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石榴ufgt基因克隆与表达特征

石榴UFGT基因克隆与表达特征

第四届中国石榴博览会暨第十届全国石榴生产与科研研讨会、...

作者：招雪晴沈雨苑兆和南京林业大学林学院南京林业大学南方现代林业协同创新中心

[目的]为了研究ufgt(UDP-类黄酮糖基转移酶)基因在石榴果皮花色苷合成中的作用。[方法]本研究以‘泰山红’石榴为试材,测定总花色苷含量,克隆ufgt基因并对数据进行生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,分析ufgt基因在果... 详细信息

[目的]为了研究ufgt(UDP-类黄酮糖基转移酶)基因在石榴果皮花色苷合成中的作用。[方法]本研究以‘泰山红’石榴为试材,测定总花色苷含量,克隆ufgt基因并对数据进行生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,分析ufgt基因在果实不同发育阶段的表达量,分析ufgt基因表达与总花色苷含量之间的相关性。[结果]在石榴果皮中获得了一个ufgt基因,命名为Pgufgt1,在NCBI的登录号为MW574958。该基因序列长度为1152 bp,编码383个氨基酸,属碱性不稳定蛋白,亲水性较强,不属于分泌蛋白,没有跨膜结构域,位于叶绿体中。进化树分析发现其与荔枝(AHK12773),可可(XP07042805)亲缘关系较近。qRT-PCR结果表明,Pgufgt1在果实发育前期表达量较低,中后期的表达量升高。相关性分析结果表明,Pgufgt1表达量与总花色苷含量具有一定的正相关性。[结论]石榴Pgufgt1可能在石榴果皮花色苷合成中起一定作用。

关键词：石榴 ufgt 基因克隆基因相对表达量花色苷

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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洋葱ufgt基因的克隆和表达分析

核农学报 2015年第9期29卷 1677-1686页

作者：张洪伟梁毅刘小义谭武平北京市农林科学院蔬菜研究中心/农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/北京京研益农科技发展中心北京100097 中国质量认证中心北京100070

为了研究洋葱ufgt基因的生物学功能及其与花青素合成之间的关系,通过简并PCR技术和RACE技术克隆了2条洋葱ufgt基因全长c DNA序列Ac ufgt1和Ac ufgt2。序列分析表明,这2个基因编码450和475个氨基酸残基组成的多肽链,包含糖基转移酶的保... 详细信息

为了研究洋葱ufgt基因的生物学功能及其与花青素合成之间的关系,通过简并PCR技术和RACE技术克隆了2条洋葱ufgt基因全长c DNA序列Ac ufgt1和Ac ufgt2。序列分析表明,这2个基因编码450和475个氨基酸残基组成的多肽链,包含糖基转移酶的保守序列PSPG框,且分别与美洲葡萄和烟草ufgt蛋白相似性较高;系统进化分析表明,它们分别与海枣及二穗短柄草的亲缘关系较近,但是二者的亲缘关系却较远;表达分析表明,这2个基因均在红皮洋葱鳞茎中大量表达,在黄皮和白皮洋葱中几乎不表达;在鳞茎膨大初期表达量最大,并在之后表达量缓慢降低,不同的是Ac ufgt2在鳞茎膨大后期缓慢上升;花青素含量测定发现红皮洋葱中含量最高,黄皮、白皮洋葱含量很低,而鳞茎膨大初期大量积累、之后缓慢积累、最后稍有下降。本研究初步证明了这2个ufgt基因与洋葱花青素合成有关系,为进一步探究洋葱花青素的生物合成途径提供了理论依据。

关键词：洋葱花青素 ufgt 基因表达

葡萄浆果着色与ufgt和MYBA基因表达量的关系研究

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南京农业大学学报 2013年第4期36卷 30-36页

作者：任国慧陶然王晨孙欣房经贵南京农业大学园艺学院江苏南京210095

以避雨栽培条件下葡萄品种的‘京秀’‘巨星’‘甬优一号’和‘藤稔’为试验材料,分析了葡萄浆果着色差异的原因并进行相关分析,同时调查研究了这4个品种葡萄浆果生长发育过程中的主要性状指标以及果皮色泽的变化规律,并对花色苷合成相... 详细信息

以避雨栽培条件下葡萄品种的‘京秀’‘巨星’‘甬优一号’和‘藤稔’为试验材料,分析了葡萄浆果着色差异的原因并进行相关分析,同时调查研究了这4个品种葡萄浆果生长发育过程中的主要性状指标以及果皮色泽的变化规律,并对花色苷合成相关重要基因的表达进行了分析。结果表明:4个品种葡萄果穗先着色的部位是果穗肩部,果粒先着色的部位是果粒尖部和中部。在葡萄成熟过程中,4个品种葡萄果面光泽明亮度(L*值)和颜色组分b*值均下降,颜色组分a*值以及红色葡萄果实颜色指数(CIRG)均增大。同时,4个品种葡萄的花色苷含量与其可溶性固形物及CIRG均呈正相关,‘京秀’‘巨星’‘藤稔’和‘甬优一号’的可溶性固形物含量与花色苷含量的相关系数分别为0.804 4、0.953 4、0.932 4和0.911 6;CIRG与花色苷含量的相关系数分别为0.821 0、0.946 0、0.996 6和0.856 9。基因表达结果显示,4个葡萄品种的UDP-类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶基因(ufgt)均在成熟时表达最高,MYBA1和MYBA2基因的表达量则在转色到成熟中后期较高。

关键词：葡萄着色 ufgt MYBA 基因表达

酵母双杂诱饵表达载体pGBKT7-ufgt的构建与表达

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分子植物育种 2018年第4期16卷 1147-1153页

作者：董燕梅张鹏飞张小军高燕温鹏飞山西农业大学园艺学院太谷030801

构建葡萄赤霞珠(Vitis vinifera *** Cabernet Sauvignon)花色苷合成前体酶——类黄酮葡萄糖基转移酶(UDPG-flavonoid-3-O-glycosyltranferase,ufgt)诱饵表达载体。通过RT-PCR扩增获得葡萄ufgt基因CDS序列,与p GBKT7酵母诱饵载体连接;经测序和双酶切鉴定后,转化酵母菌株AH109,分析ufgt蛋白在酵母菌株中的表达情况。成功扩增出ufgt基因CDS全长,并成功构建了p GBKT7-ufgt,重组载体p GBKT7-ufgt成功的转化到AH109酵母菌株中,且无毒和自激活性,能够正确稳定的表达。p GBKT7-ufgt酵母诱饵蛋白表达载体被成功构建,为后续ufgt蛋白互作筛选奠定基础。

关键词： ufgt 诱饵蛋白酵母双杂交

云南特有火把梨ufgt基因片段的克隆与序列分析

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西南林业大学学报（自然科学） 2016年第1期36卷 21-27,43页

作者：孟富宣周军王大玮陶磅董娇徐世宏段淋渊 Fu Haihui 云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室云南昆明650224 云南省农业科学院热区生态农业研究所云南元谋651300 西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室云南昆明650224 西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省农业科学院园艺作物研究所云南昆明650000 中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所云南昆明650223

为研究ufgt基因对红皮梨花色素苷合成的调控机制,以云南特有火把梨为试材,克隆得到ufgt的基因片段,运用生物信息学分析软件对该基因序列进行分析。结果表明:ufgt基因片段长1 440 bp,编码479个氨基酸的蛋白质;该氨基酸序列与沙梨、西洋... 详细信息

为研究ufgt基因对红皮梨花色素苷合成的调控机制,以云南特有火把梨为试材,克隆得到ufgt的基因片段,运用生物信息学分析软件对该基因序列进行分析。结果表明:ufgt基因片段长1 440 bp,编码479个氨基酸的蛋白质;该氨基酸序列与沙梨、西洋梨、白梨、苹果和樱桃李的同源性分别为99%、96%、94%、91%和72%;蛋白无跨膜结构,不存在导肽和信号肽,属于非分泌蛋白,定位在胞液;结构功能域分析显示该片段含典型的GT1_Gtf_Like功能域和1个GTB型超家族蛋白的典型结构。

关键词：火把梨 ufgt 基因克隆生物信息学

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几种经济植物ufgt基因的生物信息学分析

基因组学与应用生物学 2011年第1期30卷 92-102页

作者：付海辉辛培尧许玉兰刘岩韦援教董娇曹有龙周军西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室西南林业大学昆明650224 宁夏农林科学院枸杞工程技术研究中心银川750002

本文根据在GenBank中已登录的葡萄、玉米、水稻、草莓、拟南芥和苹果等植物的类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶基因的核苷酸序列和氨基酸序列,应用生物信息学软件预测了其理化性质、疏水性/亲水性、导肽、跨膜结构、卷曲螺旋结构、二级结构、... 详细信息

本文根据在GenBank中已登录的葡萄、玉米、水稻、草莓、拟南芥和苹果等植物的类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶基因的核苷酸序列和氨基酸序列,应用生物信息学软件预测了其理化性质、疏水性/亲水性、导肽、跨膜结构、卷曲螺旋结构、二级结构、功能结构域及高级结构,并构建了类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶蛋白家族的系统进化树。结果表明这几种植物的ufgt基因核苷酸序列除葡萄存在2个外显子外,其它植物均存在1个外显子。含量最丰富的氨基酸是Leu、Ala、Gly、Val和Ser等,除葡萄、苹果ufgt属于不稳定类蛋白外,其余均属于稳定类蛋白。进一步研究分析表明,这几种植物ufgt蛋白存在明显的疏水区和亲水区、信号肽、跨膜结构以及卷曲螺旋。二级结构组成上比例相似,并且都由α-螺旋、延伸链和无规则卷曲所组成。它们都存在UDPGT、COG1819和MGT等保守域。除了拟南芥外,其它几种植物都能够通过同源建模建立ufgt蛋白的三维结构。进化分析表明,把它们的ufgt基因分成5个类群,其中3个大类群,另外陆地棉和野芭蕉的ufgt基因分别单独成一类。本工作将为深入研究该蛋白在植物花、果实和叶片等器官颜色变化中发挥的功能,开展生物大分子结构模拟以及药物设计提供抛砖引玉的作用。

关键词： ufgt 生物信息学同源建模进化树

葡萄ufgt基因克隆、表达及UV-C照射诱导规律的研究

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葡萄ufgt基因克隆、表达及UV-C照射诱导规律的研究

作者：焦文娟山西农业大学

学位级别：硕士

花色苷（Anthocyanins）,不仅能够提高植株适应和抵御逆境的能力,而且具有明显的保健功能,是决定红葡萄酒品质和感官质量的重要因素之一。植物体内ufgt是合成花色苷的最后一个关键酶,直接影响花色苷的含量。本试验以赤霞珠（Vitis vinif... 详细信息

花色苷（Anthocyanins）,不仅能够提高植株适应和抵御逆境的能力,而且具有明显的保健功能,是决定红葡萄酒品质和感官质量的重要因素之一。植物体内ufgt是合成花色苷的最后一个关键酶,直接影响花色苷的含量。本试验以赤霞珠（Vitis vinifera *** Cabernet Sauvignon）葡萄为试材,在获得ufgt基因全长的基础上,制备多克隆抗体;定期对葡萄植株进行UV-C照射,在转录和翻译水平上研究UV-C照射对ufgt表达和花色苷积累的影响,主要结果如下：扩增葡萄果实ufgt基因全长1371 bp,并构建克隆载体。将克隆载体与表达载体pET-30a进行双酶切,重组得到表达载体pET-ufgt。优化蛋白表达条件,使ufgt蛋白高效表达并纯化,以此为抗原,免疫新西兰白兔,制备ufgt多克隆抗体。以赤霞珠葡萄果实为试材,研究对照和UV-C照射10 min后ufgt对花色苷含量变化规律的影响。采用荧光定量技术分析ufgt基因表达规律,结果表明UV-C照射10 min并未明显诱导ufgt基因的表达,其表达规律与对照大致相同;采用Western-blotting技术,分析ufgt蛋白含量变化规律,结果表明UV-C处理10 min没有改变ufgt蛋白的变化规律,但明显诱导了ufgt蛋白的积累;采用高效液相色谱技术和分光光度计法分别分析ufgt酶活性和花色苷含量的变化规律,结果表明UV-C照射10min后ufgt酶活性和花色苷含量均都高于对照;分析可知对照和UV-C照射10 min后花色苷含量与ufgt基因表达、蛋白含量及酶活性均呈显著正相关。由ufgt生物信息学分析可得,ufgt蛋白由456个氨基酸残基组成,分子量大小约为50 kDa,可能包含信号肽与蛋白跨膜结构,其二级结构由35.53% α-螺旋、16.67%延伸链和47.81%无规则卷曲组成。分析亲缘性可知,赤霞殊葡萄ufgt蛋白与山葡萄的同源性最高.与草莓同源性次之,与玉米的同源性较低。

关键词：葡萄果实花色苷 ufgt UV-C

高丛越桔ufgt基因电子克隆和生物信息学分析

同方学位论文库评论

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同方学位论文库

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现代农业科技 2017年第6期 81-84页

作者：信小娟马伟李玉成黑龙江省大兴安岭农林科学院黑龙江大兴安岭165000 黑龙江中医药大学大兴安岭林管局

[目的]通过电子克隆技术对高丛越桔ufgt基因进行预测。[方法]以笃斯越橘ufgt序列为探针,基于NCBI中高丛越桔的EST数据库和CAP3在线软件进行序列拼接,利用生物信息学数据库及相关软件对其结构和功能进行预测分析。[结果]高丛越桔ufgt基... 详细信息

[目的]通过电子克隆技术对高丛越桔ufgt基因进行预测。[方法]以笃斯越橘ufgt序列为探针,基于NCBI中高丛越桔的EST数据库和CAP3在线软件进行序列拼接,利用生物信息学数据库及相关软件对其结构和功能进行预测分析。[结果]高丛越桔ufgt基因全长1 789 bp,包含1 161 bp的开放阅读框,编码386个氨基酸,该蛋白为亲水性蛋白。[结论]本研究为进一步解释基因的分子功能奠定理论及实验基础。

关键词：高丛越桔 ufgt 电子克隆生物信息学

The anthocyanin's role on the food metabolic pathways,color and drying processes:An experimental and theoretical approach

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Food Bioscience 2022年第3期47卷 91-110页

作者： Sandra Peñaloza Cornelio Delesma Jesús Muñiz López-Ortiz A. Instituto de Energías Renovables Universidad Nacional Autónoma de MéxicoPriv.Xochicalco s/nCol.CentroTemixco62580MorelosMexico

This review is intended to cover the works related to the anthocyanin behavior in food that is subjected to *** experimental and theoretical results available in scientific literature are *** increase in anthocyanin concentration has been observed upon thermal ***,a conclusive explanation is still *** accessible studies suggest an increase in concentration during maturations,which could be related to the enzymatic *** possible enzymes involved in such a procedure have also been covered,including their role played in the *** possible activation mechanisms and the related factors such as temperature,pH,oxygen contents and the presence of UV-light irradiation were also ***,the metabolic pathways were also explored including experimental evaluation and theoretical models based on atomistic methodologies such as density functional theory(DFT).This review is aimed to provide a comprehensive overview of the probable mechanisms behind the increase of anthocyanin concentration during drying.

关键词： Anthocyanin Metabolic pathway PAL CHS ufgt HPLC Theoretical model