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尿路感染B2-st131大肠埃希菌菌株毒力和耐药性分析

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临床检验杂志 2016年第10期34卷 798-800页

作者：郑洁曹小利张之烽程莉周万青宁明哲徐学静沈瀚许元元南京大学医学院附属鼓楼医院检验科南京210008 宿州市皖北煤电集团总医院检验科安徽宿州234000

目的分析B2-st131大肠埃希菌克隆菌株在尿培养中的分布、耐药性和毒力特点。方法收集2012年尿培养大肠埃希菌162株,多重PCR对大肠埃希菌进行种系分型;对B2型菌株进行多位点序列分型法（MLst）鉴定B2-st131克隆菌株;采用脉冲场凝胶电泳... 详细信息

目的分析B2-st131大肠埃希菌克隆菌株在尿培养中的分布、耐药性和毒力特点。方法收集2012年尿培养大肠埃希菌162株,多重PCR对大肠埃希菌进行种系分型;对B2型菌株进行多位点序列分型法（MLst）鉴定B2-st131克隆菌株;采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术进行遗传相关性分析;PCR分析毒力基因iut A、omp T、fyu A、fde C、fim H、tra T、cva C、pap、kps MT、p AI、usp、aer、hly A、cnf和chu A的流行性;分析B2-st131菌株和非B2-st131菌株在耐药性和毒力基因分布的差异。结果 162株大肠埃希菌中35株为B2型,其中17株经鉴定为B2-st131克隆菌株。PFGE显示162株细菌具有很大的遗传多样性。毒力基因omp T、usp和chu A在B2-st131克隆菌株中的流行性显著高于非B2-st131组（P均〈0.05）。B2-st131组细菌对左氧氟沙星的耐药率高于非B2-st131（88.2%vs 60.7%,χ^2=3.867,P=0.049）。结论 B2-st131大肠埃希菌克隆菌株在我院尿培养中有一定的流行性,对左氧氟沙星的耐药率略高,主要携带omp T、usp及chu A等毒力因子。

关键词： st131 耐药性毒力大肠埃希菌

血流感染O16-st131和O25b-st131型大肠埃希菌的流行、系统发育群及耐药性

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南方医科大学学报 2018年第12期38卷 1521-1526页

作者：钟一鸣张晓荷刘文恩杨芳晏群刘清霞李艳明李虹玲邹明祥中南大学湘雅医院检验科湖南长沙410008 中南大学湘雅医学院医学检验系湖南长沙410013

目的探讨大肠埃希菌st131型菌株的流行,及其与非st131耐药性是否存在差异,st131感染者与非st131感染者临床特征是否存在差异。方法通过收集中南大学湘雅医院2016年1月～12月血流感染患者大肠埃希菌非重复菌株144株,采用多重PCR方法进行... 详细信息

目的探讨大肠埃希菌st131型菌株的流行,及其与非st131耐药性是否存在差异,st131感染者与非st131感染者临床特征是否存在差异。方法通过收集中南大学湘雅医院2016年1月～12月血流感染患者大肠埃希菌非重复菌株144株,采用多重PCR方法进行系统发育分群,采用等位基因特异性PCR进行st131菌株筛选及O血清型分型,收集144例患者的临床信息,比较st131感染者与非st131感染者的临床特征有无差异,采用Vitek2 compact药敏分析仪检测细菌的耐药性。结果系统发育分群结果显示,144株大肠埃希菌菌株以B2群为主,占41.0%(59/144),其次分别为F群、B1群和E群,分别占16.7%(24/144)、13.9%(20/144)和13.2%(19/144);其中9株(6.3%)属于st131型,包括8株O25b-B2-st131和1株O16-B2-st131;9例st131患者中,医院感染患者有7例,占77.8%。st131感染者的人口特征和临床特征与非st131感染者相似。st131型菌株对哌拉西林/他唑巴坦、亚胺培南、厄他培南、阿米卡星耐药率较低,但对头孢唑林、头孢曲松、环丙沙星、左氧氟沙星、庆大霉素以及复方新诺明耐药率>50%,ESBLs阳性率达77.8%,多重耐药率高达88.9%,并高于非st131型菌株,但差异并无统计学意义。结论本地区血液分离大肠埃希菌中,B2群和F群为最常见系统分群,st131型菌株检出率较低,国内首次在血流感染中分离出O16-st131菌株,st131感染者的临床特征与非st131感染者相似,st131型菌株多重耐药率及ESBLs阳性率高,应引起重视。

关键词：大肠埃希菌 st131 血流感染系统发育分群临床特征耐药性

大肠埃希菌对碳青霉烯类抗生素的耐药机制及分子分型

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中华微生物学和免疫学杂志 2014年第4期34卷 256-263页

作者：张嵘池丹蔡加昌胡燕燕周宏伟杨玮吕火烊陈功祥浙江大学医学院附属第二医院检验科杭州310009 温州医科大学检验医学院、生命科学学院 325035 杭州市中医院检验科浙江省人民医院检验科

目的：研究大肠埃希菌对碳青霉烯类抗生素的耐药机制及分子分型。方法2007-2011年从杭州市3家医院分离到22株对碳青霉烯类抗生素不敏感的大肠埃希菌。琼脂稀释法测定抗生素最低抑菌浓度（ MIC）；接合试验、PCR扩增和序列分析等研究细... 详细信息

目的：研究大肠埃希菌对碳青霉烯类抗生素的耐药机制及分子分型。方法2007-2011年从杭州市3家医院分离到22株对碳青霉烯类抗生素不敏感的大肠埃希菌。琼脂稀释法测定抗生素最低抑菌浓度（ MIC）；接合试验、PCR扩增和序列分析等研究细菌对碳青霉烯类抗生素耐药的分子机制。脉冲场凝胶电泳（PFGE）、多位点序列分型（MLst）和系统发育分型（phylogenetic typing）等对菌株进行分子分型。结果22株大肠埃希菌亚胺培南和美罗培南的MIC范围为1～16μg/ml，厄他培南为2～64μg/ml。所有菌株产KPC-2型碳青霉烯酶及各种β-内酰胺酶，部分菌株同时产质粒介导的AmpC酶。22株大肠埃希菌均可通过接合试验或转化试验将碳青霉烯耐药性传递给大肠埃希菌EC600，使后者获得blaKPC-2基因及与供体菌相似的耐药性。 PFGE显示仅少数菌株为相同克隆或密切相关；MLst显示最常见的序列类型为st131（9株）和st648（5株）， st38和st405各2株；系统发育分析显示9株st131菌株均为B2群，另有11株属于D群，B1群和A群各1株。结论杭州地区产KPC-2大肠埃希菌主要为世界范围流行的多重耐药菌株st131，其次为st648。

关键词：大肠埃希菌碳青霉烯分子分型 KPC-2 st131

上海市一区级医院老年患者尿路致病性大肠埃希菌分子分型和耐药性分析

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中华传染病杂志 2016年第6期34卷 337-343页

作者：李维正孙琳陈蓓严萍洪金玲张洁戴俊华陈嘉臻张文宏上海中医药大学附属普陀医院感染科 200062 上海中医药大学附属普陀医院检验科 200062 复旦大学附属华山医院感染科

目的：了解上海市普陀区老年患者分离的尿路致病性大肠埃希菌（UPEC）的分子流行病学特征和耐药特征。方法收集上海中医药大学附属普陀医院2013年1月至2015年3月自泌尿道感染住院老年患者分离的72株 UPEC ，进行多位点序列分型（MLst ... 详细信息

目的：了解上海市普陀区老年患者分离的尿路致病性大肠埃希菌（UPEC）的分子流行病学特征和耐药特征。方法收集上海中医药大学附属普陀医院2013年1月至2015年3月自泌尿道感染住院老年患者分离的72株 UPEC ，进行多位点序列分型（MLst ），检测β‐内酰胺酶基因和质粒介导的喹诺酮耐药基因（PMQR），检测 gyrA 和 parC 基因喹诺酮耐药决定区（QRDR）基因突变，并进行体外药物敏感试验。均数比较采用 t 检验，率的比较采用χ2检验或 Fisher 确切概率法。结果UPEC 对环丙沙星、头孢噻肟、复方磺胺甲口恶唑的耐药率分别为76．4％、73．6％、65．3％，而对亚胺培南、美罗培南、阿米卡星、哌拉西林‐他唑巴坦仍保持高度敏感。72株 UPEC 中，55株（76．4％）为超广谱β‐内酰胺酶（ESBL）阳性菌株，其中49株（68．1％）携带 blaCTX‐M 基因。在55株对环丙沙星耐药的菌株中，51株（92．7％）UPEC gyrA 和 parC 基因 QRDR 均有3～4个位点的错义突变，突变热点为 gyrA的83位、87位氨基酸和 parC 的80位、84位氨基酸。72株 UPEC 中最常见 st 型为 st131（18／72，25．0％）、st1193（7／72，9．7％）、st405（7／72，9．7％）、st38（5／72，6．9％）和 st648（3／72，4．2％）。st131为导致社区获得性泌尿道感染的优势 st 型。 st131、st405、st38和 st648表现出多重耐药特性，大多数为产 CTX‐M 型 ESBL 。结论本研究的社区老年患者携带的 UPEC 中存在以 st131克隆为代表的多重耐药菌株流行，需要加强监测，预防其广泛流行。

关键词：尿路致病性大肠埃希菌老年患者多位点序列分型耐药性超广谱 β-内酰胺酶 st131

长沙健康儿童肠道耐药大肠埃希菌的分子流行病学研究

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长沙健康儿童肠道耐药大肠埃希菌的分子流行病学研究

作者：刘璇中南大学

学位级别：硕士

目的:探究长沙地区健康儿童肠道产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌(extended-spectrumβ-lactamase-producing Escherichia coli,ESBL-EC)及产碳青霉烯酶大肠埃希菌(carbapenemase-producing Escherichia coli,CP-EC)的携带情况及分子流行病学,为预防和控制本地区社区耐药菌株的暴发流行及传播提供实验数据。方法:参考小学的地理位置,从长沙开福区、岳麓区、长沙县选取了3所小学,收集参与者的粪便标本并对其进行问卷调查;将标本接种科玛嘉ESBL和m Super CARBA显色平板,初步筛选肠道ESBL-EC和CP-EC;利用双纸片协同试验和改良的碳青霉烯灭活试验分别检测ESBL和碳青霉烯酶,用天地人药敏板进行药敏试验;通过PCR和测序检测耐药菌的耐药基因和毒力基因;对携带bla 和mcr-1的耐药菌进行接合实验,对接合子的生长情况、耐药情况、质粒稳定性以及质粒复制子进行检测;利用多重PCR对大肠埃希菌(Escherichia coli,***)进行系统发育分群;用多位点序列分析(multi-locus sequence analysis,MLst)分析B2群***的克隆株分布情况;利用PCR和测序对st131的血清型、fim H亚型、st131分支进行检测;对耐药菌进行生物膜实验及血清抵抗实验;比较st131菌株和non-st131菌株毒力基因和耐药基因的携带情况、成膜能力和血清抵抗能力。结果:1.从3所小学中收集了420份受试者粪便标本,结合受试者的问卷结果,共有330名健康儿童纳入了这项研究。本研究从330份粪便标本中分离出118株ESBL-EC和3株CP-EC。***-EC分离株对氨苄西林、头孢呋辛、头孢唑啉和头孢曲松的耐药率较高,对美罗培南、替加环素、呋喃妥因、哌拉西林/他唑巴坦和头孢哌酮/舒巴坦敏感;CP-EC分离株对阿米卡星、替加环素、粘菌素和米诺环素敏感。3.除了1株携带bla 基因的***外,其他所有ESBL-EC菌株都携带bla 基因,其中最常见的亚型是bla (27.1%),其次是bla CTX-M-15(24.6%)、bla CTX-M-27(24.6%)。质粒介导的喹诺酮耐药基因qnr S,aac(6’)-Ib和qnr B的检测率分别为22.0%、3.4%、1.7%。1株粘菌素耐药的菌株携带mcr-1基因,3株CP-EC菌株均携带bla 基因。***-EC中最常见的毒力基因是fim H(88.1%)、fyu A(72.9%)、tra T(65.3%)、kps MTII(61.0%)和iut A(54.2%)。ESBL-EC分离株中有52.5%的分离株为肠道外致病菌(extra-intestinal pathogenic bacteria,Ex PEC)。CP-EC中最常见的毒力基因是fim H(66.7%)、kps MTII(66.7%)和tra T(66.7%),其中2株分离株是Ex PEC。5.接合实验结果显示,3株CP-EC携带的bla 基因能够水平转移,接合子的生长与受体菌一致,bla 基因能够稳定存在于接合子中。6.大多数分离株属于B2群(33.1%),B2群中最常见的克隆株是st131(30.0%)和st1193(27.5%)。12株st131中有2种分支,分支A(n=8)和分支C1-M27(n=4)。血清型结果显示有7株***是O16-st131,5株***是O25b-st131。O16-st131分离株的fim H基因均为fim H41,O25b-st131分离株中有4株携带fim H30基因,1株携带fim H89基因。与non-st131菌株相比,st131菌株中bla 、kps MTⅡ、tra T、iut A、fyu A、PAI的携带率较高(Pst131比例较高,st131 ***属于2种分支:分支A和分支C1-M27。这是国内首次分析社区健康儿童粪便携带ESBL-EC和CP-EC的分子特征研究,是国内关于C1-M27分支的首次报道,该研究为预防和控制本地区社区耐药菌株的暴发流行及传播提供了重要实验依据。图14幅,表20个,参考文献97篇

关键词：大肠埃希菌粪便携带社区儿童 ESBL st131

血流感染和尿路感染的大肠埃希菌的分子流行病学研究

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血流感染和尿路感染的大肠埃希菌的分子流行病学研究

作者：董敏浙江大学

学位级别：硕士

背景和目的：肠外致病性大肠埃希菌(Extraintestinal pathogenic Escherichia coli, ExPEC)是一类能引起人和动物肠外组织感染的重要人畜共患病病原,可致使不同宿主发生脑膜炎、败血症、泌尿道和呼吸道感染,每年给全球公共卫生事业造成... 详细信息

背景和目的：肠外致病性大肠埃希菌(Extraintestinal pathogenic Escherichia coli, ExPEC)是一类能引起人和动物肠外组织感染的重要人畜共患病病原,可致使不同宿主发生脑膜炎、败血症、泌尿道和呼吸道感染,每年给全球公共卫生事业造成巨大的财政支出。70-95%的社区获得性尿路感染和50%的医院获得性尿路感染都由尿路致病性大肠埃希菌(Uropathogenic Escherichia coli, UPEC)引起的。同时败血性大肠埃希菌(Sepsis-associated Escherichia coli, SEPEC)也是血液感染的主要原因之一,由其引起的菌血症和败血症的病例越来越多,且具有相当高的死亡率。本研究的目的是了解我院临床分离到的尿液和血液来源的大肠埃希菌的系统分群、分子分型特征、毒力基因分布以及药物敏感性情况,为防治***疾病提供科学依据。方法：选取2011年7月至2012年6月间浙江大学医学院附属第一医院临床微生物实验室分离保存的ExPEC104株,包括55株UPEC和49株SEPEC,采用多重PCR技术对其进行系统分群、多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLst)和44种毒力基因筛查,采用K-B纸片法开展药物敏感性试验。结果：1.系统分群结果显示,104株ExPEC主要属于D群(51株,49.0%),其次为B2群(37株,35.6%)、A群(10株,9.6%)和B1群(6株,5.8%)。其中55株UPEC中B2、D、A和B1分别占43.6%、41.8%、9.1%和5.5%,49株SEPEC中B2、D、A和B1分别占26.5%、57.2%、10.2%和6.1%。2. MLst分析显示7个管家基因adk、fume、gyrB、icd、mdh、purA、recA的等位基因数值(allele numbers)分别有18、21、20、17、15、15、13种。104株ExPEC共发现34种st (sequence types)型,以st131型菌株最多,占14.42%(15/104),其他主要st型依次为st648型,占10.58%(11/104);st69型,占9.62%(10/104);st10型.占7.69%(8/104)。55株UPEC分属于20种不同st型.以st131型最多.占20.00%,49株SEPEC分属于24种不同的st型,以st10型和st648型最多,各占10.20%。新型st型2型,分别为st3905、st3907,且分别位于UPEC和SEPEC菌株中。3.毒力基因sfaS、iha、papA、iroN,、fyuA、Kps Ⅲ在104株菌株的检出率均大于50%;毒力基因afaE8、cdtB、pic在104株菌株中未检出。55株UPEC中检出率≥20.0%的毒力基因有22种,检出率最高的为fyuA(96.4%)和kps Ⅲ(92.7%),有4种毒力基因未检出(bmaE、afaE8、cdtB和pic),毒力分数(携带毒力基因个数)为5-20,第25百分位数(P25)、P50、P75分别为7、11和14。在49株SEPEC中,检出率≥20.0%的毒力基因有15种,检出率最高的为papEF(91.7%)、iha和astA(均为87.5%),有12种毒力基因未检出(f17, afaE8, cvaC, K1, rfc, vat, cdtB, pic, usp, uidA, malX,H7fliC),毒力分数为2-19,第25百分位数(P25)、P50、P75分别为6、9和11。4.104株ExPEC对氨苄西林的耐药率高达86.5%,对9种抗生素(氨苄西林、四环素、头孢唑啉、头孢噻肟、复方新诺明、头孢呋辛、环丙沙星、氨苄西林／舒巴坦、庆大霉素)的耐药率均超过了50%,耐药率最低的为美罗培南(2.9%),美罗培南耐药株均来源于血液。UPEC菌株和SEPEC菌株的ESBL (extended-spectrumβ-lactamases)阳性率分别为60.0%(33/55)、61.7%(30/49),多重耐药菌检出率分别为80.0%(44/55)、85.7%(42/49),耐抗菌药物类数的中位数分别为7和8,差异均无统计学意义。结论：(1)D群是肠道外致病性大肠埃希菌中较常见的系统分群,st131比例较高,应引起更广范围的关注。(2)粘附因子、保护素、铁载体、毒素等相关的毒力因子在肠道外致病性大肠埃希菌中广泛分布。(3)本地区临床分离的肠道外大肠埃希菌耐药情况较严重,需密切关注产ESBLs菌株的耐药情况,同时继续加强抗菌药物的管理和监测。

关键词：尿道致病性大肠埃希菌败血性大肠埃希菌系统分群多位点序列分型 st131 毒力基因耐药性

产KPC-2大肠埃希菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药机制研究

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中国卫生检验杂志 2022年第4期32卷 430-432页

作者：俞丽萍刘丽娟苏芳沈蓓琼方玲妹阿布都外力·吐尼牙孜浙江省淳安县中医院检验科浙江淳安311700 山东省平度市人民医院检验科山东平度266700 浙江省人民医院淳安分院检验科浙江杭州310014 新疆阿克苏地区第一人民医院检验中心新疆阿克苏843000

目的探讨大肠埃希菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药机制及流行特点,为其治疗提供实验依据。方法收集3家不同医院2018年—2020年门诊及住院患者分离大肠埃希菌1025株,通过PCR法检测碳青霉烯酶相关耐药基因(bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(VIM)和b... 详细信息

目的探讨大肠埃希菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药机制及流行特点,为其治疗提供实验依据。方法收集3家不同医院2018年—2020年门诊及住院患者分离大肠埃希菌1025株,通过PCR法检测碳青霉烯酶相关耐药基因(bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(VIM)和bla_(IMP));应用微量肉汤稀释法检测产KPC-2大肠埃希菌药物敏感性;应用多克隆序列位点测定(Multilocus sequence typing,MLst)方法检测菌株克隆型别;通过凝胶脉冲场电泳进一步检测菌株克隆分型;应用接合实验验证耐药基因转移。结果共分离13株产KPC-2大肠埃希菌株,分离率为1.2%,MLst数据及脉冲场凝胶电泳显示这些菌株分为7个不同克隆型9个克隆簇。此外,4株携带bla_(KPC-2)基因菌株可以成功地将其对碳青霉烯类耐药的表型转移到大肠埃希菌J53菌株中。结论产KPC-2大肠埃希菌呈克隆播散模式,bla_(KPC-2)耐药基因可以借助质粒进行水平传播,应引起临床高度重视,迫切需要密切监测携带bla_(KPC-2)基因菌株的进一步传播。

关键词：大肠埃希菌碳青霉烯耐药 KPC-2 质粒 st131