UDGs（thermostable UDG family and PaUDG-b family）. PfUDG excises uracil from various DNA substrates with the following order： U/T=U/C〉U/G=U/AP=U/-〉U/U=U/I=U/A. The optimal temperature and pH value for uracil exci- sion by PfUDG are 70 ℃ and 9.0, respectively. The removal of U is inhibited by the divalent ions of Fe, Ca, Zn, Cu, Co, Ni and Mn, as well as a high concentration of NaC1. The phosphorothioates near uracil strongly inhibit the exci- sion of uracil by PfUDG. Interestingly, pfuDNA（Pyrococcusfuriosus DNA） polymerase, which tightly binds the ura- cil-carrying oligonucleotide, does not inhibit the excision by ***, suggesting PfUDG in vivo functions as the re- pair enzyme to excise uracil damage in genome.

关键词： Pyrococcus furiosus(P furiosus) uracil DNA glycosylase(UDG) Pyrococcus furiosus DNA polymeras uracil repair in hyperthermophile

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