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target binding and residence:a new determinant of DNA double-strand break repair pathway choice in CRISPR/Cas9 genome editing

引用

Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology) 2021年第1期22卷 73-86页

作者： Yili FENG Sicheng LIU Ruodan CHEN Anyong XIE Innovation Center for Minimally Invasive Technique and Device Department of General SurgerySir Run Run Shaw HospitalZhejiang University School of MedicineHangzhou 310019China Department of Biochemistry and Molecular Biology Zhejiang University School of MedicineHangzhou 310058China Institute of Translational Medicine Zhejiang University School of MedicineHangzhou 310029China

The clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated protein 9(Cas9)is widely used for targeted genomic and epigenomic modifications and imaging in cells and organisms,and holds tremendous promise in clinical *** efficiency and accuracy of the technology are partly determined by the target binding affinity and residence time of Cas9-single-guide RNA(sgRNA)at a given ***,little attention has been paid to the effect of target binding affinity and residence duration on the repair of Cas9-induced DNA double-strand breaks(DSBs).We propose that the choice of DSB repair pathway may be altered by variation in the binding affinity and residence duration of Cas9-sgRNA at the cleaved target,contributing to significantly heterogeneous mutations in CRISPR/Cas9 genome ***,we discuss the effect of Cas9-sgRNA target binding and residence on the choice of DSB repair pathway in CRISPR/Cas9 genome editing,and the opportunity this presents to optimize Cas9-based technology.

关键词： CRISPR/Cas9 genome editing Double-strand break(DSB)repair pathway choice target binding affinity target residence

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