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基于TCGA数据库分析乳腺癌中tert相关分子网络机制

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海南医学 2021年第19期32卷 2454-2461页

作者：陈运景何贵省苏亚静吴灿章敬波吴煌福海南医学院研究生院海南海口570100 海南医学院第二附属医院乳甲外科海南海口570100

目的通过TCGA数据库中的数据分析tert基因在乳腺恶性肿瘤中的表达及生物学作用。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载乳腺癌的基因表达数据与临床资料。利用R软件包进行tert表达差异分析及其与患者预后相关性;通过共表达网络及LinkedO... 详细信息

目的通过TCGA数据库中的数据分析tert基因在乳腺恶性肿瘤中的表达及生物学作用。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载乳腺癌的基因表达数据与临床资料。利用R软件包进行tert表达差异分析及其与患者预后相关性;通过共表达网络及LinkedOmics在线数据库分析共表达基因及潜在调控mRNA分子。使用Spearman和CIBERSORT算法,分析tert与肿瘤微环境的相关性。使用GDSC在线数据库分析tert基因与常见化疗药物的敏感性。通过GSEA富集分析tert可能参与的信号通路。结果 tert在乳腺癌样本中的表达水平显著上调,差异有统计学意义(Ptert基因可作为乳腺癌的独立预后因子[Ptert表达与ALKAL1、CNPY1、FSD1、GF1B、HMGB1P1等5个基因正相关及与DERA、MCM5、AC004858.1、SLCTA14、CACNA1G-AS1等5个基因呈负相关,与mir-1245、mir-337、mir-10b、mir-199a-1、mir-377等5个miRNA呈正相关。CIBERSORT算法和Spearman相关系数分析表明tert与T cells CD4 memory activated、Macrophages M0、Macrophages M1显著正相关,与Mast cells resting、T cells CD4 memory resting显著负相关。通过GDSC数据库分析表明tert的表达与达沙替尼、吉西他滨、埃罗替尼以及伊马替尼、吉非替尼、顺铂等药物的敏感性相关(Ptert可富集在核糖核酸聚合酶、错配修复、原发性免疫缺陷信号通路。结论 tert基因在乳腺癌样本中高表达及其与患者预后较差有关,表明tert基因是乳腺癌的发病机制、诊断及治疗的靶点。

关键词： tert 乳腺恶性肿瘤相关分子网络生物信息学

甲状腺癌RAS/BRAF/tert基因突变与临床病理特征的关系

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诊断病理学杂志 2020年第4期27卷 250-254页

作者：鲁涛高洁周良锐陆俊良林岩松吴焕文中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科北京100730 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院核医学科北京100730

目的研究甲状腺癌5种驱动基因RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和tert突变与临床病理特征的关系,以期细化甲状腺癌主要驱动基因突变的人群特征,在临床实践中为患者提供更精准的分子分型检测指导。方法回顾性收集319例甲状腺癌患者的临床病理... 详细信息

目的研究甲状腺癌5种驱动基因RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和tert突变与临床病理特征的关系,以期细化甲状腺癌主要驱动基因突变的人群特征,在临床实践中为患者提供更精准的分子分型检测指导。方法回顾性收集319例甲状腺癌患者的临床病理特征和5种基因突变状态资料,分析各基因突变状态与患者年龄、性别、病理类型的相关性。结果 319例患者的RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和tert突变频率分别为5. 3%、45. 1%和12. 9%。其中37例患者检出双基因突变(11. 6%);BRAF和tert共突变发生频率最高,为9. 4%;其次为NRAS/tert共突变4例。RAS和BRAF的突变状态与患者病理类型显著相关(均Ptert突变在乳头及滤泡性癌中均可见,在滤泡性癌中比例增高,但无统计学意义。此外,RAS/BRAF/tert基因突变患者的平均年龄分别为52. 5岁、44. 6岁和59. 5岁,均显著高于总体平均年龄(40岁)(P tert驱动基因突变与患者的病理分型及年龄相关。青少年甲状腺癌患者RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和tert驱动基因突变发生频率极低,在临床实践中需有针对性的设计基因检测方案。

关键词：甲状腺癌 RAS BRAF tert 年龄病理分型

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胶质瘤中tert启动子突变的研究进展

河南医学研究 2017年第6期26卷 1018-1019页

作者：张成娟魏冰郭永军郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院分子病理科河南郑州450008

胶质瘤是中枢神经系统肿瘤中发病率最高、治疗最困难、预后最差的原发性肿瘤,发现有效的胶质瘤诊治分子靶点和预后预测分子标志物具有重要的科学意义和临床应用价值。目前,分子生物学的迅速发展给神经肿瘤学研究带来了一场深刻的变革,... 详细信息

胶质瘤是中枢神经系统肿瘤中发病率最高、治疗最困难、预后最差的原发性肿瘤,发现有效的胶质瘤诊治分子靶点和预后预测分子标志物具有重要的科学意义和临床应用价值。目前,分子生物学的迅速发展给神经肿瘤学研究带来了一场深刻的变革,特别是胶质瘤的基础研究和临床研究的所有领域。本文就胶质瘤中最新发现的端粒酶逆转录酶（telomerase reverse transcriptase,tert）的启动子突变进行探讨,

关键词：胶质瘤 tert 基因突变研究进展

rs2853677多态性通过影响Snail1对tert的转录调控造成肺癌易感

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rs2853677多态性通过影响Snail1对TERT的转录调控造成肺癌易感

温下肠腑方对大肠癌模型大鼠端粒酶活性及tert表达的影响

第十一届全国免疫学学术大会

作者：徐星天津医科大学

研究目的:确定肺癌高相关性SNPs,揭示SNPs与肺癌易感性个体差异的内在分子机制。方法:本研究通过基因型分析与GWAS(全基因组关联性分析)技术对已报道的6个肺癌相关SNPs与临床患者基因型进行对比关联,获取肺癌相关性SNP位点。通过慢病毒... 详细信息

研究目的:确定肺癌高相关性SNPs,揭示SNPs与肺癌易感性个体差异的内在分子机制。方法:本研究通过基因型分析与GWAS(全基因组关联性分析)技术对已报道的6个肺癌相关SNPs与临床患者基因型进行对比关联,获取肺癌相关性SNP位点。通过慢病毒介导的Snail1过表达分析Snail1与rs2853677对tert转录表达的协同作用。通过luciferase assay研究rs2853677的"C-T"转变对tert启动子转录活性的影响。通过3C(染色质高级构象捕获)技术在分子水平对肺癌高相关性rs2853677转录活化原癌基因tert的表观遗传调控机制进行验证。结果:实验基于对391例肺癌患者和337例正常人的基因型鉴定,发现rs2853677-C与肺腺癌发生具有高相关性。rs2853677位于tert基因第二个内含子内,luciferase assay证明该内含子为tert基因的一个增强子。3C实验证实这个增强子与tert基因启动子直接相互作用促进tert基因的表达。rs2853677位于Snail1蛋白的结合位点,Snail1结合于rs2853677-T的增强子,可以阻止增强子和启动子之间相互作用,抑制tert基因表达。rs2853677-C破坏了Snail1的结合位点,使Snail1不能抑制tert基因的表达,客观上允许了Snail1与tert表达"双高"情况的出现,促进了肿瘤的发生与发展。结论:rs2853677通过改变Snail1对tert基因增强子的结合能力影响个体的肺癌易感性。该发现为肺癌的预测与诊断提供了一个潜在的靶点。

关键词：肺癌 SNPs tert Snail1 增强子

来源： cnki会议评论

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山东中医杂志 2011年第7期30卷 495-497页

作者：季旭明欧阳兵于华芸吴智春山东中医药大学山东济南250355

目的:探讨温下肠腑方对大肠癌大鼠端粒酶活性及tert表达的影响。方法:用1,2-二甲基肼(DMH)腹腔注射建立大鼠大肠癌模型,TRAP-PCR银染法检测端粒酶活性,免疫荧光法观察tert表达。结果:在5周、10周、15周、20周、23周各时间点,模型组大鼠... 详细信息

目的:探讨温下肠腑方对大肠癌大鼠端粒酶活性及tert表达的影响。方法:用1,2-二甲基肼(DMH)腹腔注射建立大鼠大肠癌模型,TRAP-PCR银染法检测端粒酶活性,免疫荧光法观察tert表达。结果:在5周、10周、15周、20周、23周各时间点,模型组大鼠端粒酶活性表达均显著高于正常对照组(Ptert表达显著高于正常对照组(Ptert表达均显著低于模型组(Ptert表达而抑制大肠癌发生发展。

关键词：大肠癌温下肠腑方端粒酶 tert

探讨脑胶质瘤中IDH1/2、tert基因分布的相关性及其意义

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原位杂交法检测不同发育阶段小鼠睾丸中tert mRNA的表达

世界最新医学信息文摘（连续型电子期刊） 2021年第23期21卷 6-9页

作者：李秋燕黄发明张凯元谷云艳莫彦妮夏春波朱琳桂林医学院临床医学院广西桂林 541000 桂林医学院附属医院病理科广西桂林 541000 桂林医学院基础医学院广西桂林 541000

目的探讨在脑胶质瘤不同病理级别中IDH1/2基因突变与tert基因启动子区突变的分布规律及两者之间的联系性.方法采集桂林医学院附属医院神经外科于2016年1月至2019年12月期间行脑胶质瘤切除术并且经病理确诊为脑胶质瘤患者的60例肿瘤组... 详细信息

目的探讨在脑胶质瘤不同病理级别中IDH1/2基因突变与tert基因启动子区突变的分布规律及两者之间的联系性.方法采集桂林医学院附属医院神经外科于2016年1月至2019年12月期间行脑胶质瘤切除术并且经病理确诊为脑胶质瘤患者的60例肿瘤组织标本,采用实时荧光定量PCR技术检测IDH1/2基因突变与tert基因启动子区突变在不同病理级别脑胶质瘤中的分布情况.结果在60例脑胶质瘤中,IDH1/2基因突变26例(总突变率43.33％),其中低级别组突变率60.87％(14/23)明显高于高级别组突变率32.43％(12/37),且差异具有统计学意义(Ptert基因启动子区总突变率53.33％(32/60),其中23例C228T位点突变,9例C250T位点突变.低级别组突变率65.22％(15/23)明显高于高级别组突变率45.95％(17/37),且差异具有统计学意义(Ptert相关性检测结果显示,IDH1/2基因突变和tert基因启动子区突变呈负相关(r=-0.396,Ptert基因启动子区突变均更倾向低级别脑胶质瘤患者且IDH1/2与tert基因分布呈负相关,二者在脑胶质瘤的发生、发展过程的基因表达层面上可能存在相互影响.

关键词：脑胶质瘤 IDH1/2 tert

来源：评论

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实用医技杂志 2004年第9B期11卷 1808-1811页

作者：牛姗姗刘玉华张敏陕西师范大学生命科学学院陕西西安710061 陕西省血液中心陕西西安710061

本实验应用原位杂交方法检测出生后 10d～ 90d雄性小鼠睾丸中tertmRNA表达及定位。原位杂交方法 (Insituhybridization)结果显示 :① 10d雄性小鼠睾丸的曲细精管上皮中尚无tertmRNA阳性表达 ;② 2 0d雄性小鼠睾丸的曲细精管上皮可见tert... 详细信息

本实验应用原位杂交方法检测出生后 10d～ 90d雄性小鼠睾丸中tertmRNA表达及定位。原位杂交方法 (Insituhybridization)结果显示 :① 10d雄性小鼠睾丸的曲细精管上皮中尚无tertmRNA阳性表达 ;② 2 0d雄性小鼠睾丸的曲细精管上皮可见tertmRNA阳性表达 ,阳性表达位于初级精母细胞 ;③ 30d雄性小鼠睾丸的曲细精管上皮也可见tertmRNA阳性表达 ,初级精母细胞表现强阳性表达 ;④ 6 0d雄性小鼠睾丸的曲细精管上皮可见明显tertmRNA阳性表达 ,阳性表达位于初级精母细胞及精子细胞 ;⑤ 90d雄性小鼠睾丸的曲细精管上皮有较强烈的tertmRNA阳性表达 ,阳性表达位于初级精母细胞。此结果提示我们 :端粒酶在精子发生过程中存在动态变化 ,端粒酶的表达与精子发生存在密切关系。

关键词：端粒酶 tert 原位杂交精子发生睾丸

柔嫩艾美耳球虫端粒DNA和tert基因克隆及端粒酶活性测定

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柔嫩艾美耳球虫端粒DNA和TERT基因克隆及端粒酶活性测定

甲状腺乳头状癌BRAFV600E及tert启动子突变的预后意义

中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第六次代表大会暨第十次学术研讨会

作者：杨桂连李建华张西臣宫鹏涛杨举赵全吉林大学畜牧兽医学院吉林农业大学动物科技学院

本研究以***为研究对象,应用单卵囊分离技术成功分离具有较强感染力地方分离株。在此基础上,成功构建了富含端粒序列文库,进一步通过Southern杂交和酶切筛选阳性克隆,确定了***端粒DNA重复序列为5’-TTTAGGG-3’。根据已登录GenBank其... 详细信息

本研究以***为研究对象,应用单卵囊分离技术成功分离具有较强感染力地方分离株。在此基础上,成功构建了富含端粒序列文库,进一步通过Southern杂交和酶切筛选阳性克隆,确定了***端粒DNA重复序列为5’-TTTAGGG-3’。根据已登录GenBank其他球虫目原虫端粒酶逆转录酶(tert)基因序列设计简并引物,成功克隆***端粒酶tert 4688bp全长cDNA,其中4491bp的ORF编码1497个氨基酸,同时含有42bp 5’UTR和152bp 3’UTR以及多聚腺苷酸尾。利用生物信息学分析软件分析表明该基因包含tert家族的主要特征性基序。最后检测了***未孢子化卵囊、子孢子和裂殖子端粒酶活性,结果显示子孢子和裂殖子具有较高的端粒酶活性。本研究为进一步深入探索球虫端粒形成、端粒酶活性调控、基因表达和变异、细胞周期调节等机制并针对端粒结合蛋白设计特异的抗球虫靶向药物预防和治疗球虫病奠定了基础。

关键词：柔嫩艾美耳球虫 tert 端粒

来源： cnki会议评论

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中国医药指南 2018年第32期16卷 7-9页

作者：罗春华林云贺峥申九妹王静郑启忠北京中医药大学厦门医院病理科福建厦门361009

目的探讨BRAFV600E及tert启动子突变与甲状腺乳头状癌临床病理特征的关系,评估两基因突变对患者的预后的影响。方法应用荧光PCR法检测248例甲状腺乳头状癌(PTC)组织BRAF V600E和tert启动子(C228T位点和C250T位点)的突变情况,分析其与PT... 详细信息

目的探讨BRAFV600E及tert启动子突变与甲状腺乳头状癌临床病理特征的关系,评估两基因突变对患者的预后的影响。方法应用荧光PCR法检测248例甲状腺乳头状癌(PTC)组织BRAF V600E和tert启动子(C228T位点和C250T位点)的突变情况,分析其与PTC患者临床病理特征之间的关系。结果 PTC患者中BRAF V600E突变率为78.6%;tert启动子突变率为7.66%,包括C228T位点突变17例和C250T位点突变2例;tert启动子突变的19例中有10例同时伴有BRAF V600E突变。BRAF V600E突变与PTC患者性别、年龄、肿瘤大小、肿瘤单侧或双侧累及、肿瘤腺外侵犯、以及淋巴结转移等临床病理特征均无关;tert启动子突变与PTC患者性别及肿瘤单侧或双侧累及无关,但与患者年龄、肿瘤大小、肿瘤腺外侵犯以及淋巴结转移等临床病理特征均有关;BRAF及tert同时突变与患者年龄、肿瘤大小、肿瘤腺外侵犯以及淋巴结转移等临床病理特征均有关。结论 BRAF V600E在PTC患者中的突变率较高,对患者预后的评估指导价值不大;tert启动子在PTC患者中的突变率较低,对PTC患者预后评估具有指导意义。

关键词：甲状腺乳头状癌基因突变 BRAF tert 预后