检索结果-南通市图书馆

中国艰难梭菌高分离株和欧洲流行高毒株tcdA、tcdb基因转录及其毒素的表达（英文）

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国人兽共患病学报 2014年第1期30卷 1-6页

作者：李先平李文革王晶卢金星中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的研究和比较中国艰难梭菌A-B+高分离株BJ08和欧洲流行A+B+高毒株(BI/NAP1/027)UK1的tcdA、tcdb转录和毒素表达。方法每隔3h提取艰难梭菌和培养上清,用实时荧光定量PCR的方法测定各个时间段BJ08和UK1菌株tcdA、tcdb基因的表达;用ELIS... 详细信息

目的研究和比较中国艰难梭菌A-B+高分离株BJ08和欧洲流行A+B+高毒株(BI/NAP1/027)UK1的tcdA、tcdb转录和毒素表达。方法每隔3h提取艰难梭菌和培养上清,用实时荧光定量PCR的方法测定各个时间段BJ08和UK1菌株tcdA、tcdb基因的表达;用ELISA的方法检测BJ08和UK1菌株各个时间段的细胞和培养上清液中A毒素、B毒素的含量。结果 BJ08的生长速率显著大于UK1;BJ08不表达A毒素,但是检测到tcdA基因的转录,tcdA基因表达量显著低于UK1;tcdb的表达以及B毒素在两种菌株的培养上清液中和声波处理的细胞内的差异都不大。结论中国艰难梭菌A-B+高分离株BJ08和欧洲流行A+B+高毒株UK1的B毒素的转录和表达没有明显差异,BJ08菌株在中国有爆发流行的可能。

关键词：艰难梭菌 tcdA tcdb

Clostridium difficile Toxin B: Insights into Its Target Genes

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

Open Journal of Applied Sciences 2022年第3期12卷 368-386页

作者： Junyi Hu Yunjie Shan Huan Yang Xuzhou Key Laboratory of Laboratory Diagnostics School of Medical Technology Xuzhou Medical University Xuzhou China

Clostridium difficile is a grossly Gram-positive anaerobic bacterium that has been a key factor in inducing imbalances in the gut microbiota in recent years, leading to intestinal-associated inflammation. The main pathogenic toxins of Clostridium difficile are toxin A (TcdA) and toxin B (tcdb). tcdb is the main pathogenic factor of Clostridium difficile infection. This review revealed the pathogenic mechanism of Clostridium difficile toxin B, expounded the impact of Clostridium difficile on the intestinal system, and predicted the genes on which tcdb may act, thereby providing a new therapeutic target for Clostridium difficile infection, offering theoretical basis and new strategies for clinical prevention and control.

关键词： Clostridium difficile Infection tcdb Gene Regulation

艰难梭菌引起抗感染免疫的主要致病因子及其基因功能的研究进展

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

免疫学杂志 2013年第4期29卷 357-360页

作者：曹波李先平程颖中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室医院感染室北京102206

艰难梭菌是医院感染性腹泻中最常见的病原菌之一,在过去10年中,由于ribotyping 027型等高毒菌株的出现,全球艰难梭菌感染相关性疾病发病率显著上升,已经成为欧美许多国家法定传染病必报的监测病原。致病艰难梭菌的毒力因子主要包括A毒素... 详细信息

艰难梭菌是医院感染性腹泻中最常见的病原菌之一,在过去10年中,由于ribotyping 027型等高毒菌株的出现,全球艰难梭菌感染相关性疾病发病率显著上升,已经成为欧美许多国家法定传染病必报的监测病原。致病艰难梭菌的毒力因子主要包括A毒素和B毒素,刺激机体发生免疫应答。除外A、B毒素,少数艰难梭菌还产生二元毒素。本文对近年来艰难梭菌引起机体抗感染免疫的相关致病因子及其基因功能的最新研究进展进行了回顾和总结,并重点探讨了主要致病因子A毒素和B毒素结构功能及基因表达调控特征,包括构建A、B毒素分子模型,致病基因编码区多态性特征,以及负向调控因子tcdC的变异及影响,对未来疫苗靶位点的筛选以及艰难梭菌致病机制中信号转导研究具有指导意义。

关键词：艰难梭菌抗感染免疫 A毒素 B毒素 tcdA tcdb 二元毒素

Occurrence of Toxigenic Clostridium difficile in Louisiana Oysters (<i>Crassostrea virginica</i>) and Environmental Waters

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

Food and Nutrition Sciences 2015年第11期6卷 1065-1070页

作者： Naim Montazeri Da Liu Marlene E. Janes 102 Food Microbiology Laboratory Agricultural Chemistry Building School of Nutrition and Food Sciences College of Agriculture Louisiana State University/AgCenter Baton Rouge Louisiana USA

Clostridium difficile infection (CDI) was generally considered as a hospital-associated disease;however, recent community-acquired CDI has raised the concerns regarding the transmission of the pathogen through environmental sources. Limited data are available regarding the presence of C. difficile in food and water. In this study, oysters (Crassostrea virginica) and the harvest water collected from the commercial harvesting areas along the Louisiana Gulf Coast as well as the influent and effluent of a municipal treatment plant in New Orleans, LA were analyzed for toxigenic C. difficile. The bacterium was isolated from 47.37% (9/19) of oysters and 37.5% (3/8) of harvest water samples. Toxigenic C. difficile were also detected in all the wastewater influent and effluent samples. All the isolates harbored the gene tcdb encoding the virulence factor toxin B. Further PCR-ribotyping showed that the C. difficile isolated from the oysters and harvest water differed from the wastewater isolates. However, similar ribotypes were found in oysters and the surrounding harvest water. We found that oysters growing in contaminated water could bioaccumulate toxigenic C. difficile and pose a health risks by serving as a vehicle for the transmission of the pathogen to humans.

关键词： Clostridium difficile tcdb Gene Oyster Wastewater Treatment Plant Influent Effluent

我国部分地区艰难梭菌PCR-核糖体分型及毒素基因多态性研究

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

我国部分地区艰难梭菌PCR-核糖体分型及毒素基因多态性研究

作者：王晶中国疾病预防控制中心

学位级别：硕士

目的了解我国4个地区艰难梭菌PCR-核糖体型别的分型情况,并获得该4个地区艰难梭菌临床株A、B毒素基因序列,分析其基因多态性特征,了解不同型别菌株的tcdA、tcdb序列遗传特征,并探讨可能的进化特征。同时将A、B毒素基因多态性与PCR-核糖... 详细信息

目的了解我国4个地区艰难梭菌PCR-核糖体型别的分型情况,并获得该4个地区艰难梭菌临床株A、B毒素基因序列,分析其基因多态性特征,了解不同型别菌株的tcdA、tcdb序列遗传特征,并探讨可能的进化特征。同时将A、B毒素基因多态性与PCR-核糖体分型结合分析,寻找合适位点,为深入开展流行病学调查、溯源、建立适用于我国的分子检测方法提供依据。方法选取4个地区的104株难梭菌临床分离株,分别为北京、广东、山东、河南,进行毒素基因分型、PCR-核糖体分型后,从genBank下载艰难梭菌630(A+B+菌株)和M68(A-B+菌株)的基因做为模板,对tcdA、tcdb进行引物设计、sanger测序基因全长。测序结果使用DNA序列拼装软件进行序列拼装,得到测序重叠群(contigs),再以艰难梭菌630和M68为模板,确定基因起始点和终止点。对获得的50株艰难梭菌的tcdA、tcdb序列,进行数据分析,包括：PCR-核糖体型别分类、序列碱基比对、统计碱基差异数、多态性分析(SNP)、进化分析、流行病与统计学分析。结果此次研究我们成功的获取了104株来自中国4个不同地区的临床艰难梭菌的PCR-核糖体型别,共分20个型别。我国菌株基因遗传特征与欧美不同,研究中收集到部分地区的菌株显示以RT017为优势菌株(21.15%),其次为RT046/043(15.53%),RT001(14.56%)。同时还获得了不同型别代表菌株tcdA和tcdb序列,共50个tcdA、50个tcdb序列。分析结果发现,A、B基因多态性明显。tcdA序列的非同义突变SNP和碱基缺失主要发生在受体结合区,提示该区经历过激烈的正进化选择压力。tcdb序列没有发现大片段碱基缺失的现象,但是其SNP明显高于tcdA,且菌株间的突变率也要大于tcdA,进化速率更快,其非同义突变SNP集中于glucosyltransferase domain和auto-protease domain。这种现象提示,毒素基因或整个PaLoc区存在基因重组或HGT,有利于进化中的菌株保存其优势基因序列。经过分析,PCR-核糖体型别与毒素基因序列间存在着一定的联系,如如12株RT001的序列组合均为A05804,11株RT017中9株为A11807,9株RT046/043中7株为A02802,3株RT012均为A08801。结论我国部分地区艰难梭菌临床菌株的PCR-核糖体型以RT017为主(21.15%),其次为RT046/043(15.53%),RT001(14.56%),且型别存在一定的地域性分布,北京、广东以RT017为流行株,河南以RT046/043为流行株,山东以RT001为流行株,这提示应针对不同的地区建立相应的检测方法。艰难梭菌毒素型以A+B+为主,且A、B基因变异度高,具有多态性;tcdA:SNP和大片段碱基序列缺失主要发生在3’端的受体结合区;tcdb:SNP高于tcdA,主要发生在葡糖基转移酶区。本研究对A、B基因序列组合与PCR-核糖体分型进行初步探讨分析,发现存在着一定相对应的关系,如如12株RT001的序列组合均为A05804,11株RT017中9株为A11807,9株RT046/043中7株为A02802,3株RT012均为A08801。提示可以建立一种既能反应毒素情况,又能显示菌株PCR-核糖体型别的分型方法,这对于我国快速检测和治疗艰难梭菌都有重要意义。

关键词：艰难梭菌 tcdA tcdb PCR-核糖体分型毒素基因序列

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

院内艰难梭菌感染的分子流行病学特点分析

院内艰难梭菌感染的分子流行病学特点分析

作者：王洋中国医科大学

学位级别：硕士

目的:艰难梭菌,又称难辨梭状芽孢杆菌是一种革兰氏阳性的专性厌氧芽孢杆菌。随着各种抗菌药物使用的增多,尤其是广谱抗生素的广泛使用,艰难梭菌逐渐成为抗菌药物相关性腹泻最常见的病原体。艰难梭菌感染主要的临床表现为发热、腹痛及水... 详细信息

目的:艰难梭菌,又称难辨梭状芽孢杆菌是一种革兰氏阳性的专性厌氧芽孢杆菌。随着各种抗菌药物使用的增多,尤其是广谱抗生素的广泛使用,艰难梭菌逐渐成为抗菌药物相关性腹泻最常见的病原体。艰难梭菌感染主要的临床表现为发热、腹痛及水样便腹泻;轻者呈自限性,严重者可引发伪膜性肠炎,并可出现中毒性巨结肠、肠穿孔、感染性休克等并发症,甚至最终导致死亡。在二十世纪的最后十年,CDI的发病率不断提高,以核糖体分型RT027型菌株为代表的高毒力菌株是引起艰难梭菌感染发病率的提高以及重症感染增多的主要原因。我国现在对艰难梭菌感染的监测及研究并未形成全国范围的体系,相关研究的开展由于艰难梭菌检测敏感性低并且菌株分离和培养条件苛刻,实验室操作难度较大,仅为单个医院或者科室的报道。目前,沈阳及周边地区尚未开展相关的临床感染监测与临床病原学检测,针对疑似艰难梭菌感染的患者仅能进行经验性治疗,本研究拟调查中国医科大学附属第一医院住院患者艰难梭菌感染临床特点,并分析其致病菌株的流行病学特征。方法:收集中国医科大学附属第一院出现腹泻的住院患者的便标本,使用酶联免疫荧光法对标本进行A/B毒素检测、实时荧光PCR法进行毒素基因检测、同时进行厌氧培养及鉴定。根据我国成人艰难梭菌感染的诊断和治疗专家共识,分析临床症状及实验室检测结果。根据是否符合艰难梭菌感染诊断标准,将受试者分为2组,收集受试者的临床资料分析其艰难梭菌感染的危险因素。结果:自2017年6月至2018年2月,共收集中国医科大学附属第一医院符合入组标准的44位住院患者的49份便标本。受试者主要来自重症医学科(15例)、消化科(7例)和感染科(5例)、胃肠肿瘤外科(4例)。便标本送检以8月和1月为主,阳性标本数量在11月最多,所有同一个月内的阳性标本之间也均有一定的时间间隔,且多来自不同科室,整体并未集中出现阳性的趋势。49份便标本中,毒素阳性4份,阳性率8.2%;B毒素基因阳性13份,阳性率26.53%;厌氧培养阳性13份,阳性率26.53%;二元毒素基因阳性1份,阳性率2.04%。本次检测中未检测出RT027型菌株。44例受试者中,仅4例A/B毒素、毒素B基因、厌氧培养均阳性,7例A/B毒素阴性、毒素B基因、厌氧培养均阳性,1例A/B毒素、毒素B基因均阴性、厌氧培养阳性,32例A/B毒素、毒素B基因、厌氧培养均阴性。所有受试者均具有腹泻的临床表现,且无伪膜性肠炎的诊断。11例诊断为艰难梭菌感染,1例为非产毒型艰难梭菌定植。冠心病、肾衰竭、给予三代头孢菌素和联合使用2种及以上抗菌药物P<0.05。结论:研究显示,基于Xpert和梅里埃的检测试剂盒的NAAT+EIA法可用于艰难梭菌感染的临床病原学检测,但由于样本量少,其检验效能仍需进一步验证。通过NAAT+EIA法检测得出的我院院内艰难梭菌感染25%的阳性率略高于国内其他研究19%的感染率平均值。所有CDI诊断为阳性的病例分散在多个时间段和科室,均为散发病例,研究期间未出现高毒力菌株的爆发和流行。通过比较CDI组和非CDI组的患者临床信息发现:冠心病、肾衰竭、3代头孢及联合应用抗菌药物史是艰难梭菌感染的危险因素,并未发现艰难梭菌感染存在保护因素。

关键词：艰难梭菌感染 A/B毒素流行病学 tcdb

我国部分地区艰难梭菌A/B毒素基因多态性研究

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

我国部分地区艰难梭菌A/B毒素基因多态性研究

作者：曹波中国疾病预防控制中心

学位级别：硕士

目的对我国部分地区的艰难梭菌临床分离株的tcdA、tcdb进行测序,并与国际上已公布的艰难梭菌分离株的tcdA、tcdb序列进行多态性分析和进化分析,了解不同型别菌株的tcdA、tcdb序列遗传特征,并探讨可能的进化特征,为深入开展流行病学调查... 详细信息

目的对我国部分地区的艰难梭菌临床分离株的tcdA、tcdb进行测序,并与国际上已公布的艰难梭菌分离株的tcdA、tcdb序列进行多态性分析和进化分析,了解不同型别菌株的tcdA、tcdb序列遗传特征,并探讨可能的进化特征,为深入开展流行病学调查、溯源、建立分子诊断技术奠定基础。方法选取不同来源的70株(66株来自中国不同地区)艰难梭菌临床分离株,进行毒素基因分型、MLST分型后,从genBank下载艰难梭菌630(rB+菌株)和M68(A-B+菌株)的基因做为模板,对tcdA、tcdb进行引物设计、sanger测序基因全长。测序结果使用DNA序列拼装软件进行序列拼装,得到测序重叠群(contigs),再以艰难梭菌630和M68为模板,确定基因起始点和终止点。对获得的70株艰难梭菌的tcdA、tcdb序列,以及genBank上公布的其他25株菌的A、B基因,进行数据分析,包括：序列碱基比对与分型、多态性分析(SNP)、进化分析。另外,检索有关PCR法检测艰难梭菌tcdA、tcdb的文献,将查找到的引物与所获得的tcdA、tcdb序列型别进行比对,手工统计碱基差异数,分析引物情况。最后,根据多态性分析和引物比对结果,寻找特异位点设计引物,并进行临床菌株验证。结果此次研究我们成功的获取了66株来自中国不同地区的临床艰难梭菌的tcdA和tcdb序列,以及29株国外艰难梭菌的tcdb和／或tcdA序列,总共85个tcdA、95个tcdb序列。分析结果发现,A、B基因多态性明显,之前在genBank中未曾报道过的10个TST tcdA和5个TST tcdb序列菌株均分离自我国。tcdA序列的非同义突变SNP和碱基缺失主要发生在受体结合区,提示该区经历过激烈的正进化选择压力。tcdb序列没有发现大片段碱基缺失的现象,但是其SNP明显高于tcdA,且菌株间的突变率也要大于tcdA,进化速率更快,其非同义突变SNP集中于glucosyltransferase domain(主要表现在B12、B16)和receptor binding domain(主要表现在B13、B14、B15、B16)。这种现象提示,毒素基因或整个PaLoc区存在基因重组或HGT,有利于进化中的菌株保存其优势基因序列。我国菌株基因遗传特征与欧美不同,我国部分地区以A15B13 (ST37,A-B+)为优势菌株,根据tcdA、tcdb序列遗传特征和其耐药性推定这种型别的菌株很可能对我国部分地区临床和公共卫生控制存在潜在威胁。结论这是我国一次系统性地对艰难梭菌A、B基因进行的序列分析,也是对国际上tcdA、tcdb基因库的一个补充。我们再一次肯定了A、B基因的高多态性,不同的流行株其多态性各异,有自己的特征,且我国菌株基因遗传特征与欧美不同。我国艰难梭菌流行情况复杂,研究投入有限,但面临的形势复杂、严峻,A-B+菌株分离率高,迫切地需要建立一种更好更优化的适合我国的快速分子检测方法,便于大规模地鉴定、收集菌株,进行流行病学研究,获取基线资料,此次研究的毒素基因多态性为毒素基因分子检测方法做了很好的铺垫;同时我们还有必要尽快开展基础方面的研究,对菌株毒力等方面进行进一步的探讨和验证。

关键词：艰难梭菌 tcdA tcdb 单核苷酸多态性进化

使用Real-Time PCR粪便中检测艰难梭状芽孢杆菌

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国卫生检验杂志 2008年第4期18卷 653-654页

作者：史跃杰杨玉林王海颖河南省中医院检验科郑州450002

目的:探讨Real-Time PCR对粪便检测艰难梭菌的可行性。方法:以组织培养细胞毒素试验为标准,参考艰难梭菌的毒素A/B基因相应的引物和分子信标探针,对标准菌株和粪便提取的DNA实行Real-Time PCR扩增。结果:Real-Time PCR的敏感度为96.9%;... 详细信息

目的:探讨Real-Time PCR对粪便检测艰难梭菌的可行性。方法:以组织培养细胞毒素试验为标准,参考艰难梭菌的毒素A/B基因相应的引物和分子信标探针,对标准菌株和粪便提取的DNA实行Real-Time PCR扩增。结果:Real-Time PCR的敏感度为96.9%;特异性为100%;阳性预测值为100%;阴性预测值为98.3%。结论:Real-TimePCR与传统诊断方法相比具有快速、敏感、特异等优点,可以提高艰难梭菌的检测水平。

关键词： Real-Time PCR 艰难梭状芽孢杆菌 tcdA tcdb

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

临床分离艰难梭菌毒素携带特征研究

疾病监测 2009年第3期24卷 193-195页

作者：程颖卢金星鄢盛恺贾红兵李文革中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 卫生部中日友好医院检验科

目的对医院细菌室送检粪便标本中分离出的艰难梭菌,进行毒素基因以及耐药基因的初步分析。方法将细菌室收集到的112份粪便标本,经选择性厌氧培养,谷氨酸脱氢酶(GDH)以及API 20A生化条鉴定后,分离出12株艰难梭菌,分别采用PCR的方法检测t... 详细信息

目的对医院细菌室送检粪便标本中分离出的艰难梭菌,进行毒素基因以及耐药基因的初步分析。方法将细菌室收集到的112份粪便标本,经选择性厌氧培养,谷氨酸脱氢酶(GDH)以及API 20A生化条鉴定后,分离出12株艰难梭菌,分别采用PCR的方法检测tcdA和tcdb基因、二元毒素基因,克林霉素抗性基因(ermB)。结果12株艰难梭菌中8株为毒素基因阳性,其中tcdA+tcdb+为5株,占62.5%;tcdA-tcdb+为3株,占37.5%;二元毒素基因均为阴性;耐药基因ermB阳性为4株,占50%。结论艰难梭菌tcdA-tcdb+毒株所占比例增加,临床单独检测A毒素易造成漏检;艰难梭菌耐药现象值得关注。

关键词：艰难梭菌 tcdA tcdb 二元毒素 ermB