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Metabolic regulation of <i>Escherichia coli</i>cultivated under anaerobic and aerobic conditions in response to the specific pathway gene knockouts

引用

Advances in Bioscience and Biotechnology 2013年第3期4卷 455-468页

作者： Yu Matsuoka Kazuyuki Shimizu Department of Bioscience and Bioinformatics Kyushu Institute of Technology Fukuoka Japan Institute of Advanced Bioscience Keio University Tokyo Japan

Effect of the specific gene knockout on the main metabolism in Escherichia coli was reviewed, and the regulation mechanisms were clarified based on different levels of information such as gene expressions, enzyme activities, intracellular metabolite concentrations, and metabolic fluxes together with fermentation data. The effects of the knockout of such genes as pflA, pta, ppc, pykF, adhE, and ldhA on the metabolic changes were analyzed for the case under anaerobic condition. The effects of the knockout of such genes as pgi, zwf, gnd, ppc pck, pyk, and lpdA on the metabolic changes were also analyzed for the case under aerobic condition. The metabolic regulation analysis was made focusing on the roles of transcription factors.

关键词： Metabolic Regulation single-gene Knockout Mutant Escherichia coli

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