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Trilineage Sequencing Reveals Complex tcrβtranscriptomes in Neutrophils and Monocytes Alongside T Cells

Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2021年第6期19卷 926-936页

作者： Tina Fuchs Kerstin Puellmann Chunlin Wang Jian Han Alexander W.Beham Michael Neumaier Wolfgang E.Kaminski Institute for Clinical Chemistry University of Heidelberg Medical Faculty MannheimD-68167 MannheimGermany Aesculabor Hamburg D-22769 HamburgGermany iRepertoire Inc. HuntsvilleAL 35806USA HudsonAlpha Institute for Biotechnology HuntsvilleAL 35806USA Department of Surgery Hospital of SiegenD-57076 SiegenGermany Ingenium digital diagnostics D-87662 KaltentalGermany

Recent findings indicate the presence of T cell receptor(tcr)-based combinatorial immune receptors beyond T cells in neutrophils and monocytes/*** this study,using a semiquantitative trilineage immune repertoire sequencing approach as well as under rigorous bioinformatic conditions,we identify highly complex tcrβtranscriptomes in human circulating monocytes and neutrophils that separately encode repertoire diversities one and two orders of magnitude smaller than that of T *** transcriptomic analyses reveal that neutrophils,monocytes,and T cells express distinct tcrβrepertoires with less than 0.1%overall trilineage repertoire *** comparison shows that in all three leukocyte lineages,the vast majority of the expressed tcrβvariants are *** also find that differentiation of monocytes into macrophages induces dramatic individual-specific repertoire shifts,revealing a surprising degree of immune repertoire plasticity in the monocyte *** results uncover the remarkable complexity of the two phagocyte-based flexible immune systems which until now has been hidden in the shadow of T cells.

关键词： Monocyte Neutrophil T cell tcrβtranscriptome Next-generation sequencing

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