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Reconstructing gene regulatory networks in single-cell transcriptomic data analysis

Zoological Research 2020年第6期41卷 599-604页

作者： Hao Dai Qi-Qi Jin Lin Li Luo-Nan Chen Key Laboratory of Systems Biology Shanghai Institute of Biochemistry and Cell BiologyCenter for Excellence in Molecular Cell ScienceChinese Academy of SciencesShanghai 200031China Institute of Brain-Intelligence Technology Zhangjiang LaboratoryShanghai 201210China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China School of Life Science and Technology ShanghaiTech UniversityShanghai 201210China Key Laboratory of Systems Biology Hangzhou Institute for Advanced StudyUniversity of Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesHangzhouZhejiang 310024China Center for Excellence in Animal Evolution and Genetics Chinese Academy of SciencesKunmingYunnan 650223China

Gene regulatory networks play pivotal roles in our understanding of biological processes/mechanisms at the molecular *** studies have developed sample-specific or cell-type-specific gene regulatory networks from single-cell transcriptomic data based on a large amount of cell ***,we review the state-of-the-art computational algorithms and describe various applications of gene regulatory networks in biological studies.

关键词： Gene regulatory network Single-cell RNA sequencing Computational algorithm sample-specificnetwork Cell-type-specific network Cell-specific network

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