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镇巴天麻的遗传多样性与ssr指纹图谱分析

分子植物育种 2022年第13期20卷 4425-4433页

作者：王齐周天华王佳邓百万陈琛成世强张世超周代贵陕西理工大学生物科学与工程学院汉中723001 镇巴县科技进步促进中心镇巴723600 镇巴县农业技术推广站镇巴723600

为研究镇巴天麻的遗传多样性,分析不同天麻种质资源间的差异,本研究利用11对ssr引物对镇巴产红天麻和全国其他地区不同变型的天麻种质资源进行遗传多样性分析,并构建其DNA指纹图谱。研究结果表明:11对引物共检测出64个基因位点,平均每... 详细信息

为研究镇巴天麻的遗传多样性,分析不同天麻种质资源间的差异,本研究利用11对ssr引物对镇巴产红天麻和全国其他地区不同变型的天麻种质资源进行遗传多样性分析,并构建其DNA指纹图谱。研究结果表明:11对引物共检测出64个基因位点,平均每对引物5.82个;镇巴红天麻种群具有较高的遗传多样性(A=2.7273,H=0.5625,I=0.8915);天麻种群间遗传分化强烈(F_(st)=0.3431);聚类分析结果显示,相同变型的天麻种群首先聚在了一起,相同变型的不同种群也能被完全区别开来,ssr指纹图谱在变型水平和种群水平上鉴定效率良好;从20个镇巴红天麻样本中共检测出有20种基因型,Simpson指数(D)为1.000,表明ssr指纹图谱在个体水平上也有着良好的鉴定效率。本研究为天麻种质资源保护及良种选育提供理了理论依据和技术支持。

关键词：天麻(Gastrodia elata) 遗传多样性分析 ssr指纹图谱

黄淮产区地黄种质遗传多样性分析及ssr指纹图谱构建

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河南农业科学 2022年第7期51卷 61-74页

作者：李春鑫张永战陈国参杨铁钢张英涛李春董诚明河南省科学院生物研究所有限责任公司河南郑州450008 河南省农业科学院经济作物研究所河南郑州450002 河南省农业科学院芝麻研究中心河南郑州450002 河南中医药大学药学院河南郑州450046

为明确我国黄淮产区地黄种质间遗传多样性,解析种质间的亲缘关系,为该区地黄品种选育和种质鉴定提供依据,利用毛细管电泳技术和108对ssr引物对地黄种质进行分析,以获取种质间遗传相似系数、多态性引物、种质分辨率,利用软件TASSEL 3.0和... 详细信息

为明确我国黄淮产区地黄种质间遗传多样性,解析种质间的亲缘关系,为该区地黄品种选育和种质鉴定提供依据,利用毛细管电泳技术和108对ssr引物对地黄种质进行分析,以获取种质间遗传相似系数、多态性引物、种质分辨率,利用软件TASSEL 3.0和Fig Tree(V 1.4.3)进行聚类分析和作图,选取多态性好、稳定性强的引物构建地黄种质的ssr指纹图谱。结果表明,共获得多态性引物50对,其片段长度在107~365 bp,种质间遗传相似系数在0.552~0.984,平均为0.729,野生种质的平均遗传相似系数明显低于地方品种和当前主栽品种。聚类结果显示,17个地黄种质分为3个亚群。选取并利用多态性强和分辨率高、扩增稳定的15对引物构建了地黄种质的ssr指纹图谱,实现了对每个地黄种质的快速鉴定。综上,ssr分析是实现地黄鉴真、聚类、DNA指纹图谱构建的一种有效方法。

关键词：地黄种质多态性引物遗传多样性分析 ssr指纹图谱黄淮产区

辽宁地区绿豆品种ssr指纹图谱构建及品种鉴定

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食品科学 2018年第6期39卷 284-290页

作者：赵雅楠王颖张东杰黑龙江八一农垦大学食品学院黑龙江大庆163319 国家杂粮工程技术研究中心黑龙江大庆163319

目的:构建辽宁地区绿豆品种的DNA指纹图谱,建立一种快速准确的品种鉴定方法。方法:利用15对多态性丰富的简单重复序列(simple sequence repeat,ssr)引物构建辽宁地区48份绿豆品种的指纹数据库及ssr指纹图谱。结果:15对引物共扩增出58个... 详细信息

目的:构建辽宁地区绿豆品种的DNA指纹图谱,建立一种快速准确的品种鉴定方法。方法:利用15对多态性丰富的简单重复序列(simple sequence repeat,ssr)引物构建辽宁地区48份绿豆品种的指纹数据库及ssr指纹图谱。结果:15对引物共扩增出58个等位基因,每对引物检测到2~7个不等,平均为3.9,其中特异性条带13个,占总数的22.4%。多态信息含量介于0.114 5~0.776 4之间,平均为0.378 4。选择鉴别能力较强的5对引物组合,区分率为75%;15对引物组合,区分率为89.68%。构建了0/1形式的指纹数据库和ssr指纹图谱,除个别品种外均具有唯一性,可用于品种鉴定。结论:ssr指纹图谱的构建为绿豆品种鉴定提供了新的途径,为绿豆资源评价、保护及新品选育提供技术支撑和科学参考。

关键词： ssr指纹图谱绿豆品种鉴定

鲁棉研系列抗虫棉品种ssr指纹图谱构建及遗传多样性分析

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华北农学报 2013年第S1期28卷 1-6页

作者：韩宗福赵逢涛王景会王宗文申贵芳孔凡金李汝忠张军山东棉花研究中心山东济南250100

利用28对ssr核心引物构建了25个鲁棉研系列抗虫棉品种的分子指纹图谱并进行遗传多样性分析。28对核心引物的ssr位点分属21条染色体,等位基因数为2~8个,平均4.39个;PIC值为0.63~0.93,平均0.84。数字指纹图谱显示,最少采用BNL1421、BNL151... 详细信息

利用28对ssr核心引物构建了25个鲁棉研系列抗虫棉品种的分子指纹图谱并进行遗传多样性分析。28对核心引物的ssr位点分属21条染色体,等位基因数为2~8个,平均4.39个;PIC值为0.63~0.93,平均0.84。数字指纹图谱显示,最少采用BNL1421、BNL1513、BNL1231、NAU2026和BNL2646这5对引物组合可以将25份供试材料区分开。对其中14个常规品种的遗传多样性分析表明,其遗传相似系数介于0.35~0.87,平均为0.57。此结果可为现阶段鲁棉研系列种质资源的杂交选育提供依据。

关键词：鲁棉研系列品种核心引物 ssr指纹图谱遗传多样性

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天麻种质资源的ssr指纹图谱研究

西北植物学报 2018年第5期38卷 830-838页

作者：周天华丁家玺徐皓陈琛陕西理工大学生物科学与工程学院陕西汉中723001 陕西省天麻山茱萸工程技术研究中心陕西汉中723000

天麻(Gastrodia elata Bl.)为中国珍稀濒危传统药用植物,其不同种质之间形态特征差异微小,而药用成分差异较大,种质资源混乱。为了构建天麻种质资源的DNA指纹图谱,该研究应用ssr分子标记技术对天麻的3种变型(乌天麻、红天麻和绿天麻)、1... 详细信息

天麻(Gastrodia elata Bl.)为中国珍稀濒危传统药用植物,其不同种质之间形态特征差异微小,而药用成分差异较大,种质资源混乱。为了构建天麻种质资源的DNA指纹图谱,该研究应用ssr分子标记技术对天麻的3种变型(乌天麻、红天麻和绿天麻)、12个种群,共计120个样本进行了群体遗传分析。研究结果表明:(1)7对ssr引物均能对天麻样本成功进行PCR扩增且多态性丰富,每对引物的等位基因数(N_a)在5~7之间,平均为6.43;引物多态信息含量(PIC)范围为0.626 2~0.823 5,平均为0.759 5。(2)群体遗传分析结果表明,天麻在物种水平上和变型水平上均有较高的遗传多样性(物种水平:A=6.428 6,H=0.789 0,I=1.682 9;变型水平:A=2.666 6,H=0.523 9,I=0.812 3)。(3)分子方差分析结果显示,种群间和变型间均存在强烈的遗传分化(F_(st)=0.558 6,F_(ct)=0.381 8)。(4)种群聚类分析结果显示,相同变型的天麻种群首先聚在一起,3种变型能被完全分开,ssr指纹图谱在变型水平上鉴定效率良好;从120个样本中共检测出有112种基因型,Simpson指数(D)为0.99 8,说明ssr指纹图谱对天麻样本在个体水平上也有着良好的鉴定效率。该研究结果揭示了天麻的遗传背景,并建立了天麻的ssr指纹鉴定图谱,为其种质资源的保护、选育及药材鉴定奠定了科学依据与技术支撑。

关键词：天麻 ssr指纹图谱种质资源

白及种质资源及其近缘种的ssr指纹图谱研究

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西北植物学报 2017年第4期37卷 673-681页

作者：周天华黎君丁家玺杨恒陈世丽陕西理工大学生物科学与工程学院陕南秦巴山区资源生物综合开发协同创新中心

白及(Bletilla striata Rchb.)为中国珍稀濒危药用植物,野生资源枯竭,混伪种繁多。该研究基于ssr标记技术对16个地区48份白及(Bletilla striata Rchb.)样品和4份黄花白及(Bletilla ochracea Schltr.)、4份小白及(Bletilla formosana(Hayata)Schltr.)、4份华白及(Bletilla sinensis(Rolfe)Schltr.)样品进行遗传多样性分析,构建白及种质资源的ssr指纹图谱,并对60份白及样品进行种质资源鉴定,分析白及属种内及其种间的遗传分化特征。结果表明:(1)20对白及ssr引物均能在4个白及属植物中成功扩增,条带清晰且多态性丰富,每对引物的复等位基因数(Na)在49之间,等位基因数(Na)总和为127,平均为6.35。(2)筛选出基因型丰富、多态性信息含量(PIC)高的7对白及ssr引物(BJssr01、BJssr14、BJssr15、BJssr16、BJssr18、BJssr19、BJssr22)构建的白及ssr指纹图谱能将白及属各种质资源清楚分开。(3)白及属在种间水平均有较高的遗传多样性(Na=6.35,I=1.429 1,h=0.706 8),物种间遗传分化强烈(Gst=0.44),物种间的基因流较弱(Nm=0.475 3)。(4)UPGMA聚类分析表明,60份供试样品明显聚为4大支,同一物种的个体首先聚在一起,这与形态学分类基本一致;不同来源地的样品种内和种间的亲缘关系有明显差异,地理距离较近的白及样品具有较近的遗传关系。

关键词：白及属 ssr指纹图谱种质资源

新疆早熟棉品种ssr指纹图谱构建与品种鉴别

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同方期刊数据库

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棉花学报 2010年第4期22卷 360-366页

作者：薛艳张新宇沙红李雪源孙杰李保成石河子大学农学院/新疆兵团绿洲生态农业重点实验室新疆石河子832003 新疆农业科学院经作所乌鲁木齐830052 新疆农垦科学院新疆石河子832003

以新疆自1978年以来审定命名的42个早熟棉品种为材料,利用ssr分子标记对新疆早熟棉品种进行研究。从2300对ssr引物中筛选出了52对具有稳定多态性的引物,每对引物可检测到3～24个多态性片段,共检测到506个,平均9.7个,片段大小介于100～20... 详细信息

以新疆自1978年以来审定命名的42个早熟棉品种为材料,利用ssr分子标记对新疆早熟棉品种进行研究。从2300对ssr引物中筛选出了52对具有稳定多态性的引物,每对引物可检测到3～24个多态性片段,共检测到506个,平均9.7个,片段大小介于100～2000bp之间。对所得到的52个ssr指纹图谱进行组合和综合分析,用其中2对就可将所有供试品种区分开来。同时,分别对42个早熟棉品种进行指纹分析,获得各个品种的特异性指纹,可为今后棉花种子真伪快速鉴别奠定基础。

关键词：陆地棉 ssr指纹图谱品种鉴别

河南主推旱稻品种ssr指纹图谱的构建及遗传差异分析

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分子植物育种 2014年第2期12卷 226-232页

作者：韩迎春李俊周杜彦修张静孙红正赵全志河南农业大学、河南粮食作物协同创新中心、水稻河南省工程实验室、农业部黄淮海作物生理生态与耕作重点实验室、郑州市节水农业重点实验室郑州450002

为构建河南早稻种植品种的DNA指纹图谱，了解河南早稻的遗传多样性，本研究利用均匀分布于水稻12条染色体的38对ssr引物，以河南主要推广种植的10个早稻品种为材料，进行遗传多样性分析并构建ssr指纹图谱。结果表明，35对引物具有多态... 详细信息

为构建河南早稻种植品种的DNA指纹图谱，了解河南早稻的遗传多样性，本研究利用均匀分布于水稻12条染色体的38对ssr引物，以河南主要推广种植的10个早稻品种为材料，进行遗传多样性分析并构建ssr指纹图谱。结果表明，35对引物具有多态性片段，共检测到108个等位基因，平均每位点3．1个等位基因；引物平均多态性频率为0．485。10个品种间的遗传相似系数为0．435～0．907，平均0．678。利用RM552、RM171、RM5、RM308、RM338、RM17和RM5877对多态性较高的ssr引物构建的核心指纹图谱能区分出10个旱稻品种。采用非加权类平均法进行聚类分析，在遗传相似系数0．480处可将10个品种分为籼、粳两大类。

关键词：河南旱稻 ssr指纹图谱遗传差异分析

黄河流域棉花主要品种ssr指纹图谱构建及遗传差异分析

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棉花学报 2011年第6期23卷 545-551页

作者：韩宗福王景会申贵芳王宗文赵逢涛李汝忠张军孔凡金赵静山东棉花研究中心山东济南250100 济南大学山东济南250022

利用ssr分子标记构建了2009-2010年黄河流域23个主要棉花品种和2010年山东省区试4个品系的分子指纹图谱并进行遗传多样性分析。63对引物在27份供试材料中共扩增到多态性条带254条,平均每对引物4.03条。22对引物在23个品种(系)上具有特... 详细信息

利用ssr分子标记构建了2009-2010年黄河流域23个主要棉花品种和2010年山东省区试4个品系的分子指纹图谱并进行遗传多样性分析。63对引物在27份供试材料中共扩增到多态性条带254条,平均每对引物4.03条。22对引物在23个品种(系)上具有特征谱带,除鲁棉研21号、鲁棉研36号、鲁436、邯棉559外,均可用1对引物进行鉴定;采用引物组合法只需要5对引物就能将27份供试材料区分开,并利用这5对引物构建了上述品种(系)的数字指纹图谱。遗传多样性分析显示,27个品种(系)间遗传相似系数介于0.5394～0.9685之间,平均为0.6878,并且同一省份所选育的品种(系)大都聚到同一类群,说明黄河流域选育的品种还存在一定的地域局限性。

关键词：棉花黄河流域品种 ssr指纹图谱遗传多样性