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sts标记在扬麦158×淮麦18 F4群体中的应用及其与PPO活性的关系

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STS标记在扬麦158×淮麦18 F4群体中的应用及其与PPO活性的关系

作者：何贤芳安徽农业大学

学位级别：硕士

小麦籽粒中的多酚氧化酶(Polyphenol oxidase,PPO)是导致面制食品酶促褐变的主要因素。选育低多酚氧化酶活性的品种是改良面制食品外观品质和营养品质的重要途径。本研究利用分别位于小麦2A和2D染色体上PPO基因sts标记PP018和sts01,对扬... 详细信息

小麦籽粒中的多酚氧化酶(Polyphenol oxidase,PPO)是导致面制食品酶促褐变的主要因素。选育低多酚氧化酶活性的品种是改良面制食品外观品质和营养品质的重要途径。本研究利用分别位于小麦2A和2D染色体上PPO基因sts标记PP018和sts01,对扬麦158x淮麦18组合的300份F分离株系进行PCR扩增,旨在了解不同标记基因型与PPO活性的关系,主要结果如下: (1)用PP018分析的300份F分离株系中有59份扩增出876bp(2Aaa型)的目标片段;46份同时扩增出685bp和876bp的目标片段(2Aab型);其余195份扩增出685bp的目标片段(2Abb型);用sts01扩增的300份F分离株系均扩增出了560bp目标片段,说明在该群体内2D染色体上的PPO基因不存在等位基因变异。 (2)标记基因型为2Aaa的59份分离株系,其PPO活性均值为82.01 A/(ming10),活性值集中在70-80A/(ming10);标记基因型为2Aab的46份分离株系,其PPO活性均值为163.41A/(ming10),活性值主要集中在140-160A/(ming10),标记基因型为2Abb的195份分离株系,其PPO活性均值为233.73A/(ming10),活性值主要集中在220-260 A/(ming10);其中基因型为2Aaa和2Abb的PPO活性呈偏态分布,群体内活性均值为159.71 A/(ming10),活性偏低。 (3)方差分析表明,标记基因型为2Aaa、2Aab和2Abb三者的PPO活性差异达到极显著水平,其中标记基因型为2Aaa的PPO活性均值显著低于2Abb:PP018在本试验群体中对PPO活性的决定系数为66.61%。

关键词：小麦多酚氧化酶 sts标记分离株系

sts标记在扬麦158×淮麦18F_4群体中的应用及其与PPO活性的关系

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分子植物育种 2008年第3期6卷 499-503页

作者：何贤芳王晓波司红起夏云祥马传喜安徽农业大学农学院合肥230036

小麦籽粒中的多酚氧化酶活性是导致酶促褐变的主要因素。选育低多酚氧化酶活性的品种是改良面制食品外观品质的重要途径之一。本研究利用位于小麦2A和2D染色体上PPO基因分子标记PPO18和sts01,对扬麦158×淮麦18组合的300个F4代分离株系... 详细信息

小麦籽粒中的多酚氧化酶活性是导致酶促褐变的主要因素。选育低多酚氧化酶活性的品种是改良面制食品外观品质的重要途径之一。本研究利用位于小麦2A和2D染色体上PPO基因分子标记PPO18和sts01,对扬麦158×淮麦18组合的300个F4代分离株系进行PCR扩增,说明不同带型与PPO活性的相关性。结果表明用PPO18扩增的300个分离株系中有59个扩增出876bp(2Aaa型)的目标片段,其活性均值为82.01;46个同时扩增出685bp和876bp的目标片段(2Aab型)其活性均值为163.41;其余195个扩增出685bp的目标片段(2Abb型)其活性均值为233.73。方差分析表明三者的PPO活性差异达到极显著水平,其中基因型为2Aaa型的PPO活性值明显低于2Abb型;PPO18在本试验群体中对PPO活性的决定系数为66.61%;用sts01扩增的300个株系中都扩增出了560bp的片段,群体间没有差异。文中说明了两对引物在该群体中的效应及其与PPO活性的关系。

关键词：小麦多酚氧化酶 sts标记分离株系

小麦2D染色体上多酚氧化酶(PPO)基因sts标记的开发与应用

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中国农业科学 2008年第6期41卷 1583-1590页

作者：王晓波马传喜何克勤司红起张业伦安徽农业大学农学院安徽农业大学农学院合肥230036

【目的】开发出小麦籽粒PPO活性的分子标记,并对新标记的应用进行研究,为面制食品外观品质的改良提供参考。【方法】根据一条由小麦2D染色体上PPO基因编码的mRNA序列(GenBank:AY515506)设计引物,对7个高PPO活性和7个低PPO活性小麦品种进... 详细信息

【目的】开发出小麦籽粒PPO活性的分子标记,并对新标记的应用进行研究,为面制食品外观品质的改良提供参考。【方法】根据一条由小麦2D染色体上PPO基因编码的mRNA序列(GenBank:AY515506)设计引物,对7个高PPO活性和7个低PPO活性小麦品种进行PCR扩增,筛选出有差异的引物,对130份小麦品种资源进行检测,验证不同带型与PPO活性的相关性,并利用一套中国春缺体、四体及双端体对sts标记进行染色体定位。在此基础上,结合一个位于小麦2A染色体上的PPO基因分子标记(PPO18),对新开发的标记在小麦低PPO活性分子标记辅助选择中的作用进行评价。【结果】在AY515506的不同位置共设计了8对引物,其中一对引物(sts01)在高、低PPO活性材料中表现出多态性。该引物在7个低PPO活性的材料中能扩增出560bp的目标片段,在7个高PPO活性的材料中没有扩增出目标片段,利用中国春缺体、四体及双端体最终将该标记定位在2D染色体长臂上。利用该标记检测130份小麦品种,结果表明有75个品种可以扩增出560bp的目标片段,其PPO活性均值为221.08A475/(min·g·103);55个品种没有扩增出目标片段,PPO活性均值为309.98A475/(min·g·103),方差分析表明两者的差异达极显著水平(Psts01和PPO18共同检测后发现,130份品种中,有37个品种的双标记扩增均表现出高活性带型(H1H2),这些品种PPO活性的均值为337.82A475/(min·g·103),显著高于其它几种扩增带型品种的PPO活性均值(P标记扩增均表现为低活性带型(L1L2)的小麦品种PPO活性值普遍较低,可作为改良面制食品外观品质的候选亲本。【结论】sts01是一个位于小麦2D染色体长臂上PPO基因分子标记,可以在小麦PPO活性分子标记辅助选择中加以应用。

关键词：小麦多酚氧化酶活性 sts标记分子标记辅助育种

水稻抗白叶枯病基因Xa23的RFLP标记定位及其sts标记的转化

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作物学报 2006年第6期32卷 931-935页

作者：樊颖伦陈学伟王春连朱立煌章琦赵开军中国农业科学院作物科学研究所农业部作物遗传育种重点实验室中国科学院遗传与发育生物学研究所北京100101

用水稻抗白叶枯病基因Xa23的近等基因系CBB23与其感病轮回亲本金刚30(JG30)杂交,构建了包含2562个单株的F2作图群体。用水稻白叶枯病广致病菌系P6进行抗性鉴定表明,F2植株抗感分离比严格符合3∶1。根据日本水稻基因组计划RGP水稻高密度... 详细信息

用水稻抗白叶枯病基因Xa23的近等基因系CBB23与其感病轮回亲本金刚30(JG30)杂交,构建了包含2562个单株的F2作图群体。用水稻白叶枯病广致病菌系P6进行抗性鉴定表明,F2植株抗感分离比严格符合3∶1。根据日本水稻基因组计划RGP水稻高密度图谱上的RFLP探针对F2群体中的145个感病单株进行RFLP检测和连锁分析,获得了6个与Xa23紧密连锁的RFLP分子标记。其中RFLP标记C1003A靠着丝粒一侧,与Xa23的遗传图距为0.4 cM,为Xa23的图位克隆奠定了重要基础。并将标记C1003A成功地转化为sts标记,为分子标记辅助选择育种(MAS)提供了方便有效的分子标记。

关键词： Xa23 水稻白叶枯病 RFLP标记 sts标记

利用sts标记对家蚕雏翅基因mw的定位分析

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蚕业科学 2013年第6期39卷 1104-1107页

作者：马晓刘先方易晓莉侯成香李冰李木旺江苏科技大学生物与化学工程学院江苏镇江212018 江苏科技大学蚕业研究所江苏镇江212018 中国农业科学院蚕业研究所江苏镇江212018

家蚕成虫翅膀的飞行能力已经退化,利用分子标记技术对翅突变基因进行定位分析,可为家蚕翅发育调控机制研究以及鳞翅目害虫的生物防治提供有参考价值的信息。采用家蚕正常翅形品种P50和雏翅(minute wing,mw)品种u11为亲本组配正反交群体... 详细信息

家蚕成虫翅膀的飞行能力已经退化,利用分子标记技术对翅突变基因进行定位分析,可为家蚕翅发育调控机制研究以及鳞翅目害虫的生物防治提供有参考价值的信息。采用家蚕正常翅形品种P50和雏翅(minute wing,mw)品种u11为亲本组配正反交群体,并获得回交群体(P50×u11)♀×u11♂和u11♀×(P50×u11)♂,分别记作BC1F和BC1M,用sts分子标记方法对mw基因进行定位。由于雌性家蚕的染色体不会发生交换,利用BC1F群体筛选与mw基因连锁的分子标记,并用BC1M群体构建mw基因的sts分子标记遗传连锁图,筛选到与mw距离最近的sts标记T2272,其与mw的遗传距离为1.1 cM。

关键词：家蚕雏翅基因定位 sts标记

应用GISH与sts标记鉴定小麦-中间偃麦草抗黄矮病端体系

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作物学报 2006年第12期32卷 1855-1859页

作者：崔志富林志珊辛志勇唐益苗张增艳卢勤国家作物基因资源与基因改良重大工程/农业部作物遗传育种重点开放实验室/中国农业科学院作物科学研究所北京100081 福建农林大学作物科学学院福建福州350002

由大麦黄矮病毒引起的小麦黄矮病毒病是一个严重病害,至今在小麦属内还没有发现抗源。中间偃麦草2Ai-2染色体携带1个高抗黄矮病基因,对该基因的染色体臂定位将为制定抗病基因向小麦转移策略,筛选、开发特定的、与抗性连锁的分子标记的... 详细信息

由大麦黄矮病毒引起的小麦黄矮病毒病是一个严重病害,至今在小麦属内还没有发现抗源。中间偃麦草2Ai-2染色体携带1个高抗黄矮病基因,对该基因的染色体臂定位将为制定抗病基因向小麦转移策略,筛选、开发特定的、与抗性连锁的分子标记的研究提供重要信息。本文对由小麦-中间偃麦草二体附加系Z6衍生的3个抗黄矮病端体系进行鉴定,通过分析端体的遗传构成、筛选与端体共分离的sts标记以确定端体在遗传上的染色体臂归属,从而明确BYDV抗病基因的染色体位置。以拟鹅冠草基因组[Pseudoroegneria strigosa(M.Bieb.).L.o.ve,St]DNA为探针,中国春基因组(TriticumaestivumL.,ABD)DNA作封阻分别对抗病亲本Z6及抗病端体系N530的根尖体细胞染色体进行原位杂交,结果表明,N530体细胞中有2个端体显示出与Z6中外源染色体2Ai-2短臂相似,而与长臂不同的杂交信号。以小麦第2同源群的5个RFLP探针的DNA序列为基础,设计了6对PCR引物,对小麦-中间偃麦草二体异附加系、二体代换系和端体系进行扩增,结果表明,基于短臂探针psr126,psr131序列设计的2对引物,可在含有2Ai-2染色体及端体的抗黄矮病材料中特异扩增,而基于长臂探针psr112序列设计的1对引物,可在含有2Ai-2染色体的抗黄矮病材料中特异扩增,但不能在端体系进行特异扩增,证明外源端体为2Ai-2染色体的短臂。本研究不仅将黄矮病抗性基因定位于2Ai-2染色体的短臂上,而且由RFLP探针psr126、psr131和psr112序列转化的标记sts126(sequence tagged site)sts131和sts112还可分别作为追踪2Ai-2染色体短臂和长臂的分子标记,用于抗病易位系辅助选择。

关键词：端体系基因组原位杂交(GISH) sts标记小麦黄矮病中间偃麦草

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玉米抗粗缩病基因sts分子标记的筛选

玉米科学 2010年第3期18卷 61-64,67页

作者：马侠崔德周刘怀华刘旭宁丽华陈化榜山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室山东泰安271018

对与玉米抗粗缩病相关基因共分离的RAPD标记S37和S86扩增的产物进行克隆与测序,设计多对引物,以感病自交系478和抗病自交系齐319、P138和H21为材料进行PCR扩增。结果表明:根据RAPD产物1300bp片段转化的sts引物在感病自交系中扩增出特异... 详细信息

对与玉米抗粗缩病相关基因共分离的RAPD标记S37和S86扩增的产物进行克隆与测序,设计多对引物,以感病自交系478和抗病自交系齐319、P138和H21为材料进行PCR扩增。结果表明:根据RAPD产物1300bp片段转化的sts引物在感病自交系中扩增出特异带,而在抗病自交系中无此特异PCR扩增带。根据2000bp片段转化的sts引物同样在抗感病自交系中存在特异性差异。进一步用设计的两对sts-PCR引物Ⅰ-2和Ⅱ-4对20个感病自交系和34个抗病自交系进行验证,卡方测验表明,sts标记Ⅰ-2和Ⅱ-4与自交系抗感病的相关性达到极显著水平。sts-PCR标记Ⅰ-2和Ⅱ-4可直接用于玉米抗粗缩病的分子标记辅助选择育种。

关键词：玉米粗缩病 RAPD标记 sts标记分子标记辅助选择

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中国主要小麦品种春化基因的sts标记鉴定

分子植物育种 2009年第6期7卷 1106-1112页

作者：黄琼瑞王永玖张海萍胡娜司红起卢杰常成马传喜农业部安徽省小麦区域技术创新中心安徽小麦产业工程技术研究中心省部共建分子植物育种重点实验室安徽农业大学农学院合肥230036 安徽省怀远县龙亢农场怀远233428

本文选取来自中国各麦区的260份小麦品种,用sts标记对其Vrn-A1、Vrn-B1、Vrn-D1和Vrn-B3四个春化基因位点进行检测,并结合小麦田间生长情况记录,探讨春化基因的4个位点显隐性情况对品种冬春性的影响。结果表明,各位点显性基因频率以Vrn... 详细信息

本文选取来自中国各麦区的260份小麦品种,用sts标记对其Vrn-A1、Vrn-B1、Vrn-D1和Vrn-B3四个春化基因位点进行检测,并结合小麦田间生长情况记录,探讨春化基因的4个位点显隐性情况对品种冬春性的影响。结果表明,各位点显性基因频率以Vrn-D1位点最高,而Vrn-A1和Vrn-B1显性等位基因对品种冬春性的影响高于Vrn-D1和Vrn-B3基因,且所含显性春化基因越多的品种生长习性越偏向春性。另发现,Vrn-A1仅存在于春性品种中;而对于冬性品种来说,各位点均不含显性春化基因。本文标记鉴定结果与田间冬春性观察具有较高的一致性,在小麦育种及品种推广中具有较高的指导意义和应用价值。

关键词：小麦春化基因 sts标记

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小麦籽粒PPO基因sts标记开发

小麦籽粒PPO基因STS标记开发

作者：周志良安徽农业大学

学位级别：硕士

小麦籽粒中高活性的多酚氧化酶(polyphenol oxidase，简称PPO)是导致面制品褐变的主要因素。选育低多酚氧化酶活性的小麦品种是改善面制品外观品质和营养品质的重要手段。本研究参照位于小麦2B染色体上的PPO基因保守区序列(基因登录号：... 详细信息

小麦籽粒中高活性的多酚氧化酶(polyphenol oxidase，简称PPO)是导致面制品褐变的主要因素。选育低多酚氧化酶活性的小麦品种是改善面制品外观品质和营养品质的重要手段。本研究参照位于小麦2B染色体上的PPO基因保守区序列(基因登录号：AB254804)设计引物，以籽粒PPO活性两极端材料为扩增模板进行筛选，并以195份中国微核心种质材料对其有效性验证，旨在开发小麦籽粒PPO基因新分子标记，实验主要结果如下： 1.在设计的引物中，引物F-4扩增产物在籽粒PPO活性处于两极端的12份小麦品种中表现出规律性极强的多态性，在籽粒PPO活性极高的6个小麦品种扩增出了1条带(命名为a)，在籽粒PPO活性极低的6个小麦品种扩增出了3条带(分别命名为a、b、c)。利用195个微核心种质材料对引物F-4进行有效性验证，其中123个材料扩增出了一条带(a)，其PPO活性均值为246.22A475U/(min·g·10)，剩下的72个材料都扩增出3条带(a、b、c);其PPO活性均值为155.95A3475U/(min·g·10);比前者低90.27A475U/(min·g·10)，差异显著。在此基础上利用一套中国春缺体将b条带定位于2A染色体上。引物F-4能很好鉴别小麦2A染色体上PPO基因等位变异，是实用可靠的分子标记，可以在小麦育种中使用。 2.编号为F-8的引物在另一组籽粒PPO活性处于两极端的12个小麦品种中PCR产物表现出较好的多态性，籽粒PPO活性极低的7个小麦品种均扩增出两条带(a带，约400bp;b带，约600bp)，籽粒PPO活性极高的5个小麦品种均扩增出一条带(a带，约400bp)。序列比对结果显示， b带与位于2B染色体上GQ303713PPO基因相似性为99%。在此基础上利用一套中国春缺体将b条带定位于2B染色体上。序列b是PPO基因位于2B染色体上的等位变异，变异主要区域位于第二内含子，该区域变异能有效降低小麦籽粒PPO活性。引物F-8能有效鉴别小麦2B染色体PPO基因的等位变异，是实用可靠的分子标记，可以在小麦育种中使用。 3.利用F-4、sts01和F-8共同检测后发现，195份材料中，有37个三标记扩增均表现出低活性带型(LLL)，(L、L、L分别表示PPO18、sts01和F-C低PPO活性材料扩增带型;HA、HD、HB分别表示PPO18、sts01和F-8高PPO活性材料扩增带型)，这些品种PPO活性均值为118.76A475U/(min·g·10)，显著低于其它几种扩增带型品种。带型为LLHB的材料PPO活性为153.48A475U/(min·g·10D);带型为HAHDHB的材料PPO活性为358.42A475U/(min·g·10),带型为HAHDL的材料PPO活性为232.92A475U/(min·g·10)。F-4、sts01和F-8是一组实用可靠的标记组合，在分子选择育种中使用能有效选育低PPO活性小麦品种从而改善面制品品质。

关键词：小麦多酚氧化酶内含子等位变异 sts标记