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一种基于DNA甲基化的法医体液组织来源鉴定复合扩增体系有效性验证

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刑事技术 2024年

作者：李琛扬丁冬升邹广发王科文丰蕾郭向前季安全河南大学基础医学院公安部鉴定中心法医遗传学公安部重点实验室大庆市公安局刑事技术支队

本文对文献报道的由9个CpG位点构成的复合扩增体系进行有效性验证，探究该体系在中国人群中的适用性。选取唾液、精液、血液、阴道分泌液、月经血五种体液共236个样本，使用snapshot复合扩增体系检测9个CpG位点的甲基化值，位点判定阈... 详细信息

本文对文献报道的由9个CpG位点构成的复合扩增体系进行有效性验证，探究该体系在中国人群中的适用性。选取唾液、精液、血液、阴道分泌液、月经血五种体液共236个样本，使用snapshot复合扩增体系检测9个CpG位点的甲基化值，位点判定阈值设为甲基化值大于0.1。使用重亚硫酸氢盐转化后DNA（模板量范围为10～0.5 ng）对该体系进行分析。选取唾液、精液、血液、阴道分泌液四种体液DNA，两两分别按照1∶1,1∶5,1∶10,1∶20的比例混合后进行检测。最后，利用五种体液共计232份样本实验数据集进行模型的构建与测试，其中训练集（n=162）用于构建随机森林模型，测试集（n=70）对体液类型进行预测，检验模型预测效果，同时添加外部数据集（n=40）作为验证集对模型的预测效果进行验证。直接根据特异性峰检出判定，唾液、精液、血液、阴道分泌液和月经血样本鉴定准确率分别为100%、98%、98%、94%和21%。该体系对10～1 ng的重亚硫酸氢盐转化后DNA均可有效检测。在混合样本中，1∶1比例混合的样本均可被正确鉴别；1∶5、1∶10和1∶20混合样本均能检出主要成分，次要成分检出存在较大差异。利用232份样本构建随机森林模型，测试集与验证集中的五种体液来源鉴定准确性均为100%。综上，该复合扩增体系具有良好的法医学应用价值。

关键词： DNA甲基化复合扩增体系 snapshot 体液组织来源鉴定

A High-Performance Hierarchical snapshot Scheme for Hybrid Storage Systems

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Chinese Journal of Electronics 2018年第1期27卷 76-85页

作者： YU Xiao TAN Yu'an ZHANG Changyou LIANG Chen Khaled AOURRA ZHENG Jun ZHANG Quanxin School of Computer Science and Technology Beijing Institute of Technology Department of Computer Science and Technology Shandong University of Technology Institute of Software Chinese Academy of Science

With the increased snapshot operations(creation or deletion), the performance of storage system will degrade severely whether in Copy on write(COW)or Redirect on write(ROW). This paper presents a novel snapshot scheme which could use of storage resources effectively and keep the historical data accurately for SSDHDD-hybrid storage system. SSD(source volume) stores all the active data and executes read/write operations without responding to snapshot operations. In contrast,HDDs(snapshot volume) store the writing data sequentially in the form of logs and are responsible for backup and snapshot operations. In this way, the hybrid storage system can get the high throughput power via SSD even the snapshot functions are active and HDDs can keep pace with the high Input/Output operations per second(IOPS)capability of the SSD. Logs are combined and kept in a separate image volume by the controller. So, fine-grained Recovery point objective(RPO) and good Recovery time objective(RTO) can be achieved. Experiment results show that the prototype can achieve excellent I/O performance while snapshot operations are active and consume a few extra storage space.

关键词： Hybrid disk array snapshot Copy on write(COW) Redirect on write(ROW) Recovery point objective(RPO) Recovery time objective(RTO)

DATA REDUCTION OF snapshot VLBI OBSERVATIONS

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Science China Mathematics 1991年第5期34卷 590-597页

作者：南仁东 R.T.SCHILIZZI C. R.FANTI 邓杰 Beijing Astronomical Observatory Academia Sinica Beijing 100080 PRC Radiosterrenwacht Dwingeloo the Netherlands Dipartimento di Astronomia Universita di BolognaItaly

Data reduction techniques have been developed for generating images of radio sourcesfrom snapshot very long baseline interferometry (VLBI) observations with poor u-v coverage.The reliability of the radio source struct... 详细信息

关键词： VLBI CSS snapshot observation.

Design of current mirror integration ROIC for snapshot mode operation

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Journal of Semiconductors 2016年第10期37卷 68-74页

作者： Hari Shanker Gupta A S Kiran Kumar M.Shojaei Baghini Subhananda Chakrabarti Sanjeev Mehta Arup Roy Chowdhury Dinesh K Sharma Indian Institute of Technology Bombay Mumbai India Space Applications Centre Jodhpur Tekra Ahmedabad India

Current mirror integration（CMI） read out integrated circuit（ROIC） topology provides a low input impedance to photo-detectors and provides large injection efficiency, large charge handling capacity and snapshot mode operation without in-pixel opamps. The ROIC described in this paper has been implemented with a modified current mirror circuit, with matched PMOS pairs for detector input stage and its biasing. The readout circuit has been designed for 30×30μm^2 pixel size, 4×4 array size, variable frame rate, 5 Me charga pixel per second（Mpps）.Experimental performance of the test chip has achieved 15 Me charge handling capacity, a high dynamic range of83 dB, 99.8% linearity and 99.96% injection efficiency. The ROIC design has been fabricated in 3.3 V 1P6 MUMC180 nm CMOS process and tested up to 5 MHz pixel rate at room and at cryogenic temperature.

关键词： pixel pitch readout integrated circuit （ROIC） cryogenics snapshot FPA IR detectors

snapshot imaging spectrometer based on a microlens array

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Chinese Optics Letters 2019年第1期17卷 35-39页

作者：张泽霞常军任虹禧樊恺元李冬梅 School of Optics and Photonics Beijing Institute of Technology University of Chinese Academy of Sciences Institute of Semiconductors Chinese Academy of Sciences

This Letter proposes a snapshot imaging spectrometer, which obtains the spectral information and spatial information in one "shot". The device proposed can achieve the data cube size of 21 × 29 × 40 in the waveband of400–800 nm. The core element of this system is the microlens array, which contains 60 × 60 microlenses in a square arrangement, each microlens has an aperture of 125 μm× 125 μm, and the F number is 15. The microlens array is mounted in a rotation mount, which provides 360° of rotation around the optical axis to maximize the spectral resolution. The final resolution of the system is about 10 nm.

关键词： snapshot imaging spectrometer based microlens array

Building Hot snapshot Copy Based on Windows File System

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Wuhan University Journal of Natural Sciences 2006年第6期11卷 1503-1506页

作者： WANG Lina GUO Chi WANG Dejun ZHU Qin School of Compuler Wuhan University Wuhan 430072 Hubei China

This paper describes a method for building hot snapshot copy based on windows-file system （HSCF）. The architecture and running mechanism of HSCF are discussed after giving a comparison with other on-line backup tecbnology. HSCF, based on a file system filter driver, protects computer data and ensures their integrity and consistency with following three steps： access to open files, synchronization and copy on-write. Its strategies for improving system performance are analyzed including priority setting, incremental snapshot and load balance. HSCF is a new kind of snapshot technology to solve the data integrity and consistency problem in online backup, which is different from other storage-level snapshot and Open File Solution.

关键词： snapshot backup and recovery windows file system filter driver data integrity and consistency

snapshot技术检测滩羊双羔群体中与多胎性状相关SNP研究

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生物技术通报 2019年第10期35卷 152-161页

作者：田得红刘思嘉丁宁李雪赵凯中国科学院西北高原生物研究所西宁810008 中国科学院大学北京100049

对我国地方品种滩羊双羔群体进行SNP检测和多胎性状相关性研究,促进SNPs在双羔家系分子育种中的应用。从实验前期SNP筛选的基础上,利用候选基因飞行质谱法最终确定3种基因13个SNP位点作为候选位点,对滩羊双羔群体的多胎位点进行多态性检... 详细信息

对我国地方品种滩羊双羔群体进行SNP检测和多胎性状相关性研究,促进SNPs在双羔家系分子育种中的应用。从实验前期SNP筛选的基础上,利用候选基因飞行质谱法最终确定3种基因13个SNP位点作为候选位点,对滩羊双羔群体的多胎位点进行多态性检测,分析群体差异性,筛选多羔候选基因。关联分析表明:13个位点中有5个位点与多胎性能有关,3种遗传模型也被证实,但BMPR1B基因构建的单倍型却与多胎性能无关。本研究旨在为滩羊双羔分子标记本品种选种选配等分子辅助育种技术提供参考,保护与可持续利用地方家养动物稀有种质遗传资源,加快优质多胎肉羊的发展。

关键词：滩羊双羔 snapshot 多胎

全外显子组测序联合snapshot技术分析华南地区汉族人增生性糖尿病视网膜病变的遗传易感性

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中华实验眼科杂志 2018年第10期36卷 774-779页

作者：谢洁蒋正轩张良崔颖王军张爱平孟倩丽华南理工大学附属广东省人民医院眼科广州510080 广东省人民医院眼科广东省眼病防治研究所广东省医学科学院广州510080 安徽医科大学第二附属医院眼科合肥230022

目的研究增生性糖尿病视网膜病变（PDR）的遗传易感性。方法采用横断面研究设计，纳入2011年9月至2012年2月在东莞眼病研究中确诊的2型糖尿病患者和2017年7月至2018年3月在广东省人民医院眼科诊治的相关患者共220例，其中100例糖尿病患... 详细信息

目的研究增生性糖尿病视网膜病变（PDR）的遗传易感性。方法采用横断面研究设计，纳入2011年9月至2012年2月在东莞眼病研究中确诊的2型糖尿病患者和2017年7月至2018年3月在广东省人民医院眼科诊治的相关患者共220例，其中100例糖尿病患者和120例PDR患者。采用全外显子组测序技术对22例不伴视网膜病变的2型糖尿病患者（糖尿病组）和23例PDR患者（PDR组）的外周血样本DNA进行单核苷酸多态性（SNP）、InDel等鉴定，筛选出其中具有显著差异的9个外显子区域位点，采用snapshot技术对78例不伴视网膜病变的2型糖尿病患者和97例PDR患者进行9个位点的SNP分型，并分析其单倍型和连锁不平衡性。结果全外显子组测序检出75个位点SNP与PDR相关联（Psnapshot SNP分型技术验证其中9个显著差异的位点，发现其等位基因及基因型频率在PDR组和糖尿病组中差异无统计学意义（P>0.05），但7种单倍型分布频率差异有统计学意义（P1，P<0.05）。结论华南地区汉族2型糖尿病患者PDR的发生存在遗传易感性。

关键词：增生性糖尿病视网膜病变汉族遗传易感性外显子组测序 snapshot

智能冠状动脉运动追踪平台snapshot Freeze在冠状动脉CT血管成像中的应用

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中国医学影像技术 2014年第12期30卷 1822-1826页

作者：高建华陈晓霞王贵生韩文娟赵国全武警总医院CT科北京100039

目的探讨智能冠状动脉运动追踪平台snapshot Freeze（SSF）在冠状动脉CT血管成像（CCTA）中的应用价值。方法连续选取61例患者,使用Discovery CT750 HD Freedom进行冠状动脉扫描,扫描后分别使用和不使用SSF重建,得到A、B两组图像;根据... 详细信息

目的探讨智能冠状动脉运动追踪平台snapshot Freeze（SSF）在冠状动脉CT血管成像（CCTA）中的应用价值。方法连续选取61例患者,使用Discovery CT750 HD Freedom进行冠状动脉扫描,扫描后分别使用和不使用SSF重建,得到A、B两组图像;根据扫描实时心率将患者分为低心率组（心率≤70次/分,n=34）,中高心率组（心率71～80次/分,n=14）和高心率组（心率〉80次/分,n=13）。对比分析A、B组间和不同心率组间的图像质量差异。结果除左主干（S5）外,B组冠状动脉各节段图像质量评分均优于A组（P均〈0.05）;S5段剔除评分为5分者后,其余7例B组图像质量均优于A组（P=0.008）;未使用SSF重建时不可诊断的42个节段经用SSF重建后全部可用于诊断。未使用SSF重建的不同心率组间除S7、S9段外,其余各节段图像质量评分差异均有统计学意义（P均〈0.05）,图像质量随心率增加而下降;使用SSF重建后,不同心率组间各节段图像质量评分差异均无统计学意义（P均〉0.05）。未使用SSF重建的右冠状动脉中段（S2）在15段中评分最低（2.88±0.91）分,S3次之（3.65±1.32）分,且S2在低心率组亦有17例出现移动伪影影响其评估;使用SSF重建后,S2、S3移动伪影显著改善,评分分别提升至（4.32±0.59）分和（4.49±0.59）分,均满足诊断需求。结论 SSF能够有效地纠正高心率及心率波动导致的冠状动脉血管移动伪影,优化CCTA图像质量,尤其对右冠状动脉移动伪影有显著意义。

关键词：冠状血管体层摄影术,X线计算机图像质量 snapshot Freeze