检索结果-南通市图书馆

维普期刊数据库博看期刊

Inter-and Intra-specific Genetic Diversity in Diospyros Using scot and IRAP Markers

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

Horticultural Plant Journal 2020年第2期6卷 71-80页

作者： Changfei Guan Sadaruddin Chachar Pingxian Zhang Chaoqiong Hu RenziWang Yong Yang State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas College of HorticultureNorthwest A&F UniversityYanglingShaanxi 712100China Biotechnology Research Institute Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China

The genus Diospyros contains more than 500 species, among them persimmon(Diospyros kaki Thunb.) is the most economically important species. However, the inter-and intra-specific genetic diversity remains unknown due to historic cultivation, domestication and introduction in different regions of China. In this study, we investigated the genetic diversity and relationship among 268 Diospyros accessions from different regions in China using start codon-targeted(SCo T) and inter-retrotransposon-amplified polymorphism(IRAP) markers. Among 268 samples,232 accessions were D. kaki varieties and 36 were closely related species, that is, D. lotus(21), D. glaucifolia(1), D. virginiana(5), D. kaki ***. silvestris(3), D. oleifera(5) and D. deyangnsis(1). In our study, a total of 90 and 97 polymorphic alleles were obtained from nine SCo T and nine IRAP markers, respectively, and these markers displayed rich polymorphisms for evaluation of the genetic diversity among 268 samples. A study on the relationship, genetic structure and analysis of molecular variance(AMOVA) showed that inter-and intra-specific gene exchanges were frequent among/within the samples from five regions. Moreover, the genetic distance between the Southwest China(SWC) and the other regions was relatively far;the samples from North China(NC), East China(EC), South and Central China(SCC), Northwest China(NWC) regions had a relatively close relationship. The unweighted pair group method with arithmetic means(UPGMA) and population structure analysis indicated that persimmons within geographic regions were clustered together, which revealed that the samples from various regions exhibited gene exchange, and the geographical proximity of persimmons resulted in a more frequent exchange. In addition, the persimmon had a close relationship with D. kaki var. silvestris, D. deyangnsis and D. oleifera species, and exhibited a far distance with respect to D. virginiana. These SCo T and IRAP markers will be helpful for

关键词： persimmon diospyros genetic diversity population structure different regions scot IRAP

基于scot分子标记的苇状羊茅品种遗传关系及指纹图谱分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国草地学报 2023年第5期45卷 1-8页

作者：赵旭陈仕勇余静菠张慧丽关皓周青平西南民族大学青藏高原研究院四川成都610041 西南民族大学畜牧兽医学院四川成都610041

采用目标起始密码子多态性标记(scot)对13个苇状羊茅品种进行遗传多样性、遗传结构及指纹图谱分析,以期为苇状羊茅种质资源鉴定、野生种质资源驯化及新品种培育提供理论依据。从80个scot引物中筛选出多态性较好、条带清晰且重复性高的引... 详细信息

采用目标起始密码子多态性标记(scot)对13个苇状羊茅品种进行遗传多样性、遗传结构及指纹图谱分析,以期为苇状羊茅种质资源鉴定、野生种质资源驯化及新品种培育提供理论依据。从80个scot引物中筛选出多态性较好、条带清晰且重复性高的引物15个进行扩增,13个苇状羊茅品种共扩增出181条条带,平均每个引物扩增12.07条。其中,多态性条带共176条,不同引物扩增的多态性条带数在7~16条之间,平均每个引物扩增多态性条带为11.73条,多态性条带比率(PPB)为97.24%;有效等位基因数范围在1.311~1.642之间,平均为1.511;基因多样性指数范围在0.184~0.357之间,平均为0.294;Shannon指数范围在0.276~0.518之间,平均为0.435。供试的13个品种间的遗传距离在0.0444~0.1401之间,平均值为0.1003;基于遗传距离的UPGMA聚类分析可将13个品种分为两类,与遗传结构分析结果一致。分子方差分析结果表明,总的遗传变异中有14%发生在品种间,有86%发生在品种内。引物scot10、scot56、scot80可以完全区分供试苇状羊茅品种,采用scot10引物扩增出的7个多态性位点成功构建了13个苇状羊茅品种的指纹图谱。

关键词：苇状羊茅 scot 指纹图谱亲缘关系

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

红花scot-PCR反应体系的建立与优化

分子植物育种 2022年第3期20卷 895-901页

作者：刘新梅梁慧珍许兰杰余永亮杨红旗谭政委董薇李磊肖爱利郑州大学生命科学学院郑州450002 河南省农业科学院芝麻研究中心郑州450002 河南省农业技术推广总站郑州450002

为构建红花最佳扩增体系,为以后研究红花遗传多样性和目的基因标记提供了科学依据。本研究采用L_(16)(4^(5))正交试验和单因素试验相结合的方法对红花scot-PCR反应体系中的引物,DNA、dNTPs、PCR Buffer (含Mg^(2+))、Taq DNA聚合酶进行... 详细信息

为构建红花最佳扩增体系,为以后研究红花遗传多样性和目的基因标记提供了科学依据。本研究采用L_(16)(4^(5))正交试验和单因素试验相结合的方法对红花scot-PCR反应体系中的引物,DNA、dNTPs、PCR Buffer (含Mg^(2+))、Taq DNA聚合酶进行优化,每个因素都设为四水平。结果表明,五个影响因素中dNTPs的影响最大,红花最佳反应体系为引物0.6 mmol/L,DNA 60 ng,dNTPs 0.25 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.5 U,PCR Buffer (含Mg^(2+)) 2μL,ddH_(2)O补足至20μL。选用引物S15对八种红花资源对扩增体系进行验证,结果显示扩增条带清晰,多态性好,表明该体系适合红花分子标记研究。

关键词： scot 体系优化红花(Carthamus tinctorius)

青钱柳种质资源scot分子标记遗传多样性分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

世界科学技术-中医药现代化 2022年第7期24卷 2732-2739页

作者：田慧陈宏夏黄勇封毅曾昭清梁雪叶盛连潘小姣广西中医药大学药学院南宁530200

目的采用scot分子标记技术评价青钱柳的遗传多样性。方法采集广西、湖南、湖北、江西、安徽和贵州6省22个居群共176份样本,对不同居群青钱柳的遗传多样性进行研究。结果筛选出了5条引物,并对176个样品进行PCR扩增,扩增出总条带数69条,... 详细信息

目的采用scot分子标记技术评价青钱柳的遗传多样性。方法采集广西、湖南、湖北、江西、安徽和贵州6省22个居群共176份样本,对不同居群青钱柳的遗传多样性进行研究。结果筛选出了5条引物,并对176个样品进行PCR扩增,扩增出总条带数69条,其中多态性条带数69条,多态性百分比(PPB)为100%。有效等位基因(Ne)为1.4912,Nei′s基因多样性指数(H)为0.3017,Shannon′s信息指数(Ⅰ)为0.4662,种质间基因分化系数(Gst)为0.3742,基因流(Nm)为0.8362。NTSYS聚类分析结果表明,地域和种质是影响青钱柳样品间遗传相似度的重要因素,同一种质、同一地域的样品亲缘关系更为接近。结论不同的青钱柳居群遗传多样性丰富,其中广西桂林全州县野生和广西柳州三江县栽培的遗传多样性最高,具有很高的进化潜力。地域和种质(野生或栽培)是影响青钱柳各居群间亲缘关系的重要因素,除此之外,还有海拔、土壤、气候、水质、光照、甚至微生物等因素互相叠加,共同对青钱柳产生影响,从而造成青钱柳种质资源的遗传多样性复杂多样。该结果为青钱柳良种选育及质量评价提供科学依据。

关键词：青钱柳种质资源 scot 遗传多样性

海南油茶scot反应体系建立与多态性引物筛选

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分子植物育种 2023年第20期21卷 6784-6792页

作者：戚华沙谢秋霞林基忠陈加利王春梅郑道君王健海南省农业科学院热带园艺研究所国家种质资源澄迈观测实验站海南省特种经济植物种质资源创新利用重点实验室海口571100 海南大学园艺学院海口571100

scot-PCR是一种单引物扩增分子标记。为了将scot分子标记应用于海南油茶的分子鉴定和遗传多样性评价中,本研究采用单因素试验和正交试验结合方法,分析模板DNA、dNTPs、Taq DNA聚合酶及引物4种因素对海南油茶scot-PCR扩增结果的影响,构... 详细信息

scot-PCR是一种单引物扩增分子标记。为了将scot分子标记应用于海南油茶的分子鉴定和遗传多样性评价中,本研究采用单因素试验和正交试验结合方法,分析模板DNA、dNTPs、Taq DNA聚合酶及引物4种因素对海南油茶scot-PCR扩增结果的影响,构建海南油茶scot-PCR体系,并筛选多态性引物。单因素试验结果表明:DNA浓度对海南油茶扩增效率影响不大,高浓度dNTPs利于扩增产物,而Taq酶和引物扩增高效率偏于中浓度。正交试验结果表明:各因素对海南油茶scot-PCR扩增影响大小依次为引物>Taq DNA聚合酶>dNTPs>模板DNA;总体系为20μL时,最佳反应体系中模板DNA用量为30 ng,dNTPs浓度为0.30 mmol/L,引物浓度为0.60μmol/L,Taq DNA聚合酶用量为1.00 U。利用构建的scot-pcr体系对80条scot单引物进行筛选,最终筛选出16条scot条带清晰的多态性引物,多态性比率平均值达到76.25%。本试验结果可为海南油茶的遗传多样性分析和种质资源鉴定等研究提供参考数据。

关键词：海南油茶 scot 反应体系引物筛选

基于ISSR与scot分子标记的赤苍藤种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分子植物育种 2023年第14期21卷 4710-4718页

作者：杨天为黄诗宇张尚文高曼熔张向军李婷庾韦花蒙平石前广西壮族自治区农业科学院生物技术研究所南宁530007 广西大学农学院南宁530004

为了选育赤苍藤优良品种,本研究利用ISSR与scot分子标记技术对24份赤苍藤种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,11条ISSR引物共扩增出91个条带,其中多态性带条73个,平均每条引物扩增多态性条带6.6个;10条scot引物共扩增出102个条带,其... 详细信息

为了选育赤苍藤优良品种,本研究利用ISSR与scot分子标记技术对24份赤苍藤种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,11条ISSR引物共扩增出91个条带,其中多态性带条73个,平均每条引物扩增多态性条带6.6个;10条scot引物共扩增出102个条带,其中多态性条带86个,平均每条引物扩增多态性条带8.6个。基于ISSR与scot标记的遗传相似系数的范围分别是0.5604~0.8571和0.5294~0.8824,说明赤苍藤种内具有较为丰富的遗传变异,其遗传多样性的表现与地理位置的相关性不显著。ISSR与scot标记分别在遗传相似系数0.72和0.69处可将24份赤苍藤种质聚为3类,两种分子标记的聚类结果基本相同。此外,在此研究基础上通过2条ISSR引物组合(UBC824,UBC827)和2条scot引物组合(scot-2,scot-27)分别构建了赤苍藤种质的DNA指纹图谱。本研究为赤苍藤种质资源的保护与利用、品种的鉴定与分类、选育与改良提供了理论依据。

关键词：赤苍藤 ISSR scot 遗传多样性指纹图谱

基于ISSR和scot分子标记的蒙古黄芪遗传多样性分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基于ISSR和SCoT分子标记的蒙古黄芪遗传多样性分析

作者：王瑞娟内蒙古大学

学位级别：硕士

黄芪是豆科多年生草本植物蒙古黄芪[Astragalus membranaceus(Fisch.)***(Bge.)Hsiao]或膜荚黄芪[Astragalus membranaceus(Fisch.)Bge]的干燥根,具有治疗气虚、慢性溃疡、利尿和抗癌等功效。目前黄芪生产多以人工种植为主,产量和品质... 详细信息

黄芪是豆科多年生草本植物蒙古黄芪[Astragalus membranaceus(Fisch.)***(Bge.)Hsiao]或膜荚黄芪[Astragalus membranaceus(Fisch.)Bge]的干燥根,具有治疗气虚、慢性溃疡、利尿和抗癌等功效。目前黄芪生产多以人工种植为主,产量和品质不稳定、优质品种较少成为制约其生产的主要因素,如何选育优质高产的黄芪品种,对促进黄芪产业发展具有重要意义。本研究以征集内蒙古自治区、甘肃省、山西省等地蒙古黄芪为研究材料,采用形态学标记和ISSR、scot两种分子标记对其进行遗传多样性分析,旨在评估不同种质间表型性状的差异,分析不同种质间的亲缘关系,评价出遗传背景丰富、表型性状优良的种质,为黄芪优质种源的筛选和遗传改良提供理论依据。主要研究结果如下:(1)蒙古黄芪的表型性状多样性丰富,在12个表型性状中,一级分枝数变异系数最大,千粒重变异系数最小,说明一级分枝数的遗传多样性最高。聚类结果将蒙古黄芪种群分为3类,其中第一类群包含的种质资源较多,来源广泛,该种群具有冠幅大,一级分枝数和二级分枝数较多,主茎节数多,小叶数多,小叶较宽,发芽率高的特点,可作为新品种选育的育种材料。(2)株高、冠幅、二级分枝数、主茎节数、小叶长和小叶宽是影响蒙古黄芪种群表型性状变异的关键因子;两个栽培种质CF2(赤峰市喀喇沁旗)、ZLQ(锡林郭勒盟正蓝旗)和两个野生种质WC4(呼和浩特市武川县)、SX1(山西省太原市)的综合得分较高,表明它们具有优良的株型性状,适合作为培育优质蒙古黄芪品种的种质材料。(3)10个ISSR和10个scot引物扩增的总条带数、多态性条带数和多态性比例分别为129、123、95.60%和183、176、96.50%。Mantel检验显示,ISSR和scot标记的相关性显著(r=0.936),表明二者可以有效结合应用于蒙古黄芪种群的遗传多样性分析。(4)UPGMA(加权算术平均聚类分析)将40个蒙古黄芪种群分为5簇,scot标记数据和组合数据(ISSR+scot)的聚类结果具有一致性,发现蒙古黄芪种质聚类表现出一定的地域性分布规律。分子方差分析表明蒙古黄芪以种群内遗传变异为主。(5)蒙古黄芪种群的遗传多样性水平呈现中等偏低的趋势,其中HL2(和林格尔县)、GS3(甘肃省定西市)、WLT(乌拉特前旗)、DMQ3(达茂旗)、GY3(固阳县)和SX3(浑源县)这几份种质的遗传多样性水平较高,可以针对这些具有高遗传多样性和遗传差异大的种群进行育种,从而获得有利的性状。(6)形态聚类结果与分子聚类结果相似,HL1、SX1和SLQ在4个聚类分析结果中总被聚在一起,表明它们之间的遗传背景相似,可能经历过地区间相互引种。

关键词：蒙古黄芪形态性状 ISSR scot 遗传多样性育种

不同检测方法对甜菜scot和DAMD扩增产物多态性的影响

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国甜菜糖业 2022年第3期 1-8页

作者：梁雪梅吴则东黑龙江大学现代农业与生态环境学院哈尔滨150080 黑龙江省普通高校甜菜遗传育种重点实验室/黑龙江大学哈尔滨150080

为筛选更优的scot和DAMD扩增产物多态性的检测方法,为构建甜菜品种分子身份证,建立一套快速鉴定甜菜品种真实性的体系提供依据。试验以8个不同的甜菜品种对7条DAMD引物和15条scot引物进行筛选,选出多态性最好,分辨率最高的核心引物;再利... 详细信息

为筛选更优的scot和DAMD扩增产物多态性的检测方法,为构建甜菜品种分子身份证,建立一套快速鉴定甜菜品种真实性的体系提供依据。试验以8个不同的甜菜品种对7条DAMD引物和15条scot引物进行筛选,选出多态性最好,分辨率最高的核心引物;再利用1%、2%琼脂糖凝胶和6%、8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶两种电泳方法对扩增产物的多态性进行检测并对比分析。结果表明,从7条DAMD引物和15条scot引物中筛选出6条带型清晰,多态性高的核心引物。这6条核心引物在8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测产物时,条带难以分离辨认;而在6%的非变性聚丙烯酰胺凝胶中共扩增出131条带,其中130条为多态性条带,总多态性占比为99.2%。同时在用1%的琼脂糖凝胶检测产物的条带图虽能显示一定的多态性,但条带分离较差,出现重叠的情况;2%琼脂糖凝胶电泳中,扩增总条带57条,43条多态性条带,总的多态性占比为75.4%;前者扩增的总条带数比后者扩增出的总条带数多了近2.3倍,而在总多态性占比中,前者是后者的3倍。因此非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳比琼脂糖凝胶电泳的检测更适于对DAMD和scot扩增产物的检测,用于构建甜菜品种指纹图谱构建,这种需要检测样品数量大,且需获得更准确遗传信息的研究,可以提高检测效率。

关键词：甜菜 DAMD scot 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,琼脂糖凝胶电泳

维普期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基于scot标记的大豆种质遗传多样性研究

园艺与种苗 2022年第3期42卷 77-80页

作者：王雪娇苏二虎贾利敏赵晓宇郭嘉华周宇王新华李强内蒙古自治区农牧业科学院内蒙古呼和浩特010031

[目的]深入探究大豆种质在品种群水平和不同地理来源群体水平上的遗传多样性。[方法]利用目标起始密码子多态性(scot)分子标记技术,对151份国内外大豆种质资源基因组DNA进行多态性扩增分析。[结果]82条scot引物中有41条引物多态性较好,... 详细信息

[目的]深入探究大豆种质在品种群水平和不同地理来源群体水平上的遗传多样性。[方法]利用目标起始密码子多态性(scot)分子标记技术,对151份国内外大豆种质资源基因组DNA进行多态性扩增分析。[结果]82条scot引物中有41条引物多态性较好,共扩增出275个DNA条带,其中多态性条带182个,多态性条带百分率为66.18%,平均多态性信息含量为0.656。综合分析各项指标后发现,内蒙古和黑龙江大豆品种的遗传多样性较低,国外品种和其他省区品种具有较高的遗传多样性水平。基于CDDP标记的UPGMA聚类将151份供试材料分为3大类群,聚类结果与地理来源具有一定的相关性。[结论]CDDP标记技术可有效揭示大豆种质资源的遗传多样性,为种质资源的科学利用提供理论依据。

关键词：大豆种质资源 scot 遗传多样性