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Chromatin accessibility landscapes revealed the subgenome-divergent regulation networks during wheat grain development

引用

aBIOTECH 2023年第1期4卷 8-19页

作者： Hongcui Pei Yushan Li Yanhong Liu Pan Liu Jialin Zhang Xueni Ren Zefu Lu Institute of Crop Sciences Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China

Development of wheat(Triticum aestivum L.)grain mainly depends on the processes of starch synthesis and storage protein accumulation,which are critical for grain yield and ***,the regulatory network underlying the transcriptional and physiological changes of grain development is still not ***,we combined ATAC-seq and RNA-seq to discover the chromatin accessibility and gene expression dynamics during these *** found that the chromatin accessibility changes are tightly associated with differential transcriptomic expressions,and the proportion of distal ACRs was increased gradually during grain *** transcription factor(TF)binding sites were enriched at different stages and were diversified among the 3 *** further predicted the potential interactions between key TFs and genes related with starch and storage protein biosynthesis and found different copies of some key TFs played diversified ***,our findings have provided numerous resources and illustrated the regulatory network during wheat grain development,which would shed light on the improvement of wheat yields and qualities.

关键词： Wheat Chromatin accessibility subgenome-divergence Regulatory network Grain development

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