检索结果-南通市图书馆

Journal of Biophysical Chemistry 2012年第2期3卷 142-148页

作者： Mervat M. Abo-Elkhier Department of Engineering Mathematics and Physics Faculty of Engineering Mansoura University Mansoura Egypt

A novel 3-D graphical representation of protein sequence has been introduced. A right cone of a unit base and unit height has been selected to represent protein sequences on its surface. The twenty amino acids have been represented by 20 circles and all protein's residues have been represented by n lines on the cone's surface. All the spots which represent the protein's residues have been shown in the cone's top view. The spatial median of all the spots is used as a new descriptor of any protein sequence. This approach was applied on two short segments of protein of yeast Saccharomyces cerevisiae. The examination of the similarities/dissimilarities for the eight ND5 proteins and the six β-globin proteins illustrate the utility of our approach. A linear correlation and significance analysis have been provided to compare our results and the percentage sequence alignment identity.

关键词： Right Cone Non Equal Proteins Spatial Median similarity/dissimilarity Linear Correlation and Significance Analysis

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