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番茄PLC基因家族鉴定及抗番茄褐色皱果病毒(tobrfv)防御反应分析

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核农学报 2023年第2期37卷 230-240页

作者：方远鹏韦建明李云洲贵州大学农学院植物病理教研室贵州贵阳550025

番茄褐色皱果病毒(tobrfv)被我国列为检疫性病毒,严重威胁番茄的安全生产。为了明确番茄磷脂酶C(PLC)的种类,探究番茄PCL在植株抗tobrfv防御反应过程中的潜在作用。本研究首先基于生物信息学鉴定了10个番茄PLC家族成员,其中特异性磷脂酶... 详细信息

番茄褐色皱果病毒(tobrfv)被我国列为检疫性病毒,严重威胁番茄的安全生产。为了明确番茄磷脂酶C(PLC)的种类,探究番茄PCL在植株抗tobrfv防御反应过程中的潜在作用。本研究首先基于生物信息学鉴定了10个番茄PLC家族成员,其中特异性磷脂酶C(PI-PLC)7个,非特异性磷脂酶C(NPC)3个,7个PI-PLC蛋白均具备3个核心结构域(PLC_X c、PLC_Y c、C2)和1个EF_hand-like结构域,3个NPC蛋白均只具有Phosphoesterase结构域。10个番茄PLC蛋白按照结构相似度可以划分为7个分支,分别为NPC1、NPC2、NPC6、PI-PLC2、PI-PLC3、PI-PLC4、PI-PLC6。另外,10个番茄PLC蛋白的二级结构占比类似,但三级结构存在明显差异。共线性分析结果显示,番茄PLC基因与水稻、拟南芥、雷蒙德式棉PLC基因间分别存在3、12、16对共线性关系。最后,通过转录组测序方法,检测了PLC基因家族在接种tobrfv后的相对表达水平,结果显示,SlNPC1、SlNPC6、SlPLC4在tobrfv接种的样本中表达水平较高,其他PLC基因则在tobrfv接种后表达水平降低。本研究为番茄抗tobrfv研究和育种奠定了技术与理论基础。

关键词：番茄 PLC基因家族生物信息学抗病毒 tobrfv

Robust molecular detection of the new Tomato brown rugose fruit virus in infected tomato and pepper plants from Turkey

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Journal of Integrative Agriculture 2021年第8期20卷 2170-2179页

作者： Hakan FIDAN Pelin SARIKAYA Kubra YILDIZ Bengi TOPKAYA Gozde ERKIS Ozer CALIS Plant Protection Department Faculty of AgricultureAkdeniz UniversityThe CampusKonyaalti 07070AntalyaTurkey Plant Health Department Bati Akdeniz Agricultural Research Institute(BATEM)Muratpasa 07050AntalyaTurkey Antalya Directorate of Agricultural Quarantine Republic of Turkey Ministry of Agriculture and ForestryMuratpasa 07050AntalyaTurkey

Tomato brown rugose fruit virus(tobrfv)causes severe fruit loss in tomato(Solanum lycopersicum)and pepper(Capsicum annuum)plants.It is an emerging Tobamovirus that is spreading globally.The major challenge is to develop a reliable method for the detection of the virus,and to better characterize the symptoms it causes.The aims of this study,therefore,were to characterize the symptom development on tomato and pepper plants,and to establish a reliable detection method for the virus.Following infection of the tomato and pepper plants with tobrfv,the leaves turned chlorotic,mosaic or mottled,while the fruit became rugose,necrotic and marbled,and showed discoloration with yellow or brown spots.Transmission electron microscopy(TEM)revealed single rod-like virus particles characteristic of the Tobamoviruses.Classical reverse transcription PCR(RT-PCR)and quantitative PCR(qPCR)with specific primers and probes confirmed that the virus is tobrfv.We found that the resistance genes from tomato,Tm-2^(2),and pepper,L1,L2,L3 and L4,did not confer resistance to tobrfv.Here,we present a PCR-based method as a diagnostic test for detecting tobrfv in infected seeds.This method will help to prevent further spread of the virus in commercial seeds.

关键词： tomato pepper Tobamovirus tobrfv resistance

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番茄褐色皱纹果病毒分子检测与鉴定

中国蔬菜 2023年第6期 34-40页

作者：王少骅陈利达石延霞谢学文李磊范腾飞李宝聚柴阿丽中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜生物育种全国重点实验室北京100081

利用3对番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,tobrfv)特异性引物对云南红河、宁夏银川、北京顺义疑似病毒病样本进行RT-PCR检测,分别扩增出大小为812、842、1053 bp的特异性条带。对扩增产物进行测序及系统进化分析,发... 详细信息

利用3对番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,tobrfv)特异性引物对云南红河、宁夏银川、北京顺义疑似病毒病样本进行RT-PCR检测,分别扩增出大小为812、842、1053 bp的特异性条带。对扩增产物进行测序及系统进化分析,发现云南、宁夏、北京的tobrfv分离物与约旦、意大利、荷兰的tobrfv分离物聚在同一分支上,亲缘关系较近。致病性结果显示,接种后的番茄植株表现出与田间相同的症状,且在发病组织中检测到病毒tobrfv。表明来自云南红河、宁夏银川、北京顺义的番茄植株均被tobrfv侵染。

关键词：番茄褐色皱纹果病毒分子检测 tobrfv RT-PCR

警惕新型病毒tobrfv（番茄褐色皱纹果病毒）

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农业工程技术 2019年第19期 79-79页

番茄褐色皱纹果病毒,英文全称为Tomato brown rugose fruit virus,简称tobrfv。这是一种主要在番茄上发生的病害,属于烟草花叶病毒属。该病毒主要通过人和工具进行机械传播,同时,也能通过熊蜂、鸟和病果进行传播。番茄和辣椒是该病毒的... 详细信息

番茄褐色皱纹果病毒,英文全称为Tomato brown rugose fruit virus,简称tobrfv。这是一种主要在番茄上发生的病害,属于烟草花叶病毒属。该病毒主要通过人和工具进行机械传播,同时,也能通过熊蜂、鸟和病果进行传播。番茄和辣椒是该病毒的主要寄主。tobrfv于2014年在约旦和以色列首次从番茄上鉴定出来。此后在美国加利福尼亚州也

关键词： tobrfv 新型病毒

法国确认发现番茄褐色皱纹果病毒（tobrfv）危害

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农业工程技术 2020年第4期 77-77页

2020年2月11日,在法国温室中发现了疑似感染番茄褐色皱纹果病毒(tobrfv)的植物。2月17日,法国农业部根据国家食品、环境及劳动卫生署(ANSES)提供的分析结果,证实了菲尼斯泰尔省Finistere一处温室番茄农场受污染的情况,确认该温室tobrfv... 详细信息

2020年2月11日,在法国温室中发现了疑似感染番茄褐色皱纹果病毒(tobrfv)的植物。2月17日,法国农业部根据国家食品、环境及劳动卫生署(ANSES)提供的分析结果,证实了菲尼斯泰尔省Finistere一处温室番茄农场受污染的情况,确认该温室tobrfv检测结果呈阳性,该公司的两个温室正在处理被感染的植物。目前尚不清楚植物是如何被污染的。根据农业部的说法,病毒植株来自英国,但种子源于荷兰。还有三家法国番茄公司也受到密切观察。

关键词： tobrfv