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水生生物学报 2024年

作者：汪韵熊雪梅高泽霞华中农业大学水产学院农业农村部淡水生物繁育重点实验室/长江经济带大宗水生生物产业绿色发展教育部工程研究中心湖北洪山实验室湖北省名优鱼育种与健康养殖工程技术研究中心

为探究tent5c/fam46c基因（Family with sequence similarity 46c,家族序列相似性46 c）在斑马鱼（Danio rerio）肌间刺发育中的作用,选取11种鱼类分析tent5c系统演化特征,采用原位杂交技术和qRT-PcR分析tent5c基因在斑马鱼发育中的时... 详细信息

为探究tent5c/fam46c基因（Family with sequence similarity 46c,家族序列相似性46 c）在斑马鱼（Danio rerio）肌间刺发育中的作用,选取11种鱼类分析tent5c系统演化特征,采用原位杂交技术和qRT-PcR分析tent5c基因在斑马鱼发育中的时空表达特征,并利用cRISPR/cas9建立了斑马鱼tent5c基因敲除纯合突变系(tent5c-/-),对其骨骼表型和肌肉转录组进行分析。结果显示, tent5c编码tent5c氨基酸在不同鱼类中具有高度的保守性,但在无肌间刺鱼类里发生了相同的氨基酸替换; tent5c基因在48hpf （Hours post fertilization）斑马鱼的眼睛和肌隔表达,在60 dpf （Days post fertilization）斑马鱼的脊椎和肌间刺特异高表达。与野生型斑马鱼相比, tent5c-/-斑马鱼肌间刺表现为生长减缓,矿化程度降低以及数量减少。比较转录组结果表明,在tent5c基因敲除之后,斑马鱼肌肉组织有112个基因表达下调, 118个基因表达上调。差异基因主要富集于肌肉收缩和骨骼发育等相关通路,由此推测tent5c可能是通过调控这些肌肉和骨骼相关通路来对肌间刺发育产生影响。研究初步表明了tent5c基因在斑马鱼肌间刺发育中的作用,为进一步研究鱼类肌间刺等骨骼发育的分子调控机制提供了科学依据。

关键词： tent5c 肌间刺基因表达骨骼发育斑马鱼

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The non-canonical poly(A)polymerase FAM46c promotes erythropoiesis

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Journal of Genetics and Genomics 2024年第6期51卷 594-607页

作者： Ke Yang Tiangi Zhu Jiaying Yin Qiaoli Zhangg Jing Li Hong Fan Gajing Han Weiyin Xu Nan Liu Xiang Lv Bone Marrow Transplantation center The First Affiliated HospitalZhejiang University School of MedicineHangzhouZhejiang 310003China Liangzhu Laboratory Zhejang UniversityHangzhouZhejang 311121China Institute of Hematology Zhejiang UniversityHangzhouZhejiang 311121China The State Key Laboratory for complex Severeand Rare DiseasesHaihe Laboratory of Cell EcosystemDepartment of PathophysiologyInstitute of Basic Medical SciencesChinese Academy of Medical Sciences&Peking Union Medical CollegeBeijing 100005China Medical Epigenetics Research center Chinese Academy of Medical Sciences&Peking Union Medical CollegeBeijing 100005China

The post-transcriptional regulation of mRNA is a crucial component of gene *** disruption of this process has detrimental effects on the normal development and gives rise to various *** for novel post-transcriptional regulators and exploring their roles are essential for understanding development and *** a multimodal analysis of red blood cell trait genome-wide association studies(GWAS)and transcriptomes of erythropoiesis,we identify FAM46c,a non-canonical RNA poly(A)polymerase,as a necessary factor for proper red blood cell ***46c is highly expressed in the late stages of the erythroid lineage,and its developmental upregulation is controlled by an erythroidspecific *** demonstrate that FAM46c stabilizes mRNA and regulates erythroid differentiation in a polymerase activity-dependent ***,we identify transcripts of lysosome and mitochondria components as highly confident in vivo targets of FAM46c,which aligns with the need of maturing red blood cells for substantial clearance of organelles and maintenance of cellular redox *** conclusion,our study unveils a unique role of FAM46c in positively regulating lysosome and mitochondria components,thereby promoting erythropoiesis.

关键词： FAM46c tent5c Poly(A)polymerase Erythroblasts Post-transcriptional regulation Erythroid-specific enhancer

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