检索结果-南通市图书馆

sox基因在非哺乳类脊椎动物胚胎发育中的表达

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解剖学杂志 2013年第5期36卷 990-992页

作者：金文杰李忻怡张育辉陕西师范大学生命科学学院发育生物学实验室西安710062

近年来，在无脊椎和脊椎动物已经确认了众多的Sty（sexdetermining region of Ychromosome）同源基因，这类基因均具有HMG-box基序，构成了sox（SRY-relatedHMG-box）家族。sox与N-$L动物Sty的HMG-box基序有50％以上的相似性，HMG-box基序的编码蛋白可与DNA特异性结合，是重要的转录调控因子。目前已经知道，sox在动物的性别决定与分化、神经系统发育、软骨及多种组织器官的形成中具有重要功能。sox的突变、缺失有可能导致发育异常或先天性疾病[1]。

关键词： sox基因脊椎动物胚胎发育哺乳类转录调控因子神经系统发育特异性结合先天性疾病

sox基因多态性与早产儿支气管肺发育不良的关联研究

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SOX基因多态性与早产儿支气管肺发育不良的关联研究

作者：谢伯华桂林医学院

学位级别：硕士

目的:探究sox(sry-related high-mobility-group box)基因多态性与早产儿支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia,BPD)的关联。方法:选取2017.05-2020.05年桂林医学院附属医院、桂林市妇女儿童医院、深圳市宝安区妇幼保健院新生... 详细信息

目的:探究sox(sry-related high-mobility-group box)基因多态性与早产儿支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia,BPD)的关联。方法:选取2017.05-2020.05年桂林医学院附属医院、桂林市妇女儿童医院、深圳市宝安区妇幼保健院新生儿科住院确诊为BPD的56例早产儿为病例组,以同期入住上述医院无BPD的91例早产儿为对照组,对照组按性别、出生体重、胎龄与病例组进行频数匹配。采用高通量Taq Man MGB实时荧光定量PCR技术对sox4基因rs9368326、sox9基因rs1042667、sox17基因rs12234941位点多态性进行检测。结果:携带rs1042667位点突变杂合子AC可增加BPD发病风险(OR=2.767,95%CI=1.051-7.284,P=0.035);rs9368326、rs12234941位点多态性与BPD发病均无统计学关联(均有P>0.05)。结论:sox9基因rs1042667多态性可能与早产儿BPD存在关联,rs1042667突变杂合子AC可能是早产儿BPD的易感基因型。

关键词：支气管发育不良 sox基因单核苷酸多态性早产儿

稀有鮈鲫(Rare gudgeon)sox基因的克隆及序列分析

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武汉大学学报（理学版） 2006年第2期52卷 213-219页

作者：张小艳赵刚刘江东龙华陈戟余其兴武汉大学生命科学学院湖北武汉430072

根据人的SRY基因中HMG-box保守区设计引物,采用PCR技术在稀有鲫雌雄个体基因组DNA中分别扩增,发现3个大小分别为220、700和1 500 bp的片段,经过克隆和测序分析,从220 bp的片段中获得两个基因片段,证明为稀有鲫的sox1和sox21基因片段,无... 详细信息

根据人的SRY基因中HMG-box保守区设计引物,采用PCR技术在稀有鲫雌雄个体基因组DNA中分别扩增,发现3个大小分别为220、700和1 500 bp的片段,经过克隆和测序分析,从220 bp的片段中获得两个基因片段,证明为稀有鲫的sox1和sox21基因片段,无性别差异,其DNA序列与人及斑马鱼相应sox基因相似性分别为sox1:80.4%和97%;sox21:77.3%和91%,其编码的氨基酸序列与人及斑马鱼相应sox蛋白相似性分别为sox1:96%和98%;sox21:88%和100%,显示了其高度的保守性.此外,从GenBank、MEBL和DDBJ数据库获得了92个已克隆的物种SRY和sox基因全长核苷酸编码序列及HMG保守区序列数据.通过对这些数据进行序列比对及聚类树的构建,分析了sox基因家族成员的分类及分子进化模式,对稀有鲫的性别决定进行了探讨,为sox基因的进化研究提供分子基础.

关键词：性别决定稀有鮈鲫 sox基因序列分析

一种四倍体鲤科鱼sox基因的克隆和序列分析

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科学通报 2008年第12期53卷 1395-1402页

作者：郭宝成李俊兵童超波何舜平中国科学院水生生物研究所

为了研究重要功能基因在多倍体基因组中的演化情况,通过分子克隆的方法从四倍体大鳞结鱼(Tordouronensis)中获得13条sox基因序列,分别为soxB,soxC和soxE组成员.对大鳞结鱼sox基因系统进化分析的结果支持鱼类特异的基因组重复的假说,同... 详细信息

为了研究重要功能基因在多倍体基因组中的演化情况,通过分子克隆的方法从四倍体大鳞结鱼(Tordouronensis)中获得13条sox基因序列,分别为soxB,soxC和soxE组成员.对大鳞结鱼sox基因系统进化分析的结果支持鱼类特异的基因组重复的假说,同时表明,基因sox19可能为真骨鱼特有的sox基因家族成员.序列分析显示,与其他物种相比大鳞结鱼中sox基因的碱基替代,绝大多数为同义替代.结果表明,所得到的sox基因序列均受到净化选择,同时由多倍化所造成的重复基因对sox4a,sox9a和sox9b受到相同的净化选择压力.根据基因sox9a和sox9b重复基因对间内含子序列长度和相似性的差异推测大鳞结鱼可能为异源四倍体.

关键词：大鳞结鱼 sox基因四倍体基因组重复基因演化

半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)sox基因家族生物信息学分析

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渔业科学进展 2016年第2期37卷 41-48页

作者：高进马佳璐刘洋邵长伟贾晓东陈松林南京农业大学无锡渔业学院无锡214081 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛266071 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室青岛266200 中国海洋大学水产学院青岛266003

sox(SRY-related HMG-box)基因家族是在动物体内发现的一类编码转录因子的基因家族,广泛参与了动物生长发育、理化反应,特别是性别决定和分化等过程。本研究采用生物信息学方法,利用sox基因高度保守的HMG-box区序列作为种子序列,检索半... 详细信息

sox(SRY-related HMG-box)基因家族是在动物体内发现的一类编码转录因子的基因家族,广泛参与了动物生长发育、理化反应,特别是性别决定和分化等过程。本研究采用生物信息学方法,利用sox基因高度保守的HMG-box区序列作为种子序列,检索半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)基因组注释的蛋白数据库,共鉴定分离出23个sox基因。并在全基因组水平对半滑舌鳎sox基因家族进行了保守结构域序列、进化、基因结构、染色体定位及基因表达模式的系统分析。结果显示,通过保守结构域分析发现了半滑舌鳎sox基因家族除Cse sox32外,皆存在一段9个氨基酸残基(RPMNAFMVW)的高度保守基序;结合保守结构域及进化分析,所有半滑舌鳎sox基因被分为B1、B2、C、D、E、F和K共7个亚族,且不同的亚族在进化上存在种间趋同性和种内特异性;基因结构分析将半滑舌鳎sox基因分为两大类,即单外显子类和多外显子类;而染色体定位分析则显示,sox基因在染色体上散乱分布,不存在集簇现象;不同类型性腺及幼鱼变态前后的sox基因家族表达谱显示,半滑舌鳎sox基因具有不同的组织表达模式,表明其在性别分化、性腺发育及早期幼鱼发育过程中可能发挥了重要作用。本研究对于今后半滑舌鳎sox基因家族深入的功能验证及分子作用机制研究具有重要的意义,也为日益丰富的水产基因组资源的挖掘利用提供了参考。

关键词： sox基因 HMG结构域半滑舌鳎生物信息学

斑节对虾sox基因HMG盒的PCR扩增及SSCP分析

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水产学报 2005年第4期29卷 478-481页

作者：汪桂玲朱琴李家乐上海水产大学生命科学与技术学院上海水产大学生命科学与技术学院上海200090

SRY基因是人类及哺乳动物睾丸决定因子的最佳候选基因,HMG盒是SRY基因编码蛋白质的唯一功能区,在性别决定中极其重要且高度保守,许多进化程度上明显不同的物种中都能检测出SRY基因的HMG盒,即sox基因。斑节对虾是一种重要经济虾类,其性... 详细信息

SRY基因是人类及哺乳动物睾丸决定因子的最佳候选基因,HMG盒是SRY基因编码蛋白质的唯一功能区,在性别决定中极其重要且高度保守,许多进化程度上明显不同的物种中都能检测出SRY基因的HMG盒,即sox基因。斑节对虾是一种重要经济虾类,其性别决定机制研究薄弱,至今未找到性染色体。本研究根据人的SRY基因的HMG盒保守区的核苷酸序列,设计了1对兼并引物,通过PCR扩增出斑节对虾的sox基因,并对扩增产物进行SSCP分析。结果表明,斑节对虾雌雄个体均存在sox基因,从雌雄个体中均扩增出约350bp和220bp两条基因片段,推测其中350bp片段含内含子,SSCP结果显示斑节对虾内存在sox基因家族的不同成员,且雌雄存在差异。最后我们讨论了对虾性别决定可能的机制。

关键词：斑节对虾 sox基因 HMG盒 SSCP分析性别决定

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小鼠sox基因的扩增及序列分析

动物学报 2001年第S1期47卷 223-226页

作者：贺艳萍郭亚平马恩波山西大学生命科学系太原030006

用特异扩增人SRY基因保守区的一对引物研究了小鼠雌性和雄性个体基因组中的SRY盒基因 ,结果表明 ,该引物可以在小鼠雌雄个体中扩增出一条 2 3 5bp的带。经序列分析 ,雌雄之间没有差异 ,且与已知的人SRY基因的HMG box区及小鼠和家兔雄性... 详细信息

用特异扩增人SRY基因保守区的一对引物研究了小鼠雌性和雄性个体基因组中的SRY盒基因 ,结果表明 ,该引物可以在小鼠雌雄个体中扩增出一条 2 3 5bp的带。经序列分析 ,雌雄之间没有差异 ,且与已知的人SRY基因的HMG box区及小鼠和家兔雄性特异的SRY同源基因进行比较 ,同源性均在 60 %以上。本文结果支持sox基因在进化上十分保守的结论。

关键词：小鼠 sox基因 PCR

三倍体湘云鲫3个sox基因保守区的序列分析

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水生生物学报 2005年第1期29卷 101-104页

作者：郭新红刘少军向兵刘筠湖南师范大学生命科学学院蛋白质化学与鱼类发育生物学教育部重点实验室长沙410081

摘要: sox/sox基因家族成员的主要特征是具有一个HMG(high mobility group)保守盒,其编码的蛋白质可以和DNA序列特异性结合,是一类重要的转录调控因子1,在个体发育过程中sox/sox基因对性别分化和组织器官形成起着重要作用。sox/sox基因... 详细信息

摘要: sox/sox基因家族成员的主要特征是具有一个HMG(high mobility group)保守盒,其编码的蛋白质可以和DNA序列特异性结合,是一类重要的转录调控因子1,在个体发育过程中sox/sox基因对性别分化和组织器官形成起着重要作用。sox/sox基因的研究不仅可以揭示性别分化和胚胎发育的机制,而且可为某些遗传疾病的诊断和治疗提供分子方面的资料,因而有着非常重要的理论和应用价值。

关键词：三倍体湘云鲫 sox基因序列分析保守区性别分化组织器官形成胚胎发育

两种鱼类sox基因保守区的克隆和sox9基因保守区内含子的遗传变异性

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动物学报 2004年第4期50卷 681-685页

作者：陈金平孙大江梁冰石兴娣吴文化张树义中国科学院动物研究所北京100080 中国水产科学研究院鲟鱼繁育技术工程中心北京100039 北京师范大学生命科学学院北京100875

Four different sox genes in Amur sturgeon Acipenser schrenckii and five sox genes in chum salmon Oncorhynchus keta were identified for the first time in this paper, and there was no sexual difference for these genes in these two fishes. For Amur sturgeon, the encoded amino acid sequences exhibited 98%, 98%, 98%, 86% of sequence homology with those reported for human sox HMG box, respectively, and for chum salmon, the encoded amino acid sequences exhibited 93%,98%,98%,98%,96% of sequence homology with those reported for human sox HMG box, respectively. Two different forms of sox9 gene in chum salmon were found, and sox9 contained a 303 bp and 258 bp introns in the HMG box for chum salmon respectively while 572 bp for Amur sturgeon. No clear similarity was observed between the introns in the sox9 HMG box of different fishes, but the introns occur in the HMG box region between the second and third bases of the codon for arginine at residue 42 in HMG box for the three fishes, and obey the rule of “GT AG”. and the encoded amino acid sequences in the three sox9 genes HMG box are very conservative in the two fishes (100% identification). Identification of these genes is a potential step in understanding development regulations including sex determination in Amur sturgeon.

关键词：史氏鲟大麻哈鱼 sox基因克隆外显子内含子遗传变异性