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MDA-TOEPGA:A novel method to identify miRNA-disease association based on two-objective evolutionary programming genetic algorithm

引用

BIOCELL 2022年第8期46卷 1925-1933页

作者： BUWEN CAO JIAWEI LUO SAINAN XIAO XIANGJUN ZHOU College of Information and Electronic Engineering Hunan City UniversityYiyang413000China College of Computer Science and Electronic Engineering Hunan UniversityChangsha410082China

The association between miRNA and disease has attracted more and more *** now,existing methods for identifying miRNA related disease mainly rely on top-ranked association model,which may not provide a full landscape of association between miRNA and *** there is strong need of new computational method to identify the associations from miRNA group *** this paper,we proposed a framework,MDA-TOEPGA,to identify miRNAdisease association based on two-objective evolutionary programming genetic algorithm,which identifies latent miRNAdisease associations from the view of functional *** understand the miRNA functional module in diseases,the case study is *** have been compared MDA-TOEPGA with several state-of-the-art functional module *** results showed that our method cannot only outperform classical algorithms,such as K-means,IK-means,MCODE,HC-PIN,and ClusterONE,but can also achieve an ideal overall performance in terms of a composite score consisting of f1,Sensitivity,and ***,our study showed that MDA-TOEPGA is a promising method to investigate miRNA-disease association from the landscapes of functional module.

关键词： MiRNA functional module MiRNA-disease association two-objective Evolutionary programming genetic algorithm

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